WikiDer > Ингибитор диссоциации гуанозиновых нуклеотидов - Википедия
| Ингибитор диссоциации GDP | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структура дважды пренилированного комплекса ypt1: gdi | |||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | GDI | ||||||||||
| Pfam | PF00996 | ||||||||||
| Pfam клан | CL0063 | ||||||||||
| ИнтерПро | IPR018203 | ||||||||||
| SCOP2 | 1-й / Объем / СУПФАМ | ||||||||||
| |||||||||||
В молекулярной биологии Ингибиторы диссоциации гуанозина (GDIs) составляют семья малых GTPases которые выполняют регулирующую роль в везикулярный мембранный трафик. GDI связываются с GDP-связанной формой Rho и Rab малые GTPases и не только предотвращают обмен (поддержание малой GTPase в выключенном состоянии), но также предотвращают локализацию малой GTPase на мембране, которая является местом их действия. Это ингибирование может быть снято действием фактора смещения GDI.[1] GDI также подавляют cdc42 путем привязки к его хвосту и предотвращения его внедрения в мембраны; следовательно, он не может вызвать WASP и не может привести к зарождению F-актин.
GDI ' C-терминал геранилгеранилирование имеет решающее значение для их мембранной ассоциации и функции.[2][3] Этот посттрансляционная модификация катализируется Rab геранилгеранилтрансферазой (Rab-GGTase), мульти-субъединицей фермент который содержит каталитический гетеродимер и вспомогательный компонент, называемый Rab escort протеин (REP) -1.[2] REP-1 представляет недавно синтезированный Rab белки к каталитический компонент, и образует стабильный комплекс с пренилированный белки после реакции переноса. Механизм REP-1-опосредованного мембрана Ассоциация Rab5 подобна ассоциации, опосредованной ингибитором диссоциации Rab GDP (GDI). REP-1 и Rab GDI также обладают другими функциональными свойствами, включая способность ингибировать высвобождение GDP и удалять белки Rab с мембран.
В Кристальная структура из бык альфа-изоформа Rab GDI определено с разрешением 1.81 Ангстрем.[4] Белок состоит из двух основных структурный единицы: большой сложный многолистовой домен Я и меньший альфа-спиральный домен II.
Структурная организация домена I тесно связана с FAD-содержащие монооксигеназы и оксидазы.[4] Консервативные области, общие для GDI и хориидеремии ген продукт, который доставляет Раб в каталитический подразделения Раба геранилгеранилтрансфераза II, сгруппированы на одной стороне домена.[3] Два самых консервированный регионы образуют компактный структура на вершине молекулы; сайт-направленный мутагенез показал, что эти области играют решающую роль в связывании белков Rab.[4]
Рекомендации
- ^ Дирак-Швейструп А.Б., Сумизава Т., Пфеффер С.Р. (февраль 1997 г.). «Идентификация фактора смещения GDI, который высвобождает эндосомные GTPases Rab из Rab-GDI». Журнал EMBO. 16 (3): 465–72. Дои:10.1093 / emboj / 16.3.465. ЧВК 1169650. PMID 9034329.
- ^ а б Александров К., Хориучи Х., Стил-Мортимер О., Сибра М.С., Зериал М (ноябрь 1994 г.). «Rab escort protein-1 - это многофункциональный белок, который сопровождает недавно пренилированные кроличьи белки до их целевых мембран». EMBO J. 13 (22): 5262–73. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06860.x. ЧВК 395482. PMID 7957092.
- ^ а б Нисимура Н., Годжи Дж., Накамура Х., Орита С., Такай Й., Сано К. (ноябрь 1995 г.). «Клонирование изоформы человеческого Rab GDI головного мозга и ее экспрессия в клеточных линиях нейробластомы человека и образцах опухолей». Рак Res. 55 (22): 5445–50. PMID 7585614.
- ^ а б c Шалк И., Зенг К., Ву С.К., Стура Е.А., Маттесон Дж., Хуанг М., Тандон А., Уилсон И.А., Балч В.Е. (май 1996 г.). «Структура и мутационный анализ ингибитора диссоциации Rab GDP». Природа. 381 (6577): 42–8. Bibcode:1996 Натур.381 ... 42S. Дои:10.1038 / 381042a0. PMID 8609986. S2CID 4249512.
внешняя ссылка
- Гуанин + нуклеотид + диссоциация + ингибиторы в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)