WikiDer > Бета-дефенсин 2 - Википедия
Бета-дефенсин 2 (BD-2) также известный как кожно-антимикробный пептид 1 (SAP1) - это пептид что у людей кодируется DEFB4 (дефенсин, бета 4) ген.[3]
Человеческий бета-дефенсин-2 (hBD-2) представляет собой богатый цистеином катионный низкомолекулярный антимикробный пептид, недавно обнаруженный в пораженной коже.
Структура
hBD-2 - это белок, первичная структура которого состоит из 64 аминокислот. При концентрациях ≤2,4 мМ hBD-2 является мономерным.[4] Структура амфифильный с неоднородным поверхностным распределением положительного заряда и содержит несколько ключевых структурных элементов, в том числе трехцепочечный, антипараллельный бета-лист с прядями 2 и 3 в бета шпилька конформация. Определение других структурных элементов зависит от используемой техники. При использовании рентгеновской кристаллографии альфа-спираль можно наблюдать на N-концевой конец белка (коды PDB: 1fd3,1fd4, И 6cs9). При использовании ЯМР эта альфа-спираль не появляется (код PDB: 1e4q), Однако эта структура была определена с использованием усеченной версии hBD-2, в которой отсутствовали исходные 4 аминокислоты, что может быть причиной расхождения.
Функция
Defensins образуют семейство микробицидных и цитотоксический пептиды, произведенные нейтрофилы. Члены семейства дефенсинов очень похожи по последовательности белков. Бета-дефенсин 2 представляет собой пептид антибиотика, который локально регулируется воспаление.[5]
Бета-дефенсин 2 человека продуцируется рядом эпителиальный клеток и проявляет сильную антимикробную активность против Грамотрицательные бактерии и Candida, но не грамположительные S. aureus. Было высказано предположение, что бета-дефенсин 2 может способствовать редкости грамотрицательных инфекций кожи и тканей легких.[6]
hBD-2 представляет собой первый человеческий дефенсин, который продуцируется после стимуляции эпителиальных клеток при контакте с такими микроорганизмами, как P. aeruginosa или цитокины, такие как TNF-альфа и IL-1 бета. Ген и белок HBD-2 локально экспрессируются в кератиноциты связанные с воспалительными поражениями кожи. Интересно предположить, что HBD-2 является динамическим компонентом местной эпителиальной защитной системы кожи и дыхательных путей, который играет роль в защите поверхностей от инфекции и дает возможную причину того, почему инфекции кожи и легких, вызванные грамотрицательными бактериями, являются довольно редко.[6]
Хотя этот белок не обладает антибактериальной активностью против грамположительных бактерий, есть исследование, показывающее, что существует синергизм между hBD-2 и другими белками.[7] Одним из примеров этого синергетического эффекта является epiP, белок, сегрегированный некоторыми штаммами S. epidermidis. hBD2, держась за руки с epiP, способен убивать S. aureus, a грамположительные бактерии, вызывающие болезни человека.
Рекомендации
- ^ а б c ENSG00000275444, ENSG00000285433 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000177257, ENSG00000275444, ENSG00000285433 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Хардер Дж., Бартельс Дж., Кристоферс Э., Шредер Дж. М. (июнь 1997 г.). «Пептидный антибиотик из кожи человека». Природа. 387 (6636): 861. Дои:10.1038/43088. PMID 9202117. S2CID 4354862.
- ^ Савай М.В., Цзя Х.П., Лю Л., Асеев В., Винсек Дж. М., МакКрей ПБ, Ганц Т., Кирни В. Р., Тэк Б. Ф. (апрель 2001 г.). «Структура ЯМР бета-дефенсина-2 человека обнаруживает новый альфа-спиральный сегмент». Биохимия. 40 (13): 3810–3816. Дои:10.1021 / bi002519d. PMID 11300761.
- ^ «Энтрез Ген: дефенсин DEFB4, бета 4».
