WikiDer > Нуклеопорин 50

Nucleoporin 50
NUP50
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNUP50, NPAP60, NPAP60L, нуклеопорин 50 кДа, нуклеопорин 50
Внешние идентификаторыOMIM: 604646 MGI: 1351502 ГомолоГен: 5190 Генные карты: NUP50
Расположение гена (человек)
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человек)[1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное местоположение для NUP50
Геномное местоположение для NUP50
Группа22q13.31Начните45,163,925 бп[1]
Конец45,188,017 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NUP50 213682 в формате fs.png

PBB GE NUP50 218294 s в формате fs.png

PBB GE NUP50 218293 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_007172
NM_153645

NM_016714

RefSeq (белок)

NP_009103
NP_705931

NP_057923

Расположение (UCSC)Chr 22: 45.16 - 45.19 МбChr 15: 84.92 - 84.94 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 50 (Nup50) это белок что у людей кодируется NUP50 ген.[5][6]

Комплекс ядерных пор представляет собой массивную структуру, которая простирается через ядерную оболочку, образуя ворота, которые регулируют поток макромолекул между ядром и цитоплазмой. Нуклеопорины являются основными компонентами комплекса ядерных пор в эукариотических клетках. Белок, кодируемый этим геном, является членом нуклеопоринов, содержащих FG-повтор, который действует как растворимый кофактор в импортин-альфа: бета-опосредованном импорте ядерного белка. Псевдогены этого гена находятся на хромосомах 5, 6 и 14. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.[6]

Взаимодействия

NUP50 был показан взаимодействовать с участием КПНБ1[7] и CDKN1B.[8]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000093000 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000016619 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Трише В., Школьный Д., Данэм И., Беар Д., Макдермид Х.Э. (октябрь 1999 г.). «Картирование и сложный образец экспрессии гена нуклеопорина NPAP60L человека». Cytogenet Cell Genet. 85 (3–4): 221–6. Дои:10.1159/000015297. PMID 10449902.
  6. ^ а б «Ген Entrez: NUP50 нуклеопорин 50 кДа».
  7. ^ Линдси, Марк Е; Плафкер Кендра; Смит Алисия Э; Клерман Брюс Э; Macara Ian G (август 2002 г.). «Npap60 / Nup50 - это тристабильный переключатель, который стимулирует импорт ядерного белка, опосредованный импортин-альфа: бета». Ячейка. 110 (3): 349–60. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00836-X. ISSN 0092-8674. PMID 12176322.
  8. ^ Смитерман, М; Лук-порей; Swanger J; Капур Р; Clurman B.E (август 2000 г.). «Характеристика и целенаправленное разрушение мышиного Nup50, p27Kip1-взаимодействующего компонента ядерного порового комплекса». Мол. Cell. Биол. 20 (15): 5631–42. Дои:10.1128 / MCB.20.15.5631-5642.2000. ISSN 0270-7306. ЧВК 86029. PMID 10891500.

дальнейшее чтение