WikiDer > Интегрин бета 1

Integrin beta 1
ITGB1
Белок ITGB1 PDB 1K11.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыITGB1, CD29, FNRB, GPIIA, MDF2, MSK12, VLA-BETA, VLAB, субъединица интегрина бета 1
Внешние идентификаторыOMIM: 135630 MGI: 96610 ГомолоГен: 22999 Генные карты: ITGB1
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение ITGB1
Геномное расположение ITGB1
Группа10п11.22Начинать32,900,319 бп[1]
Конец33,005,792 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ITGB1 211945 s at.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3688

16412

Ансамбль

ENSG00000150093

ENSMUSG00000025809

UniProt

P05556

P09055

RefSeq (мРНК)

NM_010578

RefSeq (белок)

NP_002202
NP_391988
NP_596867

NP_034708

Расположение (UCSC)Chr 10: 32.9 - 33.01 МбChr 8: 128,69 - 128,73 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Интегрин бета-1 (ITGB1), также известный как CD29, это рецептор клеточной поверхности что у людей кодируется ITGB1 ген.[5] Этот интегрин ассоциируется с интегрин альфа 1 и интегрин альфа 2 с образованием комплексов интегринов, которые функционируют как рецепторы коллагена. Он также образует димеры с интегрин альфа 3 формировать рецепторы интегрина для нетрин 1 и катушка. Эти и другие комплексы интегрина бета 1 исторически были известны как антигены очень поздней активации (VLA).

Интегрин бета 1 выражается как минимум в четырех различных изоформы. В сердечная мышца и скелетные мышцы, изоформа интегрина бета-1D специфически экспрессируется и локализуется в костамеры, где он помогает в передаче поперечной силы от Z-диски к внеклеточный матрикс. Аномальные уровни интегрина бета-1D были обнаружены в мышечная дистрофия пояса конечностей и полинейропатия.

Структура

Интегрин бета-1 может существовать как разные изоформы через альтернативное сращивание. Шесть альтернативно сращенный были найдены варианты этого гена, которые кодируют пять белков с альтернативными C-конец.[6] Рецепторы интегринов существуют в виде гетеродимеров, и описано более 20 различных гетеродимерных рецепторов интегринов. Все интегрины, альфа- и бета-формы, имеют большие внеклеточные и короткие внутриклеточные домены.[7] Цитоплазматический домен интегрина бета-1 связывается с актин цитоскелет.[8] Интегрин бета-1 является наиболее широко экспрессируемым бета-интегрином и ассоциируется по крайней мере с 10 различными субъединицами интегрина-альфа.[7]

Функция

Члены семейства интегринов представляют собой мембранные рецепторы, участвующие в клеточной адгезии и распознавании в различных процессах, включая эмбриогенез, гемостаз, восстановление тканей, иммунная реакция и метастатическая диффузия опухолевых клеток.[7] Интегрины связывают актин цитоскелет с внеклеточный матрикс и они передают сигналы двунаправленно между внеклеточный матрикс и цитоплазматический домены.[9][10]Бета-интегрины в первую очередь ответственны за нацеливание димеров интегрина в соответствующие субклеточные места, что в адгезивных клетках очаговые спайки.[8][11] Мутанты интегрина бета-1 теряют способность нацеливаться на сайты очаговые спайки.[12][13]

Были идентифицированы три новые изоформы интегрина бета-1, названные бета-1B, бета-1C и бета-1D. Интегрин бета-1B транскрибируется, когда проксимальный 26 аминокислоты из цитоплазматический домена в экзоне 6 сохраняются, а затем следуют 12 аминокислота простираться от соседнего интронный область, край.[14] Интегрин бета-1B изоформа по-видимому, действует как доминирующий негатив в том, что он ингибирует адгезию клеток.[15] Второй интегрин бета-1 изоформа, получивший название бета-1С, было описано, что он имеет еще 48 аминокислоты добавлен к 26 аминокислоты в цитоплазматический домен;[16] функция этой изоформы была ингибирующей на Синтез ДНК в Фаза G1 из клеточный цикл.[17] Третий изоформа, называемый бета-1D, является поперечно-полосатые мышцы-специфическая изоформа, которая заменяет канонический бета-1А изоформа в сердечный и скелетные мышцы клетки. Этот изоформа образуется в результате сплайсинга в новый дополнительный экзон между экзонами 6 и 7. цитоплазматический домен интегрина бета-1D заменяет дистальный 21 аминокислоты (присутствует в интегрине бета-1A) с альтернативным отрезком 24 аминокислоты (13 уникальных).[18][19]