- ^ а б Шредер Дж. М., Хардер Дж. (Июнь 1999 г.). «Бета-дефенсин-2 человека». Международный журнал биохимии и клеточной биологии. 31 (6): 645–651. Дои:10.1016 / S1357-2725 (99) 00013-8. PMID 10404637.
- ^ Ивасе Т., Уэхара Й, Синдзи Х, Тадзима А., Со Х., Такада К., Агата Т., Мидзуно Й. (май 2010 г.). «Staphylococcus epidermidis Esp подавляет образование биопленок Staphylococcus aureus и колонизацию носа». Природа. 465 (7296): 346–349. Дои:10.1038 / природа09074. PMID 20485435. S2CID 4392908.
внешняя ссылка
- Человек DEFB4A расположение генома и DEFB4A страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
дальнейшее чтение
- Вайнберг А., Крисанапракорнкит С., Дейл Б.А. (1999). «Эпителиальные антимикробные пептиды: обзор и значение для перорального применения». Критические обзоры по оральной биологии и медицине. 9 (4): 399–414. Дои:10.1177/10454411980090040201. PMID 9825219.
- Шредер Дж. М., Хардер Дж. (Июнь 1999 г.). «Бета-дефенсин-2 человека». Международный журнал биохимии и клеточной биологии. 31 (6): 645–651. Дои:10.1016 / S1357-2725 (99) 00013-8. PMID 10404637.
- Балс Р., Ван Х, Ву З., Фриман Т., Бафна В., Заслофф М., Уилсон Дж. М. (сентябрь 1998 г.). «Человеческий бета-дефенсин 2 представляет собой солеочувствительный пептидный антибиотик, экспрессируемый в легких человека». Журнал клинических исследований. 102 (5): 874–880. Дои:10.1172 / JCI2410. ЧВК 508952. PMID 9727055.
- Лю Л., Ван Л., Цзя Х. П., Чжао С., Хэн Х. Х., Шютте BC, МакКрей П. Б., Ганц Т. (ноябрь 1998 г.). «Структура и картирование человеческого гена бета-дефенсина HBD-2 и его экспрессия в местах воспаления». Ген. 222 (2): 237–244. Дои:10.1016 / S0378-1119 (98) 00480-6. PMID 9831658.
- Мэтьюз М., Джиа Х.П., Гатмиллер Дж. М., Лош Г., Грэм С., Джонсон Г. К., Так Б. Ф., МакКрей П. Б. (июнь 1999 г.). «Производство антимикробных пептидов бета-дефенсина слизистой оболочкой полости рта и слюнными железами». Инфекция и иммунитет. 67 (6): 2740–2745. Дои:10.1128 / IAI.67.6.2740-2745.1999. ЧВК 96577. PMID 10338476.
- Джиа Х.П., Миллс Дж. Н., Бараманд-Пур Ф., Нишимура Д., Маллампали Р.К., Ван Дж., Уайлс К., Тэк Б.Ф., Бевинс С.Л., МакКрей ПБ (сентябрь 1999 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика генов крыс, кодирующих гомологи бета-дефенсинов человека». Инфекция и иммунитет. 67 (9): 4827–4833. Дои:10.1128 / IAI.67.9.4827-4833.1999. ЧВК 96815. PMID 10456937.
- Ян Д., Чертов О., Быковская С. Н., Чен К., Буффо М. Дж., Шоган Дж., Андерсон М., Шредер Дж. М., Ван Дж. М., Ховард О. М., Оппенгейм Дж. Дж. (Октябрь 1999 г.). «Бета-дефенсины: связь врожденного и адаптивного иммунитета через дендритные и Т-клеточные CCR6». Наука. 286 (5439): 525–528. Дои:10.1126 / science.286.5439.525. PMID 10521347.
- Diamond G, Kaiser V, Rhodes J, Russell JP, Bevins CL (январь 2000 г.). «Транскрипционная регуляция экспрессии гена бета-дефенсина в эпителиальных клетках трахеи». Инфекция и иммунитет. 68 (1): 113–119. Дои:10.1128 / iai.68.1.113-119.2000. ЧВК 97109. PMID 10603376.
