WikiDer > ACADVL

ACADVL
ACADVL
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыACADVL, ацил-КоА дегидрогеназа, очень длинная цепь, ACAD6, LCACD, VLCAD, ацил-КоА дегидрогеназа, очень длинная цепь
Внешние идентификаторыOMIM: 609575 MGI: 895149 ГомолоГен: 5 Генные карты: ACADVL
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение ACADVL
Геномное расположение ACADVL
Группа17p13.1Начинать7,217,125 бп[1]
Конец7,225,266 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

37

11370

Ансамбль

ENSG00000072778

ENSMUSG00000018574

UniProt

P49748

P50544

RefSeq (мРНК)

NM_000018
NM_001033859
NM_001270447
NM_001270448

NM_017366

RefSeq (белок)

NP_000009
NP_001029031
NP_001257376
NP_001257377

NP_059062

Расположение (UCSC)Chr 17: 7.22 - 7.23 МбChr 11: 70.01 - 70.02 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ацил-КоА-дегидрогеназа с очень длинной цепью, митохондриальная (VLCAD) - это фермент, который у человека кодируется ACADVL ген.

Мутации в ACADVL связаны с дефицит дегидрогеназы ацил-кофермента А с очень длинной цепью. В белок кодируемый этим геном, нацелен на внутренняя митохондриальная мембрана, где он катализирует первую стадию пути бета-окисления митохондриальных жирных кислот. Этот ацил-коэнзим А дегидрогеназа специфичен для длинноцепочечных и очень длинноцепочечных жирных кислот. Дефицит этого генного продукта снижает бета-окисление жирных кислот миокарда и связан с кардиомиопатия. Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.[5]

Структура

Ген ACADVL содержит 20 экзоны,[6] и имеет длину около 5,4 КБ.[7] VLCAD имеет интересную структуру генов у людей, поскольку он расположен в структуре «голова к голове» с DLG4 ген на Хромосома 17, и что транскрибируемые области этих генов перекрываются. Было показано, что лечение DEHP приводит к активации минимальным промотором.[8] Хотя DLG4 и VLCAD имеют общие регуляторные элементы, каждый из них имеет отдельные и отличные тканеспецифичные элементы, которые обеспечивают их функцию. У мышей эти два гена расположены «голова к голове», но не перекрываются.[7]

Функция

Фермент VLCAD катализирует большую часть бета-окисления жирных кислот, образуя транс-двойную связь C2-C3 в жирной кислоте. VLCAD специфичен для жирных кислот с очень длинной цепью, обычно C16-acylCoA и более длинных.[9] У мышей с дефицитом VLCAD гиперацетилирование белка в печени практически отсутствует; это означает, что белок VLCAD также необходим для ацетилирование белков в этой биологической системе.[10]

Клиническое значение

ACADVL связан с дефицит дегидрогеназы ацил-кофермента А с очень длинной цепью (VLCADD), который имеет множество симптомов и обычно представляет собой один из трех фенотипы. Первый - тяжелый, с ранним началом и высокой смертностью; наиболее частым симптомом является эта форма кардиомиопатия. Вторая форма - это поздняя детская форма с более легкими симптомами, которые чаще всего проявляются в виде гипокетотической гипогликемии. Окончательная форма проявляется в зрелом возрасте и представляет собой изолированное поражение скелетных мышц, рабдомиолиз, и миоглобинурия, который запускается упражнениями или голоданием.[11] Заболевание обычно диагностируется при первом выполнении тандемная масс-спектрометрия на образце крови пациента в период стресса, а затем проводят молекулярно-генетическое тестирование на наличие гена ACADVL. Дефицит лечится систематически, но при определенных условиях, таких как голодание, раздражение миокарда, обезвоживание, и следует избегать диет с высоким содержанием жиров, чтобы предотвратить вторичные осложнения.[12]

