WikiDer > ORC2

Доступные белковые структуры:
Pfam	структуры / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры

Субъединица 2 комплекса распознавания происхождения
Идентификаторы
Символ	ORC2
Pfam	PF04084
ИнтерПро	IPR007220
Доступные белковые структуры:
Pfam	структуры / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры

ORC2
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	5C8H
Идентификаторы
Псевдонимы	ORC2, ORC2L, субъединица 2 комплекса распознавания происхождения
Внешние идентификаторы	OMIM: 601182 MGI: 1328306 ГомолоГен: 4512 Генные карты: ORC2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 2 (человек)
Конец	200,963,680 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 1 (мышь)
Конец	58,505,109 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание с ориджином репликации ДНК;
Сотовый компонент	• гетерохроматин; • конденсированная внутренняя кинетохора хромосомы; • комплекс распознавания ядерной точки репликации; • центросома; • хроматин; • комплекс распознавания происхождения; • мембрана; • ядерная хромосома, теломерная область; • нуклеоплазма; • ядро клетки;
Биологический процесс	• Фаза G1; • Репликация ДНК; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • Инициирование репликации ДНК; • G1 / S переход митотического клеточного цикла;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	4999
	18393
	ENSG00000115942
	ENSMUSG00000026037
	Q13416
	Q60862
	NM_006190
	NM_001025378; NM_001271526; NM_008765
	NP_006181
	NP_001020549; NP_001258455; NP_032791
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

ORC2

Субъединица 2 комплекса распознавания происхождения это белок который закодирован ORC2 (ORC2L) ген в людях.^[5]^[6]

Функция

В комплекс распознавания происхождения (ORC) представляет собой высококонсервативный белковый комплекс из шести субъединиц, необходимый для инициации репликации ДНК в эукариотических клетках. Исследования на дрожжах показали, что ORC специфически связывается с источниками репликации и служит платформой для сборки дополнительных факторов инициации, таких как Cdc6 и белки Mcm. Белок, кодируемый этим геном, является субъединицей комплекса ORC. Этот белок образует основной комплекс с ORC3, ORC4, и ORC5. Он также взаимодействует с CDC45L и MCM10, которые, как известно, важны для инициации репликации ДНК. Было продемонстрировано, что этот белок специфически связывается с источником репликации вируса Эпштейна-Барра в клетках человека, и считается, что он необходим для репликации ДНК из вирусного ориджина репликации.^[6]