- Хардер Дж., Мейер-Хофферт Ю., Теран Л. М., Швихтенберг Л., Бартельс Дж., Мауне С., Шредер Дж. М. (июнь 2000 г.). «Mucoid Pseudomonas aeruginosa, TNF-alpha и IL-1beta, но не IL-6, индуцируют человеческий бета-дефенсин-2 в респираторном эпителии». Американский журнал респираторной клетки и молекулярной биологии. 22 (6): 714–721. Дои:10.1165 / ajrcmb.22.6.4023. PMID 10837369.
- Гувер Д.М., Раджашанкар К.Р., Блюменталь Р., Пури А., Оппенгейм Дж. Дж., Чертов О., Лубковски Дж. (Октябрь 2000 г.). «Структура человеческого бета-дефенсина-2 свидетельствует о олигомеризации более высокого порядка». Журнал биологической химии. 275 (42): 32911–32918. Дои:10.1074 / jbc.M006098200. PMID 10906336.
- Мейер Дж. Э., Хардер Дж., Гёрёг Т., Шредер Дж. М., Мауне С. (июль 2000 г.). «[экспрессия гена hBD-2 в слизистой оболочке носа]». Ларинго- Носорог- Отология. 79 (7): 400–403. Дои:10.1055 / с-2000-4626. PMID 11005092.
- Али Р.С., Фалконер А., Икрам М., Биссет С.Э., Церио Р., Куинн А.Г. (июль 2001 г.). «Экспрессия пептидных антибиотиков бета-дефенсин-1 человека и бета-дефенсин-2 человека в нормальной коже человека». Журнал следственной дерматологии. 117 (1): 106–111. Дои:10.1046 / j.0022-202x.2001.01401.x. PMID 11442756.
- Carothers DG, Graham SM, Jia HP, Ackermann MR, Tack BF, McCray PB (2001). «Производство антимикробных пептидов бета-дефенсина слизистой оболочкой гайморовой пазухи». Американский журнал ринологии. 15 (3): 175–179. Дои:10.2500/105065801779954238. PMID 11453504. S2CID 31583849.
- Бирагин А., Суренху М., Ян Д., Руффини П.А., Хейнс Б.А., Клюшненкова Э., Оппенгейм Дж. Дж., Квак Л. В. (декабрь 2001 г.). «Медиаторы врожденного иммунитета, которые нацелены на незрелые, но не зрелые дендритные клетки, индуцируют противоопухолевый иммунитет при генетическом слиянии с неиммуногенными опухолевыми антигенами». Журнал иммунологии. 167 (11): 6644–6653. Дои:10.4049 / jimmunol.167.11.6644. PMID 11714836.
- Bauer F, Schweimer K, Klüver E, Conejo-Garcia JR, Forssmann WG, Rösch P, Adermann K, Sticht H (декабрь 2001 г.). «Определение структуры бета-дефенсинов человека и мыши выявляет структурную консервацию в отсутствие значительного сходства последовательностей». Белковая наука. 10 (12): 2470–2479. Дои:10.1110 / пс 24401. ЧВК 2374044. PMID 11714914.
- Такахаши А., Вада А., Огуши К., Маэда К., Кавахара Т., Маватари К., Куразоно Х., Мосс Дж., Хираяма Т., Накая И. (ноябрь 2001 г.). «Продукция бета-дефенсина-2 эпителиальными клетками толстой кишки человека, индуцированная структурным белком нитей жгутиков Salmonella enteritidis». Письма FEBS. 508 (3): 484–488. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 03088-5. PMID 11728477. S2CID 24925463.
- Schibli DJ, Хантер HN, Асеев V, Starner TD, Wiencek JM, McCray PB, Tack BF, Vogel HJ (март 2002 г.). «Структуры раствора бета-дефенсинов человека позволяют лучше понять мощную бактерицидную активность HBD3 против Staphylococcus aureus». Журнал биологической химии. 277 (10): 8279–8289. Дои:10.1074 / jbc.M108830200. PMID 11741980.
PDB галерея | |
|---|---|
|
 | Этот белок-связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |