WikiDer > Гаплогруппа J-M172

Haplogroup J-M172
Гаплогруппа J-M172
Возможное время происхождения32000 лн[1])
Возраст коалесценции28000 лн[1]
Возможное место происхожденияЗападная Азия[2]
ПредокJ-P209
Определение мутацийM172
Самые высокие частотыИнгуш 88.8% (Балановский 2011), Индийский Веллаларс 38.7%, Чеченцы 56.7% (Балановский 2011), Грузины 21% (Уэллс 2001)-72%, Азербайджанцы 24% (Ди Джакомо 2004)-48% (Уэллс 2001), Иракцы 24%(Аль-Захери 2011)-25% Аль-Захери 2003 и Санчес 2005, Критяне 35% (Эль-Сибай 2009), Уйгуры 34% (Шоу 2010),[3] Ягнобис 32% (Уэллс 2001), Узбеки 30.4% (Шоу 2010), Греки 10%-48%(Мартинес 2007), Курды-мусульмане 28.4%(Небель 2001), Ливанский 30% (Семино 2004)[сомнительный ](Уэллс 2001), Евреи ашкенази 24%(Небель 2001)-29% (Семино 2004), Турки 24% (Cinnioglu 2004)-40% (Семино 2000), Хазара 26,6% (Haber et al, 2012),[4] Кувейт 26% (Кассеми 2009) и (Уэллс 2001), Киприоты 12.9% (Эль-Сибай 2009)-37% (Капелли 2005),[5] Абхазский 25% (Насидзе 2004 г.), Иранцы 22.5%(Гругни 2012)-24%,[6] Балкарцы 24% (Батталья 2008), Итальянцы 9%-36%(Капелли 2007) и (Семино 2000), Армяне 21%(Уэллс 2001)-24% (Насидзе 2004 г.), Палестинцы 15% (Небель 2001)[нужна цитата]-35%, Мордвины 15.3%,[7] Казанские татары 15.1%,[7] Чувашский 14%,[7] Сефардские евреи 15% (Шен 2004)-29% (Небель 2001), Осетины 16%(Балановский 2011)-24%(Насидзе 2004 г.), Черкесы 21.8% (Балановский 2011), Мальтийский 21% (Капелли 2005), Северная Индия Мусульмане-шииты 18% (Eaaswarkhanth 2009), Албанцы 16% (Батталья 2008)[нужна цитата], Сирийцы 14% (Ди Джакомо 2004)-29%[нужна цитата], и Калаши 9.1%.[требуется полная цитата][8]

В генетика человека, Гаплогруппа J-M172 или же J2[Филогенетика 1] это Y-хромосома гаплогруппа который является субклад (филиал) гаплогруппа J-M304.[Филогенетика 2] Гаплогруппа J-M172 распространена в современных популяциях в Западная Азия, Центральная Азия, Южная Азия, Европа и Северная Африка. Считается, что J-M172, возможно, возник между Кавказские горы, Месопотамия и Левант.[9][10]

Далее он разделен на две дополнительные клады, J-M410 и J-M12 (M12, M102, M221, M314).

Происхождение

Дата происхождения гаплогруппы J-M172 оценивается Батини и др. в 2015 году между 19 000 и 24 000 лет до настоящего времени (BP).[11] Самино и др. в 2004 г. датировано происхождение родительской гаплогруппы, J-P209, от 18 900 до 44 500 YBP.[12] Древний J-M410, в частности, субклад J-Y12379 *, был обнаружен в мезолит контекст, в зубе из пещеры Котиас Клде на западе Грузия датировка 9.529-9.895 кал. BP.[13] Этот образец был отнесен к аутосомному компоненту кавказских охотников-собирателей (ХГ).[14] J-M410, а точнее его субклад J-PF5008, найден также в мезолитическом образце из Пещеры Хоту и Камарбанд находится в Провинция Мазандаран из Иран, относящиеся к 9100-8600 гг. до н. э. (примерно 11000 лн).[15] Оба образца принадлежат к Триалетский Культура. Вполне вероятно, что к концу последнего оледенения 12000 лет назад люди J2 поселились на большей части территории Анатолии, Южного Кавказа и Ирана.[нужна цитата]

Заллуа и Уэллс 2004 и аз-Захери 2003 утверждал, что обнаружил самую раннюю известную миграцию J2 из Шумеры к Ханаан.[9][10][16] В 2001, Nebel et al. обнаружили, что «Согласно Андерхиллу и др. (2000), Eu 9 (H58) произошел от Eu 10 (H71) через T → G трансверсия в M172 (курсив добавлен), «и что в сегодняшних популяциях Eu 9 (постмутационная форма M172) является самым сильным в Кавказ, Малая Азия и Левант, в то время как Eu 10 становится сильнее и заменяет частоту Eu 9 по мере продвижения на юг в Аравийский полуостров,[17] так что люди с Кавказа встречались с арабами поблизости и между Месопотамия (ранее Шумеры) и Пустыня Негев, в качестве "Арабизация"распространились из Аравии в Левант и Турцию, а также многие народы (например, евреи, армяне, ливанцы) вернулись из диаспоры.

