WikiDer > SCRIB

SCRIB
SCRIB
Протеин SCRIB PDB 1uju.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSCRIB, CRIB1, SCRB1, SCRIB1, Vartul, набросанный белок плоской клеточной полярности, набросанный белком плоской клеточной полярности
Внешние идентификаторыOMIM: 607733 MGI: 2145950 ГомолоГен: 44228 Генные карты: SCRIB
Расположение гена (человек)
Хромосома 8 (человек)
Chr.Хромосома 8 (человек)[1]
Хромосома 8 (человек)
Геномное расположение для SCRIB
Геномное расположение для SCRIB
Группа8q24.3Начните143,790,920 бп[1]
Конец143,815,773 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SCRIB 212556 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_182706
NM_015356

NM_134089
NM_001310542
NM_001310543

RefSeq (белок)

NP_056171
NP_874365

NP_001297471
NP_001297472
NP_598850

Расположение (UCSC)Chr 8: 143,79 - 143,82 МбChr 15: 76.05 - 76.07 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

SCRIB, также известен как Каракули, SCRIBL, или Нарисованный гомолог (Drosophila), это эшафот белок который у человека кодируется SCRIB ген.[5][6] Первоначально он был изолирован в Drosophila melanogaster в дорожке (также известной как комплекс Scribble) с DLGAP5 (Диски большие) и LLGL1 (Летальные гигантские личинки) как супрессор опухолей.[7] У человека SCRIB обнаруживается как мембранный белок и участвует в миграция клеток, полярность ячейки, и распространение клеток в эпителиальные клетки.[7][8] Есть также убедительные доказательства того, что SCRIB может играть роль в прогрессировании рака из-за его сильного гомология к белку дрозофилы.[7]

Функция

В Drosophila melanogaster, SCRIB участвует в синаптической функции, дифференцировке нейробластов и поляризации эпителия. Механически человек гомолог белок каркаса, связанный с клеточная дифференциация сосредоточены на регуляции эпителиального, а также нейронального морфогенеза. Дефицит SCRIB ухудшает многие аспекты полярность ячейки и движение клеток. SCRIB также, вероятно, участвует в установлении апикально-базальной полярности, а также в развитии от Фаза G1 к Фаза S в клеточный цикл в результате его отношений с распространение клеток и экзоцитоз.[8]

Транскрибируемые белковые продукты гена SCRIB вместе с DLGAP5 (Диски большие) и LLGL1 (Летальные гигантские личинки) являются компонентами комплекса Scribble, локализованного в базолатеральной мембране. Комплекс Scribble играет роль в определении полярность ячейки и распространение клеток в эпителиальные клетки.[9] Точный механизм, посредством которого эти белки функционируют вместе, в настоящее время неизвестен, но они участвуют в нескольких сигнальных путях, переносе везикул и в миозин II-актиновый цитоскелет.[7] Было показано, что комплекс Scribble способствует идентичности базолатеральной мембраны за счет противодействия как комплексу Par, так и комплексу Crumbs, которые способствуют идентичности апикальной мембраны.[9] Эти гены также были идентифицированы как супрессоры опухолей в Drosophila melanogaster. Поскольку эти гены в высокой степени консервативны у людей, есть доказательства того, что они играют роль в прогрессировании рака.[7]

Структура

Гомолог человека - белок LAP, он содержит 16 лейцин-богатые повторы и четыре PDZ домены.[10] SCRIB принадлежит к белковому комплексу, содержащему betaPIX, фактор обмена для Rac / Cdc42, и GIT1, белок, активирующий ГТФазу для ARF6 участвует в рециклинге рецепторов и экзоцитозе.[11]

Субклеточное и тканевое распределение

SCRIB чаще всего обнаруживается в клеточной мембране в виде белок периферической мембраны. Комплекс Scribble локализован на базолатеральной мембране.[9] SCRIB также встречается в клеточных соединениях, таких как прилипает к стыкам и узкие стыки.[12] В частности, он находится в почка, скелетные мышцы, печень, легкое, грудь, кишечник, плацента и эпителиальный клетки.[13]

