WikiDer > Methylophaga thiooxydans
Methylophaga thiooxydans | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Тип: | |
Учебный класс: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: | М. thiooxydans |
Биномиальное имя | |
Methylophaga thiooxydans (Боден и другие. 2011)[1] | |
Тип штамма | |
DSM 22068Т |
Methylophaga thiooxydans это метилотрофный бактерия, которая требует высокие концентрации соли для роста. Первоначально он был выделен из культуры водорослей. Эмилиания Хаксли, где он растет, разрушаясь диметилсульфониопропионат из E. hexleyi в диметилсульфид и акрилат.[2][3][4][5] М. thiooxydans был вовлечен как доминирующий организм в фитопланктон цветет, где он потребляет диметилсульфид, метанол и бромистый метил выпускается умирающим фитопланктоном.[6][7] Он также был идентифицирован как один из доминирующих организмов, присутствующих в шлейфе после Глубоководный горизонт разлив нефти,[8] и был определен как основной участник разложения метанола в прибрежных поверхностных водах в Английский канал.[9]
Метаболизм
М. thiooxydans хемолитогетеротроф. Эмилиания Хаксли производит диметилсульфониопропионат как осмолит чтобы позволить ему расти при повышенных концентрациях соли в морская вода, который разбивается на бактерии в смешанной культуре для высвобождения диметилсульфида и акрилат - некоторые бактерии могут использовать первый в качестве источника углерода и энергии - забирая часть углерода в биомасса и минерализация остатка в углекислый газ и сульфат или же тиосульфат. Большинство бактерий, разлагающих диметилсульфид (включая некоторые Метилофага деформации) в качестве источника углерода покидают сера позади в полностью окисленной форме сульфата, тогда как Methylophaga sulfidovorans образует тиосульфат как конечный продукт роста.[10] М. thiooxydans выполняет дополнительный шаг, используя цитохром c-связанный тиосульфатдегидрогеназа к димериз тиосульфат в тетратионат, что дает электроны, которые могут быть переданы дыхательная цепь и используется для производства АТФ.[2][11][12] То же самое верно и для эндогенный образующийся тиосульфат или экзогенный тиосульфат из окружающей среды[2] - в обоих случаях электроны тиосульфатдегидрогеназы восстанавливают цитохром c а затем переводятся в cbb3-тип цитохром с оксидаза, откуда они переходят в молекулярные кислород, который - как терминальный акцептор электронов сводится к воды. В дыхательная цепь этого вида содержит до н.э1 сложный, В отличие от кишечная палочка и флавопротеин сукцинатдегидрогеназа, который не всегда присутствует в метилотрофный или же автотрофный бактерии, так как они не имеют полного Цикл Кребса, а вместо этого частичный цикл получил название подкова Смита - в случае Метилофага виды, фумараза и сукцинатдегидрогеназа, которые часто отсутствуют, присутствуют и позволяют расти на ограниченном диапазоне углеводов, а не только на одноуглеродных соединениях, таких как метанол или диметилсульфид, которые метаболизируются не через Цикл Кребса но через путь монофосфата рибулозы (путь RuMP, также известный как путь Quayle).[11] Этот вид имеет несколько ограниченный диапазон источников углерода, включая метанол, диметилсульфид и тиофен-3-карбоксилат [2]
Исследование
В геном последовательность была завершена в 2011 году и стала первой последовательностью генома морского метилотроф.[11] Длина генома составляет около 3 МБп, а доля G + C составляет 45,9 мол.%.
История
М. thiooxydans был изолирован в 2010 г. от культуры кокколитофора Эмилиания Хаксли после культура обогащения использование диметилсульфида в качестве единственного источника углерода и единственного донор электроновс молекулярным кислородом в качестве концевого акцептора электронов.[2]
Рекомендации
- ^ «Метилофага». LPSN. Получено 26 сентября 2018.
