WikiDer > АТФ-фосфорибозилтрансфераза - Википедия
| АТФ фосфорибозилтрансфераза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Гексамер АТФ-фосфорибозилтрансферазы, Campylobacter jejuni | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 2.4.2.17 | ||||||||
| Количество CAS | 9031-46-3 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| АТФ фосфорибозилтрансфераза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структура атр-фосфорибозилтрансферазы e.coli | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | HisG | ||||||||
| Pfam | PF01634 | ||||||||
| Pfam клан | CL0177 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR013820 | ||||||||
| PROSITE | PDOC01020 | ||||||||
| SCOP2 | 1nh8 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
| HisG, C-концевой домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 atp-фосфорибозилтрансфераза (atp-prtase) из микобактерий туберкулеза в комплексе с amp и гистидином | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | HisG_C | ||||||||
| Pfam | PF08029 | ||||||||
| Pfam клан | CL0089 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR013115 | ||||||||
| |||||||||
В энзимология, АТФ фосфорибозилтрансфераза (EC 2.4.2.17) является фермент который катализирует то химическая реакция
- 1- (5-фосфо-D-рибозил) -АТФ + дифосфат АТФ + 5-фосфо-альфа-D-рибозо-1-дифосфат
Таким образом, два субстраты этого фермента 1- (5-фосфо-D-рибозил) -АТФ и дифосфат, а его два товары находятся АТФ и 5-фосфо-альфа-D-рибоза 1-дифосфат.
Этот фермент принадлежит к семейству гликозилтрансферазы, в частности пентозилтрансферазы. В систематическое название этого класса ферментов 1- (5-фосфо-D-рибозил) -АТФ: дифосфатфосфо-альфа-D-рибозил-трансфераза. Другие широко используемые имена включают фосфорибозил-АТФ пирофосфорилаза, аденозинтрифосфатфосфорибозилтрансфераза, фосфорибозиладенозинтрифосфат: пирофосфат, фосфорибозилтрансфераза, фосфорибозил АТФ синтетаза, фосфорибозил АТФ: пирофосфатфосфорибозилтрансфераза, фосфорибозил-АТФ: пирофосфат-фосфорибозил фосфотрансфераза, фосфорибозиладенозинтрифосфатпирофосфорилаза, и фосфорибозиладенозинтрифосфатсинтетаза.
Этот фермент катализирует первый шаг в биосинтез из гистидин в бактерии, грибы и растения. Это член более крупного фосфорибозилтрансфераза надсемейство ферменты который катализировать конденсация 5-фосфо-альфа-D-рибозо-1-дифосфата с азотистые основания в присутствии двухвалентный металл ионы.[1]
Биосинтез гистидина - энергетически затратный процесс, и активность АТФ-фосфорибозилтрансферазы подлежит контролю на нескольких уровнях. Транскрипционная регуляция основан прежде всего на питательное вещество условий и определяет количество фермента, присутствующего в клетке, в то время как ингибирование обратной связи быстро модулирует активность в ответ на сотовый условия. Было показано, что фермент ингибируется 1- (5-фосфо-D-рибозил) -АТФ, гистидин, ppGpp (сигнал, связанный с неблагоприятными условиями окружающей среды) и ADP и AMP (которые отражают общую энергия статус ячейки). Поскольку этот путь биосинтеза гистидина присутствует только в прокариоты, растения и грибов, этот фермент является многообещающей мишенью для разработки новых противомикробный соединения и гербициды.
Фосфорибозилтрансфераза АТФ встречается в двух различных формах: длинная форма, содержащая два каталитический домены и С-концевой регуляторный домен, и короткая форма, в которой регуляторный домен отсутствует. Полная форма каталитически компетентный, но в организмы в краткой форме гистидил-тРНК синтетаза паралог, HisZ, требуется для ферментная активность.[2]
В структуры ферментов длинной формы из кишечная палочка и Микобактерии туберкулеза были определены.[3][4] Взаимопревращение между различными формами в значительной степени обратимо и зависит от связывания природных субстраты и ингибиторы фермента. Два каталитический домены связаны двухцепочечным бета-лист и вместе образуют "периплазматический связывающий белок "складка". Щель между этими доменами содержит активный сайт. С-концевой домен не принимает непосредственного участия в катализе, но, по-видимому, участвует в образовании гексамеров, вызванном связыванием ингибиторы такие как гистидин к ферменту, таким образом регулируя активность.
Структурные исследования
На конец 2007 г. 10 структуры были решены для этого класса ферментов, с PDB коды доступа 1H3D, 1NH7, 1NH8, 1O63, 1O64, 1Q1K, 1USY, 1VE4, 1Z7M, и 1Z7N.
Рекомендации
- ^ Sinha SC, Smith JL (декабрь 2001 г.). «Семейство белков PRT». Curr. Мнение. Struct. Биол. 11 (6): 733–9. Дои:10.1016 / S0959-440X (01) 00274-3. PMID 11751055.
- ^ Сисслер М., Делорм С., Бонд Дж., Эрлих С.Д., Рено П., Франклин С. (август 1999 г.). «Паралог аминоацил-тРНК синтетазы с каталитической ролью в биосинтезе гистидина». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (16): 8985–90. Bibcode:1999PNAS ... 96.8985S. Дои:10.1073 / пнас.96.16.8985. ЧВК 17719. PMID 10430882.
- ^ Локамп Б., Макдермотт Дж., Кэмпбелл С.А., Коггинс Дж. Р., Лапторн А.Дж. (февраль 2004 г.). «Структура АТФ-фосфорибозилтрансферазы Escherichia coli: определение сайтов связывания субстрата и способ ингибирования АМФ». J. Mol. Биол. 336 (1): 131–44. Дои:10.1016 / j.jmb.2003.12.020. PMID 14741209.
- ^ Чо Й, Шарма В., Саккеттини Дж. К. (март 2003 г.). «Кристаллическая структура фосфорибозилтрансферазы АТФ из Mycobacterium tuberculosis». J. Biol. Chem. 278 (10): 8333–9. Дои:10.1074 / jbc.M212124200. PMID 12511575.
дальнейшее чтение
- АМЕС Б.Н., МАРТИН Р.Г., ГАРРИ Б.Д. (1961). «Первый шаг биосинтеза гистидина». J. Biol. Chem. 236: 2019–26. PMID 13682989.
- Мартин Р.Г. (1963). «Фосфоролиз нуклеозидов костным мозгом кролика: природа подавления обратной связи гистидином». J. Biol. Chem. 238: 257–268.
- Волл MJ, Appella E, Martin RG (1967). «Очистка и изучение состава фосфорибозиладенозинтрифосфата: пирофосфатфосфорибозилтрансферазы, первого фермента биосинтеза гистидина». J. Biol. Chem. 242 (8): 1760–7. PMID 5337591.
