WikiDer > SCYL1

SCYL1
SCYL1
Идентификаторы
ПсевдонимыSCYL1, GKLP, NKTL, NTKL, P105, TAPK, TEIF, TRAP, HT019, SCAR21, SCY1 как псевдокиназа 1
Внешние идентификаторыOMIM: 607982 MGI: 1931787 ГомолоГен: 6947 Генные карты: SCYL1
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение SCYL1
Геномное расположение SCYL1
Группа11q13.1Начните65,525,077 бп[1]
Конец65,538,704 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001048218
NM_020680

NM_023912
NM_001361921
NM_001361922

RefSeq (белок)

NP_001041683
NP_065731

NP_076401
NP_001348850
NP_001348851

Расположение (UCSC)Chr 11: 65,53 - 65,54 МбChr 19: 5.76 - 5.77 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

SCY1-подобный 1 (S. cerevisiae), также известен как SCYL1, это человек ген который хорошо сохраняется на протяжении всей эволюции.[5][6]

Функция

Этот ген кодирует регулятор транскрипции, принадлежащий к SCY1-подобному семейству киназа-подобные белки. Белок имеет расходящийся N-концевой киназа домен который считается каталитически неактивным и может связывать определенные последовательности ДНК через свои C-терминал домен. Активирует транскрипцию теломераза обратная транскриптаза и ДНК-полимераза бета гены. Белок был локализован в ядре, а также в цитоплазме и центросомы в течение митоз. Для этого гена было обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. По крайней мере, три транскрипта кодируют белок, содержащий все экзоны, именуемый полноразмерным (FL).[5]

Гомолог FL-Scyl1 мыши на 90% идентичен и на 93% подобен по содержанию аминокислот человеческому FL-Scyl1. В Mus Musculus FL-Scyl1 кодирует полипептид из 806 аминокислот. Белок FL содержит ТЕПЛО повторяется и C-терминал спиральная катушка домен, который также содержит несколько двухосновных мотивов и заканчивается на двухосновном мотив РКЛД-COOH.

Scyl1 локализуется на СНГ-Гольджи и ER-Промежуточный отсек Гольджи (ERGIC). Scyl1 связывается с Coatomer I (COPI) и совместно с бета-COPI и ERGIC53. миРНК опосредованный нокдаун белка нарушил ретроградный поток Рецептор KDEL от Гольджи до скорой помощи.[7] Более того, локализация Scyl1 в нейронах гиппокампа крыс также демонстрирует сходные отношения с COPI.[8]

Клиническое значение

Мутации в Scyl1 - это генетический дефект, приводящий к фенотипу мышей с дефицитом мышечной массы (мыши mdf), которые страдают от прогрессирующей нейродегенерации мозжечка и нижних двигательных нейронов. Мдф модель мышей человека спиноцеребеллярная атаксия расстройства типа.[9]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000142186 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024941 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: SCYL1, подобный SCY1 1 (S. cerevisiae)».
  6. ^ Лю С.К., Лейн В.С., Линхард Г.Е. (декабрь 2000 г.). «Клонирование и предварительная характеристика белка 105 кДа с N-концевым киназоподобным доменом». Биохим. Биофиз. Acta. 1517 (1): 148–52. Дои:10.1016 / S0167-4781 (00) 00234-7. PMID 11118629.
  7. ^ Бурман Дж. Л., Бурбоньер Л., Фили Дж., Стро Т., Дейгаард С. Ю., Пресли Дж. Ф., Макферсон П. С. (август 2008 г.). «Scyl1, мутировавший в рецессивную форму спиноцеребеллярной нейродегенерации, регулирует ретроградный трафик, опосредованный COPI». J. Biol. Chem. 283 (33): 22774–86. Дои:10.1074 / jbc.M801869200. PMID 18556652.
  8. ^ Бурман Дж. Л., Бурбоньер Л., Фили Дж., Стро Т., Дейгаард С. Ю., Пресли Дж. Ф., Макферсон П. С. (15 августа 2008 г.). «Нейроны гиппокампа, окрашенные на Scyl1 и адаптерный белок клатрина-1». JBC - О обложке. Журнал биологической химии. Архивировано из оригинал 10 октября 2008 г.. Получено 2008-09-23.
  9. ^ Schmidt WM, Kraus C, Höger H, Hochmeister S, Oberndorfer F, Branka M, Bingemann S, Lassmann H, Müller M, Macedo-Souza LI, Vainzof M, Zatz M, Reis A, Bittner RE (июль 2007 г.). «Мутация в гене Scyl1, кодирующем амино-концевой киназоподобный белок, вызывает рецессивную форму спиноцеребеллярной нейродегенерации». EMBO Rep. 8 (7): 691–7. Дои:10.1038 / sj.embor.7401001. ЧВК 1905899. PMID 17571074.

дальнейшее чтение