WikiDer > Список секвенированных геномов водорослей - Википедия

List of sequenced algae genomes - Wikipedia

Этот список секвенированных геномов водорослей содержит виды водорослей, о которых известно, что они имеют общедоступные полные последовательности генома, которые были собраны, аннотированы и опубликованы. Несобранные геномы не включены, как и последовательности, состоящие только из органелл. Для геномов растений см. список секвенированных геномов растений. Для последовательностей пластид см. список секвенированных пластомов. Для всех королевств см. список секвенированных геномов.

Динофлагелляты (Альвеолаты)

Смотрите также Список секвенированных геномов протистов.

Организм

напряжение

ТипАктуальностьРазмер геномаЧисло

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Breviolum minutum (Симбиодиниум минута; клады B1)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт1,5 Гб47,014Окинавский институт науки и технологий2013[1]ПроектМорская геномика OIST[2]
Cladocopium goreaui (Симбиодиниум Goreaui; клады C, тип C1)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт1.19 Гб35,913Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / Университет Квинсленда2018[3]ПроектReFuGe 2020[4]
Кладокопиум C92 штамм Y103 (Симбиодиниум sp. клады C; предполагаемый тип C92)ДинофлагеллятаСимбионт фораминиферНеизвестно (размер сборки 0,70 Гб)65,832Окинавский институт науки и технологий2018[5]ПроектМорская геномика OIST[2]
Fugacium kawagutii CS156 = CCMP2468 (Симбиодиниум Кавагути; клады F1)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт?1.07 Гб26,609Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / Университет Квинсленда2018[3]ПроектReFuGe 2020[4]
Fugacium kawagutii CCMP2468 (Симбиодиниум Кавагути; клады F1)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт?1.18 Гб36,850Университет Коннектикута / Сямэньский университет2015[6]ПроектС. кавагути геномный проект[7]
Polarella glacialis CCMP1383ДинофлагеллятаПсихрофил, Антарктика3,02 ГБ (диплоид), 1,48 ГБ (гаплоид)58,232Университет Квинсленда2020[8]ПроектUQ eSpace[9]
Polarella glacialis CCMP2088ДинофлагеллятаПсихрофил, Арктика2,65 Гб (диплоид), 1,30 Гб (гаплоид)51,713Университет Квинсленда2020[8]ПроектUQ eSpace[9]
Симбиодиниум микроадриатикум (клад А)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт1.1 Гб49,109Университет науки и технологий короля Абдаллы2016[10]ПроектРифовая геномика[11]
Симбиодиниум Штамм A3 Y106 (Симбиодиниум sp. клады A3)ДинофлагеллятасимбионтНеизвестно (размер сборки 0,77 Гб)69,018Окинавский институт науки и технологий2018[5]ПроектМорская геномика OIST[2]

Криптомонады

Организм

напряжение

ТипАктуальностьРазмер геномаЧисло

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Cryptophyceae sp. CCMP2293НанофлагеллятаНуклеоморф, Психрофил534,5 Мб33,051Объединенный институт генома2016[12]Портал генома JGI[13]
Гиллардия тетаЭукариот Эндосимбиоз87,2 Мб24, 840Университет Далхаузи2012[14]Теплица[15]

Глаукофит

Организм

напряжение

ТипАктуальностьГеном

размер

Число

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Цианофора

парадокс

Модель

Организм

70,2 Мб3,900Университет Рутгерса2012[16]Проект v1Теплица[15]

Проект генома цианофоры[17]

Цианофора

парадокс

Модель

Организм

99.94 Мб25,831Университет Рутгерса2019[18]Проект v2Проект генома цианофоры[19]

Зеленые водоросли

Организм

напряжение

ТипАктуальностьГеном

размер

Число

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Астерохлорис sp. Cgr / DA1phoФотобионт55,8 Мб10,025Университет Дьюка2011[20]Портал генома JGI[13]
Auxenochlorella protothecoidesБиотопливо22.9 Мб7,039Университет Цинхуа2014[21]Теплица[15]
Батикокк празиносСравнительный анализ15,1 Мб7,900Объединенный институт генома2012[22]Портал генома JGI[13]
Хламидомонада Reinhardtii CC-503

cw92 mt +

Модельный организм111,1 Мб17,741Объединенный институт генома2017[23]Фитозом[24]

