WikiDer > MBD3
MBD3
Метил-CpG-связывающий домен, белок 3 это белок что у людей кодируется MBD3 ген.[5][6][7]
Функция
Метилирование ДНК является основной модификацией геномов эукариот и играет важную роль в развитии млекопитающих. Белки человека MECP2, MBD1, MBD2, MBD3 и MBD4 составляют семейство ядерных белков, связанных присутствием в каждом из связывающий домен метил-CpG (МБД). Однако, в отличие от других членов семейства, MBD3 не способен связываться с метилированной ДНК, а вместо этого связывается с гидроксиметилированная ДНК.[8] Предсказанный белок MBD3 имеет 71% и 94% идентичности с MBD2 (изоформа 1) и мышиным Mbd3. MBD3 - это подразделение NuRD, мультисубъединичный комплекс, содержащий ремоделирование нуклеосом и гистондеацетилазную активность. MBD3 опосредует ассоциацию ассоциированного с метастазами белка 2 (MTA2) с основным гистон-деацетилазным комплексом.[7]
MBD3 также содержит спиральная катушка общий для всех трех изоформ MBD3. Домен спиральной спирали, но не домен MBD, помогает поддерживать плюрипотентность эмбриональных стволовых клеток за счет рекрутирования поликомб репрессивный комплекс 2 к субнабору генов, связанных с развитием и органогенезом, тем самым устанавливая стабильную репрессию транскрипции.[9]
Взаимодействия
MBD3 был показан взаимодействовать с участием:
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000071655 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035478 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Хендрих Б., Бёрд А (ноябрь 1998 г.). «Идентификация и характеристика семейства связывающих метил-CpG белков млекопитающих». Молекулярная и клеточная биология. 18 (11): 6538–47. Дои:10.1128 / mcb.18.11.6538. ЧВК 109239. PMID 9774669.
- ^ Хендрих Б., Эбботт С., Маккуин Х., Чемберс Д., Кросс С., Берд А (сентябрь 1999 г.). «Геномная структура и хромосомное картирование генов Mbd1, Mbd2, Mbd3 и Mbd4 мыши и человека». Геном млекопитающих. 10 (9): 906–12. Дои:10.1007 / s003359901112. PMID 10441743. S2CID 819148.
- ^ а б «Ген Entrez: белок 3 связывающего домена метил-CpG MBD3».
- ^ Йилдирим О, Ли Р., Хунг Дж. Х., Чен ПБ, Донг Х, Э. С., Вен З, Рандо О. Дж., Фаццио Т. Г. (декабрь 2011 г.). «Комплекс Mbd3 / NURD регулирует экспрессию генов, меченных 5-гидроксиметилцитозином, в эмбриональных стволовых клетках». Ячейка. 147 (7): 1498–510. Дои:10.1016 / j.cell.2011.11.054. ЧВК 3252821. PMID 22196727.
- ^ Хирасаки М., Уэда А., Асака М.Н., Ураниши К., Судзуки А., Кохда М., Мизуно Ю., Окадзаки Ю., Нишимото М., Шариф Дж., Косеки Х., Окуда А. (май 2018 г.). «Идентификация домена Coiled-Coil в качестве важного элемента Mbd3 для сохранения потенциала фиксации клонов эмбриональных стволовых клеток». Стволовые клетки. 36 (9): 1355–1367. Дои:10.1002 / шток.2849. PMID 29761578.
- ^ а б c Сакаи Х., Урано Т., Ооката К., Ким М.Х., Хираи Й., Сайто М., Нодзима Ю., Исикава Ф. (декабрь 2002 г.). «MBD3 и HDAC1, два компонента комплекса NuRD, локализуются в Aurora-A-позитивных центросомах в M фазе». Журнал биологической химии. 277 (50): 48714–23. Дои:10.1074 / jbc.M208461200. PMID 12354758.