Интегрин бета-1D, по-видимому, регулируется во время миофибрилогенеза,[19] появляются сразу после слияния миобласты в C2C12 ячейка с повышающимся уровнем миофибрилла дифференциация.[20] Интегрин бета-1D специально локализован для костамеры и вставные диски из сердечная мышца и костамеры, мышечно-сухожильные соединения и нервно-мышечные соединения из скелетные мышцы, и он, по-видимому, действует в целом, как и другие интегрины, как кластеризация бета-1D интегринов на поверхности Клетки CHO привело к тирозин фосфорилирование из pp125FAK и побудил митоген-активированная протеинкиназа активация.[20]

Клиническое значение

У пациентов с мышечная дистрофия пояса конечностей, тип 2C, интегрин бета-1D значительно снижается в скелетные мышцы биопсии, координировать с уменьшением альфа 7B-интегрин и филамин 2.[21]

У пациентов с чувствительно-двигательной полинейропатия, уровни интегрин альфа-7В, интегрин бета-1D и усмешка были значительно снижены почти до неопределяемого уровня; и это соответствовало нижнему мРНК уровни.[22]

Взаимодействия

CD29 был показан взаимодействовать с

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000150093 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025809 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Гудфеллоу П.Дж., Неванлинна Х.А., Горман П., Шир Д., Лам Дж., Гудфеллоу П.Н. (январь 1989 г.). «Отнесение гена, кодирующего бета-субъединицу рецептора фибронектина человека (бета-FNR) к хромосоме 10p11.2». Анналы генетики человека. 53 (Пт 1): 15–22. Дои:10.1111 / j.1469-1809.1989.tb01118.x. PMID 2524991. S2CID 36485270.
  6. ^ «Ген Entrez: интегрин ITGB1, бета-1 (рецептор фибронектина, бета-полипептид, антиген CD29 включает MDF2, MSK12)».
  7. ^ а б c Хайнс РО (апрель 1992 г.). «Интегрины: универсальность, модуляция и передача сигналов в клеточной адгезии». Клетка. 69 (1): 11–25. Дои:10.1016 / 0092-8674 (92) 90115-с. PMID 1555235. S2CID 32774108.
  8. ^ а б Састри С.К., Хорвиц А.Ф. (октябрь 1993 г.). «Цитоплазматические домены интегрина: медиаторы цитоскелетных связей и внеклеточной и внутриклеточной инициированной трансмембранной передачи сигналов». Текущее мнение в области клеточной биологии. 5 (5): 819–31. Дои:10.1016 / 0955-0674 (93) 90031-к. PMID 8240826.
  9. ^ Берридж К., Хшановская-Водницкая М. (1996). «Фокальные спайки, сократимость и сигнализация». Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития. 12: 463–518. Дои:10.1146 / annurev.cellbio.12.1.463. PMID 8970735.
  10. ^ Шварц М.А., Шаллер М.Д., Гинзберг М.Х. (1995). «Интегрины: новые парадигмы передачи сигналов». Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития. 11: 549–99. Дои:10.1146 / annurev.cb.11.110195.003001. PMID 8689569.
  11. ^ LaFlamme SE, Akiyama SK, Yamada KM (апрель 1992 г.). «Регулирование распределения рецепторов фибронектина». Журнал клеточной биологии. 117 (2): 437–47. Дои:10.1083 / jcb.117.2.437. ЧВК 2289425. PMID 1373145.
  12. ^ Акияма С.К., Ямада С.С., Ямада К.М., LaFlamme SE (июнь 1994 г.). «Трансмембранная передача сигнала с помощью цитоплазматических доменов интегрина, экспрессируемых в односубъединичных химерах». Журнал биологической химии. 269 (23): 15961–4. PMID 7515874.
  13. ^ Решка А.А., Хаяши Ю., Хорвиц А.Ф. (июнь 1992 г.). «Идентификация аминокислотных последовательностей в цитоплазматическом домене интегрина бета 1, участвующих в ассоциации цитоскелета». Журнал клеточной биологии. 117 (6): 1321–30. Дои:10.1083 / jcb.117.6.1321. ЧВК 2289496. PMID 1376731.