Взаимодействия

ORC2 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115942 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026037 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Takahara K, Bong M, Brevard R, Eddy RL, Haley LL, Sait SJ, Shows TB, Hoffman GG, Greenspan DS (октябрь 1996 г.). «Мышиные и человеческие гомологи дрожжевого ориджина репликационного комплекса распознавания субъединицы ORC2 и хромосомная локализация родственного человеческого гена ORC2L». Геномика. 31 (1): 119–122. Дои:10.1006 / geno.1996.0018. PMID 8808289.
^ ^а ^б «Ген Entrez: комплекс распознавания происхождения ORC2L, субъединица 2-подобная (дрожжи)».
^ ^а ^б ^c ^d ^е ^ж ^г ^час ^я ^j ^k ^л ^м Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Биол. 327 (1): 111–28. Дои:10.1016 / с0022-2836 (03) 00079-2. PMID 12614612.
^ Мендес Дж, Стиллман Б. (ноябрь 2000 г.). «Хроматиновая ассоциация комплекса распознавания человеческого происхождения, cdc6 и поддерживающих белков минихромосом во время клеточного цикла: сборка пререпликационных комплексов в позднем митозе». Мол. Cell. Биол. 20 (22): 8602–12. Дои:10.1128 / mcb.20.22.8602-8612.2000. ЧВК 102165. PMID 11046155.
^ Идзуми М., Янаги К., Мизуно Т., Йокои М., Кавасаки Ю., Мун К.Ю., Гурвиц Дж., Ятагай Ф., Ханаока Ф. (декабрь 2000 г.). «Человеческий гомолог Saccharomyces cerevisiae Mcm10 взаимодействует с факторами репликации и диссоциирует от ядерных структур, устойчивых к нуклеазам, в фазе G (2)». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (23): 4769–77. Дои:10.1093 / nar / 28.23.4769. ЧВК 115166. PMID 11095689.
^ Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T., Tsurumi T. (март 2002 г.). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих». J. Biol. Chem. 277 (12): 10354–61. Дои:10.1074 / jbc.M111398200. PMID 11779870.
^ ^а ^б ^c ^d ^е Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (июль 2001 г.). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека». J. Biol. Chem. 276 (28): 26666–73. Дои:10.1074 / jbc.M102493200. PMID 11323433.
^ Мендес Дж., Зоу-Ян XH, Ким С.И., Хидака М., Танси В.П., Стиллман Б. (март 2002 г.). «Большая субъединица комплекса распознавания происхождения человека разрушается убиквитин-опосредованным протеолизом после инициации репликации ДНК». Мол. Ячейка. 9 (3): 481–91. Дои:10.1016 / с1097-2765 (02) 00467-7. PMID 11931757.
^ ^а ^б ^c Дхар С.К., Дельмолино Л., Датта А. (август 2001 г.). «Архитектура комплекса распознавания происхождения человека». J. Biol. Chem. 276 (31): 29067–71. Дои:10.1074 / jbc.M103078200. PMID 11395502.
^ Мацуока С., Баллиф Б.А., Смогоржевска А., Макдональд Э.Р., Хуров К.Э., Луо Дж., Бакаларски К.Э., Чжао З., Солимини Н., Леренталь Ю., Шайло И., Гиги С.П., Элледж С.Дж. (май 2007 г.). «Анализ субстрата ATM и ATR выявляет обширные белковые сети, реагирующие на повреждение ДНК». Наука. 316 (5828): 1160–6. Дои:10.1126 / наука.1140321. PMID 17525332. S2CID 16648052.
^ Пинто С., Кинтана Д.Г., Смит П., Михалек Р.М., Хоу Ж.Х., Бойнтон С., Джонс С.Дж., Хендрикс М., Велинзон К., Вольшлегель Д.А., Остин Р.Дж., Лейн В.С., Талли Т., Датта А. (май 1999 г.). «latheo кодирует субъединицу исходного комплекса распознавания и нарушает пролиферацию нейронов и обонятельную память взрослых при мутанте». Нейрон. 23 (1): 45–54. Дои:10.1016 / s0896-6273 (00) 80752-7. PMID 10402192. S2CID 781511.
^ Quintana DG, Hou Zh, Thome KC, Hendricks M, Saha P, Dutta A (ноябрь 1997 г.). «Идентификация HsORC4, члена комплекса распознавания репликации человека». J. Biol. Chem. 272 (45): 28247–51. Дои:10.1074 / jbc.272.45.28247. PMID 9353276.
^ Quintana DG, Thome KC, Hou Zh, Ligon AH, Morton CC, Dutta A (октябрь 1998 г.). «ORC5L, новый член комплекса распознавания происхождения человека, удален при лейомиоме матки и злокачественных миелоидных заболеваниях». J. Biol. Chem. 273 (42): 27137–45. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27137. PMID 9765232.