- ^ Brackertz M, Boeke J, Zhang R, Renkawitz R (октябрь 2002 г.). «Два тесно связанных белка p66 составляют новое семейство мощных репрессоров транскрипции, взаимодействующих с MBD2 и MBD3». Журнал биологической химии. 277 (43): 40958–66. Дои:10.1074 / jbc.M207467200. PMID 12183469.
- ^ Фэн Кью, Цао Р., Ся Л., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Чжан Ю. (январь 2002 г.). «Идентификация и функциональная характеристика компонентов p66 / p68 комплекса MeCP1». Молекулярная и клеточная биология. 22 (2): 536–46. Дои:10.1128 / MCB.22.2.536-546.2002. ЧВК 139742. PMID 11756549.
- ^ а б c Чжан Ю., Нг Х. Х., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Берд А, Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD показывает основной комплекс гистондеацетилазы и связь с метилированием ДНК». Гены и развитие. 13 (15): 1924–35. Дои:10.1101 / гад.13.15.1924. ЧВК 316920. PMID 10444591.
- ^ а б Сайто М., Исикава Ф. (сентябрь 2002 г.). «MCpG-связывающий домен MBD3 человека не связывается с mCpG, но взаимодействует с компонентами NuRD / Mi2 HDAC1 и MTA2». Журнал биологической химии. 277 (38): 35434–9. Дои:10.1074 / jbc.M203455200. PMID 12124384.
- ^ Цзян Ц.Л., Цзинь С.Г., Пфейфер ГП (декабрь 2004 г.). «MBD3L1 представляет собой репрессор транскрипции, который взаимодействует с метил-CpG-связывающим белком 2 (MBD2) и компонентами комплекса NuRD». Журнал биологической химии. 279 (50): 52456–64. Дои:10.1074 / jbc.M409149200. PMID 15456747.
дальнейшее чтение
- Шен Л., Чжан И (июнь 2013 г.). «5-гидроксиметилцитозин: генерация, судьба и геномное распределение». Текущее мнение в области клеточной биологии. 25 (3): 289–96. Дои:10.1016 / j.ceb.2013.02.017. ЧВК 4060438. PMID 23498661.
- Эбботт В.М., Меллор А., Эдвардс Ю., Фейзи Т. (апрель 1989 г.). «Растворимый бычий галактозо-связывающий лектин. Клонирование кДНК выявляет полную аминокислотную последовательность и антигенную связь с основным энцефалитогенным доменом основного белка миелина». Биохимический журнал. 259 (1): 283–90. Дои:10.1042 / bj2590283. ЧВК 1138502. PMID 2470348.
- Чжан Ю., Лерой Г., Силиг Х.П., Лейн В.С., Рейнберг Д. (октябрь 1998 г.). «Специфический для дерматомиозита аутоантиген Mi2 является компонентом комплекса, содержащего гистондеацетилазу и активность ремоделирования нуклеосом». Ячейка. 95 (2): 279–89. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81758-4. PMID 9790534. S2CID 18786866.
- Тонг Дж. К., Хассиг Калифорния, Шницлер Г. Р., Кингстон Р. Э., Шрайбер С. Л. (октябрь 1998 г.). «Деацетилирование хроматина АТФ-зависимым комплексом ремоделирования нуклеосом». Природа. 395 (6705): 917–21. Bibcode:1998Натура.395..917Т. Дои:10.1038/27699. PMID 9804427. S2CID 4355885.
- Чжан Й., Нг Х. Х., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Берд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD показывает основной комплекс гистондеацетилазы и связь с метилированием ДНК». Гены и развитие. 13 (15): 1924–35. Дои:10.1101 / гад.13.15.1924. ЧВК 316920. PMID 10444591.
- Wade PA, Gegonne A, Jones PL, Ballestar E, Aubry F, Wolffe AP (сентябрь 1999 г.). «Комплекс Mi-2 сочетает метилирование ДНК с ремоделированием хроматина и деацетилированием гистонов». Природа Генетика. 23 (1): 62–6. Дои:10.1038/12664. PMID 10471500. S2CID 52868103.
