WikiDer > Гаплогруппа митохондриальной ДНК человека
В генетика человека, а гаплогруппа митохондриальной ДНК человека это гаплогруппа определяется различиями в митохондриальная ДНК человека. Гаплогруппы используются для обозначения основных точек ветвления на митохондриальном филогенетическом дереве. Понимание эволюционного пути женского происхождения помогло популяционным генетикам проследить по материнской линии наследование современного человека обратно к человеческому происхождению в Африка и последующее распространение по всему миру.
Буквенные названия гаплогрупп (не только гаплогрупп митохондриальной ДНК) идут от А до Я. Поскольку гаплогруппы были названы в порядке их открытия, алфавитный порядок не имеет никакого значения с точки зрения реальных генетических отношений.
Гипотетическая женщина в основе всех этих групп (имеется в виду только гаплогруппы митохондриальной ДНК) - это по материнской линии самый последний общий предок (MRCA) за все живущие сейчас люди. Ее обычно называют Митохондриальная Ева.
Скорость мутации митохондриальной ДНК известна как митохондриальные молекулярные часы. Это область продолжающихся исследований, в одном исследовании сообщается об одной мутации за 8000 лет.[2]
Филогения
Часть серия на |
Генетическая генеалогия |
---|
Концепции |
похожие темы |
Это филогенетическое древо основано Ван Овеном (2009).[4]
Хронология
Гаплогруппа | Стандартное восточное время. время отправления (кя)[5] | Возможное место происхождения | Самые высокие частоты |
---|---|---|---|
L | 200 | ||
L1-6 | 170 | Восточная Африка | |
L2-6 | 150 | Восточная Африка | |
L0 | 150 | Восточная Африка | |
L1 | 140 | Центральная Африка | |
L3-6 | 130 | ||
L5 | 120 | ||
L2 | 90 | ||
L3 | 70 | Восточная Африка | |
N | 70 | Восточная Африка или Западная Азия | |
M | 60 | Восточная Африка, Западная Азия или Южная Азия | |
р | 60 | ||
U | 55 | Северо-Восточная Африка или Индия (Южная Азия) | |
RT'JT | 55 | Средний Восток | |
JT | 50 | Средний Восток | |
U8 | 50 | Западная Азия | |
R9 | 47 | ||
B4 | 44 | ||
F | 43 | ||
U4'9 | 42 | Центральная Азия | |
U5 | 35 | Западная Азия | |
U6 | 35 | Северная Африка | |
J | 35 | ||
Икс | 30 | ||
K | 30 | ||
U5a | 27 | ||
HV | 27 | Ближний Восток | |
J1a | 27 | Ближний Восток | |
Т | 27 | Месопотамия | |
K1 | 27 | ||
я | 26 | ||
J1 | 24 | Ближний Восток | |
W | 20 | ||
U4 | 20 | Центральная Азия | |
X2 | 20 | ||
ЧАС | 20 | Западная Азия | |
U5a1 | 18 | Европа | |
J1b | 11 | ||
V | 14 | ||
X2a | 13 | Северная Америка | |
H1 | 12 | ||
H3 | 12 | ||
X1 | 10 |
Географическое распределение
В документе 2004 года было высказано предположение, что наиболее распространенными гаплогруппами в современных европейских популяциях были: H, J, K, N1, T, U4, U5, V, X и W.[6]
Африканские гаплогруппы: L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, T, U5a
Австралийские гаплогруппы: M42a, M42c, M14, M15, Q, S, O, N, P. (ссылки 1, 2, 3, 4, 5, 6)
Азиатские гаплогруппы: F, C, W, M, D, N, K, U, T, A, B, C, Z, U множество вариантов номеров для каждого раздела
Смотрите также
- Митохондриальная генетика человека
- Генетическая генеалогия
- Матрилинейность
- Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы человека
- Популяционная генетика
Рекомендации
- ^ Ришишвар Л., Джордан И.К. (2017). «Последствия эволюции человека и добавки для митохондриальной заместительной терапии». BMC Genomics. 18 (1): 140. Дои:10.1186 / s12864-017-3539-3. ЧВК 5299762. PMID 28178941.
- ^ Лоогвали, Ева-Лиис; Кивисилд, Тоомас; Маргус, Тыну; Виллемс, Ричард (2009), О'Рурк, Деннис (редактор), «Объяснение несовершенства молекулярных часов митохондрий гоминидов», PLOS ONE, 4 (12): e8260, Bibcode:2009PLoSO ... 4.8260L, Дои:10.1371 / journal.pone.0008260, ЧВК 2794369, PMID 20041137
- ^ Кивисилд Т (2015). «Материнское происхождение и история популяции из целых митохондриальных геномов». Исследование Genet. 6: 3. Дои:10.1186 / s13323-015-0022-2. ЧВК 4367903. PMID 25798216.
- ^ а б ван Овен М., Кайзер М. (февраль 2009 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация. 30 (2): E386–94. Дои:10.1002 / humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749.
- ^ «Поправка на очищающий отбор: Дополнение к усовершенствованным митохондриальным молекулярным часам человека» (PDF). 2009: 82–83 [89]. Архивировано из оригинал (PDF) на 2009-12-29. Цитировать журнал требует
| журнал =
(помощь) - ^ Виллемс, Ричард; Усанга, Эсиен; Микерези, Илья; Гельге, Мукаддес; Клаустр, Мирей; Michalodimitrakis, Emmanuel N .; Папа, Каллиопи I .; Anagnou, Николас П .; Шавентре, Андре; Мойзан, Жан-Поль; Ричард, Кристель; Гречанина, Елена; Балановская, Елена В .; Рудан, Павао; Пузырев, Валерий; Степанов, Вадим; Хуснутдинова, Эльза К .; Гусар, Владислава; Балановский, Олег П .; Перичич, Марияна; Барак, Ловорка; Голубенко, Мария; Лункина, Арина; Лаос, Сирль; Пеннарун, Эрван; Парик, Юри; Толк, Хелле-Вийви; Рейдла, Маэре; Тамбец, Кристина; Мецпалу, Эне; Кивисилд, Тоомас; Деренко, Мирослава В .; Малярчук, Борис А .; Роосталу, Урмас; Лоогвяли, Ева-Лийс (1 ноября 2004 г.). «Разъединяющая однородность: пестрый кладистический холст гаплогруппы H мтДНК в Евразии». Молекулярная биология и эволюция. 21 (11): 2012–2021. Дои:10.1093 / молбев / мш209. PMID 15254257 - через Acade.oup.com.
внешняя ссылка
Викискладе есть медиафайлы по теме Гаплогруппы мтДНК человека. |
- Митохондриальные филогенетические деревья
- Скелет митохондриальной гаплогруппы
- MitoTool: веб-сервер для анализа и получения вариаций последовательности митохондриальной ДНК человека
- HaploGrep: определение гаплогруппы мтДНК на основе PhyloTree.org
- HaploFind - быстрый конвейер автоматического назначения гаплогрупп для митохондриальной ДНК человека
Филогенетическое дерево гаплогруппы митохондриальной ДНК человека (мтДНК) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Митохондриальная Ева (L) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | грамм | Q | О | А | S | р | я | W | Икс | Y | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | pre-JT | п | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HV | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ЧАС | V | J | Т |