WikiDer > Корепрессор ядерного рецептора 1

Nuclear receptor co-repressor 1
NCOR1
Белок NCOR1 PDB 2EQR.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNCOR1, N-CoR, N-CoR1, PPP1R109, TRAC1, hN-CoR, корепрессор ядерного рецептора 1
Внешние идентификаторыOMIM: 600849 MGI: 1349717 ГомолоГен: 38166 Генные карты: NCOR1
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение NCOR1
Геномное расположение NCOR1
Группа17п12-п11.2Начинать16,029,157 бп[1]
Конец16,218,185 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NCOR1 200856 x at fs.png

PBB GE NCOR1 200854 at fs.png

PBB GE NCOR1 200855 at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001190438
NM_001190440
NM_006311

NM_001252313
NM_011308
NM_177229

RefSeq (белок)

NP_001177367
NP_001177369
NP_006302

н / д

Расположение (UCSC)Chr 17: 16.03 - 16.22 МбChr 11: 62.32 - 62.46 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

В корепрессор ядерного рецептора 1 также известный как корепрессор, связанный с рецепторами тироидных гормонов и ретиноевой кислоты 1 (ПРОФ-1) это белок что у людей кодируется NCOR1 ген.[5][6]

NCOR1 - это транскрипционный корегуляторный белок, содержащий несколько ядерный рецептор взаимодействующие домены. Вдобавок NCOR1, похоже, вербует гистоновые деацетилазы в промоторные области ДНК. Следовательно, NCOR1 помогает ядерным рецепторам подавлять экспрессию генов.[5][7]

Потеря функции этого белка значительно увеличивает силу и мощность мышц мыши.[8]

Семья

Он является членом семейства корепрессоров ядерных рецепторов; другой человеческий белок, который является членом этого семейства, Корепрессор ядерного рецептора 2.[9]

