WikiDer > HtrA серинпептидаза 2

HtrA serine peptidase 2
HTRA2
5m3n.jpg
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыHTRA2, Htra2, AI481710, Omi, Prss25, mnd2, PARK13, серинпептидаза 2 HtrA, MGCA8
Внешние идентификаторыOMIM: 606441 MGI: 1928676 ГомолоГен: 113300 Генные карты: HTRA2
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение HTRA2
Геномное расположение HTRA2
Группа2п13.1Начните74,529,377 бп[1]
Конец74,533,348 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE HTRA2 203089 s в формате fs.png

PBB GE HTRA2 211152 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_013247
NM_145074
NM_001321727
NM_001321728

NM_019752

RefSeq (белок)

NP_001308656
NP_001308657
NP_037379
NP_659540

NP_062726

Расположение (UCSC)Chr 2: 74,53 - 74,53 МбChr 6: 83.05 - 83.06 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Сериновая протеаза HTRA2, митохондриальная является фермент что у людей кодируется HTRA2 ген.[5][6][7] Этот белок участвует в каспаза-зависимый апоптоз И в болезнь Паркинсона.[8][9]

Структура

Ген

Ген HTRA2 кодирует сериновую протеазу. В гене человека 8 экзоны и находится в хромосома группа 2п12.

Протеин

Белок HtrA2, также известный как Omi, представляет собой митохондриально-расположенная сериновая протеаза. Человеческий протеин сериновая протеаза HTRA2, митохондрия имеет размер 49 кДа и состоит из 458 аминокислоты. Пептидный фрагмент из 1-31 аминокислоты представляет собой последовательность митохондриального перехода, фрагмент 32-133 аминокислоты является собственностью, а 134-458 представляет собой зрелую протеазу сериновой протеазы HTRA2, митохондриальную и ее теоретическую Пи этого белка составляет 6,12.[10] HtrA2 обнаруживает сходство с DegS, бактериальной протеазой, присутствующей в периплазме грамотрицательных бактерий. Структурно HtrA2 представляет собой тримерную молекулу с центральными доменами протеазы и карбокси-концевой PDZ-домен, характерный для семейства HtrA. Домен PDZ предпочтительно связывает С-конец белкового субстрата и модулирует протеолитическую активность трипсиноподобного домена протеазы.[11]

Функция

Семейство высокотемпературных требований (HtrA) эволюционно консервативно, и эти олигомерные сериновые протеазы были классифицированы в семействе S1B клана протеаз PA в МЕРОПЫ база данных протеаз.[11] Протеазная активность члена HtrA HtrA2 / Omi необходима для митохондриального гомеостаза у мышей и людей и инактивации мутаций, связанных с нейродегенеративными нарушениями, такими как болезнь Паркинсона.[8] Более того, HtrA2 / Omi высвобождается в цитозоль из митохондрии в течение апоптоз и использует четыре наиболее N-концевой аминокислоты, чтобы имитировать каспаза и может быть задействован ингибитором белка апоптоза (IAP), ингибиторами каспазы, такими как XIAP и CIAP1 / 2. После связывания сериновая протеаза расщепляет IAP, уменьшая ингибирование клетками активации каспаз. Таким образом, HTRA2 / Omi способствует апоптозу через каспазозависимые и независимые пути.

Клиническое значение

Было показано, что члены семейства протеаз HtrA играют важную роль в физиологии клетки и участвуют в нескольких патологических процессах, включая рак.[12] и нейродегенеративное заболевание.[11] Убедительные доказательства участия HtrA2 в онкогенезе. Этот белок широко экспрессируется в различных линиях раковых клеток,[13][14][15][16] Анализ образцов биопсии показал изменения в экспрессии HtrA2 в раковых тканях по сравнению с нормальными тканями.

HtrA2 недавно был идентифицирован как ген, связанный с болезнью Паркинсона. Мутации в Htra2 были обнаружены у пациентов, страдающих болезнью Паркинсона. Кроме того, мыши, лишенные HtrA2, имеют паркинсонизм. фенотип. Это предполагает, что HtrA2 связан с прогрессированием болезни Паркинсона у людей и мышей.[9]