- ^ а б c d е Боден Р., Келли Д.П., Мюррелл Дж. К., Шефер Х (2010). «Окисление диметилсульфида до тетратионата под действием Methylophaga thiooxidans sp. нов .: новое звено в круговороте серы ». Экологическая микробиология. 12 (10): 2688–2699. Дои:10.1111 / j.1462-2920.2010.02238.x. PMID 20482741.
- ^ Шефер Х (2007). "Изоляция Метилофага виды из морских обогащающих культур, разлагающих диметилсульфид, и идентификация полипептидов, индуцированных во время роста на диметилсульфиде ». Прикладная и экологическая микробиология. 73 (8): 2580–2591. Дои:10.1128 / AEM.02074-06. ЧВК 1855583. PMID 17322322.
- ^ Ледьярд, Кэтлин М .; Делонг, Эдвард Ф .; Дейси, Джон В. Х. (1993). «Характеристика DMSP-деградирующего бактериального изолята из Саргассова моря». Архив микробиологии. 160 (4): 312–318. Дои:10.1007 / bf00292083.
- ^ Йох, Д. К. (2002). «Диметилсульфониопропионат: его источники, роль в морской пищевой сети и биологическое разложение до диметилсульфида». Appl. Env. Микробиол. 68 (12): 5804–15. Дои:10.1128 / aem.68.12.5804-5815.2002. ЧВК 134419. PMID 12450799.
- ^ Neufeld JD, Boden R, Moussard H, Schäfer H, Murrell JD (2008). «Субстрат-специфические клады активных морских метилотрофов, ассоциированных с цветением фитопланктона в прибрежной среде умеренного пояса». Прикладная и экологическая микробиология. 74 (23): 7321–7328. Дои:10.1128 / AEM.01266-08. ЧВК 2592898. PMID 18849453.
- ^ Neufeld JD, Schäfer H, Cox MJ, Boden R, McDonald IR, Murrell JC (2007). "Исследование стабильных изотопов подразумевает Метилофага spp и роман Гаммапротеобактерии в метаболизме морского метанола и метиламина ». Журнал ISME. 1 (6): 480–491. Дои:10.1038 / ismej.2007.65. PMID 18043650.
- ^ Риверс АР, Шарма С., Триндж С.Г., Мартин Дж., Джой С.Б., Моран М.А. (2013). «Транскрипционная реакция батипелагического морского бактериопланктона на разлив нефти Deepwater Horizon». Журнал ISME. 7 (12): 2315–2329. Дои:10.1038 / ismej.2013.129. ЧВК 3834857. PMID 23902988.
- ^ Сарджант С.Л., Мюррелл Дж. С., Найтингейл П. Д., Диксон Дж. Л. (2016). «Сезонная изменчивость использования микробного метанола в прибрежных водах западной части Ла-Манша» (PDF). Серия "Прогресс морской экологии". 50: 53–64. Дои:10,3354 / meps11705.
- ^ де Зварт Дж. М., Нелисс П. Н., Куенен Дж. Г. (1996). "Выделение и характеристика Methylophaga sulfidovorans sp. nov .: облигатно метилотрофная аэробная диметилсульфидокисляющая бактерия из микробного мата ». FEMS Microbiology Ecology. 20 (4): 261–270. Дои:10.1111 / j.1574-6941.1996.tb00324.x.
- ^ а б c Боден Р., Ферриера С., Джонсон, Дж., Келли Д.П., Мюррелл Дж. К., Шефер Х (2011). "Проект последовательности генома хемолитогетеротрофного галофильного метилотрофа Methylophaga thiooxydans DMS010 ". Журнал бактериологии. 193 (12): 3154–3155. Дои:10.1128 / JB.00388-11. ЧВК 3133190. PMID 21478352.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- ^ Боден Р. (2012). "Исправленное описание рода Метилофага Жанвье и другие. 1985". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 62 (Pt 7): 1644–1646. Дои:10.1099 / ijs.0.033639-0. PMID 21890722.