WikiDer > Белок, связанный с рецепторами ЛПНП - Википедия

LDL-receptor-related protein-associated protein - Wikipedia
LRPAP1
Белок LRPAP1 PDB 1lre.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыLRPAP1, A2MRAP, A2RAP, HBP44, MRAP, MYP23, RAP, альфа-2-MRAP, белок, связанный с рецептором LDL, белок, связанный с рецептором LDL, белок 1, связанный с рецептором LDL
Внешние идентификаторыOMIM: 104225 MGI: 96829 ГомолоГен: 37612 Генные карты: LRPAP1
Расположение гена (человек)
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек)[1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение LRPAP1
Геномное расположение LRPAP1
Группа4п16.3Начинать3,503,612 бп[1]
Конец3,532,446 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE LRPAP1 201186 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4043

16976

Ансамбль

ENSG00000163956

ENSMUSG00000029103

UniProt

P30533

P55302

RefSeq (мРНК)

NM_002337

NM_013587

RefSeq (белок)

NP_002328

NP_038615

Расположение (UCSC)Chr 4: 3.5 - 3.53 МбChr 5: 35.09 - 35.11 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши
Альфа-2-MRAP_N
PDB 2fyl EBI.jpg
модель пикши комплекса между двойным модулем lrp, cr56, и первым доменом рецептор-ассоциированного белка, rap-d1.
Идентификаторы
СимволАльфа-2-MRAP_N
PfamPF06400
ИнтерПроIPR009066
SCOP21лр / Объем / СУПФАМ
Альфа-2-MRAP_C
PDB 2ftu EBI.jpg
структура решения области 3 рэпа
Идентификаторы
СимволАльфа-2-MRAP_C
PfamPF06401
ИнтерПроIPR010483

Белок-ассоциированный белок 1, связанный с рецептором липопротеинов низкой плотности также известный как LRPAP1 или же РЭП является сопровождающим белок который у человека кодируется LRPAP1 ген.[5][6]

Функция

LRPAP1 связан с торговлей некоторыми членами Рецептор ЛПНП семья в том числе LRP1 и LRP2.[7] Это гликопротеин который связывает к рецептору альфа-2-макроглобулина, а также к другим членам липопротеин низкой плотности рецептор семья. Он действует, чтобы подавить привязка из всех известных лиганды для этих рецепторов, и может предотвратить рецептор агрегирование и деградация в эндоплазматическом ретикулуме, тем самым действуя как молекулярный сопровождающий.[8] Это может быть под регулирующий контроль кальмодулина, так как он способен связывать кальмодулин и быть фосфорилированный кальмодулин-зависимым киназа II.

Взаимодействия

Было показано, что белок, связанный с рецептором ЛПНП, ассоциированный с белком взаимодействовать с LRP2.[9][10]

Мутации и заболевания, связанные с LRPAP1

Белки, метаболизирующие липиды, могут повышать восприимчивость к слабоумие что приводит к различиям в генетическом составе.[11] Методика полиморфизма длин рестрикционных фрагментов ПЦР используется для генотипирования LRPAP1 вставка / удаление интрона 5.[11] Исследования показали, что генотип DD и аллель * D гена LRPAP показали повышенную частоту дегенеративных деменций по сравнению с контрольной группой и что аллель LRPAP1-D заметно увеличивает уязвимость к дегенеративным деменциям.[11] При генотипировании полиморфизм LRPAP1 наблюдается из-за вставки 37 пар оснований в интрон 5.[11] Кроме того, размер инсерционного аллеля больше, чем делеционного аллеля, что позволяет обнаруживать разницу с помощью гель-электрофореза.[12]Подавление рецептор-связывающего домена LRP LDLR происходит из-за сверхэкспрессии LRPAP (белкового продукта гена LRPAP).[13] LRP обеспечивает защиту через LDL с помощью LRPAP, и его подавление может быть связано с повышением LDL и связанной с Ab нейрональной токсичностью, поскольку LRP поддерживает связывание лиганда и интернализацию лигандов LRP, таких как апо-E-обогащенный холестерин LDL и белок Ab.[11] Вставка / делеция представляет собой интронный полиморфизм гена LRPAP, влияющий на генотип DD и аллель D для синтеза белка LRPAP может быть lrp-опосредованным механизмом, способствующим деменции.[11] Беспокойство по поводу развития чувствительности к деменции связано с несколькими общими генетическими платформами, и генотип DD или аллель D гена LRPAP могут быть одним из них.[11] Таким образом, инсерция / делеция 37 п.н., которая была изучена как интронный полиморфизм, могла иметь непреднамеренное стремление к белку липидного рецептора посредством регуляции экспрессии LRPAP, или это могло быть неравновесным сцеплением в дополнение к другому биологически значимому полиморфизму в LRPAP1 или соседний ген в хромосоме 4.[14] Результаты согласуются с более ранним исследованием, в котором авторы допустили удаление частота аллеля явно высокий у пациентов с болезнью Альцгеймера с поздним началом по сравнению с контрольной группой пожилых людей без деменции.[14]

