WikiDer > NDUFV1

NDUFV1
NDUFV1
Идентификаторы
ПсевдонимыNDUFV1, CI-51K, CI51KD, UQOR1, NADH: субъединица V1 ядра убихинон оксидоредуктазы, MC1DN4
Внешние идентификаторыOMIM: 161015 MGI: 107851 ГомолоГен: 5151 Генные карты: NDUFV1
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение NDUFV1
Геномное расположение NDUFV1
Группа11q13.2Начните67,605,653 бп[1]
Конец67,612,554 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NDUFV1 208714 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_007103
NM_001166102

NM_133666

RefSeq (белок)

NP_001159574
NP_009034

NP_598427

Расположение (UCSC)Chr 11: 67.61 - 67.61 МбChr 19: 4.01 - 4.01 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

НАДН-дегидрогеназа [убихинон] флавопротеин 1, митохондриальный (NDUFV1) является фермент что у людей кодируется NDUFV1 ген.[5] Ген NDUFV1 кодирует субъединицу размером 51 кДа комплекс I (НАДН: убихинон оксидоредуктаза) митохондриальной дыхательная цепь. Дефекты комплекса I - частая причина митохондриальной дисфункции. Дефицит митохондриального комплекса I связан с миопатии, энцефаломиопатии и нейродегенеративные расстройства, такие как болезнь Паркинсона и Синдром Ли.[6]

Структура

NDUFV1 расположен на q рука из хромосома 11 в позиции 13.2 и имеет 10 экзоны.[6] В NDUFV1 ген продуцирует белок 50,8 кДа, состоящий из 464 аминокислоты.[7][8] NDUFV1, белок, кодируемый этим геном, является членом семейства субъединиц комплекса I 51 кДа. Этот блок несет НАДН-обвязка сайта, а также флавинмононуклеотид (FMN) - сайты связывания Fe-S.[6] Он также содержит транзитный пептид домена и состоит из 6 витков, 14 бета-нити, и 19 альфа-спирали.[9][10]

Функция

Комплекс I состоит из 45 различных субъединиц. NDUFV1 является компонентом флавопротеин-серного (FP) фрагмента фермента.[11] NDUFV1 - это оксидоредуктаза и основная субъединица комплекса I, которая, как полагают, необходима для сборки и катализа. Это белок периферической мембраны расположен на матрица сторона внутренняя мембрана митохондрии.[9][10]

Каталитическая активность

НАДН + убихинон + 5 H + (В) = НАД + + убихинол + 4 H + (Вых).

NADH + акцептор = NAD + + восстановленный акцептор.[9][10]

Клиническое значение

Мутации в NDUFV1 гены связаны с дефицитом митохондриального комплекса I, который аутосомно-рецессивный. Этот дефицит является наиболее частым ферментативным дефектом окислительного фосфорилирования расстройства.[12][13] Дефицит митохондриального комплекса I показывает крайнюю степень генетическая гетерогенность и может быть вызвано мутацией в генах, кодируемых ядром, или генах, кодируемых митохондриями. Нет очевидного генотип-фенотип корреляции, и сделать вывод о лежащей в основе основе клинической или биохимической картине сложно, если не невозможно.[14] Однако большинство случаев вызвано мутациями в генах, кодируемых ядром.[15][16] Он вызывает широкий спектр клинических расстройств, от летальных неонатальных заболеваний до нейродегенеративных расстройств у взрослых. Фенотипы включают макроцефалия с прогрессивным лейкодистрофия, неспецифический энцефалопатия, гипертрофическая кардиомиопатия, миопатия, заболевание печени, Синдром Ли, Наследственная оптическая нейропатия Лебера, и некоторые формы болезнь Паркинсона.[17] Клинические проявления могут включать: лактоацидоз, церебральная дегенерация, офтальмоплегия, атаксия, спастичность, и дистония в результате мутаций в NDUFV1.[18][19]

