WikiDer > PRPF8
PRPF8
Фактор пре-мРНК-процессинга-сплайсинга 8 это белок что у людей кодируется PRPF8 ген.[5][6]
Функция
Сплайсинг пре-мРНК происходит в 2 последовательных этапа переэтерификации. Белок, кодируемый этим геном, является компонентом как U2-, так и U12-зависимых сплайсосом и, как было обнаружено, необходим для каталитического этапа II в процессе сплайсинга пре-мРНК. Он содержит несколько повторов WD, которые участвуют во взаимодействиях белок-белок. Этот белок имеет сходство последовательности с дрожжевым белком Prp8. Этот ген является геном-кандидатом на аутосомно-доминантный пигментный ретинит.[7]
Взаимодействия
PRPF8 был показан взаимодействовать с WDR57[8][9] и EFTUD2.[9]
Рекомендации
- ^ а б c ENSG00000174231 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000274442, ENSG00000174231 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020850 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ McKie AB, McHale JC, Keen TJ, Tarttelin EE, Goliath R, van Lith-Verhoeven JJ, Greenberg J, Ramesar RS, Hoyng CB, Cremers FP, Mackey DA, Bhattacharya SS, Bird AC, Markham AF, Inglehearn CF (июль 2001 г. ). «Мутации в гене PRPC8 фактора сплайсинга пре-мРНК при аутосомно-доминантном пигментном ретините (RP13)». Молекулярная генетика человека. 10 (15): 1555–62. Дои:10.1093 / hmg / 10.15.1555. PMID 11468273.
- ^ Луо Х. Р., Моро Г. А., Левин Н., Мур М. Дж. (Июль 1999 г.). «Человеческий белок Prp8 является компонентом как U2-, так и U12-зависимых сплайсосом». РНК. 5 (7): 893–908. Дои:10.1017 / S1355838299990520. ЧВК 1369814. PMID 10411133.
- ^ «Ген Entrez: PRPF8, гомолог фактора 8 процессинга пре-мРНК PRP8 (S. cerevisiae)».
- ^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
- ^ а б Achsel T, Ahrens K, Brahms H, Teigelkamp S, Lührmann R (ноябрь 1998 г.). «Человеческий белок U5-220kD (hPrp8) образует стабильный комплекс без РНК с несколькими U5-специфическими белками, включая РНК-развиндазу, гомолог фактора удлинения рибосом EF-2 и новый белок WD-40». Молекулярная и клеточная биология. 18 (11): 6756–66. Дои:10.1128 / mcb.18.11.6756. ЧВК 109259. PMID 9774689.
дальнейшее чтение
- Грейнджер Р.Дж., Беггс Д.Д. (май 2005 г.). «Белок Prp8: в основе сплайсосомы». РНК. 11 (5): 533–57. Дои:10.1261 / rna.2220705. ЧВК 1370742. PMID 15840809.
- Гарсия-Бланко М.А., Андерсон Г.Дж., Беггс Дж., Шарп, Пенсильвания (апрель 1990 г.). «Белок млекопитающих массой 220 кДа связывает пре-мРНК в сплайсосоме: потенциальный гомолог дрожжевого белка PRP8». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 87 (8): 3082–6. Дои:10.1073 / pnas.87.8.3082. ЧВК 53838. PMID 2139226.
- Пинто А. Л., Стейтц Дж. А. (ноябрь 1989 г.). «Аналог дрожжевого белка сплайсинга PRP8 у млекопитающих присутствует в малой ядерной частице рибонуклеопротеина U4 / 5/6 и сплайсосоме». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 86 (22): 8742–6. Дои:10.1073 / пнас.86.22.8742. ЧВК 298364. PMID 2479028.
- Бах М., Винкельманн Г., Люрманн Р. (август 1989 г.). «20S малый ядерный рибонуклеопротеин U5 показывает удивительно сложный белковый состав». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 86 (16): 6038–42. Дои:10.1073 / pnas.86.16.6038. ЧВК 297770. PMID 2527369.
- Андерсон Дж., Бах М., Люрманн Р., Беггс Дж. Д. (декабрь 1989 г.). «Сохранение между дрожжами и человеком белка, связанного с малым ядерным рибонуклеопротеином U5». Природа. 342 (6251): 819–21. Дои:10.1038 / 342819a0. PMID 2532307. S2CID 977768.
- Умен Дж. Г., Гатри С. (август 1995 г.). «Prp16p, Slu7p и Prp8p взаимодействуют с 3'-сайтом сплайсинга на двух различных стадиях во время второй каталитической стадии сплайсинга пре-мРНК». РНК. 1 (6): 584–97. ЧВК 1369303. PMID 7489518.
