WikiDer > EEF1D

EEF1D
EEF1D
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыEEF1D, EF-1D, EF1D, FP1047, коэффициент элонгации трансляции эукариот 1 дельта
Внешние идентификаторыOMIM: 130592 MGI: 1913906 ГомолоГен: 23404 Генные карты: EEF1D
Расположение гена (человек)
Хромосома 8 (человек)
Chr.Хромосома 8 (человек)[1]
Хромосома 8 (человек)
Геномное расположение EEF1D
Геномное расположение EEF1D
Группа8q24.3Начинать143,579,697 бп[1]
Конец143,599,541 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE EEF1D 203113 s в формате fs.png

PBB GE EEF1D 214394 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (белок)
Расположение (UCSC)Chr 8: 143,58 - 143,6 МбChr 15: 75,89 - 75,91 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Коэффициент удлинения 1-дельта это белок что у людей кодируется EEF1D ген.[5]

Функция

Этот ген кодирует субъединицу комплекса фактора элонгации-1, который отвечает за ферментативную доставку аминоацил тРНК к рибосоме. Эта субъединица функционирует как фактор обмена гуаниновых нуклеотидов. Сообщается, что эта субъединица взаимодействует с Tat ВИЧ-1 и, таким образом, репрессирует трансляцию мРНК клетки-хозяина, но не ВИЧ-1. Для этого гена было обнаружено несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскрипта, однако полноразмерная природа только двух вариантов была определена.[6]

Взаимодействия

EEF1D был показан взаимодействовать с Глицил-тРНК синтетаза,[7] EEF1G[8][9] и КТН1,[10] и предполагается, что он будет взаимодействовать с TMEM63A.[11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ENSG00000273594 GRCh38: Общий выпуск 89: ENSG00000104529, ENSG00000273594 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055762 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Сандерс Дж., Раггиаши Р., Моралес Дж., Мёллер В. (июль 1993 г.). "Человеческий лейциновый белок, содержащий гуанин-нуклеотидный обменный белок фактор удлинения-1 дельта". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1174 (1): 87–90. Дои:10.1016 / 0167-4781 (93) 90097-В. PMID 8334168.
  6. ^ «Ген Entrez: эукариотический фактор элонгации трансляции EEF1D дельта 1 (белок обмена гуаниновых нуклеотидов)».
  7. ^ Сан Ли Дж., Гю Пак С., Пак Х, Соль В., Ли С., Ким С. (февраль 2002 г.). «Сеть взаимодействия человеческих аминоацил-тРНК синтетаз и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 291 (1): 158–64. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6398. PMID 11829477.
  8. ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
  9. ^ Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
  10. ^ Онг Л.Л., Эр С.П., Хо А., Аунг М.Т., Ю Х. (август 2003 г.). «Кинектин закрепляет дельта-фактор удлинения трансляции-1 в эндоплазматическом ретикулуме». Журнал биологической химии. 278 (34): 32115–23. Дои:10.1074 / jbc.M210917200. PMID 12773547.
  11. ^ «Строковая база данных». Получено 16 мая 2014.

дальнейшее чтение