WikiDer > HPN (ген)

HPN (gene)
Гепсин-SRCR
PDB 1p57 EBI.jpg
внеклеточный домен человеческого гепсина
Идентификаторы
СимволГепсин-SRCR
PfamPF09272
ИнтерПроIPR015352
SCOP21п57 / Объем / СУПФАМ
HPN
Белок HPN PDB 1o5e.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыHPN, TMPRSS1, гепсин
Внешние идентификаторыOMIM: 142440 MGI: 1196620 ГомолоГен: 20498 Генные карты: HPN
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение HPN
Геномное расположение HPN
Группа19q13.11Начните35,040,506 бп[1]
Конец35,066,571 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE HPN 204934 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002151
NM_182983
NM_001375441
NM_001384133

NM_001110252
NM_001276269
NM_008281

RefSeq (белок)

NP_002142
NP_892028
NP_001362370
NP_001371062

NP_001103722
NP_001263198
NP_032307

Расположение (UCSC)Chr 19: 35.04 - 35.07 МбChr 7: 31.1 - 31.12 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Сериновая протеаза гепсин является фермент что у людей кодируется HPN ген.[5][6]

Функция

Гепсин представляет собой сериновую протеазу клеточной поверхности.[6]

Hepson содержит пептидаза Домен S1 и домен SRCR. Домен SRCR находится в внеклеточный часть белок, он состоит в основном из трех элементов регулярного вторичная структура: 12-остаток альфа-спираль, витая пятиниточная антипараллельный бета-лист, и второй, двухнитевой, антипараллельный лист. Два бета-листы лежат примерно под прямым углом друг к другу, спираль расположенный между ними, приняв SRCR складывать. Точная функция этого домена не была определена, хотя, вероятно, она может служить ориентиром для протеаза домен или разместите его рядом с его субстрат.[7]

Клиническое значение

Экспрессия гепсина не регулируется в рак простаты и коррелирует с прогрессированием заболевания.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105707 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001249 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Лейтус С.П., Леб К.Р., Хаген Ф.С., Курачи К., Дэви Е.В. (февраль 1988 г.). «Новая трипсиноподобная сериновая протеаза (гепсин) с предполагаемым трансмембранным доменом, экспрессируемым клетками печени и гепатомы человека». Биохимия. 27 (3): 1067–74. Дои:10.1021 / bi00403a032. PMID 2835076.
  6. ^ а б «Ген Entrez: гепсин HPN (трансмембранная протеаза, серин 1)».
  7. ^ Сомоса Дж. Р., Хо Дж. Д., Луонг К., Гейт М., Шпренгелер П. А., Мортара К., Шрейдер В. Д., Сперандио Д., Чан Г., МакГрат М. Е., Кац Б. А. (сентябрь 2003 г.). «Структура внеклеточной области человеческого гепсина выявляет домен сериновой протеазы и новый богатый цистеином домен рецептора скавенджера (SRCR)». Структура. 11 (9): 1123–31. Дои:10.1016 / S0969-2126 (03) 00148-5. PMID 12962630.
  8. ^ Ву Кью, Парри Джи (2007). «Гепсин и рак простаты». Границы биологических наук. 12 (12): 5052–9. Дои:10.2741/2447. PMID 17569629.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR015352