Теплица[15]

Хлорелла сорокиниана ул. 1228Биотопливо61,4 МбНациональная лаборатория Лос-Аламоса2018[25]Теплица[15]
Хлорелла сорокиниана UTEX 1230Биотопливо58,5 МбНациональная лаборатория Лос-Аламоса2018[26]Теплица[15]
Хлорелла сорокиниана DOE1412Биотопливо57,8 МбНациональная лаборатория Лос-Аламоса2018[27]Теплица[15]
Хлорелла вариабилис NC64AБиотопливо46,2 Мб9,7912010[28]Теплица[15]
Хлорелла обыкновеннаяБиотопливо37,3 МбНациональная возобновляемая энергия

Энергетическая лаборатория

2015[29]Теплица[15]
Coccomyxa subellipsoidea

sp. С-169

Биотопливо48,8 Мб9839Объединенный институт генома2012[30]Фитозом[24]

Теплица[15]

Дуналиелла салина

CCAP19 / 18

Галофил

Биотопливо

Бета-каротин и глицерин производство

343,7 Мб16,697Объединенный институт генома2017[31]Фитозом[24]
Евдорина sp.Многоклеточные водоросли,

модельный организм

~ 180 МбТокийский университет2018[32]
Micromonas commoda NOUM17 (RCC288)морской фитопланктон21.0 Мб10,262Научно-исследовательский институт аквариума Монтерей-Бэй2013[33][34]Портал генома JGI[13]
Микромонас

пустышка CCMP-1545

морской

фитопланктон

21.9 Мб10,575Микромонас

Геном

Консорциум

2009[35]Фитозом[24]

Теплица[15]

Микромонас

пустышка

RCC299 / NOUM17

морской

фитопланктон

20.9 Мб10,056Совместный геном

Институт

2009[35]Фитозом[24]

В

Теплица[15]

Монорафидиум

пренебрежение

Биотопливо69,7 Мб16,755Билефельд

Университет

2013[36]В

Теплица[15]

Остреококк

люцимарин

CCE9901

Маленький геном13.2 Мб7,603Объединенный институт генома2007[37]Фитозом[24]
Остреококк

тавр OTH95

Маленький геном12.9 Мб7,699CNRS2014[38]Теплица[15]
Остреококк sp.

RCC809

Маленький геном13.3 Мб7,492Совместный геном

Институт

2009[39]JGI[40]
Пикохлорум

солоэцизм

DOE101

Биотопливо15.2 Мб7,844Лос-Аламос

Национальная лаборатория

2017[41]Теплица[15]
Пикохлорум

SENEW3

Биотопливо13,5 Мб7,367Университет Рутгерса2014[42]Теплица[15]
Scenedesmus

косой DOE0152Z

Биотопливо210,3 МбБруклинский колледж2017[43]Теплица[15]
Symbiochloris reticulata (Метагеном)Фотобионт58,6 Мб12,720Объединенный институт генома2018[44]Портал генома JGI[13]
Tetraselmis sp.Биотопливо228 МбЛос-Аламос

Национальная лаборатория

2018[15]Теплица[15]
Volvox carteriМногоклеточные водоросли,

модельный организм

131,2 Мб14,247Совместный геном

Институт

2010[45]Фитозом[24]

В

Теплица[15]

Ямагишиелла unicoccaМногоклеточные водоросли,

модельный организм

~ 140 МбТокийский университет2018[32]