Взаимодействия

NDUFV1 имеет 103 двоичных белок-белковые взаимодействия в том числе 97 сопряженных взаимодействий. NDUFV1, по-видимому, взаимодействует с EWSR1, CREB1, NCOR1, и VDAC1.[20]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000167792 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037916 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Спенсер С.Р., Тейлор Дж. Б., Коуэлл И. Г., Ся К. Л., Пембл С. Е., Кеттерер Б. (декабрь 1992 г.). «Картирование субъединицы 51 кДа митохондриальной НАДН: убихинон оксидоредуктазы человека смежно с геном глутатион-S-трансферазы P1-1 на хромосоме 11q13». Геномика. 14 (4): 1116–8. Дои:10.1016 / S0888-7543 (05) 80144-2. PMID 1478657.
  6. ^ а б c «Ген Entrez: NDUFV1 NADH дегидрогеназа (убихинон) флавопротеин 1, 51 кДа». Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.
  7. ^ Яо, Даниэль. "Атлас кардиоорганических белков" База знаний (COPaKB) - Информация о белках ". amino.heartproteome.org. Получено 2018-08-27.
  8. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК 4076475. PMID 23965338.
  9. ^ а б c «NDUFV1 - NADH дегидрогеназа [убихинон] флавопротеин 1, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (Human) - ген и белок NDUFV1». www.uniprot.org. Получено 2018-08-27. Эта статья включает текст, доступный под CC BY 4.0 лицензия.
  10. ^ а б c «UniProt: универсальная база знаний о белках». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D158 – D169. Январь 2017 г. Дои:10.1093 / нар / gkw1099. ЧВК 5210571. PMID 27899622.
  11. ^ Мюррей Дж., Чжан Б., Тейлор С.В., Оглсби Д., Фахи Е., Марусич М.Ф., Гош С.С., Капальди Р.А. (апрель 2003 г.). «Субъединичный состав НАДН-дегидрогеназы человека, полученный быстрой одностадийной иммуноочисткой». Журнал биологической химии. 278 (16): 13619–22. Дои:10.1074 / jbc.C300064200. PMID 12611891.
  12. ^ Кирби Д.М., Салеми Р., Сугиана С., Отаке А., Парри Л., Белл К.М., Кирк Е.П., Бонех А., Тейлор Р.В., Даль Х.Х., Райан М.Т., Торберн Д.Р. (сентябрь 2004 г.). «Мутации NDUFS6 являются новой причиной летального неонатального дефицита митохондриального комплекса I». Журнал клинических исследований. 114 (6): 837–45. Дои:10.1172 / JCI20683. ЧВК 516258. PMID 15372108.
  13. ^ Макфарланд Р., Кирби Д.М., Фаулер К.Дж., Отаке А., Райан М.Т., Амор Д.Д., Флетчер Д.М., Диксон Д.В., Коллинз Ф.А., Тернбулл Д.М., Тейлор Р.В., Торберн Д.Р. (январь 2004 г.). «Мутации de novo в митохондриальном гене ND3 как причина детской митохондриальной энцефалопатии и дефицита комплекса I». Анналы неврологии. 55 (1): 58–64. Дои:10.1002 / ana.10787. PMID 14705112. S2CID 21076359.
  14. ^ Haack TB, Haberberger B, Frisch EM, Wieland T, Iuso A, Gorza M, Strecker V, Graf E, Mayr JA, Herberg U, Hennermann JB, Klopstock T, Kuhn KA, Ahting U, Sperl W, Wilichowski E, Hoffmann GF , Тесарова М., Хансикова Х., Земан Дж., Плеко Б., Зевиани М., Виттиг И., Стром Т.М., Шуэльке М., Фрайзингер П., Мейтингер Т., Прокиш Х. (апрель 2012 г.). «Молекулярная диагностика дефицита митохондриального комплекса I с использованием секвенирования экзома» (PDF). Журнал медицинской генетики. 49 (4): 277–83. Дои:10.1136 / jmedgenet-2012-100846. PMID 22499348. S2CID 3177674.
  15. ^ Лоффен Дж. Л., Смейтинк Дж. А., Трайбелс Дж. М., Янссен А. Дж., Трипельс Р. Х., Зенгерс Р. К., ван ден Хеувел Л. П. (2000). «Изолированный дефицит комплекса I у детей: клинические, биохимические и генетические аспекты». Человеческая мутация. 15 (2): 123–34. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200002) 15: 2 <123 :: AID-HUMU1> 3.0.CO; 2-P. PMID 10649489.
  16. ^ Triepels RH, Van Den Heuvel LP, Trijbels JM, Smeitink JA (2001). «Дефицит комплекса I дыхательной цепи». Американский журнал медицинской генетики. 106 (1): 37–45. Дои:10.1002 / ajmg.1397. PMID 11579423.
  17. ^ Робинсон Б.Х. (май 1998 г.). «Дефицит комплекса I человека: клинический спектр и участие свободных радикалов кислорода в патогенности дефекта». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика. 1364 (2): 271–86. Дои:10.1016 / с0005-2728 (98) 00033-4. PMID 9593934.
  18. ^ Зафейриу Д.И., Роденбург Р.Дж., Шеффер Х., ван ден Хеувел Л.П., Поуэлс П.Дж., Вервери А., Атанасиаду-Пиперопулу Ф., ван дер Кнаап М.С. (июнь 2008 г.). «МР-спектроскопия и серийная магнитно-резонансная томография у пациента с митохондриальной кистозной лейкоэнцефалопатией из-за дефицита комплекса I и мутации NDUFV1 и легкого клинического течения». Нейропедиатрия. 39 (3): 172–5. Дои:10.1055 / с-0028-1093336. PMID 18991197.
  19. ^ Лаугель V, This-Bernd V, Cormier-Daire V, Speeg-Schatz C, de Saint-Martin A, Fischbach M (январь 2007 г.). «Офтальмоплегия с ранним началом при синдроме Ли из-за мутаций NDUFV1». Детская неврология. 36 (1): 54–7. Дои:10.1016 / j.pediatrneurol.2006.08.007. PMID 17162199.
  20. ^ «103 бинарных взаимодействия найдено по запросу NDUFV1». База данных по молекулярным взаимодействиям IntAct. EMBL-EBI. Получено 2018-08-27.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.