WikiDer > CUTL1

CUX1
Идентификаторы
Псевдонимы	CUX1, CASP, CDP, CDP / Cut, CDP1, COY1, CUTL1, CUX, Clox, Cux / CDP, GOLIM6, Nbla10317, p100, p110, p200, p75, вырезать как homeobox 1, GDDI
Внешние идентификаторы	OMIM: 116896 ГомолоГен: 22551 Генные карты: CUX1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 7 (человек)
Конец	102,283,958 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• последовательное связывание ДНК; • Связывание ДНК; • активность протеинтирозинкиназы; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • связывание с белками, мостик; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• цитозоль; • аппарат Гольджи; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • Мембрана Гольджи; • неотъемлемый компонент мембраны; • неотъемлемый компонент мембраны Гольджи; • мембрана;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • развитие многоклеточного организма; • ретроградный транспорт, рециклинг пузырьков внутри Гольджи; • положительная регуляция морфогенеза дендритов; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • фосфорилирование пептидилтирозина; • Транспорт везикул Гольджи; • опосредованный пузырьками Гольджи транспорт;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1523
	н / д
	ENSG00000257923
	н / д
	P39880; Q13948
	н / д
NM_001202543; NM_001202544; NM_001202545; NM_001202546; NM_001913;
	NM_181500; NM_181552
	н / д
NP_001189472; NP_001189473; NP_001189474; NP_001189475; NP_001904;
	NP_852477; NP_853530; NP_001189473.1; NP_001189474.1; NP_001189475.1; NP_001904.2; NP_852477.1
	н / д
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека

CUTL1

Cux1 (CUTL1, CDP, CDP / Cux) является гомеодоменом белок что у людей кодируется CUX1 ген.^[3]^[4]^[5]^[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства гомеодоменов ДНК-связывающих белков. Он регулирует экспрессию генов, морфогенез и дифференцировку, а также играет роль в развитии клеточного цикла, особенно в S-фазе. Было описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскрипта этого гена, но полноразмерная природа некоторых из этих вариантов не была определена, и изоформа p200 Cux1 протеолитически процессируется до более мелких активных изоформ, таких как p110.^[6] Связывание ДНК Cux1 стимулируется активацией PAR2 / F2RL1 рецептор, связанный с G-белком на клеточной поверхности, в фибробластах и эпителиальных клетках рака молочной железы для регулирования Матрикс-металлопротеиназа 10, Интерлейкин-1-альфа, и Циклооксигеназа 2 (COX2) гены.^[7]

Роль в росте опухоли

Генетические данные более 7600 онкологических больных показывают, что более 1% имеет деактивированный CUX1, который связан с прогрессированием роста опухоли. Исследователи из Wellcome Trust Sanger Institute сообщили, что мутация CUX1 снижает ингибирующие эффекты биологического ингибитора, ПИК3ИП1 (протеин 1, взаимодействующий с фосфоинозитид-3-киназой), что привело к более высокой активности стимулятора роста фермент, фосфоинозитид-3-киназа (PI3K), что приводит к прогрессированию опухоли. Хотя CUX1 мутирует с меньшей частотой по сравнению с другими известными генными мутациями, вызывающими рак, этот деактивированный ген обнаруживается во многих типах рака в этом исследовании как основная причина заболевания.^[8]^[9]

CASP

Модель модема с использованием CASP.^[10]

Tne CГен UX1 Ав качестве альтернативы Sнарезанный по продукте впервые было сообщено в 1997 году.^[11]^[а] В гене CUX1 насчитывается до 33 экзоны. CASP мРНК включает экзоны с 1 по 14 и с 25 по 33.^[13] Предполагается, что белок CASP человека содержит 678 аминокислоты, из которых 400 используются совместно с CUTL1.^[11] Белок CASP составляет примерно 80 k D.^[11] В нем отсутствует ДНК-связывающая область CUTL1,^[11]^[14] но вместо этого содержит трансмембранный домен, который позволяет ему вставляться в липидные бислои.^[14] Он был локализован на аппарат Гольджи.^[14]

Сообщается, что CASP является частью комплекса с Голгина 84 это тросы COPI пузырьки и важен для ретроградного транспорта в Гольджи и между Гольджи и эндоплазматический ретикулум.^[15] Нацеливание на пузырьки включает связки и SNAREs.^[15]

Взаимодействия

Сеть CUX1, указанная в Веб-сайт BioPlex с возможностью поиска.

