WikiDer > SS18

SS18
SS18
Идентификаторы
ПсевдонимыSS18, SSXT, SYT, субъединица комплекса ремоделирования хроматина nBAF, субъединица SS18 комплекса ремоделирования хроматина BAF
Внешние идентификаторыOMIM: 600192 MGI: 107708 ГомолоГен: 38080 Генные карты: SS18
Расположение гена (человек)
Хромосома 18 (человек)
Chr.Хромосома 18 (человек)[1]
Хромосома 18 (человек)
Геномное местоположение SS18
Геномное местоположение SS18
Группа18q11.2Начните26,016,253 бп[1]
Конец26,091,217 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SS18 202816 s на fs.png

PBB GE SS18 202817 s на fs.png

PBB GE SS18 209954 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001007559
NM_001308201
NM_005637

NM_001161369
NM_001161370
NM_001161371
NM_009280

RefSeq (белок)

NP_001007560
NP_001295130
NP_005628
NP_005628.2

NP_001154841
NP_001154842
NP_001154843
NP_033306

Расположение (UCSC)Chr 18: 26.02 - 26.09 МбChr 18: 14.62 - 14.68 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок SSXT это белок что у людей кодируется SS18 ген.[5][6][7]

Функция

SS18 - участник человеческих SWI / SNF комплекс ремоделирования хроматина.[8][9][10]

Клиническое значение

SS18 участвует в хромосомная транслокация обычно встречается в синовиальная саркома.[11]

Взаимодействия

SS18 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000141380 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000037013 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Шипли Дж. М., Кларк Дж., Экипаж А. Дж., Бердсол С., Рокки П. Дж., Гилл С., Челли Дж., Монако А. П., Эйб С., Гастерсон Б. А. (май 1994 г.). «Транслокация t (X; 18) (p11.2; q11.2), обнаруженная в синовиальных саркомах человека, затрагивает два различных локуса на X-хромосоме». Онкоген. 9 (5): 1447–53. PMID 8152806.
  6. ^ Кларк Дж., Рокс П.Дж., Экипаж А.Дж., Гилл С., Шипли Дж., Чан А.М., Гастерсон Б.А., Купер С.С. (август 1994 г.). «Идентификация новых генов SYT и SSX, участвующих в транслокации t (X; 18) (p11.2; q11.2), обнаруженной в синовиальной саркоме человека». Природа Генетика. 7 (4): 502–8. Дои:10.1038 / ng0894-502. PMID 7951320. S2CID 20503729.
  7. ^ де Брюйн Д.Р., Геуртс ван Кессель А (2006). «Общее происхождение локусов генов SS18 и SS18L1, связанных с синовиальной саркомой человека». Цитогенетические и геномные исследования. 112 (3–4): 222–6. Дои:10.1159/000089874. PMID 16484776.
  8. ^ Мидделянс Э., Ван Х, Янсен П.В., Шарма В., Стунненберг Х.Г., Логи С. (2012). «SS18 вместе с факторами, специфичными для животных, определяет комплексы SWI / SNF человека BAF-типа». PLOS ONE. 7 (3): e33834. Дои:10.1371 / journal.pone.0033834. ЧВК 3307773. PMID 22442726.
  9. ^ а б Като Х., Тьернберг А., Чжан В., Крутчинский А. Н., Ан В., Такеучи Т., Оцуки Ю., Сугано С., де Бруейн Д. Р., Чайт Б. Т., Рёдер Р. Г. (февраль 2002 г.). «SYT связывается с человеческими комплексами SNF / SWI, а С-концевой регион его партнера по слиянию SSX1 нацелен на гистоны». Журнал биологической химии. 277 (7): 5498–505. Дои:10.1074 / jbc.M108702200. PMID 11734557.
  10. ^ а б Перани М., Инграм С.Дж., Купер С.С., Гарретт Мэриленд, Гудвин Г.Х. (ноябрь 2003 г.). «Консервативный домен SNH протоонкопротеина SYT взаимодействует с компонентами комплексов ремоделирования хроматина человека, в то время как повторяющийся домен QPGY образует гомоолигомеры». Онкоген. 22 (50): 8156–67. Дои:10.1038 / sj.onc.1207031. PMID 14603256.
  11. ^ Ян К., Луи В.О., Се И, Чжан А., Скайттинг Б., Мандал Н., Ларссон С., Ларссон О. (июнь 2002 г.). «Сосуществование слияний SYT-SSX1 и SYT-SSX2 в синовиальных саркомах». Онкоген. 21 (26): 4181–90. Дои:10.1038 / sj.onc.1205569. PMID 12037676.
  12. ^ Ид Дж. Э., Кунг А. Л., Скалли Р., Ливингстон Д. М. (сентябрь 2000 г.). «p300 взаимодействует с ядерным протоонкопротеином SYT как часть активного контроля клеточной адгезии». Ячейка. 102 (6): 839–48. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00072-6. PMID 11030627. S2CID 17342132.
  13. ^ де Брюйн Д.Р., дос Сантос Н.Р., Тийссен Дж., Балеманс М., Дебернарди С., Линдер Б., Янг Б.Д., Геуртс ван Кессель А. (май 2001 г.). «Белок, ассоциированный с синовиальной саркомой, SYT, взаимодействует с белком AF10, ассоциированным с острым лейкозом». Онкоген. 20 (25): 3281–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1204419. PMID 11423977.

дальнейшее чтение