По результатам исследования Ди Джакомо 2004, Гаплогруппа J-M172 распространилась в Южную Европу "из Левант или же Анатолия, вероятно, параллельно с развитием сельского хозяйства.[18] Что касается времени его распространения в Европе, Ди Джакомо указывает на события, которые почтовый-дата неолита, в частности демографический флоруит, связанный с возвышением древнегреческого мира. Semino et al. получили оценки старшего возраста для всего J2 (используя метод Животовского, см. Ди Джакомо), постулировав его первоначальное распространение среди неолитических фермеров с Ближнего Востока. Однако его субкладное распределение, показывающее локализованные пики на Южных Балканах, юге Италии, севере / центральной Италии и на Кавказе, не соответствует единственному сценарию «волны продвижения», выдавая ряд до сих пор плохо изученных постнеолитических процессы, которые создали его текущий образец. Как и Ди Джакомо, южные Балканы бронзового века были предложены Семино 2004 быть важным вектором распространения.[12]

Распределение

Гаплогруппа J-M172 находится в основном в Плодородный Полумесяц, то Кавказ (Насидзе 2003), Анатолия, Италия, то Средиземноморье прибрежный, а Иранское плато(Семино 2004). Y-ДНК: J2 (J-M172): Сирид / Нахрейнид Арабид (ы).

Самая высокая зарегистрированная частота J-M172 когда-либо составляла 87,4% среди Ингуш в Малгобек (Балановский 2011).

В частности, он находится в Ирак (Аль-Захери 2003), Кувейт (Кассеми 2009), Сирия (Луис 2004), Ливан (Заллуа 2008l), индюк (Cinnioglu 2004), Грузия (Насидзе 2003), Азербайджан (Ди Джакомо 2004), Северный Кавказ (Насидзе 2004 г.), Армения (Уэллс 2001), Иран (Насидзе 2004 г.), Израиль (Семино 2004), Палестина (Семино 2004), Кипр (Капелли 2005), Греция (Мартинес 2007), Албания (Семино 2000), Италия (Капелли 2007), и Испания (Ди Джакомо 2003), а чаще в Иракцы 24%Аль-Захери 2011, Чеченцы 51.0%-58.0% (Балановский 2011), Грузины 21% (Уэллс 2001)-72% (Уэллс 2001), Ливанский 30%(Семино 2004), Осетины 24%(Насидзе 2004 г.), Балкарцы 24% (Батталья 2008), Сирийцы 23% (Луис 2004), Турки 13% (Cinnioglu 2004)-40% (Семино 2000), Киприоты 12.9% (Эль-Сибай 2009)-37%(Капелли 2005), Армяне 21% (Уэллс 2001)-24% (Насидзе 2004 г.), Черкесы 21.8%,(Балановский 2011) Иранцы 10% (Насидзе 2004 г.)-25%, (Уэллс 2001) Албанцы 16% (Батталья 2008), (Семино 2000) Итальянцы 9%-36% (Капелли 2007), Сефардские евреи 15%(Небель 2001)-29%, (Семино 2004) Мальтийский 21%(Капелли 2005), Палестинцы 17%(Семино 2004), Саудовцы 14% (Абу-Амеро 2009), Иорданцы 14%, Оманцы 10%-15% (Ди Джакомо 2004) и (Луис 2004)и Северной Индии Мусульманин-шиит 18% (Eaaswarkhanth 2009).

Северная Африка

Гаплогруппа J2 встречается с низкими частотами в Северной Африке.

Страна / регионОтбор пробNJ-M172Изучать
ТунисТунис628Эль-Сибай 2009
ТунисСусс2208.2Фадлауи-Зид 2014
АлжирОран1024.9Робино 2008
Египет1247.6Эль-Сибай 2009
Египет14712.0Абу-Амеро 2009
Марокко2214.1Фрегель 2009
Северная АфрикаАлжир, Тунис2023.5Фрегель 2009

Центральная Азия

Страна / регионОтбор пробNJ-M172Изучать
СиньцзянЛоп-уйгуры6457.8Лю 2018
СиньцзянУйгуры5034Шоу 2010
ТаджикистанЯгнобис3132Уэллс 2001
ДушанбеТаджики1631Уэллс 2001
СиньцзянУзбеки2330.4Шоу 2010
АфганистанХазара6026.6Хабер 2012
СиньцзянКериян уйгуры3925.6Лю 2018
КазахстанУйгуры4120Уэллс 2001
СамаркандТаджики4020Уэллс 2001
ТаджикистанТаджики3818.4Уэллс 2001
ТуркменистанТуркмены3017Уэллс 2001
СиньцзянПамирские таджики3116.1Шоу 2010
АфганистанУзбеки12616Ди Кристофаро 2013
БухараУзбеки5816Уэллс 2001
СамаркандУзбеки4516Уэллс 2001
СурхандарьяУзбеки6816Уэллс 2001
УзбекистанУзбеки36613.4Уэллс 2001
КазахстанКазахи3013.3Карафет 2001
Площадь ТурфанаУйгуры1439.8Лю 2011
Хотанский районУйгуры4789.2Лю 2011
ЧанцзиХуэй1759.1Лю 2011
СиньцзянДолан Уйгуры767.9Лю 2018
НинсяХуэй657.7Лю 2011

J-M172 встречается с умеренной частотой среди жителей Центральной Азии, таких как Уйгуры, Узбеки, Туркмены, Таджики, Казахи, и Ягнобис. Согласно генетическому исследованию, проведенному в Северо-Западном Китае Shou et al. (2010), заметная высокая частота J-M172 наблюдается особенно у уйгуров 34% и узбеков 30,4% в Синьцзян, Китай. Лю Шуху и другие. (2018) обнаружили J2a1 (L26 / Page55 / PF5110 / S57, L27 / PF5111 / S396) в 43,75% (28/64) и J2a2 (L581 / S398) в 14,06% (9/64) выборки лопских уйгуров из Деревня Карчуга округа Юли (Лопнур), Синьцзян, J2a1b1 (M92, M260 / Страница 14) в 25,64% (10/39) выборке уйгуров Кериян из деревни Дарья Бойи округа Юйтян (Керия), Синьцзян, и J2a1 (L26 / Page55 / PF5110 / S57, L27 / PF5111 / S396) в 3,95% (3/76) и J2a2 (L581 / S398) в 3,95% (3/76) выборки доланских уйгуров из городка Хорикол округа Ават, Синьцзян .[19]

Гаплогруппа издавна присутствует в Средней Азии и, по-видимому, предшествовала распространению ислама (Шоу 2010). Кроме того, непосредственный предок J-M172, а именно J * (J-M304 *, a.k.a. J-P209 *, J-12f2.1 *) также встречается среди Xibo, Казахский, Дунсян и Узбекский люди в Северо-Западном Китае.

