WikiDer > Коллаген, тип XVII, альфа 1

Collagen, type XVII, alpha 1
COL17A1
Идентификаторы
ПсевдонимыCOL17A1, BA16H23.2, BP180, BPA-2, BPAG2, LAD-1, ERED, коллаген типа XVII альфа 1, коллаген типа XVII альфа 1 цепь
Внешние идентификаторыOMIM: 113811 ГомолоГен: 133558 Генные карты: COL17A1
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение COL17A1
Геномное расположение COL17A1
Группа10q25.1Начинать104,031,286 бп[1]
Конец104,085,880 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE COL17A1 204636 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1308

н / д

Ансамбль

ENSG00000065618

н / д

UniProt

Q9UMD9

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_130778
NM_000494

н / д

RefSeq (белок)

NP_000485

н / д

Расположение (UCSC)Chr 10: 104.03 - 104.09 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Коллаген XVII, ранее назывался BP180, представляет собой трансмембранный белок, который играет критическую роль в поддержании связи между внутриклеточными и внеклеточными структурными элементами, участвующими в эпидермальной адгезии, идентифицированной Диазом и коллегами в 1990 году.[3][4]

COL17A1 - официальное название гена. Он кодирует альфа-цепь коллагена XVII типа. Коллаген XVII - это трансмембранный белок, как и коллаген XIII, XXIII и XXV. Коллаген XVII является структурным компонентом гемидесмосом, мультибелковых комплексов в зоне дермально-эпидермальной базальной мембраны, которые опосредуют адгезию кератиноцитов к подлежащей мембране. Это также, по-видимому, ключевой белок в поддержании целостности роговица эпителий.[5] Мутации в этом гене связаны как с генерализованным атрофическим доброкачественным, так и с узловым буллезным эпидермолизом,[6] а также повторяющиеся эрозии роговицы, и экспрессия этого гена аномальна при различных формах рака.[7] Существуют две гомотримерные формы коллагена типа XVII. Полная форма - это трансмембранный белок. Растворимая форма, называемая либо эктодоменом, либо LAD-1, генерируется протеолитическим процессингом полноразмерной формы.[8]

Структура

Коллаген XVII - гомотример трех альфа1 (XVII) -цепей. [9] и трансмембранный белок с ориентацией типа II. Каждая а-цепь 180 кДа содержит глобулярный внутриклеточный домен размером примерно 70 кДа, который взаимодействует с бета4-интегрин, плектин, и BP230 [10][11] и необходим для стабильного крепления гемидесмосомы к кератин промежуточные нити. Большой С-концевой эктодомен с молекулярной массой приблизительно 120 кДа состоит из 15 коллагеновых субдоменов, характеризующихся типичными коллагеновыми последовательностями повторов G-X-Y, фланкированных 16 короткими неколлагеновыми участками. Общая структура эктодомена представляет собой гибкую стержнеобразную форму. тройная спираль [12][13] со значительной термической стабильностью.[14][15] Мембранная проксимальная часть эктодомена, в пределах аминокислот 506-519, отвечает за связывание с альфа 6 интегрином, это связывание, по-видимому, важно для интеграции коллагена XVII в гемидесмосомы (необходима цитата). Самый большой коллагеновый домен, Col15, который содержит 232 аминокислоты (аминокислоты 567-808), вносит значительный вклад в стабильность гомотримера коллагена XVII. С-конец коллагена XVII связывается с ламинином 5, и для правильной интеграции ламинина 5 в матрикс необходим коллаген XVII.

Патология

Мутации в гене человеческого коллагена XVII, COL17A1, приводят к отсутствию или структурным изменениям и мутациям коллагена XVII.[16] Функциональные последствия включают уменьшение адгезии эпидермиса и образование пузырей на коже в ответ на минимальные усилия сдвига. Заболевание, вызванное двуаллельными мутациями COL17A1, называется узловым. буллезный эпидермолиз, аутосомно-рецессивное заболевание кожи с различными клиническими фенотипами. Морфологические характеристики буллезного узлового эпидермолиза - рудиментарные гемидесмосомы и разделение субэпидермальных тканей. Клинические признаки, помимо волдырей и эрозий на коже и слизистых оболочках, включают дистрофию ногтей, выпадение волос и аномалии зубов.