Менделирующие формы миопия был идентифицирован в четырех родственных семьях и является вероятными причинными мутациями, реализующими экзом / аутозигом, исследованные для распознавания гомозиготных укороченных вариантов в LRPAP1.[15] Влияние TGF-β активности, шаперон LRP1 кодируется LRPAP1. Заметно выраженный дефицит LRP1 и повышающая регуляция TGF-β в пораженных клетках индивидуумов, известные данные согласуются с важностью TGF-β в ремоделировании склеры миопии и увеличивают частоту миопии у людей, страдающих миопией. Синдром Марфана который имеет характеристики активации передачи сигналов TGF-β.[16] Анализ отсутствия нормального белка был выполнен с помощью иммуноблоттинга пораженных лиц, имеющих мутации LRPAP1, выявляющие мутации в LRPAP1 вероятность мутаций с потерей функции.[15] Кодирование (белок 1, связанный с рецептором липопротеинов низкой плотности) LRPAP представляет собой в значительной степени экспрессируемый ген, а белок из 357 аминокислот считается связывающим шаперон и защищающим белки, связанные с рецептором липопротеинов. LRP1 и LRP2.[17][18] Модель, предложенная в исследовании, в котором LRPAP1 приводит к дефициту LRP1 который был ответственен за нарушение регуляции TGF-β и мог вызвать аномальное ремоделирование ВКМ в развитии глаза.[15] Наблюдение за увеличением осевой длины было одной из основных особенностей Синдром Марфана также приводит к TGF-β поддержал модель.[19][20] Следовательно, люди с миопией, отвечающие на терапевтическую стратегию, начатую до ремоделирования ВКМ, могут рассматриваться как подход для людей с миопией, связанной с LRPAP1.[15]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163956 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029103 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Стрикленд Д.К., Эшком Д.Д., Уильямс С., Бэтти Ф., Бер Э., Мактиг К., Бэтти Д.Ф., Аргрейвс WS (июль 1991 г.). «Первичная структура белка, ассоциированного с рецептором альфа-2-макроглобулина. Человеческий гомолог антигена нефрита Хеймана». Журнал биологической химии. 266 (20): 13364–9. PMID 1712782.
  6. ^ Коренберг-младший, Аргрейвс К.М., Чен XN, Тран Х., Стрикленд Д.К., Аргрейвс WS (июль 1994 г.). «Хромосомная локализация человеческих генов гликопротеина 330 члена семейства рецепторов LDL (LRP2) и связанного с ним белка RAP (LRPAP1)». Геномика. 22 (1): 88–93. Дои:10.1006 / geno.1994.1348. PMID 7959795.
  7. ^ «Ген Entrez: белок 1, связанный с рецептором липопротеинов низкой плотности LRPAP1».
  8. ^ Nielsen PR, Ellgaard L, Etzerodt M, Thogersen HC, Poulsen FM (июль 1997 г.). «Структура раствора N-концевого домена белка, ассоциированного с рецептором альфа2-макроглобулина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (14): 7521–5. Дои:10.1073 / пнас.94.14.7521. ЧВК 23854. PMID 9207124.
  9. ^ Лу X, Маккуистан Т., Орландо Р.А., Фаркуар М.Г. (апрель 2002 г.). «GAIP, GIPC и Galphai3 сконцентрированы в эндоцитарных компартментах клеток проксимальных канальцев: предполагаемая роль в регуляции функции мегалина». Журнал Американского общества нефрологов. 13 (4): 918–27. PMID 11912251.
  10. ^ Орландо Р.А., Фаркуар М.Г. (апрель 1994 г.). «Функциональные домены рецептор-ассоциированного белка (RAP)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (8): 3161–5. Дои:10.1073 / pnas.91.8.3161. ЧВК 43535. PMID 7512726.
