WikiDer > Ретиноидный рецептор X альфа

Retinoid X receptor alpha
RXRA
Белок RXRA PDB 1by4.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRXRA, NR2B1, рецептор ретиноида X альфа
Внешние идентификаторыOMIM: 180245 MGI: 98214 ГомолоГен: 2220 Генные карты: RXRA
Расположение гена (человек)
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек)[1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное расположение для RXRA
Геномное расположение для RXRA
Группа9q34.2Начинать134,317,098 бп[1]
Конец134,440,585 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE RXRA 202449 s в формате fs.png

PBB GE RXRA 202426 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002957
NM_001291920
NM_001291921

NM_001290481
NM_001290482
NM_011305

RefSeq (белок)

NP_001278849
NP_001278850
NP_002948

NP_001277410
NP_001277411
NP_035435

Расположение (UCSC)Chr 9: 134,32 - 134,44 МбChr 2: 27.68 - 27.76 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ретиноидный рецептор X альфа (RXR-альфа), также известный как NR2B1 (подсемейство ядерных рецепторов 2, группа B, член 1) представляет собой ядерный рецептор что у людей кодируется RXRA ген.[5]

Функция

Ретиноидные рецепторы X (RXR) и рецепторы ретиноевой кислоты (RAR) - ядерные рецепторы, которые опосредуют биологические эффекты ретиноидов, участвуя в ретиноевая кислота-опосредованная активация генов. Эти рецепторы проявляют свое действие путем связывания в виде гомодимеров или гетеродимеров со специфическими последовательностями в промоторах генов-мишеней и регуляции их транскрипции. Белок, кодируемый этим геном, является членом стероида и рецептор гормона щитовидной железы надсемейство факторы транскрипции.[6] В отсутствие лиганда гетеродимеры RXR-RAR связываются с мультипротеиновым комплексом, содержащим корепрессоры транскрипции, которые вызывают деацетилирование гистонов, конденсацию хроматина и подавление транскрипции. При связывании лиганда корепрессоры отделяются от рецепторов и связываются с коактиваторами, что приводит к активации транскрипции. Гетеродимер RXRA / PPARA необходим для PPARA транскрипционная активность в отношении генов окисления жирных кислот, таких как ACOX1 и цитохром P450 системные гены.[7]

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]

[[Файл:
ВитаминDSynthesis_WP1531К статьеК статьеК статьеК статьеперейти к статьеК статьеК статьеК статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеК статьеК статьеперейти к статьеК статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеК статьеперейти к статье
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
ВитаминDSynthesis_WP1531К статьеК статьеК статьеК статьеперейти к статьеК статьеК статьеК статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеК статьеК статьеперейти к статьеК статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеК статьеперейти к статье
| {{{bSize}}} px | alt = Путь синтеза витамина D (Посмотреть / редактировать)]]
Путь синтеза витамина D (Посмотреть / редактировать)
  1. ^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «VitaminDSynthesis_WP1531».

Взаимодействия

Было показано, что альфа-рецептор ретиноида X взаимодействовать с:

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000186350 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015846 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Mangelsdorf DJ, Ong ES, Dyck JA, Evans RM (май 1990 г.). «Ядерный рецептор, который определяет новый путь ответа на ретиноевую кислоту». Природа. 345 (6272): 224–9. Bibcode:1990Натура.345..224М. Дои:10.1038 / 345224a0. PMID 2159111. S2CID 4232833.
  6. ^ «Ген Entrez: рецептор ретиноида X RXRA, альфа».
  7. ^ «Рецептор ретиноевой кислоты RXR-альфа - Homo sapiens (Человек)». UniProt.
  8. ^ На С.Ю., Чой Х.С., Ким Дж. В., На Д. С., Ли Дж. В. (1998). «Bcl3, белок IkappaB, как новый коактиватор транскрипции рецептора ретиноида X». J. Biol. Chem. 273 (47): 30933–8. Дои:10.1074 / jbc.273.47.30933. PMID 9812988.
  9. ^ Монден Т., Киши М., Хосоя Т., Сато Т., Уондисфорд Ф.Э., Холленберг А.Н., Ямада М., Мори М. (1999). «p120 действует как специфический коактиватор рецептора 9-цис-ретиноевой кислоты (RXR) на гетеродимерах гамма / RXR рецептора, активируемого пролифератором пероксисом». Мол. Эндокринол. 13 (10): 1695–703. Дои:10.1210 / me.13.10.1695. PMID 10517671.
  10. ^ а б Макнамара П., Сео С.Б., Рудик Р.Д., Сегал А., Чакраварти Д., Фитцджеральд Г.А. (2001). «Регулирование ЧАСОВ и MOP4 рецепторами ядерных гормонов в сосудистой сети: гуморальный механизм для сброса периферических часов». Клетка. 105 (7): 877–89. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00401-9. PMID 11439184. S2CID 6251321.
  11. ^ а б Соль В., Чой Х.С., Мур Д.Д. (1995). «Выделение белков, которые специфически взаимодействуют с ретиноидным рецептором X: два новых сиротских рецептора». Мол. Эндокринол. 9 (1): 72–85. Дои:10.1210 / исправление.9.1.7760852. PMID 7760852.
  12. ^ Лю Б., Ли Х.Й., Вайнзимер С.А., Пауэлл Д.Р., Клиффорд Дж. Л., Кури Дж. М., Коэн П. (2000). «Прямые функциональные взаимодействия между инсулиноподобным фактором роста-связывающим белком-3 и ретиноидным X-рецептором-альфа регулируют передачу сигналов транскрипции и апоптоз». J. Biol. Chem. 275 (43): 33607–13. Дои:10.1074 / jbc.M002547200. PMID 10874028.
  13. ^ Ли Д., Десаи-Яджник В., Ло Е., Шапира М., Абагян Р., Сэмюэлс Х. Х. (1999). «NRIF3 - новый коактиватор, опосредующий функциональную специфичность рецепторов ядерных гормонов». Мол. Клетка. Биол. 19 (10): 7191–202. Дои:10.1128 / mcb.19.10.7191. ЧВК 84712. PMID 10490654.
  14. ^ Froeschlé A, Alric S, Kitzmann M, Carnac G, Auradé F, Rochette-Egly C, Bonnieu A (1998). "Рецепторы ретиноевой кислоты и мышечные белки b-HLH: партнеры в миогенезе, индуцированном ретиноидами". Онкоген. 16 (26): 3369–78. Дои:10.1038 / sj.onc.1201894. PMID 9692544.
  15. ^ Ли СК, Анзик С.Л., Чой Дж. Э., Бубендорф Л., Гуан XY, Юнг Ю.К., Каллиониеми О.П., Кононен Дж., Трент Дж. М., Азорса Д., Джун Б. Х., Чеонг Дж. Х., Ли Ю. К., Мельцер П. С., Ли Дж. В. (1999). «Ядерный фактор, ASC-2, как усиленный раком транскрипционный коактиватор, необходимый для лиганд-зависимой трансактивации ядерными рецепторами in vivo». J. Biol. Chem. 274 (48): 34283–93. Дои:10.1074 / jbc.274.48.34283. PMID 10567404.
  16. ^ Ли СК, Чжон С.И., Ким Ю.С., На СИ, Ли Ю.К., Ли Дж.В. (2001). «Два различных домена взаимодействия ядерных рецепторов и CREB-связывающий белок-зависимая трансактивационная функция активирующего сигнального коинтегратора-2». Мол. Эндокринол. 15 (2): 241–54. Дои:10.1210 / me.15.2.241. PMID 11158331.
  17. ^ Конг Х. Дж., Пак MJ, Хонг С., Ю Х. Дж., Ли YC, Чой Й., Чеонг Дж. (2003). «Белок вируса Х гепатита В регулирует трансактивационную активность и стабильность белка коактиватора транскрипции, усиленного раком, ASC-2». Гепатология. 38 (5): 1258–66. Дои:10.1053 / jhep.2003.50451. PMID 14578865. S2CID 29349615.
  18. ^ Ко Л., Кардона Г.Р., Ивасаки Т., Брамлетт К.С., Беррис Т.П., Чин В.В. (2002). «Ser-884, смежный с мотивом LXXLL коактиватора TRBP, определяет селективность в отношении ER и TR». Мол. Эндокринол. 16 (1): 128–40. Дои:10.1210 / исправление.16.1.0755. PMID 11773444.
  19. ^ На СИ, Ким Х.Дж., Ли С.К., Чой Х.С., На Д.С., Ли МО, Чунг М., Мур Д.Д., Ли Дж.В. (1998). «IkappaBbeta взаимодействует с рецептором ретиноида X и ингибирует ретиноид-зависимую трансактивацию в клетках, обработанных липополисахаридом». J. Biol. Chem. 273 (6): 3212–5. Дои:10.1074 / jbc.273.6.3212. PMID 9452433.
  20. ^ Фаруки М., Франко П.Дж., Томпсон Дж., Кагечика Х., Чандраратна Р.А., Банашак Л., Вей Л.Н. (2003). «Влияние ретиноидных лигандов на RIP140: молекулярное взаимодействие с ретиноидными рецепторами и биологическая активность». Биохимия. 42 (4): 971–9. Дои:10.1021 / bi020497k. PMID 12549917.
  21. ^ L'Horset F, Dauvois S, Heery DM, Cavaillès V, Parker MG (1996). «RIP-140 взаимодействует с множеством ядерных рецепторов посредством двух различных сайтов». Мол. Клетка. Биол. 16 (11): 