WikiDer > KDM4A

KDM4A
KDM4A
Белок JMJD2A PDB 2gf7.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыKDM4A, JHDM3A, JMJD2, JMJD2A, TDRD14A, лизин-деметилаза 4A
Внешние идентификаторыOMIM: 609764 MGI: 2446210 ГомолоГен: 27780 Генные карты: KDM4A
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение KDM4A
Геномное расположение KDM4A
Группа1п34.2-п34.1Начните43,650,149 бп[1]
Конец43,705,518 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE JMJD2A 203205 в формате fs.png

PBB GE JMJD2A 203204 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_014663

NM_001161823
NM_172382

RefSeq (белок)

NP_055478

NP_001155295
NP_759014

Расположение (UCSC)Chr 1: 43.65 - 43.71 МбChr 4: 118.14 - 118.18 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Лизин-специфическая деметилаза 4A является фермент что у людей кодируется KDM4A ген.[5][6][7]

Функция

Этот ген является членом семейства Jumonji domain 2 (JMJD2) и кодирует белок с доменом JmjN, доменом JmjC, доменом JD2H, двумя TUDOR домены, и два цинковых пальца типа PHD. Этот ядерный белок относится к альфа-кетоглутарат-зависимая гидроксилаза надсемейство. Он действует как специфичный для триметилирования деметилаза, превращая специфический триметилированный гистон на остатках лизина 9 и 36 гистона H3 в диметилированную форму и остатки диметилированного лизина 9 в монометил и в качестве репрессора транскрипции.[7]

Было обнаружено, что изменения в этом гене связаны с хромосомной нестабильностью, которая приводит к раку.[8]

У человека роль Kdm4a как онкоген или ген, связанный с раком, хорошо известен. Он вовлечен в опухоли простаты, где он сверхэкспрессируется,[9] и стимулирует пролиферацию клеток рака толстой кишки, где способствует образованию самой опухоли.[10] В клеточных линиях рака легких, где Kdm4a также сверхэкспрессируется, он координируется с другими онкогенами (например, Рас) для преобразования нормальных клеток в раковые клетки путем ингибирования путей подавления опухоли, таких как p53.[11] Подавление Kdm4a в клеточных линиях рака груди снижает пролиферацию раковых клеток за счет остановки клеточного цикла и снижает миграцию и инвазию опухоли.[12]

В моделях мышей Kdm4a влияет на различные процессы, ведущие к имплантации эмбриона.[13] Экспрессия этого гена наблюдается во всех тканях, важных для женской репродуктивной системы, включая гипоталамус, гипофиз, яичник, яйцеводы и матку, а также во время эмбрионального развития. Было показано, что нокаут этого гена у самок мышей отрицательно влияет на поддержание материнской маточной среды, подходящей для получения и имплантации бластоциста. Он также препятствует раннему эмбриональному развитию детенышей самок мышей до имплантации, что приводит к бесплодию. В то время как механизмы нормальной овуляции и оплодотворения остаются неизменными, бесплодие также может быть частично связано с пониженным уровнем Пролактин, гормон, имеющий решающее значение в процессе беременности. Нокаут Kdm4a не влияет на плодовитость и жизнеспособность щенков-самцов.[13]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000066135 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033326 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (июнь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 5 (3): 169–76. Дои:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.
  6. ^ Като М., Като М. (июнь 2004 г.). «Идентификация и характеристика генов семейства JMJD2 in silico». Международный журнал онкологии. 24 (6): 1623–8. Дои:10.3892 / ijo.25.3.759. PMID 15138608.
  7. ^ а б "Entrez Gene: JMJD2A домен jumonji, содержащий 2A".
  8. ^ Блэк Дж. К., Мэннинг А. Л., Ван Речем С., Ким Дж., Лэдд Б., Чо Дж., Пинеда С. М., Мерфи Н., Дэниэлс Д. Л., Монтанья С., Льюис П. У., Гласс К., Эллис К. Д., Дайсон Н. Дж., Гетц Дж., Ветстайн Дж. ). «Лизиндеметилаза KDM4A индуцирует сайт-специфическое копирование и репликацию областей, амплифицированных в опухолях». Ячейка. 154: 541–55. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.051. ЧВК 3832053. PMID 23871696.
  9. ^ Cloos, Paul A; Кристенсен, Джеспер; Аггер, Карл; Майолика, Алессио; Раппсильбер, Юри; Торбен, Антал; Хансен, Клаус Х; Хелин, Кристиан (28 мая 2006 г.). «Предполагаемый онкоген GASC1 деметилирует три- и диметилированный лизин 9 на гистоне H3». Природа. 442 (2006): 307–311. Дои:10.1038 / природа04837. PMID 16732293.
  10. ^ Ким, Тэ-Дон; Шин, Сук; Берри, Уильям Л .; О, Сангфил; Янкнехт, Ральф (1 декабря 2011 г.). «Деметилаза JMJD2A регулирует апоптоз и пролиферацию клеток рака толстой кишки». Журнал клеточной биохимии. 113 (4): 1368–1376. Дои:10.1002 / jcb.24009.
  11. ^ Mallette, Frédérick A .; Ричард, Стефан (15 ноября 2012 г.). «JMJD2A способствует трансформации клеток путем блокирования клеточного старения посредством репрессии транскрипции опухолевого супрессора CHD5». Отчеты по ячейкам. 2 (5): 1233–1243. Дои:10.1016 / j.celrep.2012.09.033. PMID 23168260.
  12. ^ Ли, Бэй-Сюй; Чжан, Мин-Чанг; Ло, Чэн-Лян; Ян, Пэн; Ли, Хуэй; Сюй, Хун-Мэй; Сюй, Хун-Фэй; Шэнь, И-Вэнь; Сюэ, Ай-Мин; Чжао, Цзы-Цинь (3 октября 2011 г.). «Эффекты опосредованного РНК-интерференцией подавления гена JMJD2A на линии клеток рака груди человека MDA-MB-231 in vitro». Журнал экспериментальных и клинических исследований рака. 30 (2011): 1. Дои:10.1186/1756-9966-30-90.
  13. ^ а б Санкар, Адитья; Куистра, Сюзанна Марийе; Гонсалес, Хавьер Мартин; Ольссон, Клаас; Поутанен, Матти; Хелин, Кристиан (2017). «Материнская экспрессия гистоновой деметилазы Kdm4a имеет решающее значение для предимплантационного развития». Разработка (Кембридж). 144 (2017): 3264–3277. Дои:10.1242 / dev.155473.

дальнейшее чтение