  11. ^ а б c d е ж грамм Пандей П., Прадхан С., Миттал Б. (2008). «Ген ассоциированного с LRP белка (LRPAP1) и предрасположенность к дегенеративной деменции». Гены, мозг и поведение. 7 (8): 943–950. Дои:10.1111 / j.1601-183X.2008.00436.x. PMID 18721259. S2CID 19207648.
  12. ^ Пандей П., Прадхан С., Миттал Б. (2008). «Ген ассоциированного с LRP белка (LRPAP1) и предрасположенность к дегенеративной деменции». Гены, мозг и поведение. 7 (8): 943–50. Дои:10.1111 / j.1601-183X.2008.00436.x. PMID 18721259. S2CID 19207648.
  13. ^ Willnow TE, Sheng Z, Ishibashi S, Herz J (1994). «Ингибирование захвата остатков хиломикронов в печени путем переноса гена антагониста рецептора». Наука. 264 (5164): 1471–4. Дои:10.1126 / science.7515194. PMID 7515194.
  14. ^ а б Санчес Л., Альварес В., Гонсалес П., Гонсалес И., Альварес Р., Кото Е. (2001). «Вариация гена LRP-ассоциированного белка (LRPAP1) связана с поздним началом болезни Альцгеймера». Американский журнал медицинской генетики. 105 (1): 76–8. Дои:10.1002 / 1096-8628 (20010108) 105: 1 <76 :: aid-ajmg1066> 3.3.co; 2-я. PMID 11425005.
  15. ^ а б c d Алдахмеш М.А., Хан А.О., Алкурая Х., Адли Н., Анази С., Аль-Салех А.А., Мохамед Дж.Й., Хиджази Х., Прабакаран С., Таке М., Аль-Храши А., Хашем М., Райнхекель Т., Ассири А., Алькурая Ф.С. (2013 г. -08-08). «Мутации в LRPAP1 связаны с тяжелой миопией у людей». Am J Hum Genet. 93 (2): 313–20. Дои:10.1016 / j.ajhg.2013.06.002. ЧВК 3738831. PMID 23830514.
  16. ^ Алдахмеш М.А., Хан А.О., Алкурая Х., Адли Н., Анази С., Аль-Салех А.А., Мохамед Дж.Й., Хиджази Х., Прабакаран С., Таке М., Аль-Храши А., Хашем М., Райнхекель Т., Ассири А., Алькурая Ф.С. (2013 г. ). «Мутации в LRPAP1 связаны с тяжелой миопией у людей». Американский журнал генетики человека. 93 (2): 313–20. Дои:10.1016 / j.ajhg.2013.06.002. ЧВК 3738831. PMID 23830514.
  17. ^ Willnow TE, Armstrong SA, Hammer RE, Herz J (1995). «Функциональная экспрессия белка, связанного с рецептором липопротеина низкой плотности, контролируется in vivo с помощью белка, связанного с рецептором». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (10): 4537–41. Дои:10.1073 / пнас.92.10.4537. ЧВК 41979. PMID 7538675.
  18. ^ Willnow TE, Rohlmann A, Horton J, Otani H, Braun JR, Hammer RE, Herz J (1996). «RAP, специализированный шаперон, предотвращает индуцированное лигандом удержание ER и деградацию эндоцитарных рецепторов, связанных с рецепторами LDL». Журнал EMBO. 15 (11): 2632–9. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00623.x. ЧВК 450198. PMID 8654360.
  19. ^ Loeys BL, Dietz HC, Braverman AC, Callewaert BL, De Backer J, Devereux RB, Hilhorst-Hofstee Y, Jondeau G, Faivre L, Milewicz DM, Pyeritz RE, Sponseller PD, Wordsworth P, De Paepe AM (2010). «Пересмотренная гентская нозология синдрома Марфана». Журнал медицинской генетики. 47 (7): 476–85. Дои:10.1136 / jmg.2009.072785. HDL:1854 / LU-1013955. PMID 20591885. S2CID 13895128.
  20. ^ Брук Б.С., Хабаши Дж.П., судья Д.П., Патель Н., Лойс Б., Дитц ХК (2008). «Блокада ангиотензина II и дилатация корня аорты при синдроме Марфана». Медицинский журнал Новой Англии. 358 (26): 2787–95. Дои:10.1056 / NEJMoa0706585. ЧВК 2692965. PMID 18579813.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR010483