Ингибитор серпин-пептидазы, клада А (альфа-1-антипротеиназа, антитрипсин), член 2 это белок что в люди кодируется СЕРПИНА2ген. Ингибитор сериновой пептидазы, член 2 клады А принадлежит к члену серин семейство белков, которые обладают функциональной активностью ингибирования сериновые протеазы.[3]
SERPINA2 была известна как псевдогены поскольку он имел очень похожую структуру и функции на СЕРПИНА1. Во время клонирования характеризация альфа-1- антитрипсин как ген, было обнаружено, что СЕРПИНА2 не было никаких промоутер но содержал существенные гомология к СЕРПИНА1последовательность гена.[4]
Внеклеточные предсказания SERPIN и клады общих доменов показывают, что локализация SERPINA2 в ER, скорее всего, больше, эти общие мотивы ER указывают, что их локализация, скорее всего, находится в ER.[6]
Структура
Популяционные исследования показывают, что этот ген полиморфный. Удаления, мутации сдвига рамки считывания, и критический стартовый кодон мутации (ATG в ATA) были обнаружены в некоторых популяциях, а также аллель который может кодировать функциональный белок. Этот ген может быть эволюционирующим псевдогеном.[7] Контрольный геном содержит мутацию стартового кодона и имеет кодирующая область удаление. Трехмерная модель SERPINA2 была создана с использованием неделетированной формы кристаллической структуры, которая гомологична белку SERPINA1. Модель была создана с использованием swissmodel в EXPASY, и показал, что SERPINA2 сохраняет СЕРПИН петля реактивного центра, которая наиболее совместима с ингибирующей активностью протеазы. Консенсусная последовательность, окружающая петлю реактивного центра, значительно разошлась, так что теперь она содержит триптофан мотивы зарина вместо метионин сериновый мотив.[8]
Функция
СЕРПИНА2 ранее был идентифицирован как псевдоген; однако недавно появились новые доказательства, указывающие на то, что СЕРПИНА2 производит активный транскрипт, который отвечает за кодирование белка, расположенного в эндоплазматический ретикулум. Детальное изучение СЕРПИНА2 гена в нескольких этнических группах облегчили это с добавлением СЕРПИНА2 ген в нем гаплотип характеристика частичной делецией, которая имеет паттерны, предполагающие положительный отбор потери функции белка SERPINA2.[5]
Исследования SERPINA2 показали разные результаты относительно степени дегенерации последовательности, которой она может подвергнуться.[7] Бао и др. (1988) описывает в своих исследованиях эту последовательность с Сайты сплайсинга РНК сохраняются в SERPINA2, и при экспрессии он кодирует новый секреторный белок (SERPIN) с другой субстратной специфичностью. Эти исследования SERPINA2 на людях пришли к выводу, что недавний положительный отбор благоприятствует потере функции SERPINA2 и псевдогенизации.[9]СЕРПИНА2 гены в основном экспрессируются в лейкоциты и яички что дает остаточное выражение в печень. SERPINA2 связана с продолжающимся адаптивным процессом, связанным с преимуществами в роли фертильности и хозяина. возбудитель взаимодействия.[8]
Мутации
Критическая мутация присутствует в стартовом кодоне и делеция 2kb более экзон IV и часть экзона V. Эта делеция в стартовом кодоне встречается с частотой 30%.[4] Исследования с СЕРПИНА2in vitro и in vivo показали, что он экспрессирует стабильные белки с n-связанными гликозилирование с молекулярной массой 52 кДа и совместимы с обычными SERPIN [8]
Связанное заболевание
SERPINA2 является членом семейства SERPIN, которое известно как гены, кодирующие белок. Заболевание, связанное с этим геном, эмфизема, из-за дефицита белка ат. SERPINA2 имеет функцию, аналогичную SERPINA1, и связана с функцией ингибитора пептидазы серинового типа.[10]
^Бао Дж. Дж., Рид-Фурке Л., Сиферс Р. Н., Кидд В. Дж., Ву С. Л. (февраль 1988 г.). «Молекулярная структура и гомология последовательности гена, относящегося к альфа-1-антитрипсину, в геноме человека». Геномика. 2 (2): 165–73. Дои:10.1016/0888-7543(88)90099-7. PMID2842251.
Намчиу С.Дж., Фридман Р.Д., Марсден М.Д., Сараусад Л.М., Джейсони С.Л., Фурнье Р.Э. (март 2004 г.). «Последовательность организации и области прикрепления матрикса кластера генов ингибитора сериновой протеазы человека в 14q32.1». Геном млекопитающих. 15 (3): 162–78. Дои:10.1007 / s00335-003-2311-y. PMID15014966.
Роллини П., Фурнье Р. Э. (декабрь 1997 г.). «Молекулярная связь генов человеческого альфа-1-антитрипсина и кортикостероид-связывающего глобулина на хромосоме 14q32.1». Геном млекопитающих. 8 (12): 913–6. Дои:10.1007 / s003359900610. PMID9383284.