Взаимодействия

ACADVL имеет 75 двоичных белок-белковые взаимодействия в том числе 73 сопряженных взаимодействия. ACADVL, похоже, взаимодействует с RPSA и GPHN.[13]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000072778 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018574 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «ацил-КоА дегидрогеназа, очень длинная цепь».
  6. ^ Штраус А.В., Пауэлл К.К., Хейл Д.Е., Андерсон М.М., Ахуджа А., Брэкетт Дж. К., Sims HF (ноябрь 1995 г.). «Молекулярная основа дефицита ацил-КоА дегидрогеназы митохондрий человека с очень длинной цепью, вызывающего кардиомиопатию и внезапную смерть в детстве». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (23): 10496–500. Дои:10.1073 / пнас.92.23.10496. ЧВК 40638. PMID 7479827.
  7. ^ а б Чжоу С., Блумберг Б. (февраль 2003 г.). «Перекрывающаяся генная структура человеческого VLCAD и DLG4». Ген. 305 (2): 161–6. Дои:10.1016 / s0378-1119 (02) 01235-0. PMID 12609736.
  8. ^ Чжан Л.Ф., Дин Дж.Х., Ян Б.З., Хе ГК, Роу С. (декабрь 2003 г.). «Характеристика области двунаправленного промотора между человеческими генами, кодирующими VLCAD и PSD-95». Геномика. 82 (6): 660–8. Дои:10.1016 / s0888-7543 (03) 00211-8. PMID 14611808.
  9. ^ Аояма Т., Сури М., Ушикубо С., Камиджо Т., Ямагути С., Келли Р.И., Рхед В.Дж., Утаке К., Танака К., Хашимото Т. (июнь 1995 г.). «Очистка человеческой дегидрогеназы ацил-кофермента А с очень длинной цепью и характеристика ее дефицита у семи пациентов». Журнал клинических исследований. 95 (6): 2465–73. Дои:10.1172 / JCI117947. ЧВК 295925. PMID 7769092.
  10. ^ Пуговкина О., Те Бринке Х., Офман Р., ван Крухтен А.Г., Кулик В., Вандерс Р.Дж., Хаутен С.М., де Бур В.К. (июль 2014 г.). «Ацетилирование митохондриального белка вызывается ацетил-КоА в результате окисления жирных кислот». Молекулярная генетика человека. 23 (13): 3513–22. Дои:10.1093 / hmg / ddu059. PMID 24516071.
  11. ^ Андресен Б.С., Олпин С., Поортуис Б.Дж., Шольте Х.Р., Виани-Сабан К., Вандерс Р., Ийлст Л., Моррис А., Пурфарзам М., Бартлетт К., Баумгартнер Е. Бросс П., Болунд Л., Грегерсен Н. (февраль 1999 г.). «Четкая корреляция генотипа с фенотипом заболевания при дефиците ацил-КоА дегидрогеназы с очень длинной цепью». Американский журнал генетики человека. 64 (2): 479–94. Дои:10.1086/302261. ЧВК 1377757. PMID 9973285.
  12. ^ Лесли, Н. Д .; Валенсия, К. А .; Штраус, А. В .; Zhang, K .; Adam, M. P .; Ardinger, H.H .; Pagon, R.A .; Wallace, S.E .; Bean LJH; Стивенс, К .; Амемия, А. (1993). «Дефицит ацил-кофермента дегидрогеназы с очень длинной цепью». PMID 20301763. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  13. ^ «75 бинарных взаимодействий найдено по поисковому запросу ACADVL». База данных по молекулярным взаимодействиям IntAct. EMBL-EBI. Получено 2018-08-24.

дальнейшее чтение

  • Коста К.Г., Дорланд Л., де Алмейда ИТ, Якобс К., Дюран М., Poll-The BT (июнь 1998 г.). «Влияние голодания, нагрузки длинноцепочечных триглицеридов и нагрузки карнитина на уровни длинноцепочечного ацилкарнитина в плазме при дефиците митохондриальной очень длинноцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 21 (4): 391–9. Дои:10.1023 / А: 1005354624735. PMID 9700596. S2CID 2198523.

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.