Гаптофит

Организм

напряжение

ТипАктуальностьГеном

размер

Число

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Хризохромулина

парва

Биотопливо65,8 МбЛос-Аламосская национальная лаборатория2018[46]Теплица[15]
Chrysochromulina tobinii CCMP291Модельный организм, Биотопливо59,1 Мб16,765Вашингтонский университет2015[47]Теплица[15]
Эмилиания ХакслиКокколитофораПроизводство алкенона, цветение водорослей167,7 Мб38,554Объединенный институт генома2013[48]Теплица[15]
Павловалес sp. CCMP2436Психрофил165,4 Мб26,034Объединенный институт генома2016[49]Портал генома JGI[13]

Гетероконц/Страменопилы

Организм

напряжение

ТипАктуальностьГеном

размер

Число

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Ауреококк

анофагеференс

Вредные водоросли

цвести

50.1 Мб11,522Объединенный институт генома2011[50]Теплица[15]
Ectocarpus siliculosusБурые водорослиМодельный организм198,5 Мб16,269Геноскоп2012[51]Теплица[15]
Fragilariopsis cylindrus CCMP1102Психрофил61,1 Мб21,066Университет Восточной Англии, Объединенный институт генома2017[52]Портал генома JGI[13]
Нанохлоропсис

гадитана

Биотопливо28,5 Мб10,486Университет Падуи2014[53]Теплица[15]
Нанохлоропсис

Oceanica

Биотопливо31,5 МбКитайская Академия Наук, Циндаоский институт биоэнергетики и биотехнологий2016[54]Теплица[15]
Нанохлоропсис Салина CCMP1766Биотопливо24,4 МбКитайская Академия Наук, Циндаоский институт биоэнергетики и биотехнологий2016[55]Теплица[15]
Ochromonadaceae sp. CCMP2298Психрофил61,1 Мб20,195Объединенный институт генома2016[56]Портал генома JGI[13]
Pelagophyceae sp. CCMP2097Психрофил85,2 Мб19,402Объединенный институт генома2016[57]Портал генома JGI[13]
Phaeodactylum tricornutumМодельный организм27,5 Мб10,408Консорциум диатомовых водорослей2008[58]Теплица[15]
Псевдо-ницския многосерийный CLN-47218,7 Мб19,703Объединенный институт генома2011[59]Портал генома JGI[13]
Сахарина японскаяБурые водорослиКоммерческая культура543,4 МбКитайская Академия Наук, Пекинский институт наук о жизни2015[60]Теплица[15]
Thalassiosira oceanica CCMP 1005Модельный организм92,2 Мб34,642Будущий океан2012[61]Теплица[15]
Thalassiosira pseudonanaмодельный организм32,4 Мб11,673Консорциум диатомовых водорослей2009[62]Теплица[15]

Красные водоросли (родофит)

Организм

напряжение

ТипАктуальностьГеном

размер

Число

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Chondrus crispusКаррагинан продукция, модельный организм105 Мб9,606Геноскоп2013Теплица[15]
Cyanidioschyzon

мерола 10D

Модель

организм

16,5 Мб4,775Национальный институт

генетики, Япония

2007[63]Теплица[15]
Galdieria sulphurariaЭкстремофил12,1 МбЙоркский университет2016[64]Теплица[15]
Грацилариопсис хордаМезофил92,1 Мб10,806Sungkyunkwan University2018[65]
Порфиридий пурпурныйМезофил19,7 Мб8,355Университет Рутгерса2013[66]
Порфира пупочнаяМарикультура87,6 Мб13,360Университет штата Мэн2017[67]Фитозом[24]
Pyropia yezoensisМарикультура43,5 Мб10,327Национальный исследовательский институт рыбного хозяйства2013[68]

Ризария

Организм

напряжение

ТипАктуальностьГеном

размер

Число

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Bigelowiella natansМодельный организм94. Мб21,708Университет Далхаузи2012[14]Теплица[15]

