WikiDer > HLA-Cw * 16
 | Эта статья может быть слишком техническим для большинства читателей, чтобы понять. Пожалуйста помогите улучшить это к сделать понятным для неспециалистов, не снимая технических деталей. (Май 2017 г.) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения) |
главный комплекс гистосовместимости (человек), класс I, Cw * 16 | ||
| Аллели | Cw * 1601 Cw * 1602 | |
| Структура (Видеть HLA-C) | ||
| Идентификаторы | 1601 1602 | |
| Символ (ы) | HLA-C[постоянная мертвая ссылка] | |
| EBI-HLA | Cw **1601 | |
| Cw **1602 | ||
| Общие данные | ||
| Locus | chr.6 6п21.31 | |
HLA-Cw * 16 (Cw * 16) - это HLA-C аллель-группа. Серотип определяет наиболее распространенные продукты гена HLA-Cw * 16.[1] Эта группа аллелей чаще всего встречается в Западной Африке, но единственный гаплотип Cw16 встречается в Западной Европе с необычно высокими частотами. Для Cw * 16 нет полезных серологических тестов.[2]
Аллели
| частота | ||
| исх. | численность населения | (%) |
| [3] | Бандиагара (Мали) | 28.3 |
| [3] | Фулани (Буркина-Фасо) | 21.4 |
| [3] | Мосси (Буркина-Фасо) | 17.9 |
| [3] | Ниохоло Мандинка (Сенегал) | 16.8 |
| [3] | Гипускоа Баскский (Испания) | 16.6 |
| [3] | Римаильбе (Буркина-Фасо) | 16.0 |
| [3] | Ибицы (Испания) | 11.4 |
| [3] | Буби (Биоко, уравнение, Гвинея) | 10.5 |
| [3] | Лусака (Замбия) | 10.0 |
| [3] | Жирона (Каталония, Испания) | 9.8 |
| [3] | Кения | 8.4 |
| [3] | Шона (Хараре, Зимбабве) | 8.0 |
| [3] | Тунис | 7.2 |
| [3] | Майорка и Менорка (Испания) | 7.1 |
| [3] | Восточная Андалусия (Испания) | 6.7 |
| [3] | Бети (Камерун) | 6.0 |
| [3] | Юго-Восточная Франция | 5.1 |
| [3] | E. Andalusia Gypsy (Испания) | 5.1 |
| [3] | Северная Ирландия | 5.0 |
| [3] | Суданский | 5.0 |
| [3] | Кампала (Уганда) | 4.9 |
| [3] | Бамилеке (Камерун) | 4.5 |
| [3] | Ло (Кения) | 4.5 |
| [3] | Нанди (Кения) | 4.4 |
| [3] | Кавказцы (Великобритания) | 4.1 |
| [3] | Сава (Камерун) | 3.8 |
| [3] | Маратхи (Мумбаи, Индия) | 3.7 |
| [3] | Центральная Португалия | 3.7 |
| [3] | Корсика (Франция) | 3.5 |
| [3] | Надор М. берберский (Марокко) | 3.2 |
| [3] | Бергамо (Италия) | 3.0 |
| [3] | Женева (Швейцария) | 2.7 |
| [3] | Тибилиси (Грузия) | 1.9 |
| [3] | Курды (Грузия) | 1.7 |
| [3] | Мбензеле (Центральноафриканская Республика) | 1.5 |
| [3] | Синдхи (Пакистан) | 1.5 |
| [3] | Гурайат & Град (Саудовская Аравия) | 1.2 |
| [3] | Белудж (Иран) | 1.0 |
| [3] | Натал Тамил (Южная Африка) | 1.0 |
| [3] | (Сирая) Тайвань | 1.0 |
| [3] | Западная Франция | 0.5 |
| [3] | Ливан | 0.5 |
| [3] | Тегеран (Иран) | 0.4 |
| [3] | индюк | 0.4 |
| [3] | Амман, Иордания) | 0.3 |
| [3] | Лакота Сиу (США) | 0.3 |
| [3] | Юпик Эскимос (США) | 0.2 |
Cw * 1601
Хотя Cw * 1601, вероятно, не эволюционировал в Западная африка, он определенно расширился, и это регион, в котором наблюдается большая часть разнообразия гаплотипов. Поскольку таблица частот для Cw * 1601 показывает, что самые высокие частоты для данной северной широты более или менее следуют за 0-м номером. меридиан из Западной Африки в объединенное Королевство, исключение, пучность, в западном Франция, что указывает на смещение в этих регионах или ядро миграции несущих Cw * 16 вдоль Восточного региона. Есть вторичный узел в Баски из Испания, однако, учитывая очень небольшую диверсификацию гаплотипов (см. гаплотип A29-Cw * 16-B44 на этой странице), указывает на то, что это результат асимметричной экспансии или отбора в пределах басков по аллелю.
