WikiDer > ПЭГ10

PEG10
ПЭГ10
Идентификаторы
ПсевдонимыПЭГ10, EDR, HB-1, MEF3L, Mar2, Mart2, RGAG3, отцовская экспрессия 10, SIRH1, RTL2
Внешние идентификаторыOMIM: 609810 MGI: 2157785 ГомолоГен: 116067 Генные карты: ПЭГ10
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек)[1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение PEG10
Геномное расположение PEG10
Группа7q21.3Начните94,656,325 бп[1]
Конец94,669,695 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PEG10 212092 в формате fs.png

PBB GE PEG10 212094 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001040611
NM_130877

RefSeq (белок)

NP_001035701
NP_570947

Расположение (UCSC)Chr 7: 94,66 - 94,67 МбChr 6: 4.75 - 4.76 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок, полученный из ретротранспозона, PEG10 это белок что у людей кодируется ПЭГ10 ген.[5][6][7][8]

Функция

Этот ген включает две перекрывающиеся рамки считывания одного и того же транскрипта, кодирующего разные изоформы. Более короткая изоформа имеет мотив цинкового пальца типа CCHC, содержащий последовательность, характерную для белков gag большинства ретровирусов и некоторых ретротранспозонов, и частично функционирует за счет взаимодействия с членами семейства рецепторов TGF-бета. Более длинная изоформа имеет консенсусную последовательность DSG активного сайта протеазного домена белков pol. Более длинная изоформа является результатом трансляционного сдвига кадра -1, что также наблюдается у некоторых ретровирусов. Экспрессия этих двух изоформ происходит только от отцовского аллеля из-за импринтинга. Повышенная экспрессия генов (наблюдаемая по увеличению уровней мРНК) связана с гепатоцеллюлярными карциномами.[8]

PEG10 - это отцовский импринтированный ген, который экспрессируется во взрослых и эмбриональных тканях.[9] Наиболее заметное выражение происходит в плаценте. Этот ген является высококонсервативным у всех видов млекопитающих и сохраняет гептануклеотид (GGGAAAC). Сообщалось, что этот ген играет роль в пролиферации, дифференцировке и апоптозе клеток. Сверхэкспрессия этого гена была связана с несколькими злокачественными новообразованиями, такими как гепатоцеллюлярная карцинома и В-клеточный лимфоцитарный лейкоз. Нокаутные мыши, лишенные этого гена, показали раннюю эмбриональную летальность с дефектами плаценты, что указывает на важность этого гена в эмбриональном развитии. Было показано, что в ткани плаценты при преэклампсии уровень PEG10 снижается.[10] и усиленно[11] предполагая это как возможную причинную роль в возникновении преэклампсии.

Взаимодействия

Было показано, что PEG10 взаимодействовать с участием SIAH2[12] и SIAH1.[12]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000242265 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000092035 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Оно Р., Кобаяси С., Вагацума Х., Айсака К., Кохда Т., Канеко-Ишино Т., Ишино Ф. (апрель 2001 г.). «Ген, производный от ретротранспозона, PEG10, представляет собой новый импринтированный ген, расположенный на хромосоме 7q21 человека». Геномика. 73 (2): 232–7. Дои:10.1006 / geno.2001.6494. PMID 11318613.
  6. ^ Brandt J, Schrauth S, Veith AM, Froschauer A, Haneke T., Schultheis C, Gessler M, Leimeister C, Volff JN (январь 2005 г.). «Мобильные элементы как источник генетических инноваций: экспрессия и эволюция семейства неогеновых генов, полученных из ретротранспозона, у млекопитающих». Ген. 345 (1): 101–11. Дои:10.1016 / j.gene.2004.11.022. PMID 15716091.
  7. ^ Брандт Дж., Вейт А.М., Вольф Дж. Н. (август 2005 г.). «Семейство неофункционализированных генов ретротранспозона Ty3 / gypsy в геномах млекопитающих». Цитогенетические и геномные исследования. 110 (1–4): 307–17. Дои:10.1159/000084963. PMID 16093683. S2CID 38398479.
  8. ^ а б "Entrez Gene: PEG10 экспрессируется отцовски 10".
  9. ^ «PEG10 экспрессируется отцовски 10 [Homo sapiens (человек)]». Pubmed. Получено 14 апреля 2015.
  10. ^ Лян XY, Чен X, Цзинь YZ, Чен XO, Чен QZ (18 декабря 2014 г.). «Экспрессия и значение импринтированного гена PEG10 в плаценте пациентов с преэклампсией». Генетика и молекулярные исследования. 13 (4): 10607–14. Дои:10.4238 / 2014. 18 декабря. PMID 25526181.
  11. ^ Чен Х, Сун М., Чжао Г., Лю Дж., Гао В., Си С., Мэн Т. (октябрь 2012 г.). «Повышенная экспрессия PEG10 в плаценте человека от преэклампсической беременности». Acta Histochemica. 114 (6): 589–93. Дои:10.1016 / j.acthis.2011.11.003. PMID 22137777.
  12. ^ а б Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасэгава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура И. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека через взаимодействие с SIAH1». Исследования рака. 63 (12): 3043–8. PMID 12810624.

дальнейшее чтение