  14. ^ Альтруда Ф, Червелла П., Тарон Дж., Ботта С., Бальзак Ф., Стефануто Дж., Силенго Л. (ноябрь 1990 г.). «Субъединица бета-1 интегрина человека с уникальным цитоплазматическим доменом, генерируемым альтернативным процессингом мРНК». Ген. 95 (2): 261–6. Дои:10.1016/0378-1119(90)90369-3. PMID 2249781.
  15. ^ Бальзак Ф., Ретта С.Ф., Альбини А., Мельчиорри А., Котелянский В.Е., Геуна М., Силенго Л., Тарон Г. (октябрь 1994 г.). «Экспрессия изоформы интегрина бета 1B в клетках CHO приводит к доминирующему отрицательному эффекту на адгезию и подвижность клеток». Журнал клеточной биологии. 127 (2): 557–65. Дои:10.1083 / jcb.127.2.557. HDL:2318/39410. ЧВК 2120206. PMID 7523423.
  16. ^ Лангино Л. Р., Руослахти Э. (апрель 1992 г.). «Альтернативная форма бета-1-субъединицы интегрина с вариантом цитоплазматического домена». Журнал биологической химии. 267 (10): 7116–20. PMID 1551917.
  17. ^ Мередит Дж., Такада Ю., Форнаро М., Лангино Л. Р., Шварц Массачусетс (сентябрь 1995 г.). «Ингибирование развития клеточного цикла с помощью альтернативно сплайсированного интегрина бета 1С». Наука. 269 (5230): 1570–2. Дои:10.1126 / science.7545312. PMID 7545312.
  18. ^ Жидкова Н.И., Белкин А.М., Майн Р. (сентябрь 1995 г.). «Новая изоформа интегрина бета-1, экспрессируемая в скелетных и сердечных мышцах». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 214 (1): 279–85. Дои:10.1006 / bbrc.1995.2285. PMID 7545396.
  19. ^ а б ван дер Флиер А., Куикман И., Бодуан С., ван дер Нейт Р., Зонненберг А. (август 1995 г.). «Новая изоформа интегрина бета-1, полученная путем альтернативного сплайсинга: уникальная экспрессия в сердечных и скелетных мышцах». Письма FEBS. 369 (2–3): 340–4. Дои:10.1016 / 0014-5793 (95) 00814-п. PMID 7544298. S2CID 86638879.
  20. ^ а б Белкин А.М., Жидкова Н.И., Бальзак Ф., Альтруда Ф., Томатис Д., Майер А., Тарон Г., Котелянский В.Е., Берридж К. (январь 1996 г.). «Интегрин бета 1D замещает изоформу бета 1A в поперечно-полосатых мышцах: локализация в соединительных структурах и сигнальный потенциал в немышечных клетках». Журнал клеточной биологии. 132 (1–2): 211–26. Дои:10.1083 / jcb.132.1.211. ЧВК 2120711. PMID 8567725.
  21. ^ Анастаси Джи, Катронео Джи, Тримарчи Ф., Санторо Джи, Брускетта Д., Браманти П., Пизани А., Фавалоро А. (декабрь 2004 г.). «Оценка саркогликанов, винкулин-талин-интегриновой системы и филамина2 при альфа- и гамма-саркогликанопатии: иммуногистохимическое исследование». Международный журнал молекулярной медицины. 14 (6): 989–99. Дои:10.3892 / ijmm.14.6.989. PMID 15547664.
  22. ^ Анастаси Джи, Катронео Джи, Санторо Джи, Арко А, Риццо Джи, Браманти П., Ринальди С., Сидоти А., Амато А., Фавалоро А. (сентябрь 2008 г.). «Костамерные белки в скелетных мышцах человека во время мышечной неактивности». Журнал анатомии. 213 (3): 284–95. Дои:10.1111 / j.1469-7580.2008.00921.x. ЧВК 2732038. PMID 18537849.
  23. ^ Otey CA, Pavalko FM, Burridge K (август 1990 г.). «Взаимодействие между альфа-актинином и субъединицей бета-1 интегрина in vitro». Журнал клеточной биологии. 111 (2): 721–9. Дои:10.1083 / jcb.111.2.721. ЧВК 2116186. PMID 2116421.
  24. ^ Otey CA, Vasquez GB, Burridge K, Erickson BW (октябрь 1993 г.). «Картирование сайта связывания альфа-актинина в цитоплазматическом домене интегрина бета 1». Журнал биологической химии. 268 (28): 21193–7. PMID 7691808.
  25. ^ Lozahic S, Christiansen D, Manié S, Gerlier D, Billard M, Boucheix C, Rubinstein E (март 2000 г.). «CD46 (мембранный кофакторный белок) связывается с множеством интегринов бета1 и тетраспанами». Европейский журнал иммунологии. 30 (3): 900–7. Дои:10.1002 / 1521-4141 (200003) 30: 3 <900 :: AID-IMMU900> 3.0.CO; 2-X. PMID 10741407.
  26. ^ Рэдфорд К.Дж., Торн Р.Ф., Херси П. (май 1996 г.). «CD63 ассоциируется с трансмембранными 4 членами суперсемейства, CD9 и CD81, и с интегринами бета 1 в меланоме человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 222 (1): 13–8. Дои:10.1006 / bbrc.1996.0690. PMID 8630057.
  27. ^ а б Mazzocca A, Carloni V, Sciammetta S, Cordella C, Pantaleo P, Caldini A, Gentilini P, Pinzani M (сентябрь 2002 г.). «Экспрессия белков трансмембранного суперсемейства 4 (TM4SF) и их роль в подвижности звездчатых клеток печени и миграции при заживлении ран». Журнал гепатологии. 37 (3): 322–30. Дои:10.1016 / S0168-8278 (02) 00175-7. PMID 12175627.
  28. ^ Wixler V, Geerts D, Laplantine E, Westhoff D, Smyth N, Aumailley M, Sonnenberg A, Paulsson M (октябрь 2000 г.). «Только LIM-белок DRAL / FHL2 связывается с цитоплазматическим доменом нескольких альфа- и бета-цепей интегрина и рекрутируется в адгезионные комплексы». Журнал биологической химии. 275 (43): 33669–78. Дои:10.1074 / jbc.M002519200. PMID 10906324.
  29. ^ а б ван дер Флиер А., Куикман И., Крамер Д., Гертс Д., Крефт М., Такафута Т., Шапиро С. С., Зонненберг А. (январь 2002 г.). «Различные варианты сплайсинга филамина-B влияют на миогенез, субклеточное распределение и определяют связывание с субъединицами интегрина β». Журнал клеточной биологии. 156 (2): 361–76. Дои:10.1083 / jcb.200103037. ЧВК 2199218. PMID 11807098.
  30. ^ Loo DT, Kanner SB, Aruffo A (сентябрь 1998 г.). «Филамин связывается с цитоплазматическим доменом бета1-интегрина. Идентификация аминокислот, ответственных за это взаимодействие». Журнал биологической химии. 273 (36): 23304–12. Дои:10.1074 / jbc.273.36.23304. PMID 9722563.
  31. ^ Серру В., Ле Наур Ф., Биллард М., Азорса Д.О., Ланца Ф., Буше С., Рубинштейн Э. (май 1999 г.). «Селективные комплексы тетраспан-интегрин (CD81 / альфа4бета1, CD151 / альфа3бета1, CD151 / альфа6бета1) в условиях, нарушающих взаимодействия тетраспана». Биохимический журнал. 340 (Pt 1): 103–11. Дои:10.1042/0264-6021:3400103. ЧВК 1220227. PMID 10229664.
  32. ^ а б Ли Х.С., Миллуорд-Сэдлер С.Дж., Райт М.О., Нуки Дж., Аль-Джамал Р., Солтер Д.М. (ноябрь 2002 г.). «Активация передачи сигналов Integrin-RACK1 / PKCalpha при механотрансдукции суставных хондроцитов человека». Остеоартрит и хрящ. 10 (11): 890–7. Дои:10.1053 / joca.2002.0842. PMID 12435334.
  33. ^ Лилиенталь Дж., Чанг Д.Д. (январь 1998 г.). «Rack1, рецептор активированной протеинкиназы C, взаимодействует с бета-субъединицей интегрина». Журнал биологической химии. 273 (4): 2379–83. Дои:10.1074 / jbc.273.4.2379. PMID 9442085.
  34. ^ Чанг Д.Д., Вонг С., Смит Х., Лю Дж. (Сентябрь 1997 г.). «ICAP-1, новый белок, связанный с цитоплазматическим доменом интегрина бета1, связывается с консервативным и функционально важным мотивом последовательности NPXY интегрина бета1». Журнал клеточной биологии. 138 (5): 1149–57. Дои:10.1083 / jcb.138.5.1149. ЧВК 2136751. PMID 9281591.
