WikiDer > Леггемоглобин редуктаза

Leghemoglobin reductase
леггемоглобин редуктаза
Идентификаторы
Номер ЕС1.6.2.6
Количество CAS60440-35-9
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO

В энзимология, а леггемоглобин редуктаза (EC 1.6.2.6) является фермент который катализирует в химическая реакция

НАД (P) H + H+ + 2 феррилеггемоглобина НАД (Ф) + + 2 ферролегемоглобин

Другими словами, леггемоглобин (или же фитоглобин в общем) с Fe3+ восстанавливается до единицы с ионом двухвалентного железа, Fe2+.

Этот фермент принадлежит к семейству оксидоредуктазыособенно те, которые действуют на НАДН или НАДФН с гемовым белком в качестве акцептора. В систематическое название этого класса ферментов НАД (Ф) Н: феррилеггемоглобин оксидоредуктаза. Этот фермент еще называют железо леггемоглобин редуктаза.

Роль в клубеньках бобовых

Леггемоглобин (Lb) - это гем-содержащий белок, который обратимо связывает и транспортирует O2 в N2-фиксирование клубеньков бобовых растений.[1] Чтобы функционировать как O2-носитель Lb должен быть в степени окисления железа (Lb2+). Кислородный фунт2+ (Фунт2+О2) легко самоокисляется до трехвалентного железа Lb (Lb3+) генерирующий О2 в присутствии следовых количеств переходные металлы, хелаторы и токсичные метаболиты (такие как нитрит, супероксид радикальный и перекиси),[2] однако Lb2+ является преобладающей формой в узелках.[3][4] Следовательно, механизмы существуют in vivo для поддержания Lb в функциональных черных положение дел.[5]

История

Беррис и Хасс[6] были первыми, кто предположил, что восстановленные пиридиновые нуклеотиды могут функционировать как восстановители Lb3+ в клубеньках бобовых корней и в 1969 Appleby[7] сообщил, что Lb3+ был уменьшен до фунта2+ суспензией бактероидов. В 1982 г. Кретович с сотрудниками[8] очистил фермент от люпин конкреции, катализирующие восстановление Lb3+ в фунт2+ с помощью НАДН как восстановитель. Этот фермент (названный этими авторами как Легоглобин Редуктаза -LR) похож на НАДН:цитохром б5 редуктаза (EC 1.6.2.2) из эритроцитов и мышц крупного рогатого скота. Люпин LR - это флавопротеин с молекулярной массой 60 кДа и его активность специфична для НАДН. В 1984 году Клакас и сотрудники[9] очищенный белок с активностью Lb редуктазы железа (FLbR) из соя узелки. Активность FLbR сои составляла 90% в цитозоле клубеньков и 10% в бактероидах. НАДН был лучшим восстановителем для FLbR соевых бобов, хотя НАДФН также функционировал в три раза меньше, чем НАДН. Эти исследования Клукаса и сотрудников[9] также показали, что окисление НАДН и восстановление Lb3+ не было обнаружено, когда O2 был удален из реакционной системы, но все было восстановлено при повторном добавлении O2, что свидетельствует о том, что активность FLbR равна O2-зависимый.

Горох DLDH.tif
Прогнозируемая структура сои FLbR2.tif
Рис Phytogb красный от FLbR2.tif

В бобовых

FLbR сои представляет собой флавопротеин с флавинаденин динуклеотид (FAD) как протезная группа и состоит из двух идентичных субъединиц, каждая из которых имеет молекулярную массу 54 кДа. В Kм и KКот значения FLbR сои для Lb сои3+ уменьшение составляют 9,2 мкМ и 6,2 с−1, соответственно (KКот/Kм = 674 млн−1 s−1). Аминокислотная последовательность FLbR сои очень близка к последовательности дисульфида флавин-нуклеотида. оксидоредуктазы, особенно дигидролипоамиддегидрогеназа (DLDH) (EC 1.8.1.4) из пируватдегидрогеназный комплекс. Аминокислотная последовательность FLbR сои содержит 30 остатков сигнальный пептид для транслокации в митохондрии, а также в консервативные области для сайта связывания FAD, сайта связывания NAD (P) H и дисульфидного активного сайта, характерных для горох DLDH и другие ферменты из семейства пиридинуклеотид-дисульфид оксидоредуктаз.[10]