В 2015 году два древних образца, принадлежащие J-M172 или J-M410 (J2a), были обнаружены в двух разных археологические сайты в Алтай, восточная Россия: Кытманово и Сары-бел курган. Оба древних образца относятся к Железный век культур на Алтае. Сары-бел J2 / J2a датируется 50 г. до н.э., а образец Кытманово датируется 721-889 гг. Анализ генетических примесей этих образцов также предполагает, что люди были более тесно связаны с Западные евразийцы чем другие Алтайцы того же периода, хотя они, кажется, тоже связаны с современными Тюркские народы региона.[20][21][22]

Европа

Страна / регионОтбор пробNJ-M172Изучать
Албания5519.9%
11/55
Батталья 2009
Босния и ГерцеговинаСербы818.7Батталья 2009
Кипр16412.9Эль-Сибай 2009
ГрецияКрит14335Эль-Сибай 2009
Иберия6557Фрегель 2009
Иберия11407.7Адамс 2008
ИталияСицилия21222.6Эль-Сибай 2009
ИталияМатерик69920Капелли 2007
ИталияЦентральный Марке5935.6Капелли 2007
ИталияЗападная Калабрия5735.1Капелли 2007
ИталияВаль Бадиа348.8Капелли 2007
Мальта9021.1Эль-Сибай 2009
ПортугалияСевер, Центр, Юг3036.9Эль-Сибай 2009
ПортугалияТрас-ос-Монтес (евреи)5724.5Ногейро 2010
Сардиния819.9Эль-Сибай 2009
ИспанияМайорка628.1Эль-Сибай 2009
ИспанияСевилья1557.8Эль-Сибай 2009
ИспанияЛеон605Эль-Сибай 2009
ИспанияИбица543.7Эль-Сибай 2009
ИспанияКантабрия702.9Эль-Сибай 2009
ИспанияГалиция29213Брион 2004
ИспанияКанарские острова65210.5Фрегель 2009

В Европа, частота гаплогруппы J-M172 падает по мере продвижения на север от Средиземноморье. В Италия, J-M172 встречается с региональными частотами в диапазоне от 9% до 36% (Капелли 2007). В Греция, он встречается с региональными частотами в диапазоне от 10% до 48%. Согласно недавнему исследованию, примерно 24% турецких мужчин имеют J-M172 (Cinnioglu 2004) с региональными частотами от 13% до 40% (Семино 2000). В сочетании с J-M267, до половины населения Турции принадлежит к Гаплогруппа J-P209.

Было высказано предположение, что подклад гаплогруппы J-M410 был связан с популяциями на древнем Крите путем изучения взаимосвязи между Анатолийский, Критский, и Греческий популяции со стоянок раннего неолита на Крите. Гаплогруппа J-M12 была связана с Неолит Греция (ок. 8500 - 4300 г. до н.э.) и, как сообщается, были обнаружены на современном Крите (3,1%) и материковой Греции (Македония 7.0%, Фессалия 8.8%, Арголида 1.8%) (Король 2008).

Северный Кавказ

Страна / регионОтбор пробNJ-M172Изучать
КавказАбхазский5813.8Балановский 2011
КавказАварский1156Балановский 2011
КавказЧеченский33057Балановский 2011
КавказЧеркесы14221.8Балановский 2011
КавказДаргинс1011Балановский 2011
КавказИнгуш14388.8Балановский 2011
КавказКайтак333Балановский 2011
КавказКумыки7321Юнусбаев 2011
КавказКубачи650Балановский 2011
КавказЛезгины812.5Балановский 2011
КавказОсетины35716Балановский 2011
КавказШапсуг1006Балановский 2011
Кавказ152528.1Балановский 2011

J-M172 обнаруживается на очень высоких частотах в некоторых народы из Кавказ: среди Ингуш 87.4% (Балановский 2011), Чеченцы 55.2% (Балановский 2011), Грузины 21%-72%, (Уэллс 2001), Азербайджанцы 24% (Ди Джакомо 2004)-48%, (Уэллс 2001) Абхазский 25%, (Насидзе 2004 г.) Балкарцы 24% (Батталья 2008), Осетины 24% (Насидзе 2004 г.), Армяне 21% (Уэллс 2001)-24% (Насидзе 2004 г.), Черкесы 21.8% (Балановский 2011), и другие группы ( Насидзе 2004 г. и Насидзе 2003).

