WikiDer > DSC3

DSC3
DSC3
Идентификаторы
ПсевдонимыDSC3, CDHF3, DSC, DSC1, DSC2, DSC4, HT-CP, десмоколлин 3
Внешние идентификаторыOMIM: 600271 MGI: 1194993 ГомолоГен: 1462 Генные карты: DSC3
Расположение гена (человек)
Хромосома 18 (человек)
Chr.Хромосома 18 (человек)[1]
Хромосома 18 (человек)
Геномное расположение DSC3
Геномное расположение DSC3
Группа18q12.1Начните30,989,365 бп[1]
Конец31,042,815 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DSC3 206032 в формате fs.png

PBB GE DSC3 206033 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_024423
NM_001941

NM_001291809
NM_007882

RefSeq (белок)

NP_001932
NP_077741

NP_001278738
NP_031908

Расположение (UCSC)Chr 18: 30.99 - 31.04 МбChr 18: 19.96 - 20 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Десмоколлин-3 это белок что у людей кодируется DSC3 ген.[5][6][7]

Ген

Члены десмосомного семейства расположены в двух кластерах на 18 хромосоме, занимая вместе менее 650 т.п.н. Альтернативный сплайсинг приводит к двум вариантам транскрипта, кодирующим разные изоформы.[7]

Функция

Десмоколлин-3 кальций-зависимый гликопротеин это член десмоколлин подсемейство кадгерин надсемейство. Эти десмосомный члены семьи, вместе с десмоглеины, обнаруживаются в первую очередь в эпителиальных клетках, где они составляют адгезивные белки десмосомного межклеточного соединения и необходимы для клеточной адгезии и образования десмосом.[7] Потеря этих компонентов приводит к отсутствию адгезии и увеличению подвижности клеток.[8]

Клиническое значение

Рак молочной железы

В процессе эпигенетический заглушить, экспрессия белка десмоколлина-3 снижается во многих рак груди.[8]

Наследственный гипотрихоз

А кровнородственный Афганская семья, в которой 3 сестры в возрасте от 12 до 18 лет и их 5-летний брат проявляли черты наследственности. гипотрихоз, связанные с пузырьками на коже и волосистой части головы.[9] При рождении волосы на коже головы присутствовали, а после ритуального бритья в возрасте 1 недели волосы на коже головы снова отрастали; однако волосы были хрупкими и начали выпадать в возрасте 2–3 месяцев, в результате чего на коже головы остались лишь редкие волосы. Везикулы диаметром менее 1 см наблюдались на коже черепа и большей части тела, иногда исчезали, но затем появлялись снова; периодически пузырьки лопаются с выделением жидкости, оставляя на этом участке рубцы, на заживление которых уходило от 3 до 4 месяцев. Везикул слизистой оболочки не обнаружено. При осмотре у пораженных людей почти не было бровей, ресниц, волос в подмышечных впадинах и волос на теле. Зубы, ногти, ладони, подошвы, потливость и слух были нормальными, как и электрокардиография. Сыворотка IgA, IgE, и IgD были измерены у 1 человека и не показали изменений по сравнению с контролем. Родители клинически не пострадали. Биопсия кожи головы 18-летней сестры показала небольшое закупоривание фолликулов, умеренное присутствие периваскулярных и периаднексальных воспалительных клеток и нормальные волосяные фолликулы. Сальные железы выглядели морфологически нормальными и были связаны с волосяными фолликулами.[9]

Картография

Генотипирование и анализ связей кровнородственной афганской семьи показал максимальную 2-балльную нагрузку 2,68 (тета = 0,0) по маркерам D18S36 и D18S547. Многоточечный анализ показал максимальную оценку нагрузки 3,30 для маркера D18S877. Рекомбинация события определили критический интервал 8,30 см на хромосоме 18q12.1, фланкированный маркерами D18S66 и D18S1139, содержащими 30 генов.[9]

Молекулярная генетика

Нонсенс-мутация в гене DSC3 (600271.0001), отображаемая на хромосоме 18q12.1, была идентифицирована в афганской семье кровного родства с гипотрихозом и рецидивирующими кожными пузырьками (613102). Незатронутые родители и 3 здоровых брата и сестры были гетерозиготными по мутации, которая не была обнаружена у 100 неродственных, этнически сопоставимых контрольных групп.[9] У пораженных членов этой семьи гипотрихозом были гомозиготный для трансверсии 2129T-G в экзоне 14 гена DSC3, приводящей к замене leu710-to-ter (L710X; Ayub et al. 2009) на стыке трансмембранного и C-концевого цитоплазматического домена, что, по прогнозам, вызывает преждевременное обрыв и бессмысленный распад мРНК или нестабильность усеченного белка. Незатронутые родители и 3 здоровых брата и сестры были гетерозиготными по мутации, которая не была обнаружена в 100 неродственных этнически сопоставимых контрольных группах.[9]

Взаимодействия

DSC3 был показан взаимодействовать с участием ПКП3.[10]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134762 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059898 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Amagai M, Wang Y, Minoshima S, Kawamura K, Green KJ, Nishikawa T., Shimizu N (июль 1995 г.). «Отнесение человеческих генов десмоколлина 3 (DSC3) и десмоколлина 4 (DSC4) к хромосоме 18q12». Геномика. 25 (1): 330–2. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80154-Е. PMID 7774948.
  6. ^ Бакстон Р.С., Коуин П., Фрэнк В.В., Гаррод Д.Р., Грин К.Дж., Кинг И.А., Кох П.Дж., Маги А.И., Рис Д.А., Стэнли-младший и др. (Июнь 1993 г.). «Номенклатура десмосомных кадгеринов» (PDF). J Cell Biol. 121 (3): 481–3. Дои:10.1083 / jcb.121.3.481. ЧВК 2119574. PMID 8486729.
  7. ^ а б c «Энтрез Ген: десмоколлин 3 DSC3».
  8. ^ а б Оширо MM, Ким CJ, Возняк RJ, Junk DJ, Муньос-Родригес JL, Burr JA, Fitzgerald M, Pawar SC, Cress AE, Domann FE, Futscher BW (2005). «Эпигенетическое подавление DSC3 - обычное явление при раке груди человека». Рак груди Res. 7 (5): R669–80. Дои:10.1186 / bcr1273. ЧВК 1242132. PMID 16168112.
  9. ^ а б c d е Аюб М., Басит С., Джелани М., Ур Рехман Ф., Икбал М., Ясинзай М., Ахмад В. (октябрь 2009 г.). «Гомозиготная бессмысленная мутация гена десмоколлина-3 человека (DSC3) лежит в основе наследственного гипотрихоза и рецидивирующих кожных пузырьков». Am. J. Hum. Genet. 85 (4): 515–20. Дои:10.1016 / j.ajhg.2009.08.015. ЧВК 2756559. PMID 19765682.
  10. ^ Бонне С., Гилберт Б., Хацфельд М., Чен Х, Грин К.Дж., ван Рой Ф. (апрель 2003 г.). «Определение десмосомальных взаимодействий плакофилина-3». J. Cell Biol. 161 (2): 403–16. Дои:10.1083 / jcb.200303036. ЧВК 2172904. PMID 12707304.

дальнейшее чтение