Взаимодействия

Корепрессор ядерного рецептора 1, как было показано, взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000141027 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018501 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Hörlein AJ, Näär AM, Heinzel T, Torchia J, Gloss B, Kurokawa R, Ryan A, Kamei Y, Söderström M, Glass CK (октябрь 1995 г.). «Лиганд-независимая репрессия рецептором гормона щитовидной железы, опосредованная корепрессором ядерного рецептора». Природа. 377 (6548): 397–404. Bibcode:1995Натура 377..397H. Дои:10.1038 / 377397a0. PMID 7566114. S2CID 4230850.
  6. ^ Ван Дж., Хосино Т., Реднер Р.Л., Каджигая С., Лю Дж. М. (сентябрь 1998 г.). «ETO, партнер слияния в остром миелоидном лейкозе t (8; 21), подавляет транскрипцию путем взаимодействия с человеческим комплексом N-CoR / mSin3 / HDAC1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (18): 10860–5. Bibcode:1998PNAS ... 95 10 860 Вт. Дои:10.1073 / пнас.95.18.10860. ЧВК 27986. PMID 9724795.
  7. ^ Ван Дж, Хосино Т., Реднер Р.Л., Кадзигая С., Лю Дж. М. (1998). «ETO, партнер слияния в остром миелоидном лейкозе t (8; 21), подавляет транскрипцию путем взаимодействия с человеческим комплексом N-CoR / mSin3 / HDAC1». Proc Natl Acad Sci USA. 95 (18): 10860–5. Bibcode:1998PNAS ... 95 10 860 Вт. Дои:10.1073 / пнас.95.18.10860. ЧВК 27986. PMID 9724795.
  8. ^ Ямамото Х., Уильямс Э. Г., Мучироуд Л., Канто С., Фан В., Доунс М., Элигон С., Бариш Г. Д., Десвернь Б., Эванс Р. М., Скунджанс К., Ауверкс Дж. (2011). «NCoR1 - консервативный физиологический модулятор мышечной массы и окислительной функции». Клетка. 147 (4): 827–839. Дои:10.1016 / j.cell.2011.10.017. ЧВК 3225739. PMID 22078881.
  9. ^ UniProt Семейство корепрессоров ядерных рецепторов Доступ к странице: 26 июня 2016 г.
  10. ^ Masiello D, Chen SY, Xu Y, Verhoeven MC, Choi E, Hollenberg AN, Balk SP (октябрь 2004 г.). «Рекрутирование бета-катенина диким типом или мутантными рецепторами андрогенов коррелирует с лиганд-стимулированным ростом клеток рака простаты». Мол. Эндокринол. 18 (10): 2388–401. Дои:10.1210 / me.2003-0436. PMID 15256534.
  11. ^ Песня LN, Coghlan M, Gelmann EP (январь 2004 г.). «Антиандрогенные эффекты мифепристона на взаимодействия коактиватора и корепрессора с рецептором андрогенов». Мол. Эндокринол. 18 (1): 70–85. Дои:10.1210 / me.2003-0189. PMID 14593076.
  12. ^ Ченг С., Брзостек С., Ли С.Р., Холленберг А.Н., Балк С.П. (июль 2002 г.). «Ингибирование дигидротестостерон-активируемого рецептора андрогена корепрессором ядерного рецептора». Мол. Эндокринол. 16 (7): 1492–501. Дои:10.1210 / исправление.16.7.0870. PMID 12089345.
  13. ^ Ходжсон М.К., Астапова И., Ченг С., Ли Л.Дж., Верховен М.С., Чой Э., Балк С.П., Холленберг А.Н. (февраль 2005 г.). «Рецептор андрогена рекрутирует ядерный рецептор CoRepressor (N-CoR) в присутствии мифепристона через его N- и C-концы, раскрывая новый молекулярный механизм действия антагонистов рецептора андрогенов». J. Biol. Chem. 280 (8): 6511–9. Дои:10.1074 / jbc.M408972200. PMID 15598662.
  14. ^ Тай Х. Х., Гейстерфер М., Белл Дж. К., Монива М., Дэви Дж. Р., Баучер Л., МакБерни М. В. (август 2003 г.). «CHD1 связывается с NCoR и гистондеацетилазой, а также с белками сплайсинга РНК». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 308 (1): 170–6. Дои:10.1016 / s0006-291x (03) 01354-8. PMID 12890497.
  15. ^ Пуччетти Э., Обрадович Д., Бейсерт Т., Бьянкини А., Уошберн Б., Кьярадонна Ф., Берер С., Хельцер Д., Оттманн О.Г., Пеличчи П.Г., Нерви С., Рутхардт М. (декабрь 2002 г.). «Продукты транслокации, связанные с AML, блокируют дифференцировку, вызванную витамином D (3), за счет секвестрации рецептора витамина D (3)». Рак Res. 62 (23): 7050–8. PMID 12460926.