- Татэмацу К.И., Ямадзаки Т., Исикава Ф. (август 2000 г.). «Комплекс MBD2-MBD3 связывается с полуметилированной ДНК и образует комплекс, содержащий DNMT1 в фокусах репликации в поздней S-фазе». Гены в клетки. 5 (8): 677–88. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2000.00359.x. PMID 10947852. S2CID 25185979.
- Хамфри Г.В., Ван Й., Руссанова В.Р., Хираи Т., Цинь Дж., Накатани И., Ховард Б.Х. (март 2001 г.). «Стабильные гистоновые деацетилазные комплексы, отличающиеся наличием белков домена SANT CoREST / kiaa0071 и Mta-L1». Журнал биологической химии. 276 (9): 6817–24. Дои:10.1074 / jbc.M007372200. PMID 11102443.
- Ши Ю., Доунс М., Се В., Као Х.Й., Ордентлич П., Цай С.К., Хон М., Эванс Р.М. (май 2001 г.). «Sharp, индуцибельный кофактор, который объединяет репрессию и активацию ядерных рецепторов». Гены и развитие. 15 (9): 1140–51. Дои:10.1101 / gad.871201. ЧВК 312688. PMID 11331609.
- Фэн Кью, Цао Р., Ся Л., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Чжан Ю. (январь 2002 г.). «Идентификация и функциональная характеристика компонентов p66 / p68 комплекса MeCP1». Молекулярная и клеточная биология. 22 (2): 536–46. Дои:10.1128 / MCB.22.2.536-546.2002. ЧВК 139742. PMID 11756549.
- Шлегель Дж, Гюнесу С., Mennel HD (2002). «Экспрессия генов белков метил-связывающего домена в глиомах человека». Отчеты онкологии. 9 (2): 393–5. Дои:10.3892 / или 9.2.393. PMID 11836615.
- Сайто М., Исикава Ф. (сентябрь 2002 г.). «MCpG-связывающий домен MBD3 человека не связывается с mCpG, но взаимодействует с компонентами NuRD / Mi2 HDAC1 и MTA2». Журнал биологической химии. 277 (38): 35434–9. Дои:10.1074 / jbc.M203455200. PMID 12124384.
- Brackertz M, Boeke J, Zhang R, Renkawitz R (октябрь 2002 г.). «Два тесно связанных белка p66 составляют новое семейство мощных репрессоров транскрипции, взаимодействующих с MBD2 и MBD3». Журнал биологической химии. 277 (43): 40958–66. Дои:10.1074 / jbc.M207467200. PMID 12183469.
- Сакаи Х., Урано Т., Ооката К., Ким М.Х., Хираи Й., Сайто М., Нодзима Ю., Исикава Ф. (декабрь 2002 г.). «MBD3 и HDAC1, два компонента комплекса NuRD, локализуются в Aurora-A-позитивных центросомах в M фазе». Журнал биологической химии. 277 (50): 48714–23. Дои:10.1074 / jbc.M208461200. PMID 12354758.
- Fujita N, Jaye DL, Kajita M, Geigerman C, Moreno CS, Wade PA (апрель 2003 г.). «MTA3, субъединица комплекса Mi-2 / NuRD, регулирует инвазивный путь роста при раке груди». Ячейка. 113 (2): 207–19. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00234-4. PMID 12705869. S2CID 5773916.
- Fujita N, Jaye DL, Geigerman C, Akyildiz A, Mooney MR, Boss JM, Wade PA (октябрь 2004 г.). «MTA3 и комплекс Mi-2 / NuRD регулируют судьбу клеток во время дифференцировки B-лимфоцитов». Ячейка. 119 (1): 75–86. Дои:10.1016 / j.cell.2004.09.014. PMID 15454082. S2CID 17391732.