Cux1 (CUTL1, CDP, CDP / Cux) показан для взаимодействовать с участием:

Эти физические взаимодействия описаны в BioPlex 2.0

Заметки

^ Этот CASP не то же самое, что каркасный белок под названием CASP.^[12] для Cйтогезин /АРНО ... Sкаффолдинг пRotein

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000257923 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Scherer SW, Neufeld EJ, Lievens PM, Orkin SH, Kim J, Tsui LC (май 1993 г.). «Региональная локализация гена замещающего белка CCAAT (CUTL1) в 7q22 посредством анализа гибридов соматических клеток». Геномика. 15 (3): 695–6. Дои:10.1006 / geno.1993.1130. PMID 8468066.
^ Глёкнер Г., Шерер С., Шаттевой Р., Боррайт А., Вебер Дж., Цуй Л.С., Розенталь А. (декабрь 1998 г.). «Крупномасштабное секвенирование двух областей хромосомы 7q22 человека: анализ 650 т.п.н. геномной последовательности вокруг локусов EPO и CUTL1 выявляет 17 генов». Genome Res. 8 (10): 1060–73. Дои:10.1101 / гр. 8.10.1060. ЧВК 310788. PMID 9799793.
^ Ока Т., Ангар Д., Хьюсон Ф.М., Кригер М. (апрель 2004 г.). «Комплексы COG и COPI взаимодействуют, чтобы контролировать количество GEAR, подмножество интегральных мембранных белков Гольджи». Мол. Биол. Ячейка. 15 (5): 2423–35. Дои:10.1091 / mbc.E03-09-0699. ЧВК 404034. PMID 15004235.
^ ^а ^б «Ген Entrez: CUTL1, подобный разрезу 1, замещающий белок CCAAT (Drosophila)».
^ Уилсон Б.Дж., Харада Р., Ледуй Л., Холленберг, доктор медицины, Непвеу А. (январь 2009 г.). «Фактор транскрипции CUX1 является нижестоящим эффектором рецептора 2, активируемого протеиназой (PAR2)». J. Biol. Chem. 284 (1): 36–45. Дои:10.1074 / jbc.M803808200. PMID 18952606.
^ Пресс-релиз (8 декабря 2013 г.). «Ген способствует развитию одной из ста опухолей». Wellcome Trust Sanger Institute. Получено 17 декабря 2013.
^ Вонг CC, Мартинкорена I, Rust AG и др. (2013). «Инактивация мутации CUX1 способствует онкогенезу». Природа Генетика. 46 (1): 33–8. Дои:10,1038 / нг.2846. ЧВК 3874239. PMID 24316979.
^ Сохда М., Мисуми Ю., Ямамото А., Накамура Н., Огата С., Сакисака С., Хиросе С., Икехара Ю., Ода К. (2010). «Взаимодействие Golgin-84 с комплексом COG опосредует ретроградный транспорт внутри Гольджи». Движение. 11 (12): 1552–66. Дои:10.1111 / j.1600-0854.2010.01123.x. PMID 20874812. S2CID 20424336.
^ ^а ^б ^c ^d Ливенс П.М., Туфарелли С., Донади Дж. Дж., Стэгг А., Нойфельд Е. Дж. (1997). «CASP, новый, высококонсервативный продукт альтернативного сплайсинга гена CDP / cut / cux, лишен ДНК-связывающих доменов cut-repeat и гомео, и взаимодействует с полноразмерным CDP in vitro». Ген. 197 (1–2): 73–81. Дои:10.1016 / s0378-1119 (97) 00243-6. PMID 9332351.
^ Мансур М., Ли С.Ю., Похайдак Б. (2002). "N-концевой домен спиральной спирали семейства цитохезин / ARNO факторов обмена гуаниновых нуклеотидов взаимодействует с каркасным белком CASP". Журнал биологической химии. 277 (35): 32302–9. Дои:10.1074 / jbc.M202898200. PMID 12052827.
^ Рамдзан З.М., Непвеу А (2014). «CUX1, гаплонедостаточный ген-супрессор опухоли сверхэкспрессируется при запущенных формах рака». Обзоры природы Рак. 14 (10): 673–82. Дои:10.1038 / nrc3805. PMID 25190083. S2CID 20468440.
^ ^а ^б ^c Джиллингем А.К., Пфайфер А.С., Манро С. (2002). «CASP, альтернативно сплайсированный продукт гена, кодирующего фактор транскрипции белка замещения CCAAT, представляет собой мембранный белок Гольджи, связанный с гигантином». Молекулярная биология клетки. 13 (11): 3761–74. Дои:10.1091 / mbc.E02-06-0349. ЧВК 133590. PMID 12429822.
^ ^а ^б Мальсам Дж., Сато А., Пеллетье Л., Уоррен Дж. (2005). «Связки Голгина определяют субпопуляции везикул COPI». Наука. 307 (5712): 1095–8. Дои:10.1126 / science.1108061. PMID 15718469. S2CID 12601850.
^ Ли С., Ауфьеро Б., Шильц Р.Л., Уолш М.Дж. (июнь 2000 г.). "Регулирование функции гомеодомена CCAAT смещения / отсечения белка гистоновым ацетилтрансферазой p300 / CREB-связывающим белком (CBP) фактором и CBP". Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (13): 7166–71. Дои:10.1073 / pnas.130028697. ЧВК 16517. PMID 10852958.
^ Гупта С., Луонг М.Х., Блеуминг С.А., Миле А., Луонг М., Янг Д., Кнудсен Э.С., Ван Вийнен А.Дж., Стейн Д.Л., Стейн Г.С. (сентябрь 2003 г.). «Опухолевый супрессор pRB действует как ко-репрессор смещающего белка CCAAT (CDP / разрез), чтобы регулировать транскрипцию гистона H4, контролируемую клеточным циклом». J. Cell. Физиол. 196 (3): 541–56. Дои:10.1002 / jcp.10335. PMID 12891711. S2CID 2287673.
^ Лю Дж., Барнетт А., Нойфельд Э. Дж., Дадли Дж. П. (июль 1999 г.). «Взаимодействие гомеопротеинов CDP и SATB1: потенциал для тканеспецифической регуляции». Мол. Cell. Биол. 19 (7): 4918–26. Дои:10.1128 / mcb.19.7.4918. ЧВК 84297. PMID 10373541.