Рекомендации

  1. ^ Сёгути Э., Синдзато Ч., Кавасима Т., Гёджа Ф., Мунгпакди С., Коянаги Р. и др. (2013). «Проект сборки Симбиодиниум минутный ядерный геном показывает структуру гена динофлагеллят ». Текущая биология. 25 (15): 1399–1408. Дои:10.1016 / j.cub.2013.05.062. PMID 23850284.
  2. ^ а б c "Морская геномика OIST". marinegenomics.oist.jp. Получено 2018-08-22.
  3. ^ а б Лю Х., Стивенс Т.Г., Гонсалес-Печ Р.А., Белтран В.Х., Лапейре Б., Бонгаертс П. и др. (2018). "Симбиодиниум геномы показывают адаптивную эволюцию функций, связанных с симбиозом кораллов и динофлагеллат ». Биология коммуникации. 1: 95. Дои:10.1038 / с42003-018-0098-3. ЧВК 6123633. PMID 30271976.
  4. ^ а б "Сайт данных ReFuGe 2020". Убежище2020.reefgenomics.org. Получено 2018-08-22.
  5. ^ а б Сегучи Э., Бедесси Дж., Тада I, Хисата К., Кавасима Т., Такеучи Т. и др. (2018). "Два расходящихся Симбиодиниум геномы показывают сохранение кластера генов для биосинтеза солнцезащитного крема и недавно утраченных генов ". BMC Genomics. 19 (1): 458. Дои:10.1186 / s12864-018-4857-9. ЧВК 6001144. PMID 29898658.
  6. ^ Lin S, Cheng S, Song B, Zhong X, Lin X, Li W и др. (2015). "The Симбиодиниум кавагути геном освещает экспрессию гена динофлагеллят и коралловый симбиоз ». Наука. 350 (6261): 691–4. Bibcode:2015Научный ... 350..691Л. Дои:10.1126 / science.aad0408. PMID 26542574.
  7. ^ "С. кавагути сайт данных ". web.malab.cn/symka_new. Получено 2018-08-22.
  8. ^ а б Стивенс Т.Г., Гонсалес-Печ Р.А., Ченг Й., Мохамед А.Р., Берт Д.В., Бхаттачарья Д. и др. (2020). «Геномы динофлагелляты Polarella glacialis кодируют тандемно повторяющиеся гены с одним экзоном с адаптивными функциями ". BMC Биология. 18 (1): 56. Дои:10.1186 / s12915-020-00782-8. ЧВК 7245778. PMID 32448240.
  9. ^ а б Стивенс, Тимоти; Раган, Марк; Бхаттачарья, Дебашиш; Чан, Чеонг Синь (2020). "Polarella сайт данных ". Дои:10.14264 / uql.2020.222. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  10. ^ Аранда М., Ли Ю., Лью Ю.Дж., Баумгартен С., Симаков О., Уилсон М.К. и др. (2016). «Геномы коралловых симбионтов с динофлагеллятами подчеркивают эволюционные адаптации, способствующие симбиотическому образу жизни». Научные отчеты. 6: 39734. Bibcode:2016НатСР ... 639734А. Дои:10.1038 / srep39734. ЧВК 5177918. PMID 28004835.
  11. ^ "Сайт данных Reef Genomics". smic.reefgenomics.org. Получено 2018-08-22.
  12. ^ "Информация - Cryptophyceae sp. CCMP2293 v1.0". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-31.
  13. ^ а б c d е ж грамм час я j «Водоросли». genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-31.
  14. ^ а б Кертис Б.А., Танифуджи Г., Бурки Ф., Грубер А., Иримиа М., Маруяма С. и др. (Декабрь 2012 г.). «Геномы водорослей раскрывают эволюционный мозаицизм и судьбу нуклеоморфов». Природа. 492 (7427): 59–65. Bibcode:2012Натура 492 ... 59С. Дои:10.1038 / природа11681. PMID 23201678.
  15. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй "Дом | Теплица". greenhouse.lanl.gov. Получено 2018-07-11.
  16. ^ Price DC, Chan CX, Yoon HS, Yang EC, Qiu H, Weber AP и др. (Февраль 2012 г.). «Геном Cyanophora paradoxa выясняет происхождение фотосинтеза у водорослей и растений». Наука. 335 (6070): 843–7. Bibcode:2012Sci ... 335..843P. Дои:10.1126 / science.1213561. PMID 22344442. S2CID 17190180.