Мандинка в Сенегале связана с Бандиагара в Мали, потому что Малийская империя обосновалась в Сенегале. В Буби находятся на островах у побережья Экваториальной Гвинеи (щелкните карту, чтобы увеличить в полный размер, чтобы увидеть острова)
Другие аллели и гаплотипы следуют аналогичной схеме. DR7-DQ2, DR3-DQ2 и A * 2901 следуют аналогичной схеме очевидного потока генов из Африки в Западную Европу. Хотя для DR3-DQ2 миграция, по-видимому, связана с B8 и, вероятно, произошла в начале AMH заселение Европы.
Гаплотипы
A29-Cw * 16-B44
| частота | ||
| исх. | численность населения | (%) |
| A29-Cw16-B44 (A * 2902: Cw * 1601: B * 4403) | ||
| Басков, Гипускоа (Испания) | 10.3 | |
| Басков, Сан-Себастьон (Испания) | 7.5 | |
| Долина Пасьегос (Испания) | 5.4 | |
| Басков, Арратия (Испания) | 5.3 | |
| [4] | Корнуолл (греч. Великобритания) | 5.3 |
| [4] | испанский | 5.0 |
| Уате Корс (Франция) | 4.3 | |
| Париж, Франция) | 3.9 | |
| португальский | 3.5 | |
| [4] | Французский | 3.4 |
| Ирландский | 3.4 | |
| Южноафриканский (Индиг.) | 2.7 | |
| N. Irish | 2.8 | |
| [4] | Датчанин | 2.2 |
| Тунис | 2.0 | |
| Уэльс | 2.0 | |
| Тосканский | 1.7 | |
| нидерландский язык | 1.4 | |
| Немецкий | 1.3 | |
| Тропический лес (Камерун) | 1.3 | |
A29-Cw16-B44(A * 2902: Cw * 1601: B * 4403), по-видимому, возник в Западной Африке, где частота Cw * 16 является самой высокой и претерпела большее равновесие по сцеплению. Cw * 16 медленно снижается в направлении на север и более быстро на восток и северо-восток, с самой высокой частотой / широтой к северу, как правило, вдоль Восточной Испании в Британские Ильзы, некоторые текут вверх по каналу, но частота гаплотипов падает во внутренних частях Европы.
Этот гаплотип обычно может быть расширен от A- до -DQ как A29-Cw16-B44-DR7-DQ2.2:
А*2901 : Cw*1601 : B*4403 : DRB1*0701 : DQA1*0201 : DQB1*0202
И компонент Cw16 находится в сильном неравновесном сцеплении с компонентом DR7-DQ2.2, указывая тем самым, что с момента появления гаплотипов в Европе не было достаточно времени для уравновешивания, поддерживая его недавнее внедрение в Европу. Этот конкретный гаплотип поддерживает теории миграции, которые более многочисленны, чем те, которые поддерживаются мтДНК или информацией о Y-хромосоме, многие такие `` меньшие '' миграции очевидны с гаплотипами HLA, что предполагает гораздо большую сложность для человеческой популяции, чем гаплоидный loci сделать очевидным.
Рекомендации
- ^ Чианетти Л., Теста Ю., Скотто Л. и др. (1989). «Три новых аллеля HLA класса I: структура мРНК и альтернативные механизмы процессинга». Иммуногенетика. 29 (2): 80–91. Дои:10.1007 / BF00395855. PMID 2914713.
- ^ Marsh, S.G .; Альберт, Э. Д .; Bodmer, W. F .; Bontrop, R.E .; Dupont, B .; Erlich, H.A .; Fernández-Viña, M .; Герати, Д. Э .; Holdsworth, R .; Hurley, C.K .; Lau, M .; Lee, K. W .; Мах, Б .; Maiers, M .; Mayr, W. R .; Müller, C.R .; Parham, P .; Petersdorf, E.W .; Сасадзуки, Т .; Strominger, J. L .; Svejgaard, A .; Terasaki, P. I .; Tiercy, J.M .; Троусдейл, Дж. (2010). «Номенклатура факторов системы HLA, 2010». Тканевые антигены. 75 (4): 291–455. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2010.01466.x. ЧВК 2848993. PMID 20356336.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль являюсь ан ао ap водный ар в качестве в au Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Н., Комеровски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net". Тканевые антигены. 61 (5): 403–7. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660. Внешняя ссылка в
| название =(помощь) - ^ а б c d Сасадзуки, Такехико; Цудзи, Кимиёси; Айзава, Мики (1992). HLA 1991: материалы одиннадцатого Международного семинара и конференции по гистосовместимости, состоявшихся в Иокогаме, Япония, 6–13 ноября 1991 г.. Оксфорд [Оксфордшир]: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-262390-4.