Западная Азия

Страна / регионОтбор пробNJ-M172Изучать
ЕврейскийАшкенази евреи44219Бехар 2004
Иран9225Эль-Сибай 2009
Ирак15424Аль-Захери 2011[23]
ИзраильАкка10118.6Эль-Сибай 2009
Иордания27314.6Эль-Сибай 2009
Ливан95129.4Эль-Сибай 2009
Оман12110.0Абу-Амеро 2009
Пакистан17611.9Абу-Амеро 2009
ПакистанЧитральский районFirasat 2007
Катар728.3Эль-Сибай 2009
Саудовская Аравия15714Абу-Амеро 2009[24]
СирияСирия55420.8Эль-Сибай 2009
индюк52324.2Эль-Сибай 2009
ОАЭ16410.3Эль-Сибай 2009
Йемен629.6Эль-Сибай 2009

У сефардских евреев около 15% (Небель 2001)-29% (Семино 2004), гаплогруппы J-M172, а евреи-ашкенази имеют 15% (Шен 2004)-23% (Семино 2004). Об этом сообщалось в раннем исследовании, в котором тестировалось только четыре маркера STR (Маласпина 2001) что небольшой образец итальянского Коэнс принадлежал к сети 1.2, раннему обозначению всей клады, теперь известной как J-L26, определяемой делецией в DYS413. Однако большое количество всех еврейских коэнов в мире принадлежит к гаплогруппе J-M267 (см. Модальный гаплотип Коэна).

Было показано, что гаплогруппа J-M172 имеет более северное распространение на Ближнем Востоке, хотя она существует в значительных количествах в южных регионах Ближнего Востока, меньшее ее количество было обнаружено по сравнению с ее братской гаплогруппой, J-M267, который имеет высокую частоту распространения в южном направлении. Считалось, что исходная популяция J-M172 происходила из Леванта / Сирии (Syrid-J-M172), и что его появление среди современного населения Европы, Центральной Азии и Южной Азии было признаком неолитических земледельцев.Однако, как уже говорилось, сейчас считается, что оно, скорее всего, было распространено волнами в результате постнеолитических процессов.

Южная Азия

Гаплогруппа J2 присутствует в Южная Азия в основном как J2a-M410 и J2b-M102, начиная со времен неолита (9500 YBP).[25][26]J2-M172 оказался значительно выше среди Дравидийский каст на 19%, чем среди Индоевропейский каст на 11%. J2-M172 и J-M410 встречаются 21% среди Дравидийский средние касты, за которыми следуют высшие касты - 18,6% и низшие - 14%.[27] Среди кастовых групп самая высокая частота J2-M172 наблюдалась среди тамильских Веллаларс Южной Индии - 38,7%.[27] J2 присутствует и у индейских племен, а у австро-азиатских племен его частота составляет 11%. Среди австро-азиатских племен преобладающие J2 происходит в Асур племя (77,5%), хотя и с размером выборки 40[25] и в Лодха (35%) из Западная Бенгалия.[27] J2 также присутствует в Южной Индии. горное племя Тода на уровне 38,46%, хотя размер выборки всего 26,[28] в Племя андх из Телангана на 35,19%,[29] в Нарикуравар племя на 57,9%[25] и в Племя кол из Уттар-Прадеш с частотой 33,34%.[30] Гаплогруппа J-P209 оказалась более распространенной в Индии. Мусульмане-шииты, из которых 28,7% принадлежат гаплогруппе J, 13,7% - J-M410, 10,6% - J-M267 и 4,4% - J2b (Eaaswarkhanth 2009).

В Пакистан, самые высокие частоты J2-M172 наблюдались среди Парсы при 38,89% Дравидийский Говорящий Брахуи на 28,18% и Макрани Белуджи на 24%.[31] Это также встречается в 18,18% в Макрани Сиддис и на 3% в Карнатака Сиддис.[31][32]

J2-M172 встречается с общей частотой 16,1% у людей Шри-Ланка.[33] На Мальдивах 22% мальдивского населения оказались положительными по гаплогруппе J2.[34] Субклады M172, такие как M67 и M92, не были обнаружены ни в индийских, ни в пакистанских образцах, что также может указывать на частичное общее происхождение.[27]

Распределение субкладов

Гаплогруппа J-M172 подразделяется на две взаимодополняющие подгаплогруппы: J-M410, определяемый M410 генетический маркер, и J-M12, определяемый M12 генетический маркер.

J-M172

J-M172 типичен для популяций Ближний Восток, Южная Европа, Юго-Западная Азия и Кавказ, с умеренным распространением по большей части Центральная Азия, Южная Азия, и Северная Африка.[нужна цитата]

J-M410

J-M410 * находится в Грузия, Северная Осетия.[нужна цитата]

J-M47

J-M47 встречается с низкой частотой в Грузия, (Батталья 2008) южный Иран (Регейро 2006), Катар (Кадены 2008) Саудовская Аравия (АбуАмеро 2009), Сирия (Ди Джакомо 2004), Тунис (Арреди 2004), индюк (Ди Джакомо 2004 и Cinnioglu 2004), ОАЭ, (Кадены 2008), и Центральная Азия/Сибирь (Андерхилл 2000).

J-M67

J-M67 (в более ранних статьях называемый J2f) имеет самые высокие частоты, связанные с Нахские народы. С очень высокой (большей) частотой встречались ингуши в Малгобеке (87,4%), чеченцы в Дагестане (58%), чеченцы в Чечне (56,8%) и чеченцы в Малгобеке, Ингушетия (50,9%) (Балановский 2011). На Кавказе он встречается значительно чаще среди грузин (13,3%) (Семино 2004), Железные осетины (11,3%), балкарцы Южного Кавказа (6,3%) (Семино 2004), Дигорские осетины (5,5%), абхазы (6,9%) и черкесы (5,6%) (Балановский 2011). Он также довольно часто встречается в Средиземноморье и на Ближнем Востоке, включая критян (10,2%), северо-центральных итальянцев (9,6%), южных итальянцев (4,2%; только 0,8% среди северных итальянцев), анатолийских турок (2,7%). 5,4%), греки (4-4,3%), албанцы (3,6%), евреи-ашкенази (4,9%), сефарды (2,4%), каталонцы (3,9%), андалузцы (3,2%), калабрийцы (3,3%), албанцы Калабрийцы (8,9%) (см. Ди Джакомо 2004 и Семино 2004).

