WikiDer > TAF11

TAF11
TAF11
Белок TAF11 PDB 1bh8.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTAF11, MGC: 15243, TAF2I, TAFII28, PRO2134, фактор 11, связанный с связывающим белком TATA-боксом
Внешние идентификаторыOMIM: 600772 MGI: 1916026 ГомолоГен: 55918 Генные карты: TAF11
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение TAF11
Геномное расположение TAF11
Группа6п21.31Начните34,877,462 бп[1]
Конец34,888,071 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TAF11 209358 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001270488
NM_005643

NM_026836
NM_001379368

RefSeq (белок)

NP_001257417
NP_005634

NP_081112
NP_001366297

Расположение (UCSC)Chr 6: 34,88 - 34,89 МбChr 17: 27.9 - 27.91 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Субъединица 11 фактора инициации транскрипции TFIID также известный как TAFII28, является белок что у людей кодируется TAF11 ген.[5][6][7]

Функция

Для инициации транскрипции РНК-полимеразой II требуется активность более 70 полипептидов. Белком, который координирует эти активности, является фактор транскрипции IID (TFIID), который связывается с коровым промотором для правильного позиционирования полимеразы, служит каркасом для сборки остатка транскрипционного комплекса и действует как канал для регуляторных сигналов. TFIID состоит из TATA-связывающего белка (TBP) и группы эволюционно консервативных белков, известных как TBP-ассоциированные факторы или TAF. TAF могут участвовать в базальной транскрипции, служить коактиваторами, участвовать в распознавании промоторов или модифицировать общие факторы транскрипции (GTF) для облегчения сборки комплекса и инициации транскрипции. Этот ген кодирует небольшую субъединицу TFIID, которая присутствует во всех комплексах TFIID и взаимодействует с TBP. Эта субъединица также взаимодействует с другой небольшой субъединицей, TAF13, с образованием гетеродимера со структурой, подобной структуре ядра гистона.[7]

TAFII28
PDB 1bh9 EBI.jpg
Гетеродимерная кристаллическая структура htafii18 / htafii28 со связанными pcmbs
Идентификаторы
СимволTAFII28
PfamPF04719
Pfam кланCL0012
ИнтерПроIPR006809
SCOP21bh9 / Объем / СУПФАМ

В молекулярной биологии TAFII28 относится к Коробка ТАТА связывающий белок ассоциированный фактор. Вместе с ТАТА-связывающим белком и другими TAF он образует общую транскрипция фактор, TFIID. Вместе они участвуют в собрании транскрипция преинициация сложный. В консервированный регион находится на конце C большинства членов белки.

Структура

В Кристальная структура hTAFII28 с hTAFII18 показывает, что эта область участвует в привязка из этих двух подразделения. В консервированный в регионе четыре альфа спирали и три петли устроен как в гистон H3.[5][8]

Взаимодействия

TAF11 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000064995 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000024218 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c d Mengus G, May M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I. (май 1995 г.). «Клонирование и характеристика hTAFII18, hTAFII20 и hTAFII28: трех субъединиц человеческого фактора транскрипции TFIID». EMBO J. 14 (7): 1520–31. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07138.x. ЧВК 398239. PMID 7729427.
  6. ^ Кузухара Т., Хорикоши М. (ноябрь 1996 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей субъединицу TFIID человека, содержащую множество предполагаемых структурных мотивов, включая прямые повторы». Биол. Pharm. Бык. 19 (1): 122–6. Дои:10.1248 / bpb.19.122. PMID 8820923.
  7. ^ а б «Ген Entrez: TAF11 TAF11 РНК-полимераза II, фактор, ассоциированный с ТАТА-бокс-связывающим белком (ТВР), 28 кДа».
  8. ^ а б Бирк С., Поч О, Ромье С., Рафф М., Менгус Дж., Лавин А.С., Дэвидсон И., Морас Д. (июль 1998 г.). «Человеческие TAF (II) 28 и TAF (II) 18 взаимодействуют через гистоновую складку, кодируемую атипичными эволюционно консервативными мотивами, также обнаруженными в семействе SPT3». Ячейка. 94 (2): 239–49. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81423-3. PMID 9695952. S2CID 6274415.
  9. ^ а б c Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вей В., Е Л., ​​Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Д.Д. (май 1997 г.). «BRCA1 является компонентом холофермента РНК-полимеразы II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (11): 5605–10. Дои:10.1073 / пнас.94.11.5605. ЧВК 20825. PMID 9159119.
  10. ^ Бертолотти А., Мелот Т., Акер Дж., Виньерон М., Делаттре О, Тора Л. (март 1998 г.). «EWS, но не EWS-FLI-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и hTAFII68, и субъединицами комплексов TFIID и РНК-полимеразы II». Мол. Cell. Биол. 18 (3): 1489–97. Дои:10.1128 / mcb.18.3.1489. ЧВК 108863. PMID 9488465.
  11. ^ Беллорини М., Ли Д. К., Дантонель Дж. К., Земзуми К., Рёдер Р. Г., Тора Л., Мантовани Р. (июнь 1997 г.). «CCAAT, связывающий взаимодействия NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, соседних с их гистоновыми складчатыми мотивами для ассоциации с основными остатками TBP». Нуклеиновые кислоты Res. 25 (11): 2174–81. Дои:10.1093 / nar / 25.11.2174. ЧВК 146709. PMID 9153318.
  12. ^ Мэй М., Менгус Дж., Лавин А.С., Шамбон П., Дэвидсон И. (июнь 1996 г.). «Человеческий TAF (II28) способствует стимуляции транскрипции за счет активации функции 2 ретиноидных рецепторов X». EMBO J. 15 (12): 3093–104. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00672.x. ЧВК 450252. PMID 8670810.

дальнейшее чтение