WikiDer > PTX3

PTX3
Эта статья о белке и гене. Об альбоме 2014 года см. PTX, Vol. III.
PTX3
Идентификаторы
ПсевдонимыPTX3, TNFAIP5, TSG-14, пентраксин 3
Внешние идентификаторыOMIM: 602492 MGI: 104641 ГомолоГен: 7500 Генные карты: PTX3
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение PTX3
Геномное расположение PTX3
Группа3q25.32Начинать157,436,850 бп[1]
Конец157,443,633 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PTX3 206157 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

5806

19288

Ансамбль

ENSG00000163661

ENSMUSG00000027832

UniProt

P26022

P48759

RefSeq (мРНК)

NM_002852

NM_008987

RefSeq (белок)

NP_002843

NP_033013

Расположение (UCSC)Chr 3: 157.44 - 157.44 МбChr 3: 66.22 - 66.23 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Пентраксин-родственный белок PTX3 также известен как TNF-индуцибельный белок гена 14 (TSG-14) - это белок что у людей кодируется PTX3 ген.[5][6]

Пентраксин 3 (ptx3) входит в состав пентраксин надсемейство. Это суперсемейство характеризуется циклической мультимерной структурой.[7]PTX3 быстро продуцируется и высвобождается несколькими типами клеток, в частности мононуклеарными фагоцитами, дендритные клетки (DC), фибробласты и эндотелиальные клетки в ответ на первичные воспалительные сигналы [например, толл-подобный рецептор (TLR) участие, TNFα, ИЛ-1β].[8][9] PTX3 связывается с высоким сродством с компонентом комплемента C1q, компонент внеклеточного матрикса TNFα индуцировал белок 6 (TNFAIP6; также называемый TNF-стимулированным геном 6, TSG-6) и избранные микроорганизмы, включая Aspergillus fumigatus и Синегнойная палочка.[10][11][12][13][14]PTX3 активирует классический путь дополнения активации и облегчает распознавание патогенов макрофаги и DC.[9][10][12]

Структура

Человеческий и мышиный PTX3, локализованный в синтенической области хромосома 3 (q24-28), являются высококонсервативными, разделяя 82% идентичных и 92% консервативных аминокислот. Ген PTX3 человека состоит из трех экзонов, кодирующих лидерный пептид (который отщепляется от зрелого белка), аминоконцевой домен и домен пентраксина белка.

Транскрибируемый белок PTX3 имеет длину 381 аминокислоту и прогнозируемую молекулярную массу 40,165. Да и состоит из карбокси-концевой 203 аминокислота длинный домен пентраксина в сочетании с аминоконцевой Длинный домен из 178 аминокислот не связан с другими известными белками. Карбоксиконцевой домен PTX3 содержит каноническую сигнатуру пентраксина (HxCxS / TWxS) и два консервативных цистеины (Cys-210 и Cys-271) и имеет 57% консервативных и 17% идентичных аминокислот с короткими пентраксинами. Наличие аминосвязанного гликозилирование сайт в карбокси-концевом домене на Asn-220 объясняет более высокую молекулярную массу, наблюдаемую в SDS – PAGE в восстанавливающих условиях (45 кДа в отличие от прогнозируемых 40 кДа). В естественных условиях протомеры PTX3 собираются в мультимеры.[11] В Кристальная структура PTX3 еще не определено, однако по моделирование, домен пентраксина PTX3 хорошо приспосабливается к третичной складке SAP, почти все β-тяжи и α-спиральный сегменты сохранены.[15]

PTX3 в крови

PTX3 ведет себя как белок острой фазы ответа, поскольку уровни PTX3 в крови низкие в нормальных условиях (около 25 нг / мл у мышей, <2 нг / мл у людей), быстро увеличиваются (достигая пика через 6-8 часов после индукции) и резко (200-800 нг / мл) в течение эндотоксический шок, сепсис и другие воспалительные и инфекционные состояния, коррелирующие с тяжестью заболевания. Уровни PTX3 в спинномозговой жидкости помогают различать бактериальный и асептический менингоэнцефалит.[16] В этих условиях PTX3 является быстрым маркером первичной локальной активации врожденный иммунитет и воспаление.[17][18][19][20][21]

