WikiDer > CAPN10

CAPN10
CAPN10
Идентификаторы
ПсевдонимыCAPN10, CANP10, NIDDM1, кальпаин 10
Внешние идентификаторыOMIM: 605286 MGI: 1344392 ГомолоГен: 36323 Генные карты: CAPN10
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение CAPN10
Геномное расположение CAPN10
Группа2q37.3Начинать240,586,734 бп[1]
Конец240,617,705 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CAPN10 221040 в формате fs.png

PBB GE CAPN10 219333 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_011796

RefSeq (белок)

NP_075571
NP_075573

NP_035926

Расположение (UCSC)Chr 2: 240,59 - 240,62 МбChr 1: 92.93 - 92.95 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Кальпаин-10 это белок что у людей кодируется CAPN10 ген.[5][6]

Calpains являются повсеместным, хорошо законсервированным семейством кальций-зависимых цистеиновых протеаз. Типичные белки кальпаина представляют собой гетеродимеры, состоящие из инвариантной малой субъединицы и вариабельной большой субъединицы. Большая каталитическая субъединица имеет четыре домена: домен I, N-концевой регуляторный домен, который процессируется при активации кальпаина; домен II, домен протеазы; домен III, линкерный домен неизвестной функции; и домен IV, кальмодулин-подобный кальций-связывающий домен. Гетеродимерный интерфейс преимущественно находится между доменом IV и малой субъединицей, которая также является кальмодулиноподобным кальций-связывающим доменом. Этот ген кодирует большую субъединицу. Это атипичный кальпаин, поскольку в нем отсутствует кальмодулин-подобный кальций-связывающий домен и вместо этого имеется дивергентный С-концевой домен. Следовательно, он не может гетеродимеризоваться с малой субъединицей. По своей организации он аналогичен кальпаинам 5 и 6. Этот ген связан с типом 2 или инсулинозависимым сахарным диабетом (NIDDM) и расположен в области NIDDM1. Для этого гена описано множество альтернативных вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000142330 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026270 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Хорикава Ю., Ода Н., Кокс Нью-Джерси, Ли Икс, Орхо-Меландер М, Хара М., Хинокио ​​Ю., Линднер Т.Х., Машима Х, Шварц П.Е., дель Боске-Плата Л., Хорикава И, Ода Й, Ёсиучи I, Колилла С., Полонски К.С., Вей С., Конканнон П., Ивасаки Н., Шульце Дж., Байер Л.Дж., Богардус К., Груп Л., Бурвинкл Е., Ханис С.Л., Белл Г.И. (ноябрь 2000 г.). «Генетическая изменчивость гена, кодирующего кальпаин-10, связана с сахарным диабетом 2 типа» (PDF). Нат Жене. 26 (2): 163–75. Дои:10.1038/79876. PMID 11017071. S2CID 5940859.
  6. ^ Байер Л.Дж., Пермана П.А., Ян X, Пратли Р.Э., Хэнсон Р.Л., Шен Г.К., Мотт Д., Ноулер В.С., Кокс, штат Нью-Джерси, Хорикава Ю., Ода Н., Белл Г.И., Богардус К. (октябрь 2000 г.). «Полиморфизм гена кальпаина-10 связан со снижением уровня мРНК в мышцах и резистентностью к инсулину». J Clin Invest. 106 (7): R69–73. Дои:10.1172 / JCI10665. ЧВК 387246. PMID 11018080.
  7. ^ "Entrez Gene: CAPN10 кальпаин 10".

дальнейшее чтение

внешняя ссылка