  35. ^ Чанг Д.Д., Хоанг Б.К., Лю Дж., Спрингер Т.А. (март 2002 г.). «Молекулярная основа взаимодействия между альфа-PTB-доменом Icap1 и интегрином бета-1». Журнал биологической химии. 277 (10): 8140–5. Дои:10.1074 / jbc.M109031200. PMID 11741908.
  36. ^ Хадари Ю. Р., Арбель-Горен Р., Леви Ю., Амстердам А., Алон Р., Закут Р., Зик И. (июль 2000 г.). «Связывание галектина-8 с интегринами ингибирует клеточную адгезию и вызывает апоптоз». Журнал клеточной науки. 113 (13): 2385–97. PMID 10852818.
  37. ^ Пойнат П., Де Арканджелис А., Сукхариа С., Чжу Х, Хеджекок Е.М., Лабуэсс М., Жорж-Лабуэсс Е. (апрель 2002 г.). «Консервативное взаимодействие между интегрином бета1 / PAT-3 и Nck-взаимодействующей киназой / MIG-15, которое обеспечивает навигацию комиссуральных аксонов у C. elegans». Текущая биология. 12 (8): 622–31. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 00764-9. PMID 11967148. S2CID 9977605.
  38. ^ Fournier HN, Dupé-Manet S, Bouvard D, Lacombe ML, Marie C, Block MR, Albiges-Rizo C (июнь 2002 г.). «Цитоплазматический домен интегрина-ассоциированный белок 1альфа (ICAP-1альфа) напрямую взаимодействует с супрессором метастазов nm23-H2, и оба белка нацелены на вновь образованные участки клеточной адгезии при взаимодействии с интегрином». Журнал биологической химии. 277 (23): 20895–902. Дои:10.1074 / jbc.M200200200. PMID 11919189.
  39. ^ Parsons M, Keppler MD, Kline A, Messent A, Humphries MJ, Gilchrist R, Hart IR, Quittau-Prevostel C, Hughes WE, Parker PJ, Ng T (август 2002 г.). «Сайт-направленное нарушение взаимодействия протеинкиназы C с интегрином блокирует хемотаксис клеток карциномы». Молекулярная и клеточная биология. 22 (16): 5897–911. Дои:10.1128 / MCB.22.16.5897-5911.2002. ЧВК 133968. PMID 12138200.
  40. ^ Тапли П., Хорвиц А., Бак С., Дагган К., Роршнайдер Л. (март 1989 г.). «Интегрины, выделенные из фибробластов куриных эмбрионов, трансформированных вирусом саркомы Рауса». Онкоген. 4 (3): 325–33. PMID 2468126.
  41. ^ Хорвиц А., Дугган К., Бак С., Беккерл М.С., Берридж К. (1986). «Взаимодействие рецептора фибронектина плазматической мембраны с талином - трансмембранная связь». Природа. 320 (6062): 531–3. Дои:10.1038 / 320531a0. PMID 2938015. S2CID 4356748.
  42. ^ Тачибана И., Бодорова Дж., Бердичевский Ф., Зуттер М.М., Хемлер М.Э. (ноябрь 1997 г.). «NAG-2, новый белок суперсемейства трансмембран-4 (TM4SF), который образует комплекс с интегринами и другими белками TM4SF». Журнал биологической химии. 272 (46): 29181–9. Дои:10.1074 / jbc.272.46.29181. PMID 9360996.
  43. ^ Хан, округ Колумбия, Родригес Л.Г., Гуань Д.Л. (январь 2001 г.). «Идентификация нового взаимодействия между интегрином бета1 и 14-3-3бета». Онкоген. 20 (3): 346–57. Дои:10.1038 / sj.onc.1204068. PMID 11313964.

дальнейшее чтение

  • Evans JP (июль 2001 г.). «Фертилин бета и другие ADAM как лиганды интегрина: понимание клеточной адгезии и оплодотворения». BioEssays. 23 (7): 628–39. Дои:10.1002 / bies.1088. PMID 11462216. S2CID 23712246.
  • Армулик А (январь 2002 г.). «Варианты сплайсинга интегринов бета 1 человека: происхождение, биосинтез и функции». Границы биологических наук. 7 (1–3): d219-27. Дои:10.2741 / армулик. PMID 11779688.
  • Brakebusch C, Fässler R (сентябрь 2005 г.). «Функция бета-1 интегрина in vivo: адгезия, миграция и многое другое». Отзывы о метастазах рака. 24 (3): 403–11. Дои:10.1007 / s10555-005-5132-5. PMID 16258728. S2CID 24210890.

внешняя ссылка