WikiDer > PABPC1 - Википедия
PABPC1 - Wikipedia
Полиаденилат-связывающий белок 1 это белок что у людей кодируется PABPC1 ген.[5] Белок PABP1 связывает мРНК и способствует множеству функций, таких как транспорт из ядра, деградация, трансляция и стабильность. Существует два отдельных белка PABP1, один из которых расположен в ядре (PABPN1), а другой - в цитоплазме (PABPC1). Расположение PABP1 влияет на роль этого белка и его функцию с РНК.[6]
Функция
Поли (A) -связывающий белок (PAB или PABP), который обнаружен в комплексе с 3 'поли (A) хвостом эукариотической мРНК, необходим для укорочения поли (A) и инициации трансляции. У человека PABP содержат небольшую ядерную изоформу и семейство консервативных генов других поли (A) -связывающие белки. [предоставлено OMIM][7]
PABPC1 обычно диффундирует в цитоплазме и концентрируется в сайтах с высокой концентрацией мРНК, таких как стрессовые гранулы, процессинговые тела и места с высокой трансляционной активностью. PABPC1 также связан с нонсенс-опосредованным распадом мРНК (NMD). PABPC1 связывается с поли (A) хвостом и взаимодействует с eIF4G, что стабилизирует циркуляризацию мРНК. Эта структура необходима для предотвращения деградации мРНК через NMD.[8]
В ядре PABP1 связывается с поли (A) хвостами пре-мРНК для облегчения стабильности, экспорта, транспорта и деградации. Связывание PABP1 также необходимо для ядерной деградации. PABPC1 содержит четыре мотива распознавания РНК (RRM). Первые два, RRM1 и RRM2, связывают как α-импортин, так и поли (A) хвост процессированной мРНК. Эта функция предотвращает возврат мРНК в ядро.[6]
Взаимодействия
PABPC1 был показан взаимодействовать с:
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000070756 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022283 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Grange T., de Sa CM, Oddos J, Pictet R (июнь 1987 г.). «Человеческий полиаденилат-связывающий белок мРНК: эволюционное сохранение мотива связывания нуклеиновой кислоты». Исследования нуклеиновых кислот. 15 (12): 4771–87. Дои:10.1093 / nar / 15.12.4771. ЧВК 305917. PMID 2885805.
- ^ а б Грей Н.К., Грабалкова Л., Сканлон Дж. П., Смит Р. В. (декабрь 2015 г.). «Поли (А) -связывающие белки и локализация мРНК: кто правит насестом?». Сделки биохимического общества. 43 (6): 1277–84. Дои:10.1042 / BST20150171. PMID 26614673.
- ^ «Ген Entrez: поли (A) связывающий белок PABPC1, цитоплазматический 1».
- ^ Фатчер Т., Бём В., Вайче Б., Геринг Н.Х. (октябрь 2014 г.). «Взаимодействие цитоплазматического поли (A) -связывающего белка с эукариотическим фактором инициации 4G подавляет нонсенс-опосредованный распад мРНК». РНК. 20 (10): 1579–92. Дои:10.1261 / rna.044933.114. ЧВК 4174440. PMID 25147240.
- ^ Колотева-Левин Н., Пинчаси Д., Переман И., Зур А., Брандейс М., Элрой-Стейн О. (май 2004 г.). «Субъединица Apc5 комплекса / циклосомы, способствующего анафазе, взаимодействует с поли (A) связывающим белком и подавляет внутреннюю трансляцию, опосредованную сайтом входа в рибосому». Молекулярная и клеточная биология. 24 (9): 3577–87. Дои:10.1128 / mcb.24.9.3577-3587.2004. ЧВК 387753. PMID 15082755.
- ^ Фунакоши Ю., Дои Ю., Хосода Н., Учида Н., Осава М., Симада И., Цудзимото М., Судзуки Т., Катада Т., Хосино С. (декабрь 2007 г.). «Механизм деаденилирования мРНК: доказательства молекулярного взаимодействия между фактором терминации трансляции eRF3 и деаденилазами мРНК». Гены и развитие. 21 (23): 3135–48. Дои:10.1101 / gad.1597707. ЧВК 2081979. PMID 18056425.
- ^ а б Иматака Х, Гради А, Соненберг Н (декабрь 1998 г.). «Недавно идентифицированная N-концевая аминокислотная последовательность eIF4G человека связывает поли (А) -связывающий белок и функционирует в поли (А) -зависимой трансляции». Журнал EMBO. 17 (24): 7480–9. Дои:10.1093 / emboj / 17.24.7480. ЧВК 1171091. PMID 9857202.