Патоген против апоптического самопознания

Подобно другим членам семейства пентраксинов, PTX3 связывает апоптотические клетки, тем самым препятствуя их распознаванию DC. Связывание происходит на поздних стадиях апоптотического процесса и усиливает продукцию цитокинов DC. Кроме того, предварительная инкубация апоптотических клеток с PTX3 усиливает C1q связывание и отложение C3 на поверхности клетки, предполагая роль PTX3 в опосредованном комплементом клиренсе апоптотических клеток.[22][23][24] Более того, в присутствии умирающих клеток PTX3 ограничивает перекрестную презентацию антигенов, полученных из умирающих клеток. Эти результаты предполагают, что PTX3 выполняет двойную роль: защита от патогенов и контроль аутоиммунитета.[24][25]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163661 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027832 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Breviario F, d'Aniello EM, Golay J, Peri G, Bottazzi B, Bairoch A, Saccone S, Marzella R, Predazzi V, Rocchi M (ноябрь 1992 г.). «Интерлейкин-1-индуцируемые гены в эндотелиальных клетках. Клонирование нового гена, связанного с C-реактивным белком и амилоидным P-компонентом сыворотки». Журнал биологической химии. 267 (31): 22190–7. PMID 1429570.
  6. ^ «Ген Entrez: ген PTX3, связанный с пентраксином, быстро индуцируемый IL-1 beta».
  7. ^ Эмсли Дж., Белый Х.Э., О'Хара Б.П., Олива Дж., Сринивасан Н., Щекотка И.Дж., Бланделл Т.Л., Пепис МБ, Вуд СП (январь 1994 г.). «Структура пентамерного амилоидного P компонента сыворотки крови человека». Природа. 367 (6461): 338–45. Bibcode:1994Натура.367..338E. Дои:10.1038 / 367338a0. PMID 8114934. S2CID 4284282.
  8. ^ Wirestam L, Enocsson H, Skogh T, Eloranta ML, Rönnblom L, Sjöwall C, Wetterö J (июль 2017 г.). «Интерферон-α совпадает с подавленными уровнями пентраксина-3 (PTX3) при системной красной волчанке и регулирует лейкоцитарный PTX3 in vitro». Клиническая и экспериментальная иммунология. 189 (1): 83–91. Дои:10.1111 / cei.12957. ЧВК 5461103. PMID 28257596.
  9. ^ а б Гарланда С., Боттацци Б., Бастон А., Мантовани А. (2005). «Пентраксины на перекрестке между врожденным иммунитетом, воспалением, отложением матрикса и женской фертильностью». Ежегодный обзор иммунологии. 23: 337–66. Дои:10.1146 / annurev.immunol.23.021704.115756. PMID 15771574.
  10. ^ а б Диниз С.Н., Номизо Р., Чизальпино П.С., Тейшейра М.М., Браун Г.Д., Мантовани А., Гордон С., Рейс Л.Ф., Диас А.А. (апрель 2004 г.). «PTX3 действует как опсонин для зависимой от дектина-1 интернализации зимозана макрофагами». Журнал биологии лейкоцитов. 75 (4): 649–56. Дои:10.1189 / jlb.0803371. PMID 14726497. S2CID 1172342.
