WikiDer > SUB1

SUB1
SUB1
Белок SUB1 PDB 1pcf.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSUB1, P15, PC4, p14, гомолог SUB1, регулятор транскрипции, регулятор транскрипции SUB1
Внешние идентификаторыOMIM: 600503 MGI: 104811 ГомолоГен: 38218 Генные карты: SUB1
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение для SUB1
Геномное расположение для SUB1
Группа5п13.3Начните32,531,633 бп[1]
Конец32,604,079 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SUB1 212857 x at fs.png

PBB GE SUB1 214512 s в формате fs.png

PBB GE SUB1 221727 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_006713

NM_011294

RefSeq (белок)

NP_006704

NP_035424

Расположение (UCSC)Chr 5: 32,53 - 32,6 МбChr 15: 11.98 - 12 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Коактиватор транскрипции активированной РНК-полимеразы II p15 также известен как положительный кофактор 4 (ПК4) или SUB1 гомолог это белок что у людей кодируется SUB1 ген.[5][6][7] Человек SUB1 ген[7] назван в честь ортологичный ген в дрожжах.[8]

SUB1 индуцируется окислительный стресс, и участвует в координации клеточных реакций на Разрывы цепи ДНК возникающие после окислительного стресса[9]. Дрожжи SUB1 имеют структурное и функциональное сходство с человеческими. альфа-синуклеин, белок, который играет важную роль в Болезнь Паркинсона.[10] Как и SUB1, альфа-синуклеин регулирует Ремонт ДНК включая репарацию двухцепочечных разрывов ДНК.

Взаимодействия

SUB1 был показан взаимодействовать с участием CSTF2.[11]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113387 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022205 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Kretzschmar M, Kaiser K, Lottspeich F, Meisterernst M (август 1994). «Новый медиатор транскрипции генов класса II, гомологичный вирусным регуляторам немедленной ранней транскрипции». Ячейка. 78 (3): 525–34. Дои:10.1016/0092-8674(94)90429-4. PMID 8062392. S2CID 29077941.
  6. ^ Ge H, Roeder RG (август 1994 г.). «Очистка, клонирование и характеристика человеческого коактиватора РС4, который опосредует активацию транскрипции генов класса II». Ячейка. 78 (3): 513–23. Дои:10.1016/0092-8674(94)90428-6. PMID 8062391. S2CID 1140379.
  7. ^ а б «Entrez Gene SUB1: гомолог SUB1 (S. cerevisiae)».
  8. ^ Кнаус Р., Поллок Р., Гуаренте Л. (апрель 1996 г.). «Дрожжевой SUB1 является супрессором мутаций TFIIB и имеет гомологию с человеческим коактиватором PC4». Журнал EMBO. 15 (8): 1933–40. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00544.x. ЧВК 450112. PMID 8617240.
  9. ^ Ю Л, Ма Х, Джи Х, Фолькерт MR. Ядерный белок Sub1 защищает ДНК от окислительного повреждения. Mol Cell Biochem. 2016 Янв; 412 (1-2): 165-71. DOI: 10.1007 / s11010-015-2621-х. Epub 2015 26 декабря. PMID: 26708217
  10. ^ Schaser AJ, Osterberg VR, Dent SE, Stackhouse TL, Wakeham CM, Boutros SW, Weston LJ, Owen N, Weissman TA, Luna E, Raber J, Luk KC, McCullough AK, Woltjer RL, Unni VK. Альфа-синуклеин - это ДНК-связывающий белок, который модулирует восстановление ДНК с последствиями для заболеваний с тельцами Леви. Sci Rep.29 июля 2019; 9 (1): 10919. PMID: 31358782 PMCID: PMC6662836 DOI: 10.1038 / s41598-019-47227-z
  11. ^ Кальво О., Мэнли Дж. Л. (май 2001 г.). «Эволюционно консервативное взаимодействие между CstF-64 и PC4 связывает транскрипцию, полиаденилирование и терминацию». Молекулярная клетка. 7 (5): 1013–23. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00236-2. PMID 11389848.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P53999 (Коактиватор транскрипции активированной РНК-полимеразы II p15) на PDBe-KB.