Коллаген XVII также играет роль аутоантигена в Буллезный пемфигоид (BP) и герпес беременности (HG), оба приобретенные субэпителиальные образования пузырей.[17][18] Большинство иммунодоминантных эпитопов находится в домене NC16A,[19] и связывание аутоантител нарушает адгезивные функции коллагена XVII, и это (вместе с процессами, связанными с воспалением) приводит к эпидермально-дермальному разделению и образованию пузырей на коже.[20]

Другие мутации делают эпителий роговицы глаза ломким, что приводит к доминантно наследуемому рецидивирующая дистрофия эрозии роговицы (ЭРЕД). Секвенирование всего экзома впервые выявило гетерозиготную мутацию (c.2816C> T, p.T939I), которая отделилась от ERED в большой шведской родословной, насчитывающей 200 лет.[21] Другой синонимичная мутация (c.3156C> T) было предложено ввести загадочный донорский сайт, что привело к аномальному сращивание, теория, которая впоследствии была подтверждена в нескольких семьях с ERED из разных стран.[5][22]

Рак

Экспрессия гена COL17A1 аномальна при различных формах рака.[7] Например, он был обнаружен ненормальным при пяти типах эпителиального рака, включая рак груди, рак шейки матки, рак головы и шеи и два типа рака легких. Сниженная экспрессия наблюдалась для рака шейки матки, тогда как повышенная экспрессия наблюдалась для других видов рака.[7]

Линька

Коллаген XVII конститутивно выделяется с поверхности кератиноцитов в домене NC16A с помощью TACE (TNF-альфа-превращающий фермент), металлопротеиназы семейства ADAM.[23] Выделение зависит от липидного рафта.[24] Коллаген XVII внеклеточно фосфорилируется экто-казеинкиназой 2 в домене NC16A, фосфорилирование отрицательно регулирует отщепление эктодомена.[25]

SPARC и несовершенный остеогенез

Ген SPARC полностью связан с гомозиготный мутации в коллагене XVII, что, в свою очередь, вызывает тип несовершенный остеогенез.[26][27]

