WikiDer > Пинин

Pinin

PNN

Идентификаторы

Псевдонимы

PNN, DRS, DRSP, SDK3, memA, пинин, пинин, белок, связанный с десмосомами

Внешние идентификаторы

OMIM: 603154 MGI: 1100514 ГомолоГен: 37656 Генные карты: PNN

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 14 (человек)^[1]

Группа	14q21.1	Начните	39,175,183 бп^[1]
Группа	14q21.1	Конец	39,183,220 бп^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 12 (мышь)^[2]

Группа	12 C1 \| 12 26,0 см	Начните	59,066,884 бп^[2]
Группа	12 C1 \| 12 26,0 см	Конец	59,073,998 бп^[2]

Экспрессия РНК шаблон

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• структурная молекулярная активность • Связывание ДНК • Связывание РНК • GO: 0001948 связывание с белками
Сотовый компонент	• промежуточная нить • соединение клеток • ядро клетки • межклеточное соединение • мембрана • десмосома • комплекс экзон-экзонный переход • клеточная мембрана • каталитическая стадия 2 сплайсосомы • сплайсосомальный комплекс • ядерное пятнышко
Биологический процесс	• Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • транскрипция, ДНК-шаблон • Сплайсинг РНК • обработка мРНК • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточная адгезия
Источники:Amigo / QuickGO

Ортологи

Виды

Человек

Мышь


5411


18949

Ансамбль


ENSG00000100941


ENSMUSG00000020994


Q9H307


O35691

RefSeq (мРНК)


NM_002687


NM_008891

RefSeq (белок)


NP_002678


NP_032917

Расположение (UCSC)

Chr 14: 39.18 - 39.18 Мб

Chr 12: 59.07 - 59.07 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Пинин это белок что у людей кодируется PNN ген.^[5]^[6]

Взаимодействия

Пинин был показан взаимодействовать с участием Кератин 8,^[7] Кератин 18,^[7] Кератин 19,^[7] CTBP1,^[8] RNPS1,^[9]^[10] PRPF4B,^[11] SFRS4,^[12] PPIG,^[13] SRRM2^[12] и SFRS18.^[12]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100941 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020994 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Оуян П., Сугрю С.П. (январь 1997 г.). «Характеристика пинина, нового белка, связанного с комплексом десмосома-промежуточный филамент». J Cell Biol. 135 (4): 1027–42. Дои:10.1083 / jcb.135.4.1027. ЧВК 2133386. PMID 8922384.
^ «Ген Entrez: PNN пинин, белок, связанный с десмосомами».
^ ^а ^б ^c Ши, Дж; Sugrue S.P (май 2000 г.). «Рассечение белковой связи между кератинами и пинином, белком с двойным расположением в комплексе десмосома-промежуточный филамент и в ядре». J. Biol. Chem. 275 (20): 14910–5. Дои:10.1074 / jbc.275.20.14910. ISSN 0021-9258. PMID 10809736.
^ Алпатов, Роман; Мунгуба Густаво Коста; Катон Поль; Джу Чжон Хун; Ши Ян; Ши Юйцзян; Охота на Маргариту Э; Сагрю Стивен П. (декабрь 2004 г.). «Связанный с ядерными спеклами белок Pnn / DRS связывается с корепрессором транскрипции CtBP и снимает опосредованную CtBP репрессию гена E-кадгерина». Мол. Cell. Биол. 24 (23): 10223–35. Дои:10.1128 / MCB.24.23.10223-10235.2004. ISSN 0270-7306. ЧВК 529029. PMID 15542832.
^ Юинг, Роб М.; Чу Питер; Элизма Фред; Ли Хунъянь; Тейлор Пол; Клими Шейн; МакБрум-Цераевски Линда; Робинзон Марк Д; О'Коннор Лиам; Ли Майкл; Тейлор Род; Дхарси Мойез; Хо Юэн; Хайльбут Адриан; Мур Линда; Чжан Шудун; Орнатская Ольга; Бухман Юрий В; Этье Мартен; Шэн Инлунь; Василеску Юлиан; Абу-Фарха Мохамед; Ламбер Жан-Филипп; Duewel Henry S; Стюарт Ян I; Кюль Бонни; Хог Келли; Колвилл Карен; Gladwish Katharine; Маскат Бренда; Кинах Роберт; Адамс Салли-Лин; Моран Майкл Ф; Морин Грегг Б; Топалоглоу Тодорос; Фигейз Даниэль (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
^ Ли, Чин; Лин Ру-Инн; Лай Мин-Чжи; Оуян Пин; Тарн Воан-Ю (октябрь 2003 г.). «Ядерный белок Pnn / DRS связывается со сплайсированными мРНП и участвует в процессинге и экспорте мРНК посредством взаимодействия с RNPS1». Мол. Cell. Биол. 23 (20): 7363–76. Дои:10.1128 / MCB.23.20.7363-7376.2003. ISSN 0270-7306. ЧВК 230327. PMID 14517304.
^ Деллер, Грэм; Макаров Евгений М; Каугер Джефф Дж. М.; Лунман Даса; Сазерленд Хайди Дж. Э .; Люрманн Райнхард; Торкиа Джозеф; Бикмор Венди А (июль 2002 г.). «Киназа PRP4 млекопитающих соочищает и взаимодействует с компонентами как U5 snRNP, так и комплексов деацетилазы N-CoR». Мол. Cell. Биол. 22 (14): 5141–56. Дои:10.1128 / MCB.22.14.5141-5156.2002. ISSN 0270-7306. ЧВК 139773. PMID 12077342.
^ ^а ^б ^c Зимовская, Гражина; Ши Цзя; Мунгуба Густаво; Джексон Мойра R; Алпатов Роман; Симмонс Мэтью Н; Ши Юйцзян; Сагрю Стивен П. (ноябрь 2003 г.). «Пинин / DRS / memA взаимодействует с SRp75, SRm300 и SRrp130 в эпителиальных клетках роговицы». Вкладывать деньги. Офтальмол. Vis. Наука. 44 (11): 4715–23. Дои:10.1167 / iovs.03-0240. ISSN 0146-0404. PMID 14578391.
^ Линь, Чунь Лун; Лей Стив; Лу Мин Чу; Оуян Пин (август 2004 г.). «Сверхэкспрессия SR-циклофилина, партнера по взаимодействию ядерного пинина, высвобождает факторы сплайсинга семейства SR из ядерных спеклов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 321 (3): 638–47. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.07.013. ISSN 0006-291X. PMID 15358154.

дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Бранднер JM, Reidenbach S, Franke WW (1998). «Доказательства того, что« пинин », как сообщается, специфичный для дифференцировки десмосомный белок, на самом деле является широко распространенным ядерным белком». Дифференциация. 62 (3): 119–27. Дои:10.1046 / j.1432-0436.1997.6230119.x. PMID 9447706.
Degen WG, Agterbos MA, Muyrers JP, et al. (1999). «memA / DRS, предполагаемый медиатор мультибелковых комплексов, сверхэкспрессируется в метастазирующих клеточных линиях меланомы человека BLM и MV3». Биохим. Биофиз. Acta. 1444 (3): 384–94. Дои:10.1016 / s0167-4781 (99) 00012-3. PMID 10095061.
Оуян П. (1999). «Антитела различают пинин в форме десмосомы и формы ядра: доказательство того, что пинин является подрабатывающим белком с двойным расположением в десмосоме и внутри ядра». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 263 (1): 192–200. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1353. PMID 10486276.
Ши И, Оуян П., Сугрю С.П. (2000). «Характеристика гена, кодирующего пинин / DRS / memA, и доказательства его потенциальной функции супрессора опухолей». Онкоген. 19 (2): 289–97. Дои:10.1038 / sj.onc.1203328. PMID 10645008.
Ши Дж., Сугрю С.П. (2000). «Рассечение белковой связи между кератинами и пинином, белком с двойным расположением в комплексе десмосома-промежуточный филамент и в ядре». J. Biol. Chem. 275 (20): 14910–5. Дои:10.1074 / jbc.275.20.14910. PMID 10809736.
Ху RM, Хан ZG, Song HD и др. (2000). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (17): 9543–8. Bibcode:2000PNAS ... 97.9543H. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК 16901. PMID 10931946.
Юрица М.С., Ликлидер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. Дои:10.1017 / S1355838202021088. ЧВК 1370266. PMID 11991638.
Ван П., Лу П.Дж., Лей С., Оуян П. (2002). «Модуляция альтернативного сплайсинга пре-мРНК in vivo с помощью пинина». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 294 (2): 448–55. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00495-3. PMID 12051732.
Деллер Дж., Макаров Э.М., Каугер Дж. Дж. И др. (2002). «Киназа PRP4 млекопитающих соочищает и взаимодействует с компонентами как U5 snRNP, так и комплексов деацетилазы N-CoR». Мол. Cell. Биол. 22 (14): 5141–56. Дои:10.1128 / MCB.22.14.5141-5156.2002. ЧВК 139773. PMID 12077342.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Чанг В.Л., Ли Д.К., Леу С. и др. (2003). «Молекулярная характеристика нового ядрышкового белка, pNO40». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 307 (3): 569–77. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01208-7. PMID 12893261.
Ли С., Линь Р.И., Лай М.К. и др. (2003). «Ядерный белок Pnn / DRS связывается со сплайсированными мРНП и участвует в процессинге и экспорте мРНК посредством взаимодействия с RNPS1». Мол. Cell. Биол. 23 (20): 7363–76. Дои:10.1128 / MCB.23.20.7363-7376.2003. ЧВК 230327. PMID 14517304.
Зимовска Г., Ши Дж., Мунгуба Г. и др. (2003). «Пинин / DRS / memA взаимодействует с SRp75, SRm300 и SRrp130 в эпителиальных клетках роговицы». Вкладывать деньги. Офтальмол. Vis. Наука. 44 (11): 4715–23. Дои:10.1167 / iovs.03-0240. PMID 14578391.
Сакашита Э., Тацуми С., Вернер Д. и др. (2004). «Человеческая RNPS1 и связанные с ней факторы: универсальный альтернативный регулятор сплайсинга пре-мРНК in vivo». Мол. Cell. Биол. 24 (3): 1174–87. Дои:10.1128 / MCB.24.3.1174-1187.2004. ЧВК 321435. PMID 14729963.
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК 514446. PMID 15302935.
Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Линь Ц.Л., Лей С., Лу М.С., Оуян П. (2004). «Сверхэкспрессия SR-циклофилина, партнера по взаимодействию ядерного пинина, высвобождает факторы сплайсинга семейства SR из ядерных спеклов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 321 (3): 638–47. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.07.013. PMID 15358154.