дальнейшее чтение

Гэвин К.А., Хидака М., Стиллман Б. (1996). «Консервативные белки-инициаторы у эукариот». Наука. 270 (5242): 1667–1671. Дои:10.1126 / science.270.5242.1667. PMID 7502077. S2CID 43633493.
Саха П., Томе К.С., Ямагути Р., Хоу З., Веремович С., Датта А. (1998). "Человеческий гомолог Saccharomyces cerevisiae CDC45". J. Biol. Chem. 273 (29): 18205–18209. Дои:10.1074 / jbc.273.29.18205. PMID 9660782.
Ритци М., Баак М., Мусал С., Романовски П., Ласки Р.А., Книпперс Р. (1998). «Поддерживающие белки минихромосомы человека и белок комплекса 2 распознавания происхождения человека на хроматине». J. Biol. Chem. 273 (38): 24543–24549. Дои:10.1074 / jbc.273.38.24543. PMID 9733749.
Пинто С., Кинтана Д. Г., Смит П., Михалек Р. М., Хоу Ж. Х., Бойнтон С., Джонс С. Дж., Хендрикс М., Велинзон К., Вольшлегель Д. А., Остин Р. Дж., Лейн В. С., Талли Т., Датта А. (1999). «latheo кодирует субъединицу исходного комплекса распознавания и нарушает пролиферацию нейронов и обонятельную память взрослых при мутанте». Нейрон. 23 (1): 45–54. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80752-7. PMID 10402192. S2CID 781511.
Цзян В., Макдональд Д., Хоуп Т.Дж., Хантер Т. (1999). «Комплекс протеинкиназы Cdc7-Dbf4 млекопитающих необходим для инициации репликации ДНК». EMBO J. 18 (20): 5703–5713. Дои:10.1093 / emboj / 18.20.5703. ЧВК 1171637. PMID 10523313.
Натале Д.А., Ли СиДжей, Сан WH, DePamphilis ML (2000). «Избирательная нестабильность белка Orc1 объясняет отсутствие комплексов распознавания функционального происхождения во время перехода M-G (1) у млекопитающих». EMBO J. 19 (11): 2728–2738. Дои:10.1093 / emboj / 19.11.2728. ЧВК 212765. PMID 10835370.
Томе К.С., Дхар С.К., Кинтана Д.Г., Дельмолино Л., Шахсафаэй А., Датта А. (2001). «Подмножества субъединиц комплекса распознавания происхождения человека (ORC) экспрессируются в непролиферирующих клетках и связываются с белками, не являющимися ORC». J. Biol. Chem. 275 (45): 35233–35241. Дои:10.1074 / jbc.M005765200. PMID 10954718.
Идзуми М., Янаги К., Мизуно Т., Йокои М., Кавасаки Ю., Мун К.Ю., Гурвиц Дж., Ятагай Ф., Ханаока Ф. (2001). «Человеческий гомолог Saccharomyces cerevisiae Mcm10 взаимодействует с факторами репликации и диссоциирует от ядерных структур, устойчивых к нуклеазам, в фазе G (2)». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (23): 4769–4777. Дои:10.1093 / nar / 28.23.4769. ЧВК 115166. PMID 11095689.
Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (2001). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека». J. Biol. Chem. 276 (28): 26666–26673. Дои:10.1074 / jbc.M102493200. PMID 11323433.
Дхар С.К., Дельмолино Л., Датта А. (2001). «Архитектура комплекса распознавания происхождения человека». J. Biol. Chem. 276 (31): 29067–29071. Дои:10.1074 / jbc.M103078200. PMID 11395502.
Дхар С.К., Йошида К., Мачида Ю., Хайра П., Чаудхури Б., Вольшлегель Дж. А., Леффак М., Йейтс Дж., Датта А. (2001). «Репликация из oriP вируса Эпштейна-Барра требует ORC человека и ингибируется геминином». Ячейка. 106 (3): 287–296. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00458-5. PMID 11509178. S2CID 12479646.
Идзуми М, Ятагай Ф, Ханаока Ф (2002). «Зависимый от клеточного цикла протеолиз и фосфорилирование Mcm10 человека». J. Biol. Chem. 276 (51): 48526–31. Дои:10.1074 / jbc.M107190200. PMID 11602595.
Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T, Tsurumi T. (2002). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих». J. Biol. Chem. 277 (12): 10354–10361. Дои:10.1074 / jbc.M111398200. PMID 11779870.
Schaarschmidt D, Ladenburger EM, Keller C, Knippers R (2002). "Белки Mcm человека в начале репликации во время фазового перехода G1 в S". Нуклеиновые кислоты Res. 30 (19): 4176–4185. Дои:10.1093 / нар / gkf532. ЧВК 140533. PMID 12364596.
Matheos D, Ruiz MT, Price GB, Zannis-Hadjopoulos M (2002). «Ku-антиген, ориджин-специфический связывающий белок, который связывается с белками репликации, необходим для репликации ДНК млекопитающих». Биохим. Биофиз. Acta. 1578 (1–3): 59–72. Дои:10.1016 / S0167-4781 (02) 00497-9. PMID 12393188.
Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (2003). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Биол. 327 (1): 111–128. Дои:10.1016 / S0022-2836 (03) 00079-2. PMID 12614612.

внешние ссылки

PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для субъединицы 2 комплекса распознавания происхождения человека (ORC2)

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115942 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026037 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8808289-5] Takahara K, Bong M, Brevard R, Eddy RL, Haley LL, Sait SJ, Shows TB, Hoffman GG, Greenspan DS (октябрь 1996 г.). «Мышиные и человеческие гомологи дрожжевого ориджина репликационного комплекса распознавания субъединицы ORC2 и хромосомная локализация родственного человеческого гена ORC2L». Геномика. 31 (1): 119–122. Дои:10.1006 / geno.1996.0018. PMID 8808289.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: комплекс распознавания происхождения ORC2L, субъединица 2-подобная (дрожжи)».