- ^ Хосино С., Имаи М., Кобаяси Т., Учида Н., Катада Т. (июнь 1999 г.). «Релизинг-фактор полипептидной цепи эукариот (eRF3 / GSPT), несущий сигнал терминации трансляции к 3'-Poly (A) хвосту мРНК. Прямая ассоциация erf3 / GSPT с полиаденилат-связывающим белком». Журнал биологической химии. 274 (24): 16677–80. Дои:10.1074 / jbc.274.24.16677. PMID 10358005.
- ^ Рой Дж., Де Крещенцо Дж., Халегпур К., Каведжян А., О'Коннор-МакКорт М., Соненберг Н. (июнь 2002 г.). «Paip1 взаимодействует со связывающим поли (A) белком через два независимых связывающих мотива». Молекулярная и клеточная биология. 22 (11): 3769–82. Дои:10.1128 / mcb.22.11.3769-3782.2002. ЧВК 133836. PMID 11997512.
- ^ Крейг А. В., Хагигхат А., Ю. А. Т., Соненберг Н. (апрель 1998 г.). «Взаимодействие полиаденилат-связывающего белка с гомологом eIF4G PAIP усиливает трансляцию». Природа. 392 (6675): 520–3. Дои:10.1038/33198. PMID 9548260. S2CID 10891925.
- ^ Khaleghpour K, Kahvejian A, De Crescenzo G, Roy G, Svitkin YV, Imataka H, O'Connor-McCourt M, Sonenberg N (август 2001 г.). «Двойные взаимодействия репрессора трансляции Paip2 с поли (A) связывающим белком». Молекулярная и клеточная биология. 21 (15): 5200–13. Дои:10.1128 / MCB.21.15.5200-5213.2001. ЧВК 87244. PMID 11438674.
дальнейшее чтение
- Герлах М., Бурд К.Г., Дрейфус Г. (апрель 1994 г.). «Поли (A)-связывающий мРНК белок: локализация, количество и специфичность связывания РНК». Экспериментальные исследования клеток. 211 (2): 400–7. Дои:10.1006 / excr.1994.1104. PMID 7908267.
- Кэмпбелл Л. Х., Борг К. Т., Хейнс Дж. К., Мун RT, Шенберг Д. Р., Арриго С. Дж. (Сентябрь 1994 г.). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 Rev необходим in vivo для связывания поли (A) -связывающего белка с Rev-зависимыми РНК». Журнал вирусологии. 68 (9): 5433–8. Дои:10.1128 / jvi.68.9.5433-5438.1994. ЧВК 236943. PMID 8057425.
- Хуанг И, Кармайкл Г.Г. (апрель 1996 г.). «Роль полиаденилирования в ядерно-цитоплазматическом транспорте мРНК». Молекулярная и клеточная биология. 16 (4): 1534–42. Дои:10.1128 / mcb.16.4.1534. ЧВК 231138. PMID 8657127.
- Крейг А. В., Хагигат А., Ю. А. Т., Соненберг Н. (апрель 1998 г.). «Взаимодействие полиаденилат-связывающего белка с гомологом eIF4G PAIP усиливает трансляцию». Природа. 392 (6675): 520–3. Дои:10.1038/33198. PMID 9548260. S2CID 10891925.
- Афонина Э., Штаубер Р., Павлакис Г.Н. (май 1998 г.). «Человеческий поли (А) -связывающий белок 1 перемещается между ядром и цитоплазмой». Журнал биологической химии. 273 (21): 13015–21. Дои:10.1074 / jbc.273.21.13015. PMID 9582337.
- Иматака Х, Гради А, Соненберг Н (декабрь 1998 г.). «Недавно идентифицированная N-концевая аминокислотная последовательность eIF4G человека связывает поли (А) -связывающий белок и функционирует в поли (А) -зависимой трансляции». Журнал EMBO. 17 (24): 7480–9. Дои:10.1093 / emboj / 17.24.7480. ЧВК 1171091. PMID 9857202.
- Хорнштейн Э, Гит А, Браунштейн I, Авни Д., Мейухас О. (январь 1999 г.). «Экспрессия гена поли (А) -связывающего белка трансляционно регулируется зависимым от роста способом через 5'-концевой мотив олигопиримидинового тракта». Журнал биологической химии. 274 (3): 1708–14. Дои:10.1074 / jbc.274.3.1708. PMID 9880551.