  16. ^ Тагами Т., Лутц У.Х., Кумар Р., Джеймсон Дж. Л. (декабрь 1998 г.). «Взаимодействие рецептора витамина D с корепрессорами и коактиваторами ядерного рецептора». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 253 (2): 358–63. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9799. PMID 9878542.
  17. ^ а б c d е Чжан Дж., Калкум М., Чайт Б.Т., Рёдер Р.Г. (март 2002 г.). «Корепрессорный комплекс ядерного рецептора N-CoR-HDAC3 ингибирует путь JNK через интегральную субъединицу GPS2». Мол. Клетка. 9 (3): 611–23. Дои:10.1016 / с1097-2765 (02) 00468-9. PMID 11931768.
  18. ^ а б c d Юн Х.Г., Чан Д.В., Рейнольдс А.Б., Цинь Дж., Вонг Дж. (Сентябрь 2003 г.). «N-CoR опосредует репрессию, зависящую от метилирования ДНК, через метил-CpG-связывающий белок Kaiso». Мол. Клетка. 12 (3): 723–34. Дои:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID 14527417.
  19. ^ а б c d Юн Х.Г., Чан Д.В., Хуан Ц.К., Ли Дж., Фонделл Дж.Д., Цинь Дж., Вонг Дж. (Март 2003 г.). «Очистка и функциональная характеристика комплекса N-CoR человека: роли HDAC3, TBL1 и TBLR1». EMBO J. 22 (6): 1336–46. Дои:10.1093 / emboj / cdg120. ЧВК 151047. PMID 12628926.
  20. ^ Стивенс А., Гарсайд Х., Берри А., Уотерс С., Уайт А., Рэй Д. (май 2003 г.). «Диссоциация коактиватора стероидного рецептора 1 и рекрутирование корепрессора ядерного рецептора на человеческий глюкокортикоидный рецептор путем модификации интерфейса лиганд-рецептор: роль тирозина 735». Мол. Эндокринол. 17 (5): 845–59. Дои:10.1210 / me.2002-0320. PMID 12569182.
  21. ^ Шульц М., Эггерт М., Баниахмад А., Достерт А., Хайнцель Т., Ренкавиц Р. (июль 2002 г.). «RU486-индуцированный агонизм рецептора глюкокортикоидов контролируется N-концом рецептора и связыванием корепрессора». J. Biol. Chem. 277 (29): 26238–43. Дои:10.1074 / jbc.M203268200. PMID 12011091.
  22. ^ а б Fischle W., Dequiedt F, Fillion M, Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E (сентябрь 2001 г.). «Активность гистондеацетилазы HDAC7 человека связана с HDAC3 in vivo». J. Biol. Chem. 276 (38): 35826–35. Дои:10.1074 / jbc.M104935200. PMID 11466315.
  23. ^ а б Ли Дж., Ван Дж., Ван Дж., Наваз З., Лю Дж. М., Цинь Дж., Вонг Дж. (Август 2000 г.). «Оба корепрессорных белка SMRT и N-CoR существуют в больших белковых комплексах, содержащих HDAC3». EMBO J. 19 (16): 4342–50. Дои:10.1093 / emboj / 19.16.4342. ЧВК 302030. PMID 10944117.
  24. ^ а б Fischle W., Dequiedt F, Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W., Verdin E (январь 2002 г.). «Ферментативная активность, связанная с HDAC класса II, зависит от мультибелкового комплекса, содержащего HDAC3 и SMRT / N-CoR». Мол. Клетка. 9 (1): 45–57. Дои:10.1016 / с1097-2765 (01) 00429-4. HDL:11858 / 00-001M-0000-002C-9FF9-9. PMID 11804585.
  25. ^ а б Андерхилл С., Кутоб М.С., Йи С.П., Торчиа Дж. (Декабрь 2000 г.). «Новый корепрессорный комплекс ядерного рецептора, N-CoR, содержит компоненты комплекса SWI / SNF млекопитающих и корепрессор KAP-1». J. Biol. Chem. 275 (51): 40463–70. Дои:10.1074 / jbc.M007864200. PMID 11013263.
  26. ^ а б Хуанг Э.Й., Чжан Дж., Миска Э.А., Гюнтер М.Г., Кузаридес Т., Лазар М.А. (январь 2000 г.). «Корепрессоры ядерного рецептора являются партнером гистоновых деацетилаз класса II в Sin3-независимом пути репрессии». Genes Dev. 14 (1): 45–54. ЧВК 316335. PMID 10640275.
  27. ^ Петри К., Гайдез Ф, Хауэлл Л., Хили Л., Ваксман С., Гривз М., Зелент А. (май 2003 г.). «Ген гистондеацетилазы 9 кодирует несколько изоформ белка». J. Biol. Chem. 278 (18): 16059–72. Дои:10.1074 / jbc.M212935200. PMID 12590135.
