WikiDer > CDH3 (ген)

CDH3
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4OY9
Идентификаторы
Псевдонимы	CDH3, CDHP, HJMD, PCAD, кадгерин 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 114021 MGI: 88356 ГомолоГен: 20425 Генные карты: CDH3
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 16 (человек)
Конец	68,722,616 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 8 (мышь)
Конец	106,557,297 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ионов кальция; • связывание ионов металлов; • молекулярная функция; • связывание с белками цитоскелета; • активность гомодимеризации белков; • связывание кадгерина;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • неотъемлемый компонент мембраны; • мембрана; • клеточная мембрана; • поверхность клетки; • катениновый комплекс;
Биологический процесс	• процесс цикла волос; • положительная регуляция пролиферации кератиноцитов; • отрицательное регулирование времени катагена; • ответ на стимул; • ороговение; • лечение раны; • регуляция цикла волос каноническим сигнальным путем Wnt; • отрицательное регулирование производства трансформирующего фактора роста бета2; • положительная регуляция активности монофенолмонооксигеназы; • гомеостаз сетчатки; • положительная регуляция экспрессии генов; • клеточная адгезия; • положительная регуляция сигнального пути рецептора инсулиноподобного фактора роста; • канонический путь передачи сигналов Wnt; • положительная регуляция процесса биосинтеза меланина; • положительное регулирование транспорта меланосом; • организация стыковки приверженцев; • ответ на наркотик; • визуальное восприятие; • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны; • межклеточная адгезия; • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt; • сборка ячейки-ячейки; • кальций-зависимая клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны; • межклеточная адгезия, опосредованная кадгерином; • клеточный морфогенез;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1001
	12560
	ENSG00000062038
	ENSMUSG00000061048
	P22223
	P10287
	NM_001793; NM_001317195; NM_001317196
	NM_001037809; NM_007665
	NP_001304124; NP_001304125; NP_001784
	NP_001032898; NP_031691
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

CDH3 (gene)

Кадгерин-3, также известен как П-кадгерин, это белок что у людей кодируется CDH3 ген.^[5]^[6]

Функция

Этот ген - классический кадгерин из надсемейства кадгеринов. Кодируемый белок представляет собой кальций-зависимый гликопротеин межклеточной адгезии, состоящий из пяти внеклеточных повторов кадгерина, трансмембранного участка и высококонсервативного цитоплазматический хвост. Этот ген расположен в кластере из шести кадгеринов в области на длинном плече хромосомы 16, которая участвует в потере событий гетерозиготности при раке груди и простаты. Кроме того, аберрантная экспрессия этого белка наблюдается при аденокарциноме шейки матки.

Клиническое значение

Мутации в этом гене связаны с врожденными гипотрихоз с ювенильной макулярной дистрофией.^[6]

Взаимодействия

CDH3 (ген), как было показано, взаимодействовать с участием:

Смотрите также

Синдром EEM

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000062038 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061048 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Каупманн К., Беккер-Фолльманн Дж., Шерер Г., Йокуш Х., Старзински-Повиц А. (октябрь 1992 г.). «Ген молекулы клеточной адгезии М-кадгерин отображается на хромосоме 8 мыши и хромосоме человека 16q24.1-qter и находится рядом с локусом E-кадгерина (увоморулина) у обоих видов». Геномика. 14 (2): 488–90. Дои:10.1016 / S0888-7543 (05) 80247-2. PMID 1427864.
^ ^а ^б «Ген Энтреза: CDH3 кадгерин 3, тип 1, Р-кадгерин (плацентарный)».
^ ^а ^б ^c ^d Клингельхёфер Дж, Трояновский РБ, Лаур О.Ю., Трояновский С (август 2000 г.). «Амино-концевой домен классических кадгеринов определяет специфичность адгезивных взаимодействий». Журнал клеточной науки. 113 (16): 2829–36. PMID 10910767.
^ ^а ^б Schmeiser K, Grand RJ (апрель 1999 г.). «Судьба E- и P-кадгерина на ранних стадиях апоптоза». Гибель клеток и дифференциация. 6 (4): 377–86. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400504. PMID 10381631.
^ Lehtonen S, Lehtonen E, Kudlicka K, Holthöfer H, Farquhar MG (сентябрь 2004 г.). «Нефрин образует комплекс с белками адгезивных соединений и CASK в подоцитах и в клетках почек собак Madin-Darby, экспрессирующих нефрин». Американский журнал патологии. 165 (3): 923–36. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63354-8. ЧВК 1618613. PMID 15331416.

дальнейшее чтение

Herrenknecht K, Ozawa M, Eckerskorn C, Lottspeich F, Lenter M, Kemler R (октябрь 1991 г.). «Альфа-катенин, связывающий увоморулин, является гомологом винкулина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (20): 9156–60. Дои:10.1073 / пнас.88.20.9156. ЧВК 52671. PMID 1924379.
Симояма Ю., Хирохаши С., Хирано С., Ногучи М., Симосато Ю., Такеити М., Абе О. (апрель 1989 г.). «Молекулы адгезии клеток кадгерина в эпителиальных тканях и карциномах человека». Исследования рака. 49 (8): 2128–33. PMID 2702654.
Симояма Y, Ёсида Т., Терада М., Симосато Ю., Абе О, Хирохаши С. (октябрь 1989 г.). «Молекулярное клонирование Са2 + -зависимой молекулы клеточно-клеточной адгезии человека, гомологичной мышиному кадгерину плаценты: его низкая экспрессия в тканях плаценты человека». Журнал клеточной биологии. 109 (4, п. 1): 1787–94. Дои:10.1083 / jcb.109.4.1787. ЧВК 2115800. PMID 2793940.
Паласиос Дж., Бенито Н., Писарро А., Суарес А., Эспада Дж., Кано А., Гамалло С. (март 1995 г.). «Аномальная экспрессия Р-кадгерина при карциноме груди. Корреляция с экспрессией Е-кадгерина и патологическими особенностями». Американский журнал патологии. 146 (3): 605–12. ЧВК 1869170. PMID 7534041.
van der Linden PJ, de Goeij AF, Dunselman GA, Erkens HW, Evers JL (июнь 1995 г.). «Экспрессия кадгеринов и интегринов в эндометрии человека на протяжении менструального цикла». Фертильность и бесплодие. 63 (6): 1210–6. Дои:10.1016 / s0015-0282 (16) 57599-2. PMID 7538474.
Тан А., Эллер М.С., Хара М., Яар М., Хирохаши С., Гилкрест Б.А. (апрель 1994 г.). «E-кадгерин является основным медиатором адгезии меланоцитов человека к кератиноцитам in vitro». Журнал клеточной науки. 107 (4): 983–92. PMID 8056851.
Тассин М.Т., Безиау А., Гублер М.С., Бойер Б. (март 1994 г.). «Пространственно-временная экспрессия молекул, связанных с соединительными комплексами во время созревания in vivo почечных подоцитов». Международный журнал биологии развития. 38 (1): 45–54. PMID 8074995.
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Наварро П., Лозано Е., Кано А. (август 1993 г.). «Экспрессии E- или P-кадгерина недостаточно для изменения морфологии и онкогенного поведения клеток карциномы веретена мыши. Возможное участие плакоглобина». Журнал клеточной науки. 105 (4): 923–34. PMID 8227214.
Reynolds AB, Daniel JM, Mo YY, Wu J, Zhang Z (июнь 1996 г.). «Новый катенин p120cas связывает классические кадгерины и вызывает необычный морфологический фенотип в фибробластах NIH3T3». Экспериментальные исследования клеток. 225 (2): 328–37. Дои:10.1006 / excr.1996.0183. PMID 8660921.
Soler AP, Harner GD, Knudsen KA, McBrearty FX, Grujic E, Salazar H, Han AC, Keshgegian AA (август 1997 г.). «Экспрессия P-кадгерина позволяет идентифицировать простатоспецифические антиген-отрицательные клетки в эпителиальных тканях мужских половых дополнительных органов и в карциномах простаты. Значение для биологии рака простаты». Американский журнал патологии. 151 (2): 471–8. ЧВК 1858007. PMID 9250159.
Вакита Х., Фурукава Ф., Баба С., Такигава М. (ноябрь 1997 г.). «Клетки линии клеток плоскоклеточной карциномы человека (DJM-1) синтезируют молекулы Р-кадгерина посредством повышения внеклеточного кальция: кальций регулирует экспрессию гена Р-кадгерина на уровне трансляции посредством фосфорилирования тирозина белка». Международный журнал рака. 73 (3): 432–9. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 (19971104) 73: 3 <432 :: AID-IJC19> 3.0.CO; 2-E. PMID 9359492.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Креммидиотис Дж., Бейкер Е., Кроуфорд Дж., Эйр Х. Дж., Нахмиас Дж., Каллен Д. Ф. (май 1998 г.). «Локализация генов кадгерина человека в областях хромосом, демонстрирующих связанную с раком потерю гетерозиготности». Геномика. 49 (3): 467–71. Дои:10.1006 / geno.1998.5281. PMID 9615235.
Джаррард Д.Ф., Пол Р., ван Боховен А., Нгуен С.Х., Бова Г.С., Уилок М.Дж., Джонсон К.Р., Шалкен Дж., Бассемейкерс М., Айзекс В.Б. (ноябрь 1997 г.). «Р-кадгерин представляет собой базальный клеточно-специфический эпителиальный маркер, который не экспрессируется при раке простаты». Клинические исследования рака. 3 (11): 2121–8. PMID 9815605.
Schmeiser K, Grand RJ (апрель 1999 г.). «Судьба E- и P-кадгерина на ранних стадиях апоптоза». Гибель клеток и дифференциация. 6 (4): 377–86. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400504. PMID 10381631.
Руфас О., Фиш Б., Зив С., Шалги Р. (февраль 2000 г.). «Экспрессия молекул адгезии кадгерина на человеческих гаметах». Молекулярная репродукция человека. 6 (2): 163–9. Дои:10.1093 / моль · ч / 6.2.163. PMID 10655458.
Клингельхёфер Дж, Трояновский РБ, Лаур О.Ю., Трояновский С (август 2000 г.). «Амино-концевой домен классических кадгеринов определяет специфичность адгезивных взаимодействий». Журнал клеточной науки. 113 (16): 2829–36. PMID 10910767.
Хан А.С., Эдельсон М.И., Перальта Солер А., Кнудсен К.А., Лифшиц-Мерсер Б., Чернобыльский Б., Розенблюм Н.Г., Салазар Н. (ноябрь 2000 г.). «Экспрессия кадгерина в железистых опухолях шейки матки». Рак. 89 (10): 2053–8. Дои:10.1002 / 1097-0142 (20001115) 89:10 <2053 :: AID-CNCR4> 3.0.CO; 2-C. PMID 11066045.
Bauer K, Gosau M, Reinders J, Oefner P, Reichert TE, Bauer R (ноябрь 2013 г.). «Пресенилин 1 / γ-секретаза модулирует процессинг Р-кадгерина и влияет на адгезию клеток в клеточных линиях плоскоклеточной карциномы полости рта». Канцерогенез. 34 (11): 2622–8. Дои:10.1093 / carcin / bgt211. PMID 23740836.

внешние ссылки

CDH3 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
CDH3 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.

Эта статья о ген на хромосома человека 16 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000062038 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061048 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1427864-5] Каупманн К., Беккер-Фолльманн Дж., Шерер Г., Йокуш Х., Старзински-Повиц А. (октябрь 1992 г.). «Ген молекулы клеточной адгезии М-кадгерин отображается на хромосоме 8 мыши и хромосоме человека 16q24.1-qter и находится рядом с локусом E-кадгерина (увоморулина) у обоих видов». Геномика. 14 (2): 488–90. Дои:10.1016 / S0888-7543 (05) 80247-2. PMID 1427864.

[entrez-6] а ^б «Ген Энтреза: CDH3 кадгерин 3, тип 1, Р-кадгерин (плацентарный)».

[pmid10910767-7] а ^б ^c ^d Клингельхёфер Дж, Трояновский РБ, Лаур О.Ю., Трояновский С (август 2000 г.). «Амино-концевой домен классических кадгеринов определяет специфичность адгезивных взаимодействий». Журнал клеточной науки. 113 (16): 2829–36. PMID 10910767.

[pmid10381631-8] а ^б Schmeiser K, Grand RJ (апрель 1999 г.). «Судьба E- и P-кадгерина на ранних стадиях апоптоза». Гибель клеток и дифференциация. 6 (4): 377–86. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400504. PMID 10381631.

[pmid15331416-9] Lehtonen S, Lehtonen E, Kudlicka K, Holthöfer H, Farquhar MG (сентябрь 2004 г.). «Нефрин образует комплекс с белками адгезивных соединений и CASK в подоцитах и в клетках почек собак Madin-Darby, экспрессирующих нефрин». Американский журнал патологии. 165 (3): 923–36. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63354-8. ЧВК 1618613. PMID 15331416.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

Navigation