Клиническое значение

В PDZ домен SCRIB связывается непосредственно с вирус папилломы человека Белок Е6.[14] SCRIB предназначен для убиквитинирование комплексом E6 и UBE3A и E6 вызывает деградацию SCRIB.[14]

Роль супрессора опухолей

Как упоминалось выше, SCRIB был идентифицирован как опухолевый супрессор наряду с DLGAP5 (Диски большие) и LLGL1 (Смертельные гигантские личинки).[7] В частности, было показано, что мутанты с дефицитом SCRIB способствуют активности многих онкогены.[9] Например, известно, что SCRIB ингибирует образование рака груди, а истощение SCRIB способствует неопластический рост за счет нарушения морфогенез и подавление смерть клетки через ассоциацию с Мой с.[9][15] В клетках человека, экспрессирующих онкогенный Рас или Раф, было обнаружено, что потеря SCRIB привела к вторжению в внеклеточный матрикс различными типами клеток. Считается, что это прямой результат регулирования MAP киназа путь по SCRIB.[16]

Роль в эпителиальном мезенхимальном переходе (ЭМП)

Благодаря своей роли в полярность ячейки и подвижность клеток, SCRIB также был замешан в эпителиальный мезенхимальный переход (EMT), который связан с опухолью метастаз и распространение во многих раки. EMT участвует в прогрессировании рака, позволяя статическим эпителиальный клетки становятся мигрирующими и позволяют этим клеткам адаптироваться, а также колонизировать новую среду. В злокачественных эпителиальных тканях SCRIB обнаруживается в основном в цитозоле, а не в обычном месте в мембране, таким образом, дополнительно участвуя в опухолевой прогрессии и EMT для SCRIB.[17]

Нокдаун-мутанты привели к потере адгезии между эпителиальными клетками почек собак Madin-Darby. Эта потеря адгезии коррелировала с приобретенным мезенхимальный появление, увеличение моторики и потеря направленности. Эти эффекты были прямым результатом прерывания E-кадгерин-опосредованная клеточная адгезия.[18] Уменьшение миграции клеток и общее снижение маркеров клеточной подвижности, а также эпителиальный мезенхимальный переход Медиаторы также наблюдались в небольших клетках аденокарциномы легких, которые были истощены по SCRIB.[17]

