WikiDer > PPIE (ген)

PPIE (gene)
PPIE
Белок PPIE PDB 1zcx.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPPIE, CYP-33, CYP33, пептидилпролилизомераза E
Внешние идентификаторыOMIM: 602435 MGI: 1917118 ГомолоГен: 38142 Генные карты: PPIE
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномная локализация PPIE
Геномная локализация PPIE
Группа1п34.2Начинать39,692,182 бп[1]
Конец39,763,914 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PPIE 210502 s в формате fs.png

PBB GE PPIE 202494 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001195007
NM_006112
NM_203456
NM_203457
NM_001319293

NM_019489

RefSeq (белок)

NP_001181936
NP_001306222
NP_006103
NP_982281

NP_062362

Расположение (UCSC)Chr 1: 39.69 - 39.76 МбChr 4: 123.13 - 123.14 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Пептидилпролилизомераза E (циклофилин E), также известный как PPIE, является фермент который у человека кодируется PPIE ген на хромосоме 1. Как член семейства пептидил-пролил цис-транс-изомераз (PPIase), этот белок катализирует цис-транс изомеризация имидного пролина пептидные связи, что позволяет облегчить сворачивание или восстановление белков.[5] Кроме того, PPIE участвует во многих биологических процессах, в том числе митохондриальных. метаболизм, апоптоз, и воспаление, а также сопутствующие заболевания и состояния, такие как ишемическое реперфузионное повреждение, СПИД, грипп, и рак.[6][7][8]

Структура

Как и другие циклофилины, PPIE образует β-цилиндрическую структуру с гидрофобным ядром. Этот β-бочонок состоит из восьми антипараллельных β-нитей и ограничен двумя α-спиралями вверху и внизу. Кроме того, β-витки и петли в прядях способствуют гибкости ствола. В частности, PPIE содержит два РНК-связывающих домена на N-конце и домен PPIase длиной 165 оснований на C-конце. Домен PPIase гомологичен PPIA и может связываться и ингибироваться CsA.[8]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом пептидилпролилцис-транс-изомеразы (PPIase) семья. PPIases катализируют цис-транс-изомеризация из пролин имидные пептидные связи в олигопептиды и ускорить складывание белков.[5] Как правило, PPIases обнаруживаются у всех эубактерий и эукариот, а также у некоторых архебактерий и, следовательно, очень консервативны.[6][9] Семейство PPIase делится на три структурно различных подсемейства: циклофилин (CyP), FK506-связывающий белок (FKBP), и парвулин (Пвн).[6][8] Как циклофилин PPI связывает циклоспорин А (CsA) и может быть обнаружен внутри клетки или секретируется клеткой.[7] У эукариот циклофилины повсеместно локализуются во многих типах клеток и тканей.[7][8] Помимо активности PPIase и белков-шаперонов, циклофилины участвуют в митохондриальном метаболизме, апоптозе, иммунологическом ответе, воспалении, росте и пролиферации клеток.[6][7][8] PPIE, в частности, также проявляет РНК-связывающую активность.[5]

Клиническое значение

Из-за близкой гомологии в домене PPIase между PPIE и PPIA, PPIE также может участвовать в процессе репликации ВИЧ.[8] Более того, PPIE помогает предотвратить инфекции путем вирус гриппа А.[10] Как циклофилин, PPIE также связывает иммунодепрессивное лекарство CsA с образованием комплекса CsA-циклофилин, который затем нацеливается на кальциневрин, чтобы ингибировать сигнальный путь для активации Т-клеток.[7]

В сердечных миогенных клетках циклофилины активируются тепловым шоком и гипоксией-реоксигенацией, а также образуют комплекс с белками теплового шока. Таким образом, циклофилины могут выполнять функцию кардиопротекции во время ишемического реперфузионного повреждения.

В настоящее время экспрессия циклофилина сильно коррелирует с патогенезом рака, но конкретные механизмы еще предстоит выяснить.[7]

Взаимодействия

PPIE (ген) показал взаимодействовать с CsA и MLL.[7][11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000084072 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000028651 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c «Ген Entrez: PPID пептидилпролилизомераза E (циклофилин E)».
  6. ^ а б c d Казуи Т., Иноуэ Н., Ямада О., Комацу С. (январь 1992 г.). «Избирательная церебральная перфузия при операции по поводу аневризмы дуги аорты: переоценка». Летопись торакальной хирургии. 53 (1): 109–14. Дои:10.1016 / 0003-4975 (92) 90767-х. PMID 1530810.
  7. ^ а б c d е ж грамм Яо Ц., Ли М., Ян Х, Чай Х, Фишер В., Чен С. (март 2005 г.). «Роль циклофилинов в раке и других системах органов». Всемирный журнал хирургии. 29 (3): 276–80. Дои:10.1007 / s00268-004-7812-7. PMID 15706440.
  8. ^ а б c d е ж Ван Т., Юнь Ч., Гу Си, Чанг В. Р., Лян округ Колумбия (август 2005 г.). «1.88 Кристаллическая структура домена C hCyP33: новый домен пептидил-пролил цис-транс-изомеразы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 333 (3): 845–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.06.006. PMID 15963461.
  9. ^ Hoffmann H, Schiene-Fischer C (июль 2014 г.). «Функциональные аспекты внеклеточных циклофилинов». Биологическая химия. 395 (7–8): 721–35. Дои:10.1515 / hsz-2014-0125. PMID 24713575.
  10. ^ Ван З., Лю X, Чжао З., Сюй Ц., Чжан К., Чэнь Ц., Сунь Л., Гао Г.Ф., Е Икс, Лю В. (2011). «Циклофилин E действует как негативный регулятор репликации вируса гриппа, нарушая образование вирусного рибонуклеопротеинового комплекса». PLOS ONE. 6 (8): e22625. Дои:10.1371 / journal.pone.0022625. ЧВК 3160840. PMID 21887220.
  11. ^ Ярмарка К., Андерсон М., Буланова Е., Ми Х, Тропшуг М., Диас М. О. (май 2001 г.). «Белковые взаимодействия пальцев MLL PHD модулируют регуляцию гена-мишени MLL в клетках человека». Молекулярная и клеточная биология. 21 (10): 3589–97. Дои:10.1128 / MCB.21.10.3589-3597.2001. ЧВК 100280. PMID 11313484.

дальнейшее чтение