Взаимодействия

Было показано, что серинпептидаза 2 HtrA взаимодействовать с участием MAPK14,[5] XIAP[17][18] и BIRC2.[17][18]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115317 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068329 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Фаччио Л., Фуско С., Чен А., Мартинотти С., Бонвентре СП, Зервос А.С. (январь 2000 г.). «Характеристика новой сериновой протеазы человека, которая имеет обширную гомологию с бактериальной эндопротеазой теплового шока HtrA и регулируется ишемией почек». Журнал биологической химии. 275 (4): 2581–8. Дои:10.1074 / jbc.275.4.2581. PMID 10644717.
  6. ^ Gray CW, Ward RV, Karran E, Turconi S, Rowles A, Viglienghi D, Southan C, Barton A, Fantom KG, West A, Savopoulos J, Hassan NJ, Clinkenbeard H, Hanning C, Amegadzie B, Davis JB, Dingwall C , Livi GP, Creasy CL (сентябрь 2000 г.). «Характеристика HtrA2 человека, новой сериновой протеазы, участвующей в клеточном стрессовом ответе млекопитающих». Европейский журнал биохимии / FEBS. 267 (18): 5699–710. Дои:10.1046 / j.1432-1327.2000.01589.x. PMID 10971580.
  7. ^ «Ген Entrez: серинпептидаза 2 HTRA2 HtrA».
  8. ^ а б Джонс Дж. М., Датта П., Сринивасула С. М., Джи В., Гупта С., Чжан З., Дэвис Е., Хайноцки Дж., Сондерс Т. Л., Ван Керен М. Л., Фернандес-Алнемри Т., Мейслер М. Х., Алнемри Е. С. (октябрь 2003 г.). «Потеря активности митохондриальной протеазы Omi вызывает нервно-мышечное расстройство у мутантных мышей mnd2» (PDF). Природа. 425 (6959): 721–7. Дои:10.1038 / природа02052. HDL:2027.42/62561. PMID 14534547. S2CID 4372496.
  9. ^ а б Strauss KM, Martins LM, Plun-Favreau H, Marx FP, Kautzmann S, Berg D, Gasser T., Wszolek Z, Müller T, Bornemann A, Wolburg H, Downward J, Riess O, Schulz JB, Krüger R (август 2005 г.) . «Мутации потери функции в гене, кодирующем Omi / HtrA2, при болезни Паркинсона». Молекулярная генетика человека. 14 (15): 2099–111. Дои:10.1093 / hmg / ddi215. PMID 15961413.
  10. ^ "Uniprot: O43464 - HTRA2_HUMAN".
  11. ^ а б c Vande Walle L, Lamkanfi M, Vandenabeele P (март 2008 г.). «Митохондриальная сериновая протеаза HtrA2 / Omi: обзор». Гибель клеток и дифференциация. 15 (3): 453–60. Дои:10.1038 / sj.cdd.4402291. PMID 18174901.
  12. ^ Bulteau AL, Bayot A (июнь 2011 г.). «Митохондриальные протеазы и рак». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика. 1807 (6): 595–601. Дои:10.1016 / j.bbabio.2010.12.011. PMID 21194520.
  13. ^ Bowden MA, Di Nezza-Cossens LA, Jobling T, Salamonsen LA, Nie G (октябрь 2006 г.). «Сериновые протеазы HTRA1 и HTRA3 подавляются с увеличением степени рака эндометрия человека». Гинекологическая онкология. 103 (1): 253–60. Дои:10.1016 / j.ygyno.2006.03.006. PMID 16650464.
  14. ^ Lee SH, Lee JW, Kim HS, Kim SY, Park WS, Kim SH, Lee JY, Yoo NJ (май 2003 г.). «Иммуногистохимический анализ экспрессии Omi / HtrA2 при раке желудка». APMIS. 111 (5): 586–90. Дои:10.1034 / j.1600-0463.2003.1110508.x. PMID 12887511. S2CID 24058023.
  15. ^ Narkiewicz J, Klasa-Mazurkiewicz D, Zurawa-Janicka D, Skorko-Glonek J, Emerich J, Lipinska B (май 2008 г.). «Изменения уровня мРНК и белка HtrA1, HtrA2 и HtrA3 человека при раке яичников». Клиническая биохимия. 41 (7–8): 561–9. Дои:10.1016 / j.clinbiochem.2008.01.004. PMID 18241672.
  16. ^ Zurawa-Janicka D, Kobiela J, Stefaniak T, Wozniak A, Narkiewicz J, Wozniak M, Limon J, Lipinska B (2008). «Изменения экспрессии сериновых протеаз HtrA1 и HtrA2 во время вызванного эстрогеном окислительного стресса и нефроканцерогенеза у самцов сирийского хомяка». Acta Biochimica Polonica. 55 (1): 9–19. Дои:10.18388 / abp.2008_3123. PMID 18231652.
  17. ^ а б Хегде Р., Сринивасула С.М., Датта П., Мадеш М., Васселл Р., Чжан З., Чеонг Н., Неджмех Дж., Фернандес-Алнемри Т., Хошино С., Алнемри Е.С. (октябрь 2003 г.). «Фактор высвобождения полипептидной цепи GSPT1 / eRF3 протеолитически процессируется в IAP-связывающий белок». Журнал биологической химии. 278 (40): 38699–706. Дои:10.1074 / jbc.M303179200. PMID 12865429.
  18. ^ а б Верхаген А.М., Силке Дж., Экерт П.Г., Пакуш М., Кауфманн Х., Коннолли Л.М., Дэй К.Л., Тикоо А., Берк Р., Вробель С., Мориц Р.Л., Симпсон Р.Дж., Во Д.Л. (январь 2002 г.). «HtrA2 способствует гибели клеток за счет активности сериновой протеазы и способности противодействовать ингибитору белков апоптоза». Журнал биологической химии. 277 (1): 445–54. Дои:10.1074 / jbc.M109891200. PMID 11604410.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  • В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: S01.278