WikiDer > Белок, связывающий промотор Squamosa - Википедия

Squamosa promoter binding protein - Wikipedia
SBP
PDB 1ul4 EBI.jpg
Структура раствора ДНК-связывающего домена промотора Squamosa, связывающего белок-подобный 4
Идентификаторы
СимволSBP
PfamPF03110
ИнтерПроIPR004333
PROSITEPDOC00798
SCOP22lao / Объем / СУПФАМ
TCDB3.A.1

Промотор SQUAMOSA, связывающий белок, подобный (SBP или же SPL) семья факторы транскрипции определяются конкретным заводом ДНК-связывающий домен. Член-основатель семьи был определен на основании его специфики. in vitro привязка к промоутер гена SQUAMOSA львиный зев.[1] Считается, что белки SBP являются активаторами транскрипции.

Функция

Белки SPB играют роль в развитии листьев, изменение вегетативной фазы, развитие цветов и плодов, архитектура растений, спорогенез, передача сигналов гибберелевой кислоты и токсиновый ответ.[2]

Структура

В домене 10 консервированный цистеин и гистидин остатки это, вероятно, цинк лигандыДомен SBP - это высококонсервативный ДНК-связывающий домен. Это примерно 80 аминокислоты в длину и содержит цинковый палец мотивс двумя сайтами связывания цинка: Cys-Cys-His-Cys и Cys-Cys-Cys-His. Имеет трехниточный антипараллельный бета-лист.[3]

Рекомендации

  1. ^ Klein J, Saedler H, Huijser P (январь 1996 г.). «Новое семейство ДНК-связывающих белков включает предполагаемые регуляторы транскрипции гена идентичности цветочной меристемы Antirrhinum majus SQUAMOSA». Мол. Генерал Жене. 250 (1): 7–16. Дои:10.1007 / bf02191820. PMID 8569690. S2CID 20915344.
  2. ^ Чен X, Чжан З., Лю Д., Чжан К., Ли А., Мао Л. (2010). «Белковые факторы транскрипции, связывающие промотор SQUAMOSA: главные игроки роста и развития растений». Дж Интегр Завод Биол. 52 (11): 946–51. Дои:10.1111 / j.1744-7909.2010.00987.x. PMID 20977652.
  3. ^ Ямасаки К., Кигава Т., Иноуэ М., Татено М., Ямасаки Т., Ябуки Т. и др. (2004). «Новый цинк-связывающий мотив, обнаруженный структурами раствора ДНК-связывающих доменов транскрипционных факторов семейства SBP Arabidopsis». Дж Мол Биол. 337 (1): 49–63. Дои:10.1016 / j.jmb.2004.01.015. PMID 15001351.

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR004333