J-M92 / M260, субклад J-M67, был обнаружен у 25,64% (10/39) выборки кериянских уйгуров из деревни Дарья Бойи округа Ютянь (Керия), Синьцзян.[19] Эта уйгурская деревня расположена в удаленном оазисе в Пустыня Такламакан.

J-M319

J-M319 встречается с низкой или средней частотой в Критский Греки (Мартинес 2007 и Король 2008), Иракские евреи (Шен 2004), и Марокканские евреи (Шен 2004).

J-M158

J-M158 (местоположение под L24 не определено) J-M158 обнаруживается с низкой частотой в индюк (Cinnioglu 2004), Южная Азия (Сенгупта 2006 и Андерхилл 2000), Индокитай (Андерхилл 2000), и Пиренейский полуостров.

Филогенетика

В филогенетике Y-хромосомы субклады являются ветвями гаплогрупп. Эти субклады также определяются однонуклеотидными полиморфизмами (SNP) или уникальными полиморфизмами событий (UEP).

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)(α)(β)(γ)(δ)(е)(ζ)(η)YCC 2002 (от руки)YCC 2005 (от руки)YCC 2008 (от руки)YCC 2010r (от руки)ISOGG 2006ISOGG 2007ISOGG 2008ISOGG 2009ISOGG 2010ISOGG 2011ISOGG 2012
J-12f2a9VIMed23Eu10H4BJ *JJJ------J
J-M629VIMed23Eu10H4BJ1J1aJ1aJ1a------Частный
J-M1729VIMed24Eu9H4BJ2 *J2J2J2------J2
J-M479VIMed24Eu9H4BJ2aJ2aJ2a1J2a4a------J2a1a
J-M689VIMed24Eu9H4BJ2bJ2bJ2a3J2a4c------J2a1c
J-M1379VIMed24Eu9H4BJ2cJ2cJ2a4J2a4h2a1------J2a1h2a1a
J-M1589VIMed24Eu9H4BJ2dJ2dJ2a5J2a4h1------J2a1h1
J-M129VIMed24Eu9H4BJ2e *J2eJ2bJ2b------J2b
J-M1029VIMed24Eu9H4BJ2e1 *J2e1J2bJ2b------J2b
J-M999VIMed24Eu9H4BJ2e1aJ2e1aJ2b2aJ2b2a------Частный
J-M679VIMed24Eu9H4BJ2f *J2fJ2a2J2a4b------J2a1b
J-M929VIMed24Eu9H4BJ2f1J2f1J2a2aJ2a4b1------J2a1b1
J-M1639VIMed24Eu9H4BJ2f2J2f2J2a2bJ2a4b2------Частный

Научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

Филогенетические деревья

Существует несколько подтвержденных и предполагаемых филогенетических деревьев, доступных для гаплогруппы J-M172. Научно принятый - это консорциум Y-хромосомы (YCC), опубликованный в Karafet 2008 и впоследствии обновленный. Черновик дерева, который показывает развивающуюся науку, предоставил Томас Кран из Центра геномных исследований Хьюстон, Техас. Международное общество генетической генеалогии (ISOGG) также предоставляет любительское дерево.[Филогенетика 3][Филогенетика 4]

Чертеж дерева Центра геномных исследований

Это Томас Кран из черновика дерева Центра геномных исследований. Предлагаемое дерево для гаплогруппы J-M172 (Krahn и FTDNA 2013). Для краткости показаны только первые три уровня субкладов.

  • M172, L228
    • M410, L152, L212, L505, L532, L559
      • PF5008
        • Y182822
          • L581
            • Z37823
      • PF4610
        • Z6046
        • L26
    • М12, М102, М221, М314, L282
      • M205
      • M241
        • M99
        • M280
        • M321
        • P84
        • L283

Дерево Консорциума Y-хромосомы

Это официальное научное дерево, созданное Консорциумом Y-хромосомы (YCC). Последнее крупное обновление было в 2008 г. (Карафет 2008). Последующие обновления производились ежеквартально и раз в два года. Текущая версия является переработкой обновления 2010 года.[35]

Дерево ISOGG

Ниже приведены субклады гаплогруппы J-M172 с их определяющей мутацией, согласно дерево ISOGG (по состоянию на февраль 2018 г.). Обратите внимание, что идентификаторы на основе происхождения могут быть изменены, поскольку обнаруживаются новые SNP, которые дополняют и дополнительно уточняют дерево. Для краткости показаны только первые три уровня субкладов.

