WikiDer > PABPC4

PABPC4
PABPC4
Белок PABPC4 PDB 1cvj.png
Идентификаторы
ПсевдонимыPABPC4, APP-1, APP1, PABP4, iPABP, поли (A) связывающий белок цитоплазмы 4
Внешние идентификаторыOMIM: 603407 MGI: 2385206 ГомолоГен: 37855 Генные карты: PABPC4
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение PABPC4
Геномное расположение PABPC4
Группа1п34,3Начните39,560,816 бп[1]
Конец39,576,790 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PABPC4 201064 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003819
NM_001135653
NM_001135654

NM_130881
NM_148917
NM_001356377

RefSeq (белок)

NP_001129125
NP_001129126
NP_003810

н / д

Расположение (UCSC)Chr 1: 39.56 - 39.58 МбChr 4: 123.26 - 123.3 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Полиаденилат-связывающий белок 4 (PABPC4) это белок что у людей кодируется PABPC4 ген.[5][6]

Функция

Поли (A) -связывающие белки (PABP) связываются с поли (A) хвостом, присутствующим на 3-х первичных концах большинства мРНК эукариот. PABPC4 или IPABP (индуцибельный PABP) выделяли как индуцированную активацией мРНК Т-клеток, кодирующую белок. Активация Т-клеток увеличивала уровни мРНК PABPC4 в Т-клетках примерно в 5 раз. PABPC4 содержит 4 РНК-связывающих домена и богатый пролином С-конец. PABPC4 локализуется преимущественно в цитоплазме. Предполагается, что PABPC4 может быть необходим для регуляции стабильности лабильных видов мРНК в активированных Т-клетках. PABPC4 также был идентифицирован как антиген APP1 (протеин-1 активированных тромбоцитов), экспрессируемый на тромбин-активированных тромбоцитах кролика. PABPC4 может также участвовать в регуляции трансляции белка в тромбоцитах и ​​мегакариоцитах или может участвовать в связывании или стабилизации полиаденилатов в плотных гранулах тромбоцитов.[6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции PABPC4. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Pabpc4tm1a (КОМП) Wtsi[10][11] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[12][13][14]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[8][15] Было проведено двадцать испытаний на мутант мышей, и наблюдалась одна значительная аномалия: самки гомозиготных мутантов нарушенной толерантности к глюкозе.[8]

Взаимодействия

PABPC4 был показан взаимодействовать с PHLDA1.[16]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000090621 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000011257 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Féral C, Mattéi MG, Pawlak A, Guellaën G (ноябрь 1999 г.). «Хромосомная локализация трех генов поли (A) -связывающего белка человека и четырех родственных псевдогенов». Hum Genet. 105 (4): 347–53. Дои:10.1007 / s004390051113. ЧВК 1865476. PMID 10543404.
  6. ^ а б «Ген Entrez: поли (A) связывающий белок PABPC4, цитоплазматический 4 (индуцибельная форма)».
  7. ^ «Данные теста на толерантность к глюкозе для Pabpc4». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ а б c Гердин, АК (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  9. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  10. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  11. ^ "Информатика генома мыши".
  12. ^ Скарнес В.С., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
  13. ^ Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
  14. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247.
  15. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.
  16. ^ Хинц Т., Флиндт С., Маркс А., Янссен О., Кабелиц Д. (май 2001 г.). «Ингибирование синтеза белка с помощью продукта гена TDAG51 человека, индуцируемого Т-клеточным рецептором». Cell. Сигнал. 13 (5): 345–52. Дои:10.1016 / S0898-6568 (01) 00141-3. PMID 11369516.

дальнейшее чтение