WikiDer > RDBP

RDBP
NELFE
Белок RDBP PDB 1x5p.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNELFE, D6S45, NELF-E, RD, RDBP, RDP, член комплекса отрицательного фактора удлинения E
Внешние идентификаторыOMIM: 154040 MGI: 102744 ГомолоГен: 134736 Генные карты: NELFE
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение NELFE
Геномное расположение NELFE
Группа6п21.33Начните31,952,087 бп[1]
Конец31,959,038 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE RDBP 209219 на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002904

NM_001045863
NM_001045864
NM_138580

RefSeq (белок)

NP_002895

NP_001039328
NP_001039329
NP_613046

Расположение (UCSC)Chr 6: 31.95 - 31.96 МбChr 17: 34,85 - 34,86 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Отрицательный коэффициент удлинения E это белок что у людей кодируется RDBP ген.[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является частью комплекса, называемого отрицательный коэффициент удлинения (NELF) который подавляет РНК-полимераза II удлинение транскрипта. Этот белок имеет сходство с ядерными РНК-связывающими белками; однако не было продемонстрировано, что этот белок связывает РНК. Белок содержит ряд чередующихся основных и кислотных остатков, в основном аргинина (R) и аспарагиновой кислоты (D). Ген локализуется в главном комплексе гистосовместимости (MHC класс III) область на хромосоме 6.[5]

Взаимодействия

RDBP была показана взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ENSG00000206357, ENSG00000231044, ENSG00000204356, ENSG00000206268, ENSG00000233801 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000229363, ENSG00000206357, ENSG00000231044, ENSG6200000220435G, ENSG6200000220435 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024369 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: RDBP RD РНК-связывающий белок».
  6. ^ а б c Нарита Т., Ямагути Ю., Яно К., Сугимото С., Чанарат С., Вада Т., Ким Д. К., Хасегава Дж., Омори М., Инукай Н., Эндох М., Ямада Т., Ханда Х (март 2003 г.). «Человеческий фактор элонгации транскрипции NELF: идентификация новых субъединиц и восстановление функционально активного комплекса». Молекулярная и клеточная биология. 23 (6): 1863–73. Дои:10.1128 / mcb.23.6.1863-1873.2003. ЧВК 149481. PMID 12612062.
  7. ^ Ленер Б., Семпл Д.И., Браун С.Е., Советник Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / s0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
  8. ^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3: 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.

дальнейшее чтение

внешние ссылки