  • J2 M172 / Страница 28 / PF4908, L228 / PF4895 / S321
    • J2a M410, L152, L212 / PF4988, L559 / PF4986
      • J2a1 DYS413≤18, L26 / Страница55 / PF5110 / S57, F4326 / L27 / PF5111 / S396
        • J2a1a M47, M322
        • J2a1b M67 / PF5137 / S51
        • J2a1c M68
        • J2a1d M319
        • J2a1e M339
        • J2a1f M419
        • J2a1g P81 / PF4275
        • J2a1h L24 / S286, L207.1
        • J2a1i L88.2, L198
      • J2a2 L581 / PF5026 / S398
        • J2a2a P279 / PF5065
    • J2b L282, M12, M102, M221, M314 / PF4939
      • J2b1 M205
      • J2b2 M241
        • J2b2a L283

Смотрите также

Генетика

Y-ДНК J Субклады

Основное дерево Y-ДНК

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам"
A00A0-T [χ 3]
A0A1 [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я  J    LT [χ 5]      K2 [χ 6]
L    Т   K2a [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п [χ 12]
НЕТ  S [χ 13] M [χ 14]   P1    P2
NОQр

Рекомендации

  1. ^ а б «Архивная копия». В архиве из оригинала на 2019-06-18. Получено 2019-09-27.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
  2. ^ Степень дифференциации Hg J, наблюдаемая как с двуаллельными, так и с микросателлитными маркерами, указывает на Ближний Восток как на его вероятную родину. В этой области J-M172 и J-M267 представлены в равной степени и демонстрируют самую высокую степень внутренней изменчивости, указывая на то, что наиболее вероятно, что эти субклады также возникли на Ближнем Востоке. (Ди Джакомо 2004)
  3. ^ Шоу, Вэй-Хуа; Цяо, Эн-Фа; Вэй, Чуань-Ю; Донг, Юн-Ли; Тан, Си-Цзе; Ши, Хун; Тан, Вен-Ру; Сяо, Чун-Цзе (23 апреля 2010 г.). «Распределение Y-хромосомы среди населения Северо-Западного Китая указывает на значительный вклад скотоводов из Центральной Азии и меньшее влияние западных евразийцев». Журнал генетики человека. 55 (5): 314–322. Дои:10.1038 / jhg.2010.30. PMID 20414255.
  4. ^ Haber M, Platt DE, Ashrafian Bonab M, Youhanna SC, Soria-Hernanz DF, Martínez-Cruz B, et al. (2012). «Этнические группы Афганистана разделяют наследие Y-хромосомы, структурированное историческими событиями». PLOS ONE. 7 (3): e34288. Bibcode:2012PLoSO ... 734288H. Дои:10.1371 / journal.pone.0034288. ЧВК 3314501. PMID 22470552.
  5. ^ К. Капелли, Н. Рыжая, В. Романо и другие., "Структура населения в бассейне Средиземного моря: перспектива хромосомы Y", Анналы генетики человека (2005)
  6. ^ "Гаплогруппа Y в Иране Альфреда А. Абурто-младшего". В архиве с оригинала от 13.10.2012. Получено 2014-04-06.
  7. ^ а б c "Трофимова Наталья Вадимовна, ИЗМЕНЧИВОСТЬ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК И Y-ХРОМОСОМЫВ ПОПУЛЯЦИЯХ ВОЛГО-УРАЛЬСКОГО РЕГИОНА, 03.02.07" (PDF). Архивировано из оригинал (PDF) на 2015-01-14. Получено 2015-01-07.
  8. ^ Генетическое исследование, проведенное Firasat (2007) на особях калашей, обнаружило высокие и разнообразные частоты.
  9. ^ а б Заллуа и Уэллс: журнал National Geographic, октябрь 2004 г. [1] В архиве 2014-04-07 в Wayback Machine и [2] В архиве 2012-02-10 в Wayback Machine.
  10. ^ а б "Н. Аль-Захери и др." Полиморфизм Y-хромосомы и мтДНК в Ираке, перекресток раннего расселения людей и постнеолитических миграций "(2003)" (PDF). Семейное древо ДНК. Архивировано из оригинал (PDF) 27 декабря 2010 г.. Получено 1 сентября 2013.
  11. ^ Batini C, Hallast P, Zadik D, Delser PM, Benazzo A, Ghirotto S и др. (Май 2015 г.). «Недавнее крупномасштабное расширение отцовства в Европе, показанное повторным упорядочиванием населения». Nature Communications. 6: 7152. Bibcode:2015 НатКо ... 6.7152B. Дои:10.1038 / ncomms8152. ЧВК 4441248. PMID 25988751.
  12. ^ а б Семино О., Магри С., Бенуцци Дж., Лин А.А., Аль-Захери Н., Батталья В. и др. (Май 2004 г.). "Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморском регионе". Американский журнал генетики человека. 74 (5): 1023–34. Дои:10.1086/386295. ЧВК 1181965. PMID 15069642.
  13. ^ «Архивная копия». В архиве из оригинала 2020-04-23. Получено 2020-05-11.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
  14. ^ Джонс Э. Р., Гонсалес-Фортес Г., Коннелл С., Сиска В., Эрикссон А., Мартиниано Р. и др. (Ноябрь 2015 г.). «Геномы верхнего палеолита раскрывают глубокие корни современных евразийцев». Nature Communications. 6: 8912. Bibcode:2015 НатКо ... 6.8912J. Дои:10.1038 / ncomms9912. ЧВК 4660371. PMID 26567969.
  15. ^ Лазаридис, Иосиф; Надел, Дэни; Роллефсон, Гэри; Merrett, Deborah C .; Роланд, Надин; Маллик, Свапан; Фернандес, Даниэль; Новак, Марио; Гамарра, Беатрис; Сирак, Кендра; Коннелл, Сара; Стюардсон, Кристин; Харни, Иадаоин; Фу, Цяомэй; Гонсалес-Фортес, Глория; Джонс, Эппи Р .; Роденберг, Сонгюль Альпаслан; Лендьель, Дьёрдь; Боккантин, Фанни; Гаспарян, Борис; Monge, Janet M .; Грегг, Майкл; Эшед, Веред; Мизрахи, Ахува-Сиван; Мейкледжон, Кристофер; Герритсен, Фокке; Бедженару, Люминита; Блюхер, Маттиас; Кэмпбелл, Арчи; Каваллери, Джанпьеро; Комас, Дэвид; Фрогель, Филипп; Гилберт, Эдмунд; Керр, Шона М .; Ковач, Питер; Краузе, Йоханнес; МакГеттиган, Даррен; Мерриган, Майкл; Мерриуэзер, Д. Эндрю; О'Рейли, Симус; Richards, Martin B .; Семино, Орнелла; Шамун-Пур, Мишель; Стефанеску, Георге; Штумволл, Майкл; Тоньес, Анке; Торрони, Антонио; Уилсон, Джеймс Ф .; Йенго, Лоик; Оганесян, Нелли А .; Паттерсон, Ник; Пинхаси, Рон; Райх, Дэвид (август 2016 г.). «Геномное понимание происхождения сельского хозяйства на древнем Ближнем Востоке». Природа. 536 (7617): 419–424. Bibcode:2016Натура.536..419L. Дои:10.1038 / природа19310. ЧВК 5003663. PMID 27459054.
