WikiDer > Гликопротеин В вируса герпеса

Herpesvirus glycoprotein B
Гликопротеин В вируса герпеса (PH-подобный 2)
GlycoproteinB.png
Кристаллографическая структура гликопротеина B из Вирус простого герпеса Тип 1.[1]
Идентификаторы
СимволГликопрот_B_PH2
PfamPF17417
ИнтерПроIPR038631
OPM суперсемейство109
Белок OPM3nw8
Гликопротеин B вируса герпеса (PH-подобный 1)
Идентификаторы
СимволГликопрот_B_PH1
PfamPF17416
ИнтерПроIPR035377
Гликопротеин В вируса герпеса эктодомен
Идентификаторы
СимволГликопротеин_B
PfamPF00606

Гликопротеин В вируса герпеса это популярный гликопротеин который участвует в проникновение в вирусные клетки из Вирус простого герпеса (HSV). Герпесвирусы есть конверт и внешний липидный бислой который содержит двенадцать поверхностных гликопротеинов. За заразительность чтобы достичь, двухцепочечный ДНК геном ВПГ должен попасть в клетку-хозяин посредством слияния его оболочки с клеточная мембрана или через эндоцитоз. Другие вирусные гликопротеины, участвующие в процессе проникновения в вирусные клетки, включают gC, gB, gD, gH и gL, но только gC, gB, gD и gH необходимы для слияния оболочки HSV с клеточной мембраной. Можно отметить, что все герпесвирусы имеют гликопротеины gB, gH и gL.[2]

Структура

Гликопротеин В вируса герпеса является трансмембранным типом 1. белок с сигнальной последовательностью на N-конце.[2] В Кристальная структура вируса простого герпеса (ВПГ) типа 1 и гликопротеина В вируса Эпштейна-Барра эктодомены были решены как тример, выявив пять структурных доменов (I-V).[3][4] Домен I содержит две внутренние петли слияния, которые, как считается, вставляются в клеточную мембрану во время слияния вирус-клетка.[5] Предполагается, что в HSV домен II взаимодействует с другим гликопротеином вируса герпеса, gH / gL, в процессе слияния.[6] Домен III состоит из структурно важной удлиненной альфа-спирали, в то время как домен IV, как предполагается, взаимодействует с клеточными рецепторами.[7] Наконец, домен V действует вместе с доменом I во время белок-липидных взаимодействий. При ВПГ нейтрализует моноклональные антитела карта в структурные области I, II, IV и V.[7] Благодаря своей уникальной структуре гликопротеин B вируса герпеса (наряду с гликопротеином G вируса везикулярного стоматита и gp64 бакуловируса) принадлежит к новому классу гликопротеинов слияния с вирусной мембраной, классу III.[3]

Функция

Гликопротеин В вируса герпеса является наиболее консервативным из всех поверхностных гликопротеинов и действует в первую очередь как гибридный белок. Точные функции gB и gH / gL неизвестны, но они необходимы для проникновения вируса в клетку и составляют основной механизм слияния. Утверждение, что gB участвует в слиянии, происходит из заметного синцитиального фенотипа, вызванного определенными мутациями внутри цитоплазматический домен гликопротеина B,[8] а также его структурная гомология с другими вирусными слитыми белками.[3]

Рекомендации

  1. ^ PDB: 3NW8​; Стампфер С.Д., Лу Х., Коэн Г.Х., Айзенберг Р.Дж., Хельдвайн Э.Е. (декабрь 2010 г.). «Структурная основа локальных pH-зависимых конформационных изменений гликопротеина B вируса простого герпеса типа 1». Дж. Вирол. 84 (24): 12924–33. Дои:10.1128 / JVI.01750-10. ЧВК 3004323. PMID 20943984.
  2. ^ а б Перейра Л., Али М., Кусулас К., Хо Б., Бэнкс Т. (сентябрь 1989 г.). «Доменная структура гликопротеина B вируса простого герпеса 1: карта нейтрализующих эпитопов в областях непрерывных и прерывистых остатков». Вирусология. 172 (1): 11–24. Дои:10.1016/0042-6822(89)90102-5. PMID 2475970.
  3. ^ а б c Heldwein EE, Lou H, Bender FC, Cohen GH, Eisenberg RJ, Harrison SC (июль 2006 г.). «Кристаллическая структура гликопротеина B вируса простого герпеса 1». Наука. 313 (5784): 217–20. Bibcode:2006Научный ... 313..217H. CiteSeerX 10.1.1.412.1906. Дои:10.1126 / science.1126548. PMID 16840698. S2CID 15532098.
  4. ^ Backovic M, Longnecker R, Jardetzky TS (февраль 2009 г.). «Структура тримерного варианта гликопротеина В вируса Эпштейна-Барра». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 106 (8): 2880–5. Bibcode:2009ПНАС..106.2880Б. Дои:10.1073 / pnas.0810530106. ЧВК 2650359. PMID 19196955.
  5. ^ Ханна Б.П., Кэрнс TM, Бендер ФК, Уитбек Дж. К., Лу Х., Айзенберг Р. Дж., Коэн Г. Х. (июль 2009 г.). «Гликопротеин В вируса простого герпеса связывается с мембранами-мишенями через петли слияния». Дж. Вирол. 83 (13): 6825–36. Дои:10.1128 / JVI.00301-09. ЧВК 2698560. PMID 19369321.
  6. ^ Атанасиу Д., Уитбек Дж. К., де Леон М. П., Лу Х., Ханна Б. П., Коэн Г. Х., Айзенберг Р. Дж. (Апрель 2010 г.). «Бимолекулярная комплементация определяет функциональные области gB вируса простого герпеса, которые связаны с gH / gL, как необходимый шаг, ведущий к слиянию клеток». Дж. Вирол. 84 (8): 3825–34. Дои:10.1128 / JVI.02687-09. ЧВК 2849501. PMID 20130048.
  7. ^ а б Бендер ФК, Саманта М., Хельдвейн Е.Е., де Леон М.П., ​​Билман Э., Лу Х., Уитбек Дж. К., Айзенберг Р. Дж., Коэн Г. Х. (апрель 2007 г.). «Антигенный и мутационный анализ гликопротеина В вируса простого герпеса выявил четыре функциональных участка». Дж. Вирол. 81 (8): 3827–41. Дои:10.1128 / JVI.02710-06. ЧВК 1866100. PMID 17267495.
  8. ^ "datasheets.scbt.com" (PDF).

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR000234