Геном сои содержит не менее двух копий (названных flbr1 и flbr2) из flbr ген.[11] Аминокислотная последовательность FLbR2 сои имеет значительную гомологию с FLbR1 сои и DLDH митохондрий листьев гороха и содержит митохондриальную группу из 30 остатков. транзитный пептид.[12] Последовательности FLbR также были обнаружены и проанализированы в бобовых культурах, кроме сои. Например, нуклеотидная последовательность вигна КДНК FLbR имеет 88 и 85% сходства с FLbR сои и DLDH гороха соответственно. В Kм и KКот значения FLbR вигны для Lb3+ уменьшение составляют 10,4 мкМ и 3,1 с−1, соответственно (KКот/Kм = 298 млн−1 s−1).[13]

На других заводах

FLbR2 сои снижает рис Фитоглобин1.1 (Phytogb1.13+).[14] По-видимому, соевый FLbR2-рис Фитоглобин1.13+ взаимодействие слабое. An in silico анализ показал, что соя FLbR2 и рис Phytogb1.13+ взаимодействовать на FAD-привязке домен FLbR2 сои и CD-петли и спирали F риса Phytogb1.13+. Следовательно, FLbR могут быть обобщенным in vivo механизм ферментативного восстановления Phytogbs3+.

Рекомендации

  1. ^ Эпплби К. А. Происхождение и функции гемоглобина в растениях, Sci. Прогресс, 76 (1992) 365-398.
  2. ^ Бекана М., Клукас Р. В., Окисление и восстановление леггемоглобина в корневых клубеньках бобовых растений, Физиология растений, 98 (1992) 1217-1221.
  3. ^ Ли К. К., Клукас Р. В., Снижение содержания легегемоглобина железа в клубеньках корня сои, Физиология растений, 74 (1984) 984-988.
  4. ^ Ли К. К., Ширман Л. Л., Эриксон Б. К., Клукас Р. В., Леггемоглобин железа в прикрепленных к растениям бобовых клубеньках., Физиология растений, 109 (1995) 261-267.
  5. ^ Бекана М., Клукас Р. В. Ферментативные и неферментативные механизмы восстановления леггемоглобина железа в корневых клубеньках бобовых, Proc. Natl. Акад. Sci. США, 87 (1990) 7295-7299.
  6. ^ Беррис Р. Х., Хасс Э. Красный пигмент клубеньков бобовых корней., J. Biol. Chem., 155 (1944) 227-229.
  7. ^ Эпплби К. А., Свойства леггемоглобина in vivo, и его выделение в виде оксилегемоглобина железа, Biochim Biophys. Acta, 188 (1969) 222-229.
  8. ^ Кретович В. Л., Мелик-Саркисян С. С., Баширова Н. Ф., Топунов А. Ф. Ферментативное восстановление леггемоглобина в клубеньках люпина // Прикл. Biochem., 4 (1982) 209-217.
  9. ^ а б Саари Л. Л., Клукас Р. В., Железо-леггемоглобинредуктаза из корневых клубеньков сои, Arch. Biochem. Biophys., 231 (1984) 102-113.
  10. ^ Джи Л., Вуд С., Бекана М., Клукас Р. В., Очистка и определение характеристик железо леггемоглобинредуктазы клубеньков сои, Plant Physiol., 96 (1991) 32-37.
  11. ^ Джи Л., Бекана М., Сарат Г., Клукас Р. В., Клонирование и анализ последовательности кДНК, кодирующей трехвалентную леггемоглобинредуктазу из клубеньков сои, Plant Physiol., 104 (1994) 453-459.
  12. ^ Моран Дж. Ф., Сан З., Сарат Г., Арредондо-Питер Р., Джеймс Э. К., Бекана М., Клукас Р. В., Молекулярное клонирование, функциональная характеристика и субклеточная локализация дигидролипоамидредуктазы клубеньков сои., Физиология растений, 128 (2002) ) 300-313.
  13. ^ Луан П., Аречага-Окампо Э., Сарат Г., Арредондо-Питер Р., Клукас Р. В., Анализ ферро-леггемоглобин-редуктазы из коровьего гороха (Vigna unguiculata) корневые клубеньки., Plant Sci., 154 (2000) 161-170.
  14. ^ Gopalasubramaniam SK, Kondapalli KC, Millán-Pacheco C., Pastor N., Stemmler TL, Moran JF, Arredondo-Peter R., Дигидролипоамиддегидрогеназа сои (леггемоглобин редуктаза 2 железа) взаимодействует с несимбиотическим гемоглобином железа 1. , 2 (2013) 33.
  • Саари Л.Л., Клукас Р.В. (1984). «Железо леггемоглобинредуктаза из клубеньков корня сои». Arch. Biochem. Биофизы. 231 (1): 102–13. Дои:10.1016/0003-9861(84)90367-9. PMID 6539095.

Смотрите также