WikiDer > Фосфотирозин-связывающий домен

Phosphotyrosine-binding domain
Фосфотирозин-связывающий домен
PDB 1wvh EBI.jpg
Структура PTB-домена tensin1.[1]
Идентификаторы
СимволPTB
PfamPF08416
ИнтерПроIPR013625
CDDcd00934
Домен PTB (тип IRS-1)
PDB 1irs EBI.jpg
irs-1 домен ptb в комплексе с фосфопептидом рецептора il-4, ЯМР, минимизированная средняя структура
Идентификаторы
СимволIRS
PfamPF02174
ИнтерПроIPR002404
УМНАЯPTBI
SCOP21cli / Объем / СУПФАМ
CDDcd01204

В молекулярной биологии Фосфотирозин-связывающие домены находятся белковые домены которые связаны с фосфотирозин.

Фосфотирозин-связывающий домен (PTB, также фосфотирозин-взаимодействие или домен PI) в белке тензин как правило, находится в C-конец. Тенсин - это многодоменный белок, который связывается с актиновые нити и функционирует как очаговая адгезия молекула (очаговые спайки - это участки плазматической мембраны, через которые клетки прикрепляются к внеклеточному матриксу). Человек Тенсин имеет актин-сайты привязки, SH2 (Pfam PF00017) домена и области, аналогичной подавитель опухолей PTEN.[2] Домен PTB взаимодействует с цитоплазматический хвосты беты интегрин путем связывания с мотивом NPXY.[3]

Фосфотирозин-связывающий домен субстрат рецептора инсулина-1 не относится к фосфотирозин-связывающему домену тензина. субстрат-1 инсулинового рецептора белки содержат как домен гомологии плекстрина и домен связывания фосфотирозина (PTB). PTB домены способствовать взаимодействие с активированным тирозин-фосфорилированный рецептор инсулина. Домен PTB расположен в направлении N конечная. Два аргинины в этом домене несут ответственность за водородная связь остатки фосфотирозина на Ac-ЛЯССНПАПЫ-NH2 пептид в прилегающей к мембране области рецептора инсулина. Дальнейшее взаимодействие через "мостик" молекулы воды координируются остатки остаток Asn и Ser.[4] Домен PTB имеет компактную 7-нитевую бета-бутерброд структура, закрытая C-концом спираль. Подложка пептид входит в L-образную поверхностную щель, образованную С-концевой спиралью и нитями 5 и 6.[5]

Белки человека, содержащие эти домены

APBA1; APBA2; APBA3; APPL1; EPS8; EPS8L1; EPS8L2; EPS8L3; TENC1; TNS; TNS1; TNS3; TNS4; DOK1; DOK2; DOK3; DOK4; DOK5; DOK6; DOK7; FRS2; FRS3; IRS1; IRS2; IRS4; NOS1AP; TLN1; TLN2

Смотрите также

  • SH2 домены также связывают фосфорилированные тирозины

Рекомендации

  1. ^ МакКлеверти CJ, Лин DC, Liddington RC (июнь 2007 г.). «Структура домена PTB тензина1 и модель его рекрутирования на фибриллярные адгезии». Белковая наука. 16 (6): 1223–9. Дои:10.1110 / пс. 072798707. ЧВК 2206669. PMID 17473008.
  2. ^ Чен Х, Исии А., Вонг В. К., Чен Л. Б., Ло Ш. (октябрь 2000 г.). «Молекулярная характеристика тензина человека». Biochem. J. 351 (2): 403–11. Дои:10.1042/0264-6021:3510403. ЧВК 1221376. PMID 11023826.
  3. ^ Lo SH (январь 2004 г.). «Тенсин». Int. J. Biochem. Cell Biol. 36 (1): 31–4. Дои:10.1016 / S1357-2725 (03) 00171-7. PMID 14592531.
  4. ^ Экк М.Дж., Де-Паганон С., Труб Т., Нолти Р.Т., Шулсон С.Е. (май 1996 г.). «Структура домена IRS-1 PTB, связанного с прилегающей мембранной областью рецептора инсулина». Клетка. 85 (5): 695–705. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81236-2. PMID 8646778. S2CID 8896348.
  5. ^ Чжоу М.М., Хуанг Б., Олейничак Е.Т., Медоуз Р.П., Шукер С.Б., Миядзаки М., Труб Т., Шулсон С.Е., Фесик С.В. (апрель 1996 г.). «Структурная основа распознавания фосфопептида рецептора IL-4 доменом IRS-1 PTB». Nat. Struct. Биол. 3 (4): 388–93. Дои:10.1038 / nsb0496-388. PMID 8599766. S2CID 41440041.

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR013625
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR002404