  11. ^ а б Bottazzi B, Vouret-Craviari V, Bastone A, De Gioia L, Matteucci C, Peri G, Spreafico F, Pausa M, D'Ettorre C, Gianazza E, Tagliabue A, Salmona M, Tedesco F, Introna M, Mantovani A ( Декабрь 1997 г.). «Формирование мультимера и распознавание лиганда длинным пентраксином PTX3. Сходства и различия с коротким пентраксином C-реактивным белком и амилоидным P-компонентом сыворотки». Журнал биологической химии. 272 (52): 32817–23. Дои:10.1074 / jbc.272.52.32817. PMID 9407058.
  12. ^ а б Гарланда С, Хирш Э, Бозза С, Салюстри А, Де Ацетис М, Нота Р, Макканьо А, Рива Ф, Боттацци Б, Пери Джи, Дони А, Ваго Л, Ботто М, Де Сантис Р, Карминати П, Сиракуза Дж, Альтруда Ф., Векки А., Романи Л., Мантовани А. (ноябрь 2002 г.). «Неизбыточная роль длинного пентраксина PTX3 в противогрибковом врожденном иммунном ответе». Природа. 420 (6912): 182–6. Bibcode:2002Натура. 420..182Г. Дои:10.1038 / природа01195. PMID 12432394. S2CID 4414588.
  13. ^ Наута А.Дж., Боттацци Б., Мантовани А., Сальватори Дж., Кишор Ю., Швэбл В.Дж., Гинграс А.Р., Цима С., Виванко Ф., Эджидо Дж., Тихсма О., Хак ЕС, Даха М.Р., Роос А. (февраль 2003 г.). «Биохимическая и функциональная характеристика взаимодействия между пентраксином 3 и C1q». Европейский журнал иммунологии. 33 (2): 465–73. Дои:10.1002 / immu.200310022. PMID 12645945. S2CID 9479617.
  14. ^ Салюстри А, Гарланда С, Хирш Э, Де Ацетис М, Макканьо А, Боттацци Б, Дони А, Бастоун А, Мантовани Джи, Бек Пекко П, Сальватори Джи, Махони DJ, Дэй А.Дж., Сиракуза Джи, Романи Л., Мантовани А. ( Апрель 2004 г.). «PTX3 играет ключевую роль в организации внеклеточного матрикса кумулюса oophorus и в оплодотворении in vivo». Разработка. 131 (7): 1577–86. Дои:10.1242 / dev.01056. PMID 14998931.
  15. ^ Introna M, Alles VV, Castellano M, Picardi G, De Gioia L, Bottazzai B, Peri G, Breviario F, Salmona M, De Gregorio L, Dragani TA, Srinivasan N, Blundell TL, Hamilton TA, Mantovani A (март 1996) . «Клонирование мыши ptx3, нового члена семейства гена пентраксина, экспрессируемого во внепеченочных сайтах». Кровь. 87 (5): 1862–72. Дои:10.1182 / blood.V87.5.1862.1862. PMID 8634434.
  16. ^ Затта М., Ди Белла С., Боттацци Б., Росси Ф., Д'Агаро П., Сегат Л. и др. (Декабрь 2019 г.). «Определение уровня пентраксина 3 в спинномозговой жидкости при инфекциях центральной нервной системы». Европейский журнал клинической микробиологии и инфекционных заболеваний. 39 (4): 665–670. Дои:10.1007 / s10096-019-03767-w. PMID 31813079. S2CID 208812200.
  17. ^ Мюллер Б., Пери Дж., Дони А., Торри В., Ландманн Р., Боттацци Б., Мантовани А. (июль 2001 г.). «Уровни циркулирующего длинного пентраксина PTX3 коррелируют с тяжестью инфекции у тяжелобольных пациентов». Реанимационная медицина. 29 (7): 1404–7. Дои:10.1097/00003246-200107000-00017. PMID 11445697. S2CID 1709839.
  18. ^ Fazzini F, Peri G, Doni A, Dell'Antonio G, Dal Cin E, Bozzolo E, D'Auria F, Praderio L, Ciboddo G, Sabbadini MG, Manfredi AA, Mantovani A, Querini PR (декабрь 2001 г.). «PTX3 при васкулитах мелких сосудов: независимый индикатор активности болезни, продуцируемой в местах воспаления». Артрит и ревматизм. 44 (12): 2841–50. Дои:10.1002 / 1529-0131 (200112) 44:12 <2841 :: AID-ART472> 3.0.CO; 2-6. PMID 11762945.