- Лароя Дж., Куэста Р., Брюер Дж., Шнайдер Р. Дж. (Апрель 1999 г.). «Контроль распада мРНК путем теплового шока-убиквитин-протеасома». Наука. 284 (5413): 499–502. Дои:10.1126 / science.284.5413.499. PMID 10205060.
- Хосино С., Имаи М., Кобаяси Т., Учида Н., Катада Т. (июнь 1999 г.). «Релизинг-фактор полипептидной цепи эукариот (eRF3 / GSPT), несущий сигнал терминации трансляции к 3'-Poly (A) хвосту мРНК. Прямая ассоциация erf3 / GSPT с полиаденилат-связывающим белком». Журнал биологической химии. 274 (24): 16677–80. Дои:10.1074 / jbc.274.24.16677. PMID 10358005.
- Deo RC, Bonanno JB, Sonenberg N, Burley SK (сентябрь 1999 г.). «Распознавание полиаденилатной РНК поли (А) -связывающим белком». Клетка. 98 (6): 835–45. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81517-2. PMID 10499800. S2CID 16247357.
- Фераль С., Маттеи М.Г., Павлак А., Гуэллан Дж. (Октябрь 1999 г.). «Хромосомная локализация трех генов поли (A) -связывающего белка человека и четырех родственных псевдогенов». Генетика человека. 105 (4): 347–53. Дои:10.1007 / s004390051113. ЧВК 1865476. PMID 10543404.
- Гроссет С., Чен С.Й., Сюй Н., Соненберг Н., Жакмен-Саблон Х., Шю А.Б. (сентябрь 2000 г.). «Механизм трансляционного обмена мРНК: взаимодействие между поли (А) хвостом и детерминантой, кодирующей РНК c-fos через белковый комплекс». Клетка. 103 (1): 29–40. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00102-1. PMID 11051545. S2CID 18135412.
- Khaleghpour K, Свиткин YV, Крейг AW, DeMaria CT, Deo RC, Burley SK, Sonenberg N (январь 2001 г.). «Репрессия трансляции новым партнером человеческого поли (A) связывающего белка, Paip2». Молекулярная клетка. 7 (1): 205–16. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00168-X. PMID 11172725.
- Бушелл М., Вуд В., Карпентер Г., Пейн В.М., Морли С.Дж., Клеменс М.Дж. (июнь 2001 г.). «Нарушение взаимодействия эукариотического фактора инициации синтеза белка 4B с поли (A) -связывающим белком путем расщепления, опосредованного каспазой и вирусной протеазой». Журнал биологической химии. 276 (26): 23922–8. Дои:10.1074 / jbc.M100384200. PMID 11274152.
- Féral C, Guellaën G, Pawlak A (май 2001 г.). «Семенники человека экспрессируют специфический поли (A) -связывающий белок». Исследования нуклеиновых кислот. 29 (9): 1872–83. Дои:10.1093 / nar / 29.9.1872. ЧВК 37253. PMID 11328870.
- Khaleghpour K, Kahvejian A, De Crescenzo G, Roy G, Svitkin YV, Imataka H, O'Connor-McCourt M, Sonenberg N (август 2001 г.). «Двойные взаимодействия репрессора трансляции Paip2 с поли (A) связывающим белком». Молекулярная и клеточная биология. 21 (15): 5200–13. Дои:10.1128 / MCB.21.15.5200-5213.2001. ЧВК 87244. PMID 11438674.
- Вудс А.Дж., Робертс М.С., Чоудхари Дж., Барри С.Т., Мазаки Ю., Сабе Х., Морли С.Дж., Кричли Д.Р., Норман Дж.С. (февраль 2002 г.). «Паксиллин связывается с поли (A) -связывающим белком 1 в плотной эндоплазматической сети и на переднем крае мигрирующих клеток». Журнал биологической химии. 277 (8): 6428–37. Дои:10.1074 / jbc.M109446200. PMID 11704675.
- Ли Дж., Бедфорд MT (март 2002 г.). «PABP1, идентифицированный как субстрат аргининметилтрансферазы с использованием массивов белков высокой плотности». Отчеты EMBO. 3 (3): 268–73. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf052. ЧВК 1084016. PMID 11850402.
- Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. Дои:10.1017 / S1355838202021088. ЧВК 1370266. PMID 11991638.
PDB галерея | |
|---|---|
|