Взаимодействия

Коллаген, тип XVII, альфа 1, как было показано взаимодействовать с Кератин 18,[28] Актинин альфа 4,[29] Дистонин,[11][30] Актинин, альфа 1,[29] CTNND1[31] и ITGB4.[32][33]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000065618 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ Franzke, C.W .; Bruckner, P .; Брукнер-Тудерман, Л. (2005). «Коллагеновые трансмембранные белки: последние открытия в области биологии и патологии». J. Biol. Chem. 280 (6): 4005–4008. Дои:10.1074 / jbc.R400034200. PMID 15561712.
  4. ^ Диаз, Л. А; Ratrie, H; Saunders, W. S; Футамура, S; Squiquera, H L; Анхальт, Дж. Дж .; Джудиче, Дж. Дж. (Октябрь 1990 г.). «Выделение эпидермальной кДНК человека, соответствующей 180-кД аутоантигену, распознаваемому буллезным пемфигоидом и сывороткой герпеса гестации. Иммунолокализация этого белка в гемидесмосоме». Журнал клинических исследований. 86 (4): 1088–1094. Дои:10.1172 / JCI114812. ISSN 0021-9738. ЧВК 296836. PMID 1698819.
  5. ^ а б Оливер, В.Ф .; van Bysterveldt, K.A .; Cadzow, M .; и другие. (2016). «Мутация, изменяющая сплайсинг COL17A1, преобладает в наследственных рецидивирующих эрозиях роговицы» (PDF). Офтальмология. 123 (4): 709–722. Дои:10.1016 / j.ophtha.2015.12.008. PMID 26786512.
  6. ^ Бардхан, Аджой; Брукнер-Тудерман, Лина; Chapple, Iain L.C .; Хорошо, Джо-Дэвид; Харпер, Наташа; Имеет, Кристина; Magin, Thomas M .; Маринкович, М. Петр; Маршалл, Джон Ф .; McGrath, John A .; Меллерио, Джемайма Э. (24 сентября 2020 г.). «Буллезный эпидермолиз». Nature Reviews Праймеры от болезней. 6 (1): 78. Дои:10.1038 / s41572-020-0210-0. ISSN 2056-676X. PMID 32973163. S2CID 221861310.
  7. ^ а б c Thangavelu, P.U .; Krenács, T .; Dray, E .; Duijf, P.H.G. (2016), «При эпителиальном раке аберрантное метилирование промотора COL17A1 предсказывает его неправильную экспрессию и повышенную инвазию», Clin Epigenetics, 8: 120, Дои:10.1186 / s13148-016-0290-6, ЧВК 5116176, PMID 27891193
  8. ^ «Ген Entrez: коллаген COL17A1, тип XVII, альфа 1».
  9. ^ Hirako, Y .; Usukura, J .; Nishizawa, Y .; Оварибе, К. (1996). «Демонстрация молекулярной формы BP180, буллезного пемфигоидного антигена массой 180 кДа и его потенциала для образования тримеров». J. Biol. Chem. 271 (23): 13739–13745. Дои:10.1074 / jbc.271.23.13739. PMID 8662839.
  10. ^ Hopkinson, S.B .; Финдли, К .; Jones, J.C .; Джонс, JC (1998). «Взаимодействие BP180 (коллаген XVII типа) и альфа-6 интегрина необходимо для стабилизации структуры гемидесмосом». J. Invest. Дерматол. 111 (6): 1015–1022. Дои:10.1046 / j.1523-1747.1998.00452.x. PMID 9856810.
  11. ^ а б Хопкинсон, С. Б.; Джонс Дж. С. (январь 2000 г.). «N-конец трансмембранного белка BP180 взаимодействует с N-концевым доменом BP230, тем самым опосредуя закрепление кератинового цитоскелета на поверхности клетки в месте гемидесмосомы». Мол. Биол. Клетка. 11 (1): 277–86. Дои:10.1091 / mbc.11.1.277. ISSN 1059-1524. ЧВК 14774. PMID 10637308.
  12. ^ Hirako, Y .; Usukura, J .; Nishizawa, Y .; Оварибе, К. (1996). «Демонстрация молекулярной формы BP180, буллезного пемфигоидного антигена массой 180 кДа и его потенциала для образования тримеров». J. Biol. Chem. 271 (23): 13739–13745. Дои:10.1074 / jbc.271.23.13739. PMID 8662839.
  13. ^ Hirako, Y .; Usukura, J .; Uematsu, J .; Хашимото, Т .; Kitajima, Y .; Оварибе, К. (1998). «Расщепление BP180, буллезного пемфигоидного антигена массой 180 кДа, дает коллагеновый внеклеточный полипептид массой 120 кДа». J. Biol. Chem. 273 (16): 9711–9717. Дои:10.1074 / jbc.273.16.9711. PMID 9545306.
  14. ^ Schacke, H .; Schumann, H .; Hammami-Hauasli, N .; Рагхунатх, М .; Брукнер-Тудерман, Л. (1998). «Две формы коллагена XVII в кератиноцитах. Полноразмерный трансмембранный белок и растворимый эктодомен». J. Biol. Chem. 273 (40): 25937–25943. Дои:10.1074 / jbc.273.40.25937. PMID 9748270.
  15. ^ Areida, S.K .; Reinhardt, D. P .; Muller, P.K .; Fietzek, P.P .; Kowitz, J .; Маринкович, М. П .; Нотбом, Х. (2001). «Свойства эктодомена коллагена XVII типа. Доказательства складывания тройной спирали с n- на c-концевую». J. Biol. Chem. 276 (2): 1594–1601. Дои:10.1074 / jbc.M008709200. PMID 11042218.
  16. ^ Zillikens, D .; Джудиче, Г. Дж. (1999). «Коллаген BP180 / тип XVII: его роль в приобретенных и наследственных нарушениях дермо-эпидермального соединения». Arch. Дерматол. Res. 291 (4): 187–194. Дои:10.1007 / s004030050392. PMID 10335914. S2CID 27592712.
  17. ^ Зилликенс, Д. (1999). «Приобретенное кожное заболевание гемидесмосом». J.Dermatol. Наука. 20 (2): 134–154. Дои:10.1016 / S0923-1811 (99) 00019-5. PMID 10379705.
