WikiDer > STAU1

STAU1
STAU1
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSTAU1, PPP1R150, STAU, двухцепочечный РНК-связывающий белок стауфен 1
Внешние идентификаторыOMIM: 601716 MGI: 1338864 ГомолоГен: 3384 Генные карты: STAU1
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человек)[1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение STAU1
Геномное расположение STAU1
Группа20q13.13Начните49,113,339 бп[1]
Конец49,188,367 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE STAU1 207320 x at fs.png

PBB GE STAU1 211505 s в формате fs.png

PBB GE STAU1 208948 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001109905
NM_001109906
NM_001291160
NM_011490

RefSeq (белок)

NP_001103375
NP_001103376
NP_001278089
NP_035620

Расположение (UCSC)Chr 20: 49.11 - 49.19 МбChr 2: 166.95 - 167 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Двухцепочечный РНК-связывающий белок гомолог 1 Staufen это белок что у людей кодируется STAU1 ген.[5][6][7]

Штауфен - член семьи двухцепочечная РНК (дцРНК) -связывающие белки, участвующие в транспорте и / или локализации мРНК в различные субклеточные компартменты и / или органеллы. Эти белки характеризуются наличием множества дцРНК-связывающих доменов, которые необходимы для связывания РНК, имеющих двухцепочечные вторичные структуры. Человеческий гомолог стауфена, кодируемый STAU, кроме того, содержит микротрубочка-связывающий домен, аналогичный тому из белок, связанный с микротрубочками 1B, и связывает тубулин. Было показано, что продукт гена STAU присутствует в цитоплазме вместе с шероховатой эндоплазматической сети (RER), вовлекая этот белок в транспорт мРНК через сеть микротрубочек к RER, сайту трансляции. Пять вариантов транскрипции, полученные в результате альтернативное сращивание гена STAU и кодирующего три изоформы. Три из этих вариантов кодируют одну и ту же изоформу, однако различаются своим 5'UTR.[7]

STAU1 связан с стрессовые гранулы.[8]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124214 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039536 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ DesGroseillers L, Lemieux N (февраль 1997 г.). «Локализация гена двухцепочечного РНК-связывающего белка человека (STAU) в полосе 20q13.1 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика. 36 (3): 527–529. Дои:10.1006 / geno.1996.0499. PMID 8884277.
  6. ^ Ким Ю.К., Фурик Л., Desgroseillers L, Maquat LE (январь 2005 г.). «Staufen1 млекопитающих рекрутирует Upf1 на специфические 3'UTR мРНК, чтобы вызвать распад мРНК». Ячейка. 120 (2): 195–208. Дои:10.1016 / j.cell.2004.11.050. PMID 15680326. S2CID 16786108.
  7. ^ а б «Ген Entrez: STAU1 staufen, РНК-связывающий белок, гомолог 1 (Drosophila)».
  8. ^ Томас М.Г., Мартинес Тосар Л.Дж., Лоши М., Паскини Дж. М., Корреале Дж., Киндлер С., Боккаччо Г.Л. (январь 2005 г.). «Рекрутирование Staufen в стрессовые гранулы не влияет на ранний транспорт мРНК в олигодендроцитах». Молекулярная биология клетки. 16 (1): 405–420. Дои:10.1091 / mbc.E04-06-0516. ЧВК 539183. PMID 15525674.

дальнейшее чтение