использованная литература

  1. ^ а б c ENSG00000180900 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000274287, ENSG00000180900 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022568 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Ген Entrez: гомолог SCRIB (Drosophila)».
  6. ^ Нагасе Т., Секи Н., Танака А., Исикава К., Номура Н. (август 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (4): 167–74, 199–210. Дои:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.
  7. ^ а б c d е ж Патрик Гумберт; Сара Рассел; Хелена Ричардсон (июнь 2003 г.). «Dlg, Scribble и Lgl в полярности клеток, пролиферации клеток и раке». BioEssays. 25 (6): 542–53. Дои:10.1002 / bies.10286. PMID 12766944.
  8. ^ а б L E Dow; Дж. С. Кауфман; Джей Кэдди; А. С. Петерсон; С. М. Джейн; С. М. Рассел и П. О. Гумберт (апрель 2007 г.). «Супрессор опухолей Scribble определяет полярность клеток во время направленной миграции эпителия: регуляция рекрутирования Rho GTPase на передний край». Онкоген. 26 (16): 2272–82. Дои:10.1038 / sj.onc.1210016. PMID 17043654.
  9. ^ а б c d е Ройер К., Лу Х (сентябрь 2011 г.). "Полярность эпителиальных клеток: главный привратник против рака?". Разница в гибели клеток. 18 (9): 1470–7. Дои:10.1038 / cdd.2011.60. ЧВК 3178423. PMID 21617693.
  10. ^ Дженнифер Н. Мердок; Дебора Дж. Хендерсон; Кит Дудни; Карлес Гастон-Массуэ; Хелен М. Филлипс; Кэролайн Патернотт; Рут Аркелл; Филип Станье и Эндрю Дж. Копп (ноябрь 2002 г.). «Нарушение каракулей (Scrb1) вызывает серьезные дефекты нервной трубки у мышей с круглым хвостом». Гм. Мол. Genet. 12 (2): 87–98. Дои:10,1093 / чмг / 12.2.87. PMID 12499390.
  11. ^ Nola S, Sebbagh M, Marchetto S, Osmani N, Nourry C, Audebert S, Navarro C, Rachel R, Montcouquiol M, Sans N, Etienne-Manneville S, Borg JP, Santoni MJ (ноябрь 2008 г.). «Scrib регулирует активность PAK в процессе миграции клеток». Гм. Мол. Genet. 17 (22): 3552–65. Дои:10.1093 / hmg / ddn248. PMID 18716323.
  12. ^ Пети М.М., Меулеманс С.М., Ален П., Аюби Т.А., Янсен Э., Ван де Вен В.Дж. (январь 2005 г.). «Супрессор опухолей Scrib взаимодействует с зиксин-родственным белком LPP, который перемещается между сайтами клеточной адгезии и ядром». BMC Cell Biol. 6 (1): 1. Дои:10.1186/1471-2121-6-1. ЧВК 546208. PMID 15649318.
  13. ^ Наварро С., Нола С., Одеберт С., Сантони М.Дж., Арсанто Дж. П., Гинестье С., Маркетто С., Жакемье Дж., Иснардон Д., Ле Бивик А., Бирнбаум Д., Борг Дж. П. (июнь 2005 г.). «Вербовка узлов Scribble у млекопитающих зависит от вовлечения E-кадгерина». Онкоген. 24 (27): 4330–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1208632. PMID 15806148.
  14. ^ а б Nakagawa S, Huibregtse JM (ноябрь 2000 г.). «Человеческие каракули (Вартул) нацелены на опосредованную убиквитином деградацию белками E6 папилломавируса высокого риска и убиквитин-протеинлигазой E6AP». Мол. Cell. Биол. 20 (21): 8244–53. Дои:10.1128 / MCB.20.21.8244-8253.2000. ЧВК 86433. PMID 11027293.
  15. ^ Чжан Л., Розенберг А., Бергами К.С., Ю М., Сюань З., Джаффе А.Б., Оллред К., Мутхусвами С.К. (ноябрь 2008 г.). «Нарушение регуляции каракулей способствует онкогенезу молочной железы и показывает роль полярности клеток в карциноме». Ячейка. 135 (5): 865–78. Дои:10.1016 / j.cell.2008.09.045. ЧВК 3015046. PMID 19041750.
  16. ^ L E Dow; Я Эльсум; C L King; К. М. Кинросс; Е. Ричардсон и П. О. Гумберт (июль 2008 г.). «Потеря человеческого Scribble взаимодействует с H-Ras, чтобы способствовать клеточной инвазии посредством дерегуляции передачи сигналов MAPK». Онкоген. 27 (46): 5988–6001. Дои:10.1038 / onc.2008.219. PMID 18641685.
  17. ^ а б Валентина Вайра; Алиса Фаверсани; Такехико Дохи; Марко Маджони; Марио Нозотти; Дельфина Този; Дарио К. Альтьери; Сильвано Босари (июнь 2011 г.). «Аберрантная сверхэкспрессия каракулей модуля клеточной полярности при раке человека». Американский журнал патологии. 178 (6): 2478–83. Дои:10.1016 / j.ajpath.2011.02.028. ЧВК 3124121. PMID 21549346.
  18. ^ И Цинь; Кристофер Капальдо; Барри М. Гамбинер и Ян Г. Макара (декабрь 2005 г.). «Белок полярности SCRIB млекопитающих регулирует адгезию и миграцию эпителиальных клеток через E-кадгерин». Журнал клеточной биологии. 171 (6): 1061–71. Дои:10.1083 / jcb.200506094. ЧВК 2171311. PMID 16344308.

дальнейшее чтение