WikiDer > DCPS (ген)
DCPS (gene)
| Поглотитель мРНК фермента декапирования (DcpS) N-конец | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура фермента обезглавливания мРНК (dcps) из mus musculus при разрешении 1,83 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | DcpS | ||||||||
| Pfam | PF05652 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR008594 | ||||||||
| SCOP2 | 1st4 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
| Поглотитель мРНК, фермент, связывающий концевую часть С | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | DcpS_C | ||||||||
| Pfam | PF11969 | ||||||||
| Pfam клан | CL0265 | ||||||||
| SCOP2 | 1st4 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
Поглотитель мРНК фермент DcpS это белок что у людей кодируется DCPS ген.[5][6][7]
Ферменты, убирающие мРНК, включают Dcp2 и DcpS. DcpS - мусорщик пирофосфатаза это гидролизует структура остаточной крышки, следующая 3' к 5' мРНК деградация. DcpS использует ограничение динуклеотиды или закрытый олигонуклеотиды так как субстраты для высвобождения m (7) GMP (N7-метил GMP), в то время как Dcp2 использует кэпированную мРНК в качестве субстрата для гидролиза кэпа с высвобождением m (7) GDP (N7-метил GDP).[8] Связь DcpS с 3 'на 5' экзонуклеаза экзосома компоненты предполагают, что эти две активности связаны и существует связанный экзонуклеолитический распад-зависимый путь декапирования. В семье есть гистидин триада (HIT) последовательность в его C-концевом домене с тремя гистидины разделены по гидрофобный остатки.[9] Центральный гистидин в DcpS HIT мотив имеет решающее значение для деятельности по снятию крышки и определяет HIT мотив как новый домен декапирования мРНК, что делает DcpS первым членом HIT семейство белков с определенным биологический функция.
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000110063 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032040 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Лю Х., Роджерс Н.Д., Цзяо Х, Киледжян М. (август 2002 г.). «Поглотитель мРНК, декэпирующий фермент DcpS, является членом семейства пирофосфатаз HIT». EMBO J. 21 (17): 4699–4708. Дои:10.1093 / emboj / cdf448. ЧВК 126188. PMID 12198172.
- ^ ван Дейк Э, Ле Хир Х, Серафин Б. (октябрь 2003 г.). «DcpS может действовать в пути распада мРНК 5'-3 'в дополнение к пути 3'-5'». Proc Natl Acad Sci U S A. 100 (21): 12081–12086. Bibcode:2003ПНАС..10012081В. Дои:10.1073 / pnas.1635192100. ЧВК 218716. PMID 14523240.
- ^ «Ген Entrez: энзим для удаления колпачков DCPS, поглотитель».
- ^ Лю Х., Киледжян М. (февраль 2006 г.). «Обеззараживание сообщения: начало или конец». Biochem. Soc. Транс. 34 (Pt 1): 35–8. Дои:10.1042 / BST20060035. PMID 16246173.
- ^ Han GW, Schwarzenbacher R, McMullan D, Abdubek P, Ambing E, Axelrod H, Biorac T, Canaves JM, Chiu HJ, Dai X, Deacon AM, DiDonato M, Elsliger MA, Godzik A, Grittini C, Grzechnik SK, Hale J , Hampton E, Haugen J, Hornsby M, Jaroszewski L, Klock HE, Koesema E, Kreusch A, Kuhn P, Lesley SA, McPhillips TM, Miller MD, Moy K, Nigoghossian E, Paulsen J, Quijano K, Reyes R, Spraggon Дж., Стивенс Р. К., ван ден Бедем Х., Веласкес Дж., Винсент Дж., Уайт А., Вольф Дж., Сюй К., Ходжсон К. О., Вули Дж., Уилсон И. А. (сентябрь 2005 г.). «Кристаллическая структура фермента деэпинга мРНК Апо (DcpS) от мышей с разрешением 1,83 А». Белки. 60 (4): 797–802. Дои:10.1002 / prot.20467. PMID 16001405. S2CID 20494085.
Смотрите также
дальнейшее чтение
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–174. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–156. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–1560. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК 310934. PMID 11042152.
- Ван З., Киледжиан М (2002). «Функциональная связь между экзосомой млекопитающих и декапированием мРНК». Клетка. 107 (6): 751–762. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00592-X. PMID 11747811. S2CID 8098116.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Квасницка Д.А., Краковяк А., Такер С. и др. (2003). «Координированная экспрессия НАДФН-зависимой флавинредуктазы, Fre-1, и Hint-связанной 7meGMP-направленной гидролазы, DCS-1». J. Biol. Chem. 278 (40): 39051–39058. Дои:10.1074 / jbc.M306355200. ЧВК 2556063. PMID 12871939.
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–45. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Гу М., Фабрега С., Лю С.В. и др. (2004). «Понимание структуры, механизма и регуляции активности декапирования мРНК скавенджера». Мол. Клетка. 14 (1): 67–80. Дои:10.1016 / S1097-2765 (04) 00180-7. PMID 15068804.
- Лю С.В., Цзяо X, Лю Х. и др. (2004). «Функциональный анализ ферментов, обезвреживающих мРНК». РНК. 10 (9): 1412–1422. Дои:10.1261 / rna.7660804. ЧВК 1370627. PMID 15273322.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Малис Н., Кэрролл К., Миян Дж., Толлервей Д., Маккарти Дж. Э. (2004). «Пирофосфатазная активность Dcs1« мусорщика »m7GpppX модулирует реакции дрожжей, вызванные питательными веществами». Нуклеиновые кислоты Res. 32 (12): 3590–3600. Дои:10.1093 / нар / гх687. ЧВК 484174. PMID 15240832.
- Чен Н., Уолш М.А., Лю Й. и др. (2005). «Кристаллические структуры человеческого DcpS в безлигандных и связанных с m7GDP формах предполагают динамический механизм декапирования скавенджера мРНК». J. Mol. Биол. 347 (4): 707–718. Дои:10.1016 / j.jmb.2005.01.062. PMID 15769464.
- Квасницка-Кроуфорд Д.А., Винсент С.Р. (2005). «Роль новой двойной флавинредуктазы (NR1) и ассоциированного белка гистидиновой триады (DCS-1) в цитотоксичности, вызванной менадионом». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 336 (2): 565–571. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.08.129. PMID 16140270.
- Малис Н., Маккарти JEG (2006). «Dcs2, новый стресс-индуцированный модулятор активности пирофосфатазы m7GpppX, который локализуется в P-тельцах». J. Mol. Биол. 363 (2): 370–382. Дои:10.1016 / j.jmb.2006.08.015. PMID 16963086.
внешняя ссылка
- PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческой m7GpppX дифосфатазы (DCPS)
Галерея PDB | |
|---|---|
|
 | Эта статья о ген на хромосома человека 11 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |