WikiDer > Бета-рецептор лимфотоксина

LTBR
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1RF3, 4MXW
Идентификаторы
Псевдонимы	LTBR, CD18, D12S370, LT-BETA-R, TNF-R-III, TNFCR, TNFR-RP, TNFR2-RP, TNFR3, TNFRSF3, рецептор лимфотоксина бета
Внешние идентификаторы	OMIM: 600979 MGI: 104875 ГомолоГен: 1753 Генные карты: LTBR
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 12 (человек)
Конец	6,391,571 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 6 (мышь)
Конец	125,313,885 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • активность рецептора, активируемого фактором некроза опухоли; • идентичное связывание с белками; • связывание убиквитин-протеин-лигазы;
Сотовый компонент	• неотъемлемый компонент мембраны; • мембрана; • клеточная мембрана; • неотъемлемый компонент плазматической мембраны; • аппарат Гольджи;
Биологический процесс	• миелоидная дифференцировка дендритных клеток; • сигнальный путь, опосредованный фактором некроза опухоли; • положительное регулирование каскада JNK; • развитие многоклеточного организма; • клеточный ответ на механический стимул; • ответ на липополисахарид; • регулирование пролиферации клеток; • положительная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути; • воспалительная реакция; • GO: 0022415 вирусный процесс; • преобразование сигнала; • апоптотический процесс; • иммунная реакция; • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB; • развитие гемопоэтических или лимфоидных органов;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	4055
	17000
	ENSG00000111321
	ENSMUSG00000030339
	P36941
	P50284
	NM_001270987; NM_002342
	NM_010736
	NP_001257916; NP_002333
	NP_034866
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Lymphotoxin beta receptor

Бета-рецептор лимфотоксина (LTBR), также известный как член суперсемейства рецепторов фактора некроза опухолей 3 (TNFRSF3), это рецептор клеточной поверхности за лимфотоксин участвует в апоптоз и цитокин релиз.^[5]^[6]^[7] Он является членом рецептор фактора некроза опухоли надсемейство.

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом фактор некроза опухоли (TNF) семейство рецепторов. Он экспрессируется на поверхности большинства типов клеток, включая клетки эпителиальный и миелоидный линии, но не на Т и B лимфоциты. Белок специфически связывает лимфотоксин мембранная форма (комплекс лимфотоксина-альфа и лимфотоксина-бета). Кодируемый белок и его лиганд играют роль в развитии и организации лимфоидная ткань и трансформированные клетки. Активация кодируемого белка может запускать апоптоз.^[5]

LTBR не только помогает вызвать апоптоз, но и может привести к высвобождению цитокин интерлейкин 8. Сверхэкспрессия LTBR в HEK293 клетки увеличивает активность промотора IL-8 и приводит к высвобождению IL-8. LTBR также важен для развития и организации вторичных лимфоидных органов и высвобождения хемокинов.^[8]

Структура

Графики Рамачандрана показывают, что 64,6% всех остатков находятся в благоприятной области. Эта структура была обнаружена с помощью дифракции рентгеновских лучей. Разрешение составляет 3,50 ангстрем. Углы альфа и бета составляют 90 градусов, а угол гаммы - 120 градусов.^[9]

Взаимодействия

Бета-рецептор лимфотоксина может взаимодействовать с Гомолог Diablo^[10] и TRAF3.^[11]^[12]^[13]

дальнейшее чтение

Elewaut D, Ware CF (2007). «Нетрадиционная роль LT-альфа-бета в дифференцировке Т-клеток». Тенденции Иммунол. 28 (4): 169–75. Дои:10.1016 / j.it.2007.02.005. PMID 17336158.
Браунинг Дж. Л., Нгам-эк А., Лоутон П. и др. (1993). «Лимфотоксин бета, новый член семейства TNF, который образует гетеромерный комплекс с лимфотоксином на поверхности клетки». Клетка. 72 (6): 847–56. Дои:10.1016 / 0092-8674 (93) 90574-А. PMID 7916655. S2CID 28961163.
Кроу П.Д., ВанАрсдейл Т.Л., Уолтер Б.Н. и др. (1994). «Бета-специфический рецептор лимфотоксина». Наука. 264 (5159): 707–10. Bibcode:1994Наука ... 264..707C. Дои:10.1126 / science.8171323. PMID 8171323.
Баенс М., Чаффанет М., Кассиман Дж. Дж. И др. (1993). «Создание и оценка библиотеки hncDNA транскрибированных последовательностей 12p человека, полученных из гибрида соматических клеток». Геномика. 16 (1): 214–8. Дои:10.1006 / geno.1993.1161. PMID 8486360.
Баенс М., Аерсенс Дж., Ван Занд К. и др. (1996). «Выделение и региональное распределение кДНК хромосомы 12p человека». Геномика. 29 (1): 44–52. Дои:10.1006 / geno.1995.1213. PMID 8530100.
Ван X, Bornslaeger EA, Haub O и др. (1996). «Ген-кандидат для мутации мышей на стадии гаструляции без амниона кодирует TRAF-родственный белок». Dev. Биол. 177 (1): 274–90. Дои:10.1006 / dbio.1996.0162. PMID 8660894.
Накано Х., Осима Х., Чунг В. и др. (1996). «TRAF5, активатор NF-kappaB и предполагаемый преобразователь сигнала для рецептора лимфотоксина-бета». J. Biol. Chem. 271 (25): 14661–4. Дои:10.1074 / jbc.271.25.14661. PMID 8663299.
Мацумото М., Се Т.Ю., Чжу Н. и др. (1997). «Корбовый белок вируса гепатита С взаимодействует с цитоплазматическим хвостом рецептора лимфотоксина-бета». Дж. Вирол. 71 (2): 1301–9. Дои:10.1128 / JVI.71.2.1301-1309.1997. ЧВК 191185. PMID 8995654.
ВанАрсдейл Т.Л., ВанАрсдейл С.Л., Force WR и др. (1997). «Сигнальный комплекс рецептора лимфотоксина-бета: роль фактора 3, связанного с рецептором фактора некроза опухоли, в гибели клеток и активации ядерного фактора kappaB». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (6): 2460–5. Bibcode:1997PNAS ... 94.2460V. Дои:10.1073 / пнас.94.6.2460. ЧВК 20110. PMID 9122217.
Wu MY, Hsu TL, Lin WW и др. (1997). «Активность серин / треонинкиназы, связанная с цитоплазматическим доменом рецептора лимфотоксина-бета в клетках HepG2». J. Biol. Chem. 272 (27): 17154–9. Дои:10.1074 / jbc.272.27.17154. PMID 9202035.
Чен СМ, Ю Л.Р., Хван Л.Х., Ли Ю.Х. (1997). «Прямое взаимодействие корового белка вируса гепатита С с клеточным рецептором лимфотоксина-бета модулирует сигнальный путь рецептора лимфотоксина-бета». Дж. Вирол. 71 (12): 9417–26. Дои:10.1128 / JVI.71.12.9417-9426.1997. ЧВК 230246. PMID 9371602.
Мидзусима С., Фудзита М., Исида Т. и др. (1998). «Клонирование и характеристика кДНК, кодирующей человеческий гомолог фактора 5, ассоциированного с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF5)». Ген. 207 (2): 135–40. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00616-1. PMID 9511754.
Krajewska M, Krajewski S, Zapata JM, et al. (1998). «Экспрессия TRAF-4 в эпителиальных клетках-предшественниках. Анализ в нормальных тканях взрослого человека, плода и опухоли». Являюсь. Дж. Патол. 152 (6): 1549–61. ЧВК 1858434. PMID 9626059.
Буссо В., Солер П., Моро Дж. И др. (1999). «Экспрессия трех членов семейства рецепторов TNF-R (4-1BB, рецептор лимфотоксина-бета и Fas) в легких человека». Евро. Респир. J. 12 (4): 926–31. Дои:10.1183/09031936.98.12040926. PMID 9817170.
Мерфи М., Уолтер Б.Н., Пайк-Нобиле Л. и др. (1999). «Экспрессия рецептора лимфотоксина бета на фолликулярных стромальных клетках в лимфоидных тканях человека». Разница в гибели клеток. 5 (6): 497–505. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400374. PMID 10200501.
Wu MY, Wang PY, Han SH, Hsieh SL (1999). «Цитоплазматический домен рецептора лимфотоксина-бета опосредует гибель клеток в клетках HeLa». J. Biol. Chem. 274 (17): 11868–73. Дои:10.1074 / jbc.274.17.11868. PMID 10207006.
Yu KY, Kwon B, Ni J и др. (1999). «Недавно идентифицированный член суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли (TR6) подавляет LIGHT-опосредованный апоптоз». J. Biol. Chem. 274 (20): 13733–6. Дои:10.1074 / jbc.274.20.13733. PMID 10318773.
Руни И.А., Бутрович К.Д., Гласс А.А. и др. (2000). «Рецептор лимфотоксина-бета необходим и достаточен для LIGHT-опосредованного апоптоза опухолевых клеток». J. Biol. Chem. 275 (19): 14307–15. Дои:10.1074 / jbc.275.19.14307. PMID 10799510.
Лангегген Х., Берге К.Э., Джонсон Э., Хетланд Г. (2003). «Эндотелиальные клетки пупочной вены человека экспрессируют рецептор комплемента 1 (CD35) и рецептор комплемента 4 (CD11c / CD18) in vitro». Воспаление. 26 (3): 103–10. Дои:10.1023 / А: 1015585530204. PMID 12083416. S2CID 54700.
Чанг Й.Х., Се С.Л., Чен М.С., Лин У.В. (2002). «Рецептор лимфотоксина бета индуцирует экспрессию гена интерлейкина 8 посредством активации NF-kappaB и AP-1». Exp. Cell Res. 278 (2): 166–74. Дои:10.1006 / excr.2002.5573. PMID 12169272.

внешняя ссылка

Лимфотоксин + бета + рецептор в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111321 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030339 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] а ^б «Ген Entrez: LTBR-рецептор лимфотоксина бета (надсемейство TNFR, член 3)».

[pmid8486360-6] Баенс М., Чаффанет М., Кассиман Дж. Дж., Ван ден Берге Х., Маринен П. (апрель 1993 г.). «Создание и оценка библиотеки hncDNA транскрибированных последовательностей 12p человека, полученных из гибрида соматических клеток». Геномика. 16 (1): 214–8. Дои:10.1006 / geno.1993.1161. PMID 8486360.

[pmid8171323-7] Crowe PD, VanArsdale TL, Walter BN, Ware CF, Hession C, Ehrenfels B, Browning JL, Din WS, Goodwin RG, Smith CA (апрель 1994). «Бета-специфический рецептор лимфотоксина». Наука. 264 (5159): 707–10. Bibcode:1994Наука ... 264..707C. Дои:10.1126 / science.8171323. PMID 8171323.

[pmid12169272-8] Чанг Й.Х., Се С.Л., Чен М.С., Лин У.В. (август 2002 г.). «Рецептор лимфотоксина бета индуцирует экспрессию гена интерлейкина 8 посредством активации NF-kappaB и AP-1». Exp. Cell Res. 278 (2): 166–74. Дои:10.1006 / excr.2002.5573. PMID 12169272.

[9] «Анализ MolProbity Ramachandran» (PDF). Архивировано из оригинал (PDF) на 2012-10-12.

[pmid12571250-10] Куай, Джун; Никбарг Эллиотт; Вутерс Джо; Цю Юнчан; Ван Джек; Линь Лих-Линг (апрель 2003 г.). «Эндогенная ассоциация TRAF2, TRAF3, cIAP1 и Smac с рецептором лимфотоксина бета раскрывает новый механизм апоптоза». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 278 (16): 14363–9. Дои:10.1074 / jbc.M208672200. ISSN 0021-9258. PMID 12571250.

[pmid9122217-11] Ван Арсдейл, Т. Л.; VanArsdale S L; Force W R; Уолтер Б.Н.; Mosialos G; Kieff E; Рид Дж. С; Ware C F (март 1997 г.). «Сигнальный комплекс рецептора лимфотоксина-бета: роль фактора 3, связанного с рецептором фактора некроза опухоли, в гибели клеток и активации ядерного фактора kappaB». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 94 (6): 2460–5. Bibcode:1997PNAS ... 94.2460V. Дои:10.1073 / пнас.94.6.2460. ISSN 0027-8424. ЧВК 20110. PMID 9122217.

[pmid10207006-12] Wu, M Y; Ван П. И; Han S H; Hsieh S.L. (апрель 1999 г.). «Цитоплазматический домен рецептора лимфотоксина-бета опосредует гибель клеток в клетках HeLa». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 274 (17): 11868–73. Дои:10.1074 / jbc.274.17.11868. ISSN 0021-9258. PMID 10207006.

[pmid9162022-13] Marsters, S.A.; Эйрес Т. М.; Скубач М; Серый C L; Rothe M; Ашкенази А (май 1997 г.). «Медиатор проникновения вируса герпеса, член семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNFR), взаимодействует с членами семейства факторов, связанных с TNFR, и активирует факторы транскрипции NF-kappaB и AP-1». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 272 (22): 14029–32. Дои:10.1074 / jbc.272.22.14029. ISSN 0021-9258. PMID 9162022.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

Navigation