  28. ^ Исо Т., Сарторелли В., Поизат С., Иеззи С., Ву Х.Й., Чанг Дж., Кедес Л., Хамамори Ю. (сентябрь 2001 г.). «HERP, новый гетеродимерный партнер HES / E (spl) в передаче сигналов Notch». Мол. Клетка. Биол. 21 (17): 6080–9. Дои:10.1128 / mcb.21.17.6080-6089.2001. ЧВК 87325. PMID 11486045.
  29. ^ Пэк С.Х., Охги К.А., Роуз Д.В., Ку Э.Х., Гласс С.К., Розенфельд М.Г. (июль 2002 г.). «Обмен комплексов корепрессора N-CoR и коактиватора Tip60 связывает экспрессию генов с помощью NF-kappaB и белка-предшественника бета-амилоида». Клетка. 110 (1): 55–67. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00809-7. PMID 12150997. S2CID 17679498.
  30. ^ Кокура К., Каул С.К., Вадхва Р., Номура Т., Хан М.М., Синагава Т., Ясукава Т., Кольменарес К., Исии С. (сентябрь 2001 г.). «Семейство белков Ski требуется для репрессии транскрипции, опосредованной MeCP2». J. Biol. Chem. 276 (36): 34115–21. Дои:10.1074 / jbc.M105747200. PMID 11441023.
  31. ^ а б c Доуэлл П., Измаил Дж. Э., Аврам Д., Петерсон В. Дж., Невривы Д. Д., Лейд М. (май 1999 г.). «Идентификация корепрессора ядерного рецептора как белка, взаимодействующего с альфа-рецептором, активируемого пролифератором пероксисом». J. Biol. Chem. 274 (22): 15901–7. Дои:10.1074 / jbc.274.22.15901. PMID 10336495.
  32. ^ Хан М.М., Номура Т., Ким Х., Каул С.К., Вадхва Р., Синагава Т., Итикава-Ивата Э., Чжун С., Пандольфи П.П., Исии С. (июнь 2001 г.). «Роль PML и PML-RARalpha в Mad-опосредованной репрессии транскрипции». Мол. Клетка. 7 (6): 1233–43. Дои:10.1016 / с1097-2765 (01) 00257-х. PMID 11430826.
  33. ^ Аманн Дж. М., Нип Дж., Стром Д. К., Люттербах Б., Харада Х, Ленни Н., Даунинг Дж. Р., Мейерс С., Хиберт С. В. (октябрь 2001 г.). «ETO, мишень t (8; 21) при остром лейкозе, устанавливает четкие контакты с множественными деацетилазами гистонов и связывает mSin3A через свой домен олигомеризации». Мол. Клетка. Биол. 21 (19): 6470–83. Дои:10.1128 / mcb.21.19.6470-6483.2001. ЧВК 99794. PMID 11533236.
  34. ^ Чжан Дж., Хуг Б.А., Хуанг Е.Ю., Чен К.В., Гельметти В., Маккарана М., Минуччи С., Пеликчи П.Г., Лазар М.А. (январь 2001 г.). «Олигомеризация ЭТО обязательна для корепрессорного взаимодействия». Мол. Клетка. Биол. 21 (1): 156–63. Дои:10.1128 / MCB.21.1.156-163.2001. ЧВК 88789. PMID 11113190.
  35. ^ Guidez F, Ivins S, Zhu J, Söderström M, Waxman S, Zelent A (апрель 1998 г.). «Снижение чувствительности к ретиноевой кислоте при связывании корепрессора ядерного рецептора с PML- и PLZF-RARalpha лежит в основе молекулярного патогенеза и лечения острого промиелоцитарного лейкоза». Кровь. 91 (8): 2634–42. Дои:10.1182 / blood.V91.8.2634.2634_2634_2642. PMID 9531570.
  36. ^ Лаэрти CD, Биллин А.Н., Лавинский Р.М., Йочам Г.С., Буш А.С., Сан Дж. М., Маллен Т. М., Дэви Дж. Р., Роуз Д. В., Гласс С. К., Розенфельд М. Г., Эйер Д. Е., Эйзенман Р. Н. (июль 1998 г.). «SAP30, компонент корепрессорного комплекса mSin3, участвующий в N-CoR-опосредованной репрессии специфическими факторами транскрипции». Мол. Клетка. 2 (1): 33–42. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80111-2. PMID 9702189.
  37. ^ Guenther MG, Lane WS, Fischle W., Verdin E, Lazar MA, Shiekhattar R (май 2000 г.). «Основной корепрессорный комплекс SMRT, содержащий HDAC3 и TBL1, белок с повторами WD40, связанный с глухотой». Genes Dev. 14 (9): 1048–57. Дои:10.1101 / gad.14.9.1048 (неактивно 2020-10-04). ЧВК 316569. PMID 10809664.CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на октябрь 2020 г. (связь)

дальнейшее чтение

внешняя ссылка