WikiDer > RP9

RP9
RP9
Идентификаторы
ПсевдонимыRP9, PAP-1, PAP1, пигментный ретинит 9 (аутосомно-доминантный), фактор сплайсинга пре-мРНК, фактор сплайсинга пре-мРНК RP9
Внешние идентификаторыOMIM: 607331 MGI: 2157166 ГомолоГен: 10290 Генные карты: RP9
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек)[1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение RP9
Геномное расположение RP9
Группа7п14.3Начинать33,094,797 бп[1]
Конец33,109,404 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE RP9 gnf1h07168 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_203288

NM_018739

RefSeq (белок)

NP_976033

NP_061209

Расположение (UCSC)Chr 7: 33.09 - 33.11 МбChr 9: 22.41 - 22.47 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Пигментный ретинит 9 (аутосомно-доминантный), также известный как RP9 или же ПАП-1, это белок который у человека кодируется RP9 ген.[5]

Функция

Удаление интроны от ядерных пред-мРНК происходит в комплексе, называемом сплайсосома, который состоит из 4 малых ядерных рибонуклеопротеидов (snRNP) частиц и неопределенное количество временно связанных факторов сплайсинга. Точная роль PAP-1 в сплайсинге до конца не изучена, но считается, что PAP-1 локализуется в ядерных спеклах, содержащих фактор сплайсинга. SC35 и напрямую взаимодействует с другим фактором сращивания, U2AF35.[6]

Клиническое значение

Мутации в PAP1 лежат в основе аутосомно-доминантный пигментный ретинит сопоставлен с геном RP9 локус.[7]

Взаимодействия

RP9 был показан взаимодействовать с Вспомогательный фактор малой ядерной РНК U2 1.[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164610 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032239 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Энтрез Ген: RP9 пигментный ретинит 9 (аутосомно-доминантный)».
  6. ^ а б Маита Х, Китаура Х, Кин Т.Дж., Инглхерн С.Ф., Арига Х., Игучи-Арига С.М. (ноябрь 2004 г.). «PAP-1, мутированный ген, лежащий в основе формы доминантного пигментного ретинита RP9, является фактором сплайсинга». Exp. Cell Res. 300 (2): 283–96. Дои:10.1016 / j.yexcr.2004.07.029. PMID 15474994.
  7. ^ Кин Т.Дж., Химс М.М., Маккай А.Б., Мур А.Т., Доран Р.М., Макки Д.А., Мэнсфилд, округ Колумбия, Мюллер Р.Ф., Бхаттачарья С.С., Берд А.С., Маркхэм А.Ф., Инглхерн С.Ф. (апрель 2002 г.). «Мутации в белке-мишени киназы Pim-1, связанной с формой RP9 аутосомно-доминантного пигментного ретинита». Евро. J. Hum. Genet. 10 (4): 245–9. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5200797. PMID 12032732.

дальнейшее чтение