  19. ^ Mairuhu AT, Peri G, Setiati TE, Hack CE, Koraka P, Soemantri A, Osterhaus AD, Brandjes DP, van der Meer JW, Mantovani A, van Gorp EC (август 2005 г.). «Повышенные уровни в плазме длинного пентраксина, пентраксина 3, при тяжелых инфекциях, вызванных вирусом денге». Журнал медицинской вирусологии. 76 (4): 547–52. Дои:10.1002 / jmv.20397. PMID 15977234. S2CID 24762210.
  20. ^ Azzurri A, Sow OY, Amedei A, Bah B, Diallo S, Peri G, Benagiano M, D'Elios MM, Mantovani A, Del Prete G (январь 2005 г.). «Уровни IFN-гамма-индуцируемого белка 10 и пентраксина 3 в плазме являются инструментами для мониторинга воспаления и активности заболевания при инфекции Mycobacterium tuberculosis». Микробы и инфекции. 7 (1): 1–8. Дои:10.1016 / j.micinf.2004.09.004. PMID 15716076.
  21. ^ Латини Р., Маджони А.П., Пери Дж., Гонзини Л., Луччи Д., Мокарелли П., Ваго Л., Паскуалини Ф, Синьорини С., Солдатески Д., Тарли Л., Швайгер С., Фреско С., Сесере Р., Тоньони Дж., Мантовани А. (октябрь 2004 г. ). «Прогностическое значение длинного пентраксина PTX3 при остром инфаркте миокарда». Тираж. 110 (16): 2349–54. Дои:10.1161 / 01.CIR.0000145167.30987.2E. PMID 15477419.
  22. ^ Гершов Д., Ким С., Брот Н., Элкон К.Б. (ноябрь 2000 г.). «C-реактивный белок связывается с апоптотическими клетками, защищает клетки от сборки компонентов терминального комплемента и поддерживает противовоспалительный врожденный иммунный ответ: последствия для системного аутоиммунитета». Журнал экспериментальной медицины. 192 (9): 1353–64. Дои:10.1084 / jem.192.9.1353. ЧВК 2193350. PMID 11067883.
  23. ^ Familian A, Zwart B, Huisman HG, Rensink I, Roem D, Hordijk PL, Aarden LA, Hack CE (июль 2001 г.). «Хроматин-независимое связывание амилоидного Р-компонента сыворотки с апоптотическими клетками». Журнал иммунологии. 167 (2): 647–54. Дои:10.4049 / jimmunol.167.2.647. PMID 11441067.
  24. ^ а б Ровере П., Пери Дж., Фаццини Ф., Боттацци Б., Дони А., Бонданца А., Циммерманн В. С., Гарланда С., Фашио Ю., Саббадини М. Г., Ругарли С., Мантовани А., Манфреди А. А. (декабрь 2000 г.). «Длинный пентраксин PTX3 связывается с апоптотическими клетками и регулирует их клиренс антигенпрезентирующими дендритными клетками». Кровь. 96 (13): 4300–6. Дои:10.1182 / кровь.V96.13.4300. PMID 11110705.
  25. ^ Баруа П., Пропато А., Думитриу И.Е., Ровере-Керини П., Руссо В., Фонтана Р., Аккапеццато Д., Пери Дж., Мантовани А., Барнаба В., Манфреди А.А. (январь 2006 г.). «Рецептор распознавания образов PTX3 задействуется в синапсе между умирающими и дендритными клетками и редактирует перекрестную презентацию собственных, вирусных и опухолевых антигенов». Кровь. 107 (1): 151–8. Дои:10.1182 / кровь-2005-03-1112. PMID 16166594.

дальнейшее чтение