  16. ^ Аль-Захери, Н. (2003). «Полиморфизмы Y-хромосомы и мтДНК в Ираке, перекресток раннего расселения людей и постнеолитических миграций». Молекулярная филогенетика и эволюция. 28 (3): 458–72. Дои:10.1016 / с1055-7903 (03) 00039-3. PMID 12927131.
  17. ^ Небель А., Филон Д., Бринкманн Б., Маджумдер П.П., Фаерман М., Оппенгейм А. (ноябрь 2001 г.). «Пул Y-хромосомы евреев как часть генетического ландшафта Ближнего Востока». Американский журнал генетики человека. 69 (5): 1095–1112. Дои:10.1086/324070. ЧВК 1274378. PMID 11573163. См. Особенно рисунок 6. Семино 2000 является источником, который также утверждает, что Eu 9 происходит от Eu 10 (Eu 10 - это другой подклад Гаплогруппа J (мтДНК)).
  18. ^ Ди Джакомо Ф., Лука Ф., Попа Л.О., Акар Н., Ананьоу Н., Банико Дж. И др. (2004). «Y-хромосомная гаплогруппа J как признак постнеолитической колонизации Европы». Генетика человека. 115 (5): 357–71. Дои:10.1007 / s00439-004-1168-9. PMID 15322918. S2CID 18482536.
  19. ^ а б LIU Shuhu, NIZAM Yilihamu, RABIYAMU Bake, ABDUKERAM Bupatima и DOLKUN Matyusup, «Исследование генетического разнообразия трех изолированных популяций в Синьцзяне с использованием Y-SNP». Acta Anthropologica Sinica, 2018, 37(1): 146-156.
  20. ^ Аллентофт; и другие. (2015). «Популяционная геномика Евразии бронзового века». Природа. 522 (7555): 167–172. Bibcode:2015Натура.522..167A. Дои:10.1038 / природа14507. PMID 26062507. S2CID 4399103. В архиве из оригинала на 2020-02-04. Получено 2020-01-21.
  21. ^ К. Роттенштайнер, J2a2-PH3085, SK1403: Древний Алтай, современные уйгурские и турецкие В архиве 2015-06-26 на Wayback Machine, J2-M172 Исследование гаплогруппы.
  22. ^ Ф. Иммануэль, Коды для результатов Gedmatch, Страница древней ДНК В архиве 2015-09-05 в Wayback Machine, F999962 для RISE504, образец Кытманово и F999965 для RISE602, образец Сары-бел.
  23. ^ Аль-Захери и др., 2011 г., Дополнительный файл 3. Абсолютные частоты гаплогрупп и субгаплогрупп Y-хромосомы в 48 популяциях, включенных в PCA. В архиве 2015-11-06 в Wayback Machine Примечание: только 37 из 154 образцов (24%) являются J2 в Ираке согласно списку Аль-Захери 2011. 43,6% - это частота J2 среди всех иракцев гаплогруппы J, а не всех гаплогрупп.
  24. ^ Абу-Амеро (2009), Разнообразие Y-хромосомы Саудовской Аравии и его связь с соседними регионами В архиве 2017-04-03 в Wayback Machine, Цитата: самые распространенные гаплогруппы в Саудовской Аравии: J1-M267 (42%), J2-M172 (14%), E1-M2 (8%), R1-M17 (5%) и K2-M184 (5%). также хорошо представлены в других арабских популяциях (Таблица (Table1) .1).
  25. ^ а б c Сингх С., Сингх А., Раджкумар Р., Сампат Кумар К., Кадаркарай Сами С., Низамуддин С. и др. (Январь 2016 г.). «Рассмотрение влияния неолитической демической диффузии на индийский пул Y-хромосомы через гаплогруппу J2-M172». Научные отчеты. 6: 19157. Bibcode:2016НатСР ... 619157С. Дои:10.1038 / srep19157. ЧВК 4709632. PMID 26754573.
  26. ^ Эррера, Рене Дж .; Гарсия-Бертран, Ральф (2018). ДНК предков, происхождение человека и миграции. Академическая пресса. п. 250. ISBN 978-0-12-804128-4.
  27. ^ а б c d Сенгупта С., Животовский Л.А., Кинг Р., Мехди С.К., Эдмондс С.А., Чоу С.Э. и др. (Февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии позволяют идентифицировать как местные, так и экзогенные экспансии и выявлять незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Американский журнал генетики человека. 78 (2): 202–21. Дои:10.1086/499411. ЧВК 1380230. PMID 16400607.
  28. ^ Арункумар Г., Сориа-Эрнанц Д.Ф., Кавита В.Дж., Арун В.С., Шьяма А., Ашокан К.С. и др. (2012). «Дифференциация населения южноиндийских мужских линий коррелирует с расширением сельского хозяйства, предшествовавшим кастовой системе». PLOS ONE. 7 (11): e50269. Bibcode:2012PLoSO ... 750269A. Дои:10.1371 / journal.pone.0050269. ЧВК 3508930. PMID 23209694.
  29. ^ Thanseem I, Thangaraj K, Chaubey G, Singh VK, Bhaskar LV, Reddy BM и др. (Август 2006 г.). «Генетическое родство среди низших каст и племенных групп Индии: вывод из Y-хромосомы и митохондриальной ДНК». BMC Genetics. 7: 42. Дои:10.1186/1471-2156-7-42. ЧВК 1569435. PMID 16893451.
  30. ^ Шарма С., Рай Э., Шарма П., Джена М., Сингх С., Дарвиши К. и др. (Январь 2009 г.). «Индийское происхождение отцовской гаплогруппы R1a1 * подтверждает автохтонное происхождение браминов и кастовой системы». Журнал генетики человека. 54 (1): 47–55. Дои:10.1038 / jhg.2008.2. PMID 19158816.
  31. ^ а б Камар Р., Аюб К., Мохюддин А. и др. (Май 2002 г.). «Вариация Y-хромосомной ДНК в Пакистане». Являюсь. J. Hum. Genet. 70 (5): 1107–24. Дои:10.1086/339929. ЧВК 447589. PMID 11898125.
  32. ^ Шах А.М., Таманг Р., Мурджани П., Рани Д.С., Говиндарадж П., Кулкарни Г., Бхаттачарья Т., Мустак М.С., Бхаскар Л.В., Редди А.Г., Гадви Д., Гай ПБ, Чаубей Г., Паттерсон Н., Райх Д., Тайлер-Смит К., Сингх Л., Тангарадж К. (2011). "Индийские сидди: потомки африканцев с индийской примесью". Являюсь. J. Hum. Genet. 89 (1): 154–61. Дои:10.1016 / j.ajhg.2011.05.030. ЧВК 3135801. PMID 21741027.
  33. ^ «Генетика языка и земледелия в Индии» (PDF). В архиве (PDF) из оригинала от 19.02.2006. Получено 2017-01-27. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  34. ^ "Предки мальдивских островитян в свете популяционной генетики: Мальдивские предки в свете генетики". 24 мая 2013 года. В архиве из оригинала 29 октября 2013 г.. Получено 6 августа, 2016.
  35. ^ "Y-ДНК Haplotree". В архиве из оригинала 27.01.2013. Получено 2013-01-05. Family Tree DNA использует дерево Y-хромосомы Консорциума и размещает его на своем веб-сайте.