  17. ^ "Проект генома цианофоры". cyanophora.rutgers.edu. Получено 2018-07-12.
  18. ^ Прайс Д.С., Гудинаф Ю.В., Рот Р., Ли Дж. Х., Кариявасам Т., Мутвил М. и др. (Август 2019 г.). "Анализ улучшенного Cyanophora paradoxa сборка генома ". ДНК исследования. 26 (4): 289–299. Дои:10.1093 / dnares / dsz009. ЧВК 6704402. PMID 31098614.
  19. ^ "Проект Cyanophora Genome v2". cyanophora.rutgers.edu/cyanophora_v2018. Получено 2019-08-01.
  20. ^ "Информация - Asterochloris sp. Cgr / DA1pho v2.0". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-31.
  21. ^ Гао Ц., Ван И, Шен И, Ян Д., Хе Х, Дай Дж, Ву Ц. (июль 2014 г.). «Механизмы накопления масла маслянистой микроводоросли Chlorella protothecoides, выявленные через ее геном, транскриптомы и протеомы». BMC Genomics. 15: 582. Дои:10.1186/1471-2164-15-582. ЧВК 4111847. PMID 25012212.
  22. ^ Моро Х., Верхелст Б., Кулу А., Дерелль Е., Ромбо С., Гримсли Н. и др. (Август 2012 г.). «Функции генов и структура генома у Bathycoccus prasinos отражают клеточную специализацию, лежащую в основе зеленой линии». Геномная биология. 13 (8): R74. Дои:10.1186 / gb-2012-13-8-r74. ЧВК 3491373. PMID 22925495.
  23. ^ «Фитозом». phytozome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-12.
  24. ^ а б c d е ж грамм час «Фитозом». phytozome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-12.
  25. ^ «CSI_1228 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-13.
  26. ^ «ASM313072v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-13.
  27. ^ «ASM311615v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-13.
  28. ^ Блан Дж., Дункан Дж., Агаркова И., Бородовский М., Гурнон Дж., Куо А. и др. (Сентябрь 2010 г.). «Геном Chlorella variabilis NC64A показывает адаптацию к фотосимбиозу, коэволюции с вирусами и загадочному полу». Растительная клетка. 22 (9): 2943–55. Дои:10.1105 / tpc.110.076406. ЧВК 2965543. PMID 20852019.
  29. ^ «ASM102112v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-13.
  30. ^ «Coccomyxa subellipsoidae v2.0 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-13.
  31. ^ «Dsal_v1.0 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-13.
  32. ^ а б Хамаджи, Такаши; Каваи-Тоёока, Хироко; Учимура, Харука; Сузуки, Масахиро; Ногучи, Хидеки; Минакучи, Йохей; Тойода, Ацуши; Фудзияма, Асао; Миягишима, Син-я (2018-03-08). «Анизогамия эволюционировала с уменьшением области определения пола у вольвоциновых зеленых водорослей». Биология коммуникации. 1 (1): 17. Дои:10.1038 / с42003-018-0019-5. ISSN 2399-3642. ЧВК 6123790. PMID 30271904.
  33. ^ «Информация - Micromonas commoda NOUM17 (RCC 299)». genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-31.
  34. ^ Worden AZ, Lee JH, Mock T, Rouzé P, Simmons MP, Aerts AL, et al. (Апрель 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas». Наука. 324 (5924): 268–72. Bibcode:2009Sci ... 324..268W. Дои:10.1126 / science.1167222. PMID 19359590. S2CID 206516961.
  35. ^ а б Worden AZ, Lee JH, Mock T, Rouzé P, Simmons MP, Aerts AL, et al. (Апрель 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas». Наука. 324 (5924): 268–72. Bibcode:2009Sci ... 324..268W. Дои:10.1126 / science.1167222. PMID 19359590. S2CID 206516961.
  36. ^ Боген С., Аль-Дилаими А., Альберсмайер А., Вичманн Дж., Грундманн М., Рупп О. и др. (Декабрь 2013). «Реконструкция липидного обмена микроводоросли Monoraphidium neglectum по последовательности ее генома позволяет выявить характеристики, пригодные для производства биотоплива». BMC Genomics. 14: 926. Дои:10.1186/1471-2164-14-926. ЧВК 3890519. PMID 24373495.
  37. ^ Паленик Б., Гримвуд Дж., Аэртс А., Рузе П., Саламов А., Патнэм Н. и др. (Май 2007 г.). «Крошечный эукариот Ostreococcus дает геномное понимание парадокса видообразования планктона». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (18): 7705–10. Bibcode:2007ПНАС..104.7705П. Дои:10.1073 / pnas.0611046104. ЧВК 1863510. PMID 17460045.
  38. ^ Blanc-Mathieu R, Verhelst B, Derelle E, Rombauts S, Bouget FY, Carré I и др. (Декабрь 2014 г.). «Усовершенствованный геном модельной морской водоросли Ostreococcus tauri раскрывается при оценке сборок Illumina de novo». BMC Genomics. 15 (1): 1103. Дои:10.1186/1471-2164-15-1103. ЧВК 4378021. PMID 25494611.
  39. ^ «Информация - Ostreococcus sp. RCC809». genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-16.
  40. ^ «Домашний - Ostreococcus sp. RCC809». genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-26.
  41. ^ Гонсалес-Эскер ЧР, Твари С.Н., Ховде Б.Т., Старкенбург С.Р. (январь 2018 г.). «Picochlorum soloecismus». Анонсы генома. 6 (4): e01498–17. Дои:10.1128 / genomeA.01498-17. ЧВК 5786678. PMID 29371352.
  42. ^ Foflonker F, Price DC, Qiu H, Palenik B, Wang S, Bhattacharya D (февраль 2015 г.). «Геном галотолерантной зеленой водоросли Picochlorum sp. Раскрывает стратегии роста в меняющихся условиях окружающей среды». Экологическая микробиология. 17 (2): 412–26. Дои:10.1111/1462-2920.12541. PMID 24965277. S2CID 23615707.
  43. ^ Starkenburg SR, Polle JE, Hovde B, Daligault HE, Davenport KW, Huang A и др. (Август 2017 г.). "Scenedesmus obliquus Штамм DOE0152z". Анонсы генома. 5 (32). Дои:10.1128 / genomeA.00617-17. ЧВК 5552973. PMID 28798164.
  44. ^ "Информация - Symbiochloris reticulata Africa извлеченный метагеном v1.0". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-31.
  45. ^ Прочник С.Е., Умен Дж., Недельку А.М., Халльманн А., Миллер С.М., Ниший И. и др. (Июль 2010 г.). «Геномный анализ организационной сложности многоклеточной зеленой водоросли Volvox carteri». Наука. 329 (5988): 223–6. Bibcode:2010Sci ... 329..223P. Дои:10.1126 / science.1188800. ЧВК 2993248. PMID 20616280.
  46. ^ «ASM288719v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-11.
  47. ^ «Ctobinv2 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-27.
  48. ^ Прочтите BA, Kegel J, Klute MJ, Kuo A, Lefebvre SC, Maumus F, et al. (Июль 2013). «Пангеном фитопланктона Emiliania лежит в основе его глобального распространения». Природа. 499 (7457): 209–13. Bibcode:2013Натура.499..209.. Дои:10.1038 / природа12221. PMID 23760476.
  49. ^ "Информация - Pavlovales sp. CCMP2436 v1.0". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-31.
  50. ^ Gobler CJ, Berry DL, Dyhrman ST, Wilhelm SW, Salamov A, Lobanov AV, et al. (Март 2011 г.). «Ниша вредоносной водоросли Aureococcus anophagefferens, выявленная с помощью экогеномики». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (11): 4352–7. Bibcode:2011PNAS..108.4352G. Дои:10.1073 / pnas.1016106108. ЧВК 3060233. PMID 21368207.
