WikiDer > EIF6

EIF6
EIF6
Идентификаторы
ПсевдонимыEIF6, CAB, EIF3A, ITGB4BP, b (2) gcn, eIF-6, p27 (BBP), p27BBP, фактор инициации трансляции эукариот 6
Внешние идентификаторыOMIM: 602912 MGI: 1196288 ГомолоГен: 7135 Генные карты: EIF6
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человек)[1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение EIF6
Геномное расположение EIF6
Группа20q11.22Начните35,278,911 бп[1]
Конец35,284,985 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ITGB4BP 78047 s в формате fs.png

PBB GE ITGB4BP 210213 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_010579

RefSeq (белок)

NP_001254739
NP_002203
NP_852131
NP_852133

NP_034709

Расположение (UCSC)Chr 20: 35,28 - 35,28 МбChr 2: 155,82 - 155,83 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор инициации трансляции эукариот 6 (EIF6), также известен как Интегрин бета 4 связывающий белок (ITGB4BP), это человек ген.[5]

Гемидесмосомы структуры, которые связывают базальная пластинка к промежуточной нити цитоскелет. Важным функциональным компонентом гемидесмосом является субъединица интегрина бета-4 (ITGB4), белок, содержащий два домена фибронектина III типа. Белок, кодируемый этим геном, связывается с доменами фибронектина III типа ITGB4 и может помочь связать ITGB4 с цитоскелетом промежуточных филаментов. Кодируемый белок, который нерастворим и содержится как в ядро и в цитоплазма, может функционировать как фактор инициации перевода и катализирует ассоциацию 40S и 60S рибосомальный субъединицы вместе с eIF5 связаны с GTP. Множественные варианты транскрипции, кодирующие несколько разных изоформы были обнаружены для этого гена.[5]

EIF6 играет важную роль в образовании 80S рибосом эукариот, росте клеток и экспрессии генов. Рибосома 80S, которая может разделяться на субъединицы 40S и 60S. EIF6 помогает защитить зрелую 60-ю субъединицу, и затем EIF6 должен диссоциировать с 60-й субъединицей, чтобы он мог связываться с 40-й субъединицей с образованием рибосомы. Поддержание баланса EIF6 важно для организма: небольшое количество EIF6 помогает синтезу нормальной рибосомы, в то время как большое количество EIF6 ингибирует 60-е субъединицы, связывающиеся с 40-ю субъединицами.[6]

Функция

EIF6 существует как в ядрышке, так и в цитоплазме. В ядрышке эукариот прерибосомный комплекс 90S отделяется от прерибосомального комплекса 60S и прерибосомного комплекса 40S, которые участвуют в синтезе зрелой рибосомы. EIF6 незаменим в биогенезе 60S субъединицы, и удаление EIF6 имеет летальный эффект. Частичная делеция eIF6 приводит к уменьшению количества свободной 60S субъединицы рибосомы, что означает, что она выводит из равновесия соотношение субъединиц 40S / 60S и ограничивает скорость синтеза белка. Прерибосомный комплекс 60S, связанный с шаттлом eIF6 из ядрышка в цитоплазму, а затем диссоциированный eIF6 с пре-60S, так что субъединица 60S может связываться с субъединицей 40S и продолжается до последующего распространения. EIF6 может действовать как фактор инициации трансляции, ограничивающий скорость, и уровни его экспрессии влияют на скорость трансляции. Немногие из eIF6 в малых количествах будут ускорять трансляцию белка, в то время как большие из eIF6 будут блокировать процесс трансляции, ингибируя продукцию рибосом.[7] Активность eIF6 также вызывает гликолиз и синтез жирных кислот за счет контроля трансляции мРНК.[8]

Выражение

EIF6 имеет разный уровень экспрессии в разных тканях и клетках. EIF6 имеет высокий уровень экспрессии в стволовых и циклических клетках, тогда как в постмитотических клетках его нет; высокий уровень в мозге и эпителии, низкий уровень в мышцах.[9]

Взаимодействия

EIF6 был показан взаимодействовать с участием FHL2,[10] ITGB4[11] и GNB2L1.[12]

EIF6 играет важную роль в образовании 80S рибосом, росте клеток и экспрессии генов.[13]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000242372 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027613 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: белок, связывающий интегрин бета 4 ITGB4BP».
  6. ^ Брина Д., Гроссо С., Милузио А., Бифо С. (октябрь 2011 г.). «Контроль трансляции за счет образования 80S и доступности 60S: центральная роль eIF6, фактора ограничения скорости в прогрессии клеточного цикла и туморогенезе». Клеточный цикл. 10 (20): 3441–6. Дои:10.4161 / cc.10.20.17796. PMID 22031223.
  7. ^ Брина Д., Милузио А., Риккарди С., Бифо С. (июль 2015 г.). «Антиассоциативная активность eIF6 необходима для биогенеза рибосом, контроля трансляции и прогрессирования опухоли». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - механизмы регуляции генов. 1849 (7): 830–5. Дои:10.1016 / j.bbagrm.2014.09.010. PMID 25252159.
  8. ^ Biffo S, Manfrini N, Ricciardi S (февраль 2018 г.). «Перекрестки между трансляцией и метаболизмом при раке». Текущее мнение в области генетики и развития. 48: 75–81. Дои:10.1016 / j.gde.2017.10.011. PMID 29153483.
  9. ^ Милузио А, Бегнет А, Вольта В, Бифо С (май 2009 г.). «Фактор инициации эукариот 6 обеспечивает непрерывную связь между биогенезом и трансляцией рибосомы 60S». EMBO отчеты. 10 (5): 459–65. Дои:10.1038 / embor.2009.70. ЧВК 2680881. PMID 19373251.
  10. ^ Wixler V, Geerts D, Laplantine E, Westhoff D, Smyth N, Aumailley M, Sonnenberg A, Paulsson M (октябрь 2000 г.). «Только LIM-белок DRAL / FHL2 связывается с цитоплазматическим доменом нескольких цепей альфа- и бета-интегринов и задействуется в адгезионных комплексах». Журнал биологической химии. 275 (43): 33669–78. Дои:10.1074 / jbc.M002519200. PMID 10906324.
  11. ^ Biffo S, Sanvito F, Costa S, Preve L, Pignatelli R, Spinardi L, Marchisio PC (ноябрь 1997 г.). «Выделение нового связывающего интегрин бета4 белка (p27 (BBP)), высоко экспрессируемого в эпителиальных клетках». Журнал биологической химии. 272 (48): 30314–21. Дои:10.1074 / jbc.272.48.30314. PMID 9374518.
  12. ^ Ceci M, Gaviraghi C, Gorrini C, Sala LA, Offenhäuser N, Marchisio PC, Biffo S (декабрь 2003 г.). «Высвобождение eIF6 (p27BBP) из субъединицы 60S позволяет сборку 80S рибосомы». Природа. 426 (6966): 579–84. Дои:10.1038 / природа02160. PMID 14654845. S2CID 2431706.
  13. ^ Брина Д., Гроссо С., Милузио А., Бифо С. (октябрь 2011 г.). «Контроль трансляции за счет образования 80S и доступности 60S: центральная роль eIF6, фактора ограничения скорости в прогрессии клеточного цикла и туморогенезе». Клеточный цикл. 10 (20): 3441–6. Дои:10.4161 / cc.10.20.17796. PMID 22031223.

дальнейшее чтение