[pmid12614612-7] а ^б ^c ^d ^е ^ж ^г ^час ^я ^j ^k ^л ^м Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Биол. 327 (1): 111–28. Дои:10.1016 / с0022-2836 (03) 00079-2. PMID 12614612.

[pmid11046155-8] Мендес Дж, Стиллман Б. (ноябрь 2000 г.). «Хроматиновая ассоциация комплекса распознавания человеческого происхождения, cdc6 и поддерживающих белков минихромосом во время клеточного цикла: сборка пререпликационных комплексов в позднем митозе». Мол. Cell. Биол. 20 (22): 8602–12. Дои:10.1128 / mcb.20.22.8602-8612.2000. ЧВК 102165. PMID 11046155.

[pmid11095689-9] Идзуми М., Янаги К., Мизуно Т., Йокои М., Кавасаки Ю., Мун К.Ю., Гурвиц Дж., Ятагай Ф., Ханаока Ф. (декабрь 2000 г.). «Человеческий гомолог Saccharomyces cerevisiae Mcm10 взаимодействует с факторами репликации и диссоциирует от ядерных структур, устойчивых к нуклеазам, в фазе G (2)». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (23): 4769–77. Дои:10.1093 / nar / 28.23.4769. ЧВК 115166. PMID 11095689.

[pmid11779870-10] Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T., Tsurumi T. (март 2002 г.). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих». J. Biol. Chem. 277 (12): 10354–61. Дои:10.1074 / jbc.M111398200. PMID 11779870.

[pmid11323433-11] а ^б ^c ^d ^е Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (июль 2001 г.). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека». J. Biol. Chem. 276 (28): 26666–73. Дои:10.1074 / jbc.M102493200. PMID 11323433.

[pmid11931757-12] Мендес Дж., Зоу-Ян XH, Ким С.И., Хидака М., Танси В.П., Стиллман Б. (март 2002 г.). «Большая субъединица комплекса распознавания происхождения человека разрушается убиквитин-опосредованным протеолизом после инициации репликации ДНК». Мол. Ячейка. 9 (3): 481–91. Дои:10.1016 / с1097-2765 (02) 00467-7. PMID 11931757.

[pmid11395502-13] а ^б ^c Дхар С.К., Дельмолино Л., Датта А. (август 2001 г.). «Архитектура комплекса распознавания происхождения человека». J. Biol. Chem. 276 (31): 29067–71. Дои:10.1074 / jbc.M103078200. PMID 11395502.

[pmid17525332-14] Мацуока С., Баллиф Б.А., Смогоржевска А., Макдональд Э.Р., Хуров К.Э., Луо Дж., Бакаларски К.Э., Чжао З., Солимини Н., Леренталь Ю., Шайло И., Гиги С.П., Элледж С.Дж. (май 2007 г.). «Анализ субстрата ATM и ATR выявляет обширные белковые сети, реагирующие на повреждение ДНК». Наука. 316 (5828): 1160–6. Дои:10.1126 / наука.1140321. PMID 17525332. S2CID 16648052.

[pmid10402192-15] Пинто С., Кинтана Д.Г., Смит П., Михалек Р.М., Хоу Ж.Х., Бойнтон С., Джонс С.Дж., Хендрикс М., Велинзон К., Вольшлегель Д.А., Остин Р.Дж., Лейн В.С., Талли Т., Датта А. (май 1999 г.). «latheo кодирует субъединицу исходного комплекса распознавания и нарушает пролиферацию нейронов и обонятельную память взрослых при мутанте». Нейрон. 23 (1): 45–54. Дои:10.1016 / s0896-6273 (00) 80752-7. PMID 10402192. S2CID 781511.

[pmid9353276-16] Quintana DG, Hou Zh, Thome KC, Hendricks M, Saha P, Dutta A (ноябрь 1997 г.). «Идентификация HsORC4, члена комплекса распознавания репликации человека». J. Biol. Chem. 272 (45): 28247–51. Дои:10.1074 / jbc.272.45.28247. PMID 9353276.

[pmid9765232-17] Quintana DG, Thome KC, Hou Zh, Ligon AH, Morton CC, Dutta A (октябрь 1998 г.). «ORC5L, новый член комплекса распознавания происхождения человека, удален при лейомиоме матки и злокачественных миелоидных заболеваниях». J. Biol. Chem. 273 (42): 27137–45. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27137. PMID 9765232.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

Navigation