Библиография

  1. ^ [1]
  2. ^ Небель А., Филон Д., Бринкманн Б., Маджумдер П.П., Фаерман М., Оппенгейм А. (2001). «Пул Y-хромосомы евреев как часть генетического ландшафта Ближнего Востока». Являюсь. J. Hum. Genet. 69 (5): 1095–112. Дои:10.1086/324070. ЧВК 1274378. PMID 11573163.
  3. ^ Маласпина П., Цопаномичалоу М., Думан Т., Стефан М., Сильвестри А., Ринальди Б. и др. (2001). «Многоступенчатый процесс распространения линии Y-хромосомы в Средиземноморье» (PDF). Анна. Гм. Genet. 65 (Pt 4): 339–49. Дои:10.1046 / j.1469-1809.2001.6540339.x. HDL:2108/44448. PMID 11592923. S2CID 221448190.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам"
A00A0-T [χ 3]
A0A1 [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я  J    LT [χ 5]      K2 [χ 6]
L    Т   K2a [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п [χ 12]
НЕТ  S [χ 13] M [χ 14]   P1    P2
NОQр

Филогенетические заметки

  1. ^ В этой таблице показаны исторические названия J-M172 в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 является субкладом 23.
    YCC 2002/2008 (стенография)J-M172
    Джоблинг и Тайлер-Смит 20009
    Андерхилл 2000VI
    Молот 2001Med
    Карафет 200124
    Семино 2000Eu9
    Вс 1999H4
    Капелли 2001B
    YCC 2002 (от руки)J2 *
    YCC 2005 (от руки)J2
    YCC 2008 (от руки)J2
    YCC 2010r (от руки)J2
  2. ^ В этой таблице показаны исторические названия для J-P209 (AKA J-12f2.1 или J-M304) в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 является субкладом 23.
    YCC 2002/2008 (стенография)J-P209
    (AKA J-12f2.1 или J-M304)
    Джоблинг и Тайлер-Смит 20009
    Андерхилл 2000VI
    Молот 2001Med
    Карафет 200123
    Семино 2000Eu10
    Вс 1999H4
    Капелли 2001B
    YCC 2002 (от руки)J *
    YCC 2005 (от руки)J
    YCC 2008 (от руки)J
    YCC 2010r (от руки)J
  3. ^ "ISOGG 2018 Y-ДНК гаплогруппа J". www.isogg.org. В архиве из оригинала от 18.08.2017. Получено 2010-04-11.
  4. ^ «Архивная копия». В архиве из оригинала от 24.09.2010. Получено 2010-12-27.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
  1. ^ Ренфрю AC (1998). Археология и язык: загадка индоевропейского происхождения (Pimlico ed.). Лондон: Пимлико. ISBN 978-0-7126-6612-1.