дальнейшее чтение

Оттоленги С., Мантовани Р., Николис С., Ронки А., Джильони Б. (1990). «Последовательности ДНК, регулирующие транскрипцию гена глобина человека при неделеционной наследственной персистенции фетального гемоглобина». Гемоглобин. 13 (6): 523–41. Дои:10.3109/03630268908993104. PMID 2481658.
Непвеу А (2001). «Роль многофункционального фактора транскрипции гомеодомена CDP / Cut / Cux в регулировании дифференцировки, роста и развития клеток». Ген. 270 (1–2): 1–15. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00485-1. PMID 11403998.
Neufeld EJ, Skalnik DG, Lievens PM, Orkin SH (1993). «Замещающий белок CCAAT человека гомологичен гомеопротеину дрозофилы, разрезанный». Nat. Genet. 1 (1): 50–5. Дои:10.1038 / ng0492-50. PMID 1301999. S2CID 37107643.
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Черноусов М.А., Шталь Р.С., Кэри Д.Д. (1996). «Шванновские клетки секретируют новый адгезивный белок, подобный коллагену, который связывает N-синдекан». J. Biol. Chem. 271 (23): 13844–53. Дои:10.1074 / jbc.271.23.13844. PMID 8662884.
Ливенс П.М., Туфарелли С., Донади Дж. Дж., Стэгг А., Нойфельд Е. Дж. (1997). «CASP, новый, высококонсервативный продукт альтернативного сплайсинга гена CDP / cut / cux, лишен ДНК-связывающих доменов cut-repeat и гомео, и взаимодействует с полноразмерным CDP in vitro». Ген. 197 (1–2): 73–81. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00243-6. PMID 9332351.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Chattopadhyay S, Whitehurst CE, Chen J (1998). «Область прикрепления ядерного матрикса перед энхансером гена бета-рецептора Т-клеток связывает Cux / CDP и SATB1 и модулирует зависимую от энхансера экспрессию репортерного гена, но не экспрессию эндогенного гена». J. Biol. Chem. 273 (45): 29838–46. Дои:10.1074 / jbc.273.45.29838. PMID 9792700.
Лю Дж., Барнетт А., Нойфельд Э. Дж., Дадли Дж. П. (1999). «Взаимодействие гомеопротеинов CDP и SATB1: потенциал тканеспецифической регуляции». Мол. Cell. Биол. 19 (7): 4918–26. Дои:10.1128 / mcb.19.7.4918. ЧВК 84297. PMID 10373541.
Ронг Цзэн В., Суси Э, Сунг Мун Н., Мартин-Судан Н., Берубе Г., Ледуй Л., Непвеу А. (2000). «Экзон / интронная структура и альтернативные транскрипты гена CUTL1». Ген. 241 (1): 75–85. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00465-5. PMID 10607901.
Мартин-Судант Н., Драхман Дж. Г., Каушанский К., Непвеу А. (2000). «Активность связывания CDP / Cut ДНК снижается в гранулоцитах, макрофагах и эритроцитах, но остается повышенной в дифференцирующихся мегакариоцитах». Лейкемия. 14 (5): 863–73. Дои:10.1038 / sj.leu.2401764. PMID 10803519.
Ли С., Ауфьеро Б., Шильц Р.Л., Уолш М.Дж. (2000). "Регулирование функции гомеодомена CCAAT смещения / отсечения белка гистоновым ацетилтрансферазой p300 / CREB-связывающим белком (CBP) фактором и CBP". Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (13): 7166–71. Дои:10.1073 / pnas.130028697. ЧВК 16517. PMID 10852958.
Нироди С., Харт Дж., Дхаван П., Мун Н.С., Непвеу А., Ричмонд А. (2001). «Роль CDP в отрицательной регуляции экспрессии гена CXCL1». J. Biol. Chem. 276 (28): 26122–31. Дои:10.1074 / jbc.M102872200. ЧВК 2665279. PMID 11371564.
Moon NS, Premdas P, Truscott M, Leduy L, Bérubé G, Nepveu A (2001). «Для активации стабильного связывания ДНК гомеодоменным белком CDP / разрезанного белка необходимо S-фазное протеолитическое расщепление». Мол. Cell. Биол. 21 (18): 6332–45. Дои:10.1128 / MCB.21.18.6332-6345.2001. ЧВК 87367. PMID 11509674.
Сантагуида М., Динг К., Берубе Дж., Траскотт М., Уайт П., Непвеу А. (2002). «Фосфорилирование белка замещения CCAAT (CDP) / фактора транскрипции Cux циклином A-Cdk1 модулирует его ДНК-связывающую активность в G (2)». J. Biol. Chem. 276 (49): 45780–90. Дои:10.1074 / jbc.M107978200. PMID 11584018.
Dintilhac A, Bernués J (2002). «HMGB1 взаимодействует со многими очевидно неродственными белками, распознавая короткие аминокислотные последовательности» (PDF). J. Biol. Chem. 277 (9): 7021–8. Дои:10.1074 / jbc.M108417200. PMID 11748221. S2CID 39560486.

внешние ссылки

CUTL1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Человек CUX1 расположение генома и CUX1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

[13] Этот CASP не то же самое, что каркасный белок под названием CASP.^[12] для Cйтогезин /АРНО ... Sкаффолдинг пRotein

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000257923 - Ансамбль, Май 2017

[2] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8468066-3] Scherer SW, Neufeld EJ, Lievens PM, Orkin SH, Kim J, Tsui LC (май 1993 г.). «Региональная локализация гена замещающего белка CCAAT (CUTL1) в 7q22 посредством анализа гибридов соматических клеток». Геномика. 15 (3): 695–6. Дои:10.1006 / geno.1993.1130. PMID 8468066.

[pmid9799793-4] Глёкнер Г., Шерер С., Шаттевой Р., Боррайт А., Вебер Дж., Цуй Л.С., Розенталь А. (декабрь 1998 г.). «Крупномасштабное секвенирование двух областей хромосомы 7q22 человека: анализ 650 т.п.н. геномной последовательности вокруг локусов EPO и CUTL1 выявляет 17 генов». Genome Res. 8 (10): 1060–73. Дои:10.1101 / гр. 8.10.1060. ЧВК 310788. PMID 9799793.

[pmid15004235-5] Ока Т., Ангар Д., Хьюсон Ф.М., Кригер М. (апрель 2004 г.). «Комплексы COG и COPI взаимодействуют, чтобы контролировать количество GEAR, подмножество интегральных мембранных белков Гольджи». Мол. Биол. Ячейка. 15 (5): 2423–35. Дои:10.1091 / mbc.E03-09-0699. ЧВК 404034. PMID 15004235.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: CUTL1, подобный разрезу 1, замещающий белок CCAAT (Drosophila)».

[pmid18952606-7] Уилсон Б.Дж., Харада Р., Ледуй Л., Холленберг, доктор медицины, Непвеу А. (январь 2009 г.). «Фактор транскрипции CUX1 является нижестоящим эффектором рецептора 2, активируемого протеиназой (PAR2)». J. Biol. Chem. 284 (1): 36–45. Дои:10.1074 / jbc.M803808200. PMID 18952606.

[8] Пресс-релиз (8 декабря 2013 г.). «Ген способствует развитию одной из ста опухолей». Wellcome Trust Sanger Institute. Получено 17 декабря 2013.

[9] Вонг CC, Мартинкорена I, Rust AG и др. (2013). «Инактивация мутации CUX1 способствует онкогенезу». Природа Генетика. 46 (1): 33–8. Дои:10,1038 / нг.2846. ЧВК 3874239. PMID 24316979.

[pmid20874812-10] Сохда М., Мисуми Ю., Ямамото А., Накамура Н., Огата С., Сакисака С., Хиросе С., Икехара Ю., Ода К. (2010). «Взаимодействие Golgin-84 с комплексом COG опосредует ретроградный транспорт внутри Гольджи». Движение. 11 (12): 1552–66. Дои:10.1111 / j.1600-0854.2010.01123.x. PMID 20874812. S2CID 20424336.

[pmid9332351-11] а ^б ^c ^d Ливенс П.М., Туфарелли С., Донади Дж. Дж., Стэгг А., Нойфельд Е. Дж. (1997). «CASP, новый, высококонсервативный продукт альтернативного сплайсинга гена CDP / cut / cux, лишен ДНК-связывающих доменов cut-repeat и гомео, и взаимодействует с полноразмерным CDP in vitro». Ген. 197 (1–2): 73–81. Дои:10.1016 / s0378-1119 (97) 00243-6. PMID 9332351.

[pmid12052827-12] Мансур М., Ли С.Ю., Похайдак Б. (2002). "N-концевой домен спиральной спирали семейства цитохезин / ARNO факторов обмена гуаниновых нуклеотидов взаимодействует с каркасным белком CASP". Журнал биологической химии. 277 (35): 32302–9. Дои:10.1074 / jbc.M202898200. PMID 12052827.

[pmid25190083-14] Рамдзан З.М., Непвеу А (2014). «CUX1, гаплонедостаточный ген-супрессор опухоли сверхэкспрессируется при запущенных формах рака». Обзоры природы Рак. 14 (10): 673–82. Дои:10.1038 / nrc3805. PMID 25190083. S2CID 20468440.

[pmid12429822-15] а ^б ^c Джиллингем А.К., Пфайфер А.С., Манро С. (2002). «CASP, альтернативно сплайсированный продукт гена, кодирующего фактор транскрипции белка замещения CCAAT, представляет собой мембранный белок Гольджи, связанный с гигантином». Молекулярная биология клетки. 13 (11): 3761–74. Дои:10.1091 / mbc.E02-06-0349. ЧВК 133590. PMID 12429822.

[pmid15718469-16] а ^б Мальсам Дж., Сато А., Пеллетье Л., Уоррен Дж. (2005). «Связки Голгина определяют субпопуляции везикул COPI». Наука. 307 (5712): 1095–8. Дои:10.1126 / science.1108061. PMID 15718469. S2CID 12601850.

[pmid10852958-17] Ли С., Ауфьеро Б., Шильц Р.Л., Уолш М.Дж. (июнь 2000 г.). "Регулирование функции гомеодомена CCAAT смещения / отсечения белка гистоновым ацетилтрансферазой p300 / CREB-связывающим белком (CBP) фактором и CBP". Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (13): 7166–71. Дои:10.1073 / pnas.130028697. ЧВК 16517. PMID 10852958.

[pmid12891711-18] Гупта С., Луонг М.Х., Блеуминг С.А., Миле А., Луонг М., Янг Д., Кнудсен Э.С., Ван Вийнен А.Дж., Стейн Д.Л., Стейн Г.С. (сентябрь 2003 г.). «Опухолевый супрессор pRB действует как ко-репрессор смещающего белка CCAAT (CDP / разрез), чтобы регулировать транскрипцию гистона H4, контролируемую клеточным циклом». J. Cell. Физиол. 196 (3): 541–56. Дои:10.1002 / jcp.10335. PMID 12891711. S2CID 2287673.

[pmid10373541-19] Лю Дж., Барнетт А., Нойфельд Э. Дж., Дадли Дж. П. (июль 1999 г.). «Взаимодействие гомеопротеинов CDP и SATB1: потенциал для тканеспецифической регуляции». Мол. Cell. Биол. 19 (7): 4918–26. Дои:10.1128 / mcb.19.7.4918. ЧВК 84297. PMID 10373541.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[а]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[12]

Navigation