  18. ^ Diaz, L.A .; Ratrie, H .; Saunders, W. S .; Futamura, S .; Squiquera, H.L .; Anhalt, G.J .; Джудиче, Дж. Дж. (Октябрь 1990 г.). «Выделение эпидермальной кДНК человека, соответствующей 180-кД аутоантигену, распознаваемому буллезным пемфигоидом и сывороткой герпеса гестации. Иммунолокализация этого белка в гемидесмосоме». Журнал клинических исследований. 86 (4): 1088–1094. Дои:10.1172 / JCI114812. ISSN 0021-9738. ЧВК 296836. PMID 1698819.
  19. ^ Giudice, G.J .; Эмери, Д. Дж .; Zelickson, B.D .; Anhalt, G.J .; Liu, Z .; Диас, Л. А. (1993-11-15). «Буллезный пемфигоид и аутоантитела к герпесу беременности распознают общий неколлагеновый участок на эктодомене BP180». Журнал иммунологии. 151 (10): 5742–5750. ISSN 0022-1767. PMID 8228259.
  20. ^ Liu, Z .; Diaz, L.A .; Troy, J. L .; Тейлор, А. Ф .; Эмери, Д. Дж .; Fairley, J. A .; Джудиче, Г. Дж. (Ноябрь 1993 г.). «Модель пассивного переноса органоспецифического аутоиммунного заболевания, буллезного пемфигоида, с использованием антител, выработанных против гемидесмосомного антигена, BP180». Журнал клинических исследований. 92 (5): 2480–2488. Дои:10.1172 / JCI116856. ISSN 0021-9738. ЧВК 288433. PMID 7693763.
  21. ^ Jonsson, F .; Byström, B .; Дэвидсон, A.E .; и другие. (2015). «Мутации в коллагене, тип XVII, альфа 1 (COL17A1) вызывают рецидивирующую эрозионную дистрофию эпителия (ERED)». Гм. Мутат. 36 (4): 463–473. Дои:10.1002 / humu.22764. PMID 25676728. S2CID 13562400.
  22. ^ Линь, Б: Р .; Le, D.J .; Chem, Y .; и другие. (2016). «Полное секвенирование экзома и анализ сегрегации подтверждают, что мутация в COL17A1 является причиной рецидивирующей эрозионной дистрофии эпителия в большой доминантной родословной, ранее сопоставленной с хромосомой 10q23-q24». PLOS ONE. 11 (6): e0157418. Bibcode:2016PLoSO..1157418L. Дои:10.1371 / journal.pone.0157418. ЧВК 4911149. PMID 27309958.
  23. ^ Franzke, C.W .; Tasanen, K .; Borradori, L .; Huotari, V .; Брукнер-Тудерман, Л. (2004). «Отщепление коллагена XVII / BP180: структурные мотивы влияют на отщепление от поверхности клетки». J. Biol. Chem. 279 (23): 24521–24529. Дои:10.1074 / jbc.M308835200. PMID 15047704.
  24. ^ Зимина Е.П., Брукнер-Тудерман Л., Францке С. (2005). «Выделение эктодомена коллагена XVII зависит от микросреды плазматической мембраны». J Biol Chem. 280 (40): 34019–24. Дои:10.1074 / jbc.M503751200. PMID 16020548.
  25. ^ Зимина Е.П., Фрич А., Шермер Б., Бакулина А.Ю., Башкуров М., Бенцинг Т., Брукнер-Тудерман Л. (2007). «Внеклеточное фосфорилирование коллагена XVII экто-казеинкиназой 2 ингибирует выделение эктодомена». J Biol Chem. 282 (31): 22737–46. Дои:10.1074 / jbc.M701937200. PMID 17545155.
  26. ^ Справка, Дом генетики. «Ген SPARC». Домашний справочник по генетике.
  27. ^ «Запись OMIM - № 616507 - OSTEOGENESIS IMPERFECTA, ТИП XVII; OI17». omim.org.
  28. ^ Ахо, S; Уитто Дж. (Март 1999 г.). «Буллезный пемфигоидный антиген 180 кДа / коллаген типа XVII: тканеспецифическая экспрессия и молекулярные взаимодействия с кератином 18». J. Cell. Биохим. 72 (3): 356–67. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19990301) 72: 3 <356 :: AID-JCB5> 3.0.CO; 2-M. ISSN 0730-2312. PMID 10022517.
  29. ^ а б Gonzalez, AM; Отей С; Edlund M; Джонс Дж. С. (декабрь 2001 г.). «Взаимодействие компонента гемидесмосомы и членов семейства актининов». J. Cell Sci. 114 (Pt 23): 4197–206. ISSN 0021-9533. PMID 11739652.
  30. ^ Костер, январь; Гиртс Дирк; Фавр Бертран; Боррадори Лука; Зонненберг Арно (январь 2003 г.). «Анализ взаимодействий между BP180, BP230, плектином и интегрином alpha6beta4, важным для сборки гемидесмосом». J. Cell Sci. 116 (Pt 2): 387–99. Дои:10.1242 / jcs.00241. ISSN 0021-9533. PMID 12482924.
  31. ^ Ахо, S; Rothenberger K; Уитто Дж (июнь 1999 г.). «Катенин p120ctn человека: тканеспецифическая экспрессия изоформ и молекулярные взаимодействия с коллагеном BP180 / типа XVII». J. Cell. Биохим. 73 (3): 390–9. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19990601) 73: 3 <390 :: AID-JCB10> 3.0.CO; 2-1. ISSN 0730-2312. PMID 10321838.
  32. ^ Ахо, S; Уитто Дж (февраль 1998 г.). «Прямое взаимодействие между внутриклеточными доменами буллезного пемфигоидного антигена 2 (BP180) и бета-4 интегрина, гемидесмосомных компонентов базальных кератиноцитов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 243 (3): 694–9. Дои:10.1006 / bbrc.1998.8162. ISSN 0006-291X. PMID 9500991.
  33. ^ Schaapveld, RQ; Borradori L; Geerts D; ван Леусден М. Р.; Куикман I; Ниверс М. Дж .; Niessen C M; Steenbergen R D; Снайдерс П. Дж .; Зонненберг А (июль 1998 г.). «Формирование гемидесмосом инициируется субъединицей интегрина бета4, требует комплексного образования бета4 и HD1 / плектин и включает прямое взаимодействие между бета4 и буллезным пемфигоидным антигеном 180».. J. Cell Biol. 142 (1): 271–84. Дои:10.1083 / jcb.142.1.271. ISSN 0021-9525. ЧВК 2133016. PMID 9660880.

дальнейшее чтение