  51. ^ «ASM31002v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-11.
  52. ^ Mock T, Otillar RP, Strauss J, McMullan M, Paajanen P, Schmutz J, et al. (Январь 2017 г.). «Эволюционная геномика адаптированной к холоду диатомеи Fragilariopsis cylindrus». Природа. 541 (7638): 536–540. Bibcode:2017Натура.541..536М. Дои:10.1038 / природа20803. HDL:10754/622831. PMID 28092920.
  53. ^ Corteggiani Carpinelli E, Telatin A, Vitulo N, Forcato C, D'Angelo M, Schiavon R и др. (Февраль 2014). «Сборка генома в масштабе хромосом и профилирование транскриптома Nannochloropsis gaditana при истощении азота». Молекулярный завод. 7 (2): 323–35. Дои:10.1093 / mp / sst120. PMID 23966634.
  54. ^ «ASM187094v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-26.
  55. ^ «ASM161424v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-26.
  56. ^ "Информация - Ochromonadaceae sp. CCMP2298 v1.0". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-08-02.
  57. ^ "Информация - Pelagophyceae sp. CCMP2097 v1.0". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-08-02.
  58. ^ "Phaeodactylum tricornutum (ID 418) - Геном - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-26.
  59. ^ "Инфо - Псевдо-нитцския многосерийная CLN-47". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-08-02.
  60. ^ «SJ6.1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-27.
  61. ^ Цзян З, Лю С., Ву И, Цзян Х, Чжоу К. (2017). «Разнообразие млекопитающих Китая (2-е издание)». Наука о биоразнообразии. 25 (8): 886–895. Дои:10.17520 / biods.2017098.
  62. ^ «ASM14940v2 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-27.
  63. ^ Нодзаки Х., Такано Х., Мисуми О, Терасава К., Мацузаки М., Маруяма С. и др. (Июль 2007 г.). «100% полная последовательность выявляет необычно простые геномные особенности красной водоросли Cyanidioschyzon merolae из горячего источника». BMC Биология. 5: 28. Дои:10.1186/1741-7007-5-28. ЧВК 1955436. PMID 17623057.
  64. ^ «ASM170485v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-30.
  65. ^ Ли Дж., Ян Э.С., Граф Л., Ян Дж. Х., Цю Х., Зелзион У и др. (2018-04-23). «Анализ проекта генома красных водорослей. Грацилариопсис хорда дает представление об эволюции размера генома у Rhodophyta ". Молекулярная биология и эволюция. 35 (8): 1869–1886. Дои:10.1093 / molbev / msy081. PMID 29688518.
  66. ^ Бхаттачарья Д., Прайс Д.С., Чан С.Х., Цю Х., Роуз Н., Болл С. и др. (2013-06-17). «Геном красной водоросли Porphyridium purpureum». Nature Communications. 4 (1): 1941. Bibcode:2013 НатКо ... 4.1941B. Дои:10.1038 / ncomms2931. ЧВК 3709513. PMID 23770768.
  67. ^ Brawley SH, Blouin NA, Ficko-Blean E, Wheeler GL, Lohr M, Goodson HV и др. (Август 2017 г.). «Porphyra umbilicalis (Bangiophyceae, Rhodophyta)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 114 (31): E6361 – E6370. Дои:10.1073 / pnas.1703088114. ЧВК 5547612. PMID 28716924.
  68. ^ Накамура Ю., Сасаки Н., Кобаяши М., Одзима Н., Ясуике М., Сигенобу Ю. и др. (2013-03-11). «Первая последовательность генома морской красной водоросли Susabi-nori (Pyropia yezoensis), не содержащая симбионтов». PLOS ONE. 8 (3): e57122. Bibcode:2013PLoSO ... 857122N. Дои:10.1371 / journal.pone.0057122. ЧВК 3594237. PMID 23536760.