- Голиаф Р., Шугарт Ю., Янссенс П., Вайссенбах Дж., Бейтон П., Рамасар Р., Гринберг Дж. (Октябрь 1995 г.). «Тонкая локализация локуса аутосомно-доминантного пигментного ретинита на хромосоме 17р». Американский журнал генетики человека. 57 (4): 962–5. ЧВК 1801525. PMID 7573060.
- Гринберг Дж., Голиаф Р., Бейтон П., Рамесар Р. (июнь 1994 г.). «Новый локус аутосомно-доминантного пигментного ретинита на коротком плече хромосомы 17». Молекулярная генетика человека. 3 (6): 915–8. Дои:10,1093 / hmg / 3,6,915. PMID 7951236.
- Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Коджис Т.Л., Хайнцманн С., Флодман П., Нго Дж. Т., Спаркс Р. С., Спенс М. А., Бейтман Дж. Б., Хекенливли-младший (февраль 1996 г.). «Уточнение карты локуса RP13 на хромосоме 17p13.3 человека во второй семье с аутосомно-доминантным пигментным ретинитом». Американский журнал генетики человека. 58 (2): 347–55. ЧВК 1914553. PMID 8571961.
- Рейес Дж. Л., Койс П., Конфорти Б. Б., Конарска М. М. (март 1996 г.). «Канонический динуклеотид GU в 5'-сайте сплайсинга распознается p220 snRNP U5 в сплайсосоме». РНК. 2 (3): 213–25. ЧВК 1369364. PMID 8608445.
- Хинц М., Мур М.Дж., Биндерайф А. (август 1996 г.). «Доменный анализ человеческой РНК U5. Триметилирование кэпа, связывание с белками и сборка сплайсосом». Журнал биологической химии. 271 (31): 19001–7. Дои:10.1074 / jbc.271.31.19001. PMID 8702566.
- Кьяра, доктор медицины, Паланджян Л., Фельд Крамер Р., Рид Р. (август 1997 г.). «Доказательства того, что U5 snRNP распознает 3'-сайт сплайсинга для каталитической стадии II у млекопитающих». Журнал EMBO. 16 (15): 4746–59. Дои:10.1093 / emboj / 16.15.4746. ЧВК 1170101. PMID 9303319.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Ахсель Т., Аренс К., Брамс Х, Тейгелькамп С., Люрманн Р. (ноябрь 1998 г.). «Человеческий белок U5-220kD (hPrp8) образует стабильный комплекс без РНК с несколькими U5-специфическими белками, включая РНК-развиндазу, гомолог фактора удлинения рибосом EF-2 и новый белок WD-40». Молекулярная и клеточная биология. 18 (11): 6756–66. Дои:10.1128 / mcb.18.11.6756. ЧВК 109259. PMID 9774689.
- Рейес Дж. Л., Густафсон Э. Х., Луо Х. Р., Мур М. Дж., Конарска М. М. (февраль 1999 г.). «С-концевой участок hPrp8 взаимодействует с консервативным динуклеотидом GU в 5'-сайте сплайсинга». РНК. 5 (2): 167–79. Дои:10.1017 / S1355838299981785. ЧВК 1369749. PMID 10024169.
- Макаров Е.М., Макарова О.В., Ахсель Т., Люрманн Р. (май 2000 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого фактора сплайсинга prp6p содержит несколько элементов TPR и стабильно связан с snRNP U5 посредством белок-белковых взаимодействий». Журнал молекулярной биологии. 298 (4): 567–75. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3685. PMID 10788320.
- Le Hir H, Moore MJ, Maquat LE (май 2000 г.). «Сплайсинг пре-мРНК изменяет состав мРНП: доказательства стабильной ассоциации белков в соединениях экзон-экзон». Гены и развитие. 14 (9): 1098–108. ЧВК 316578. PMID 10809668.
- Макхейл Дж. К., Маккай AB, Тарттелин Э. Э., Инглхерн CF (2000). «Карта экспрессии области 17p13.3 хромосомы человека, охватывающая доминантный локус пигментного ретинита RP13, область синдрома лизэнцефалии Миллера-Дикера (MDLS) и предполагаемый локус супрессора опухоли». Цитогенетика и клеточная генетика. 88 (3–4): 225–9. Дои:10.1159/000015556. PMID 10828595. S2CID 46632974.
внешняя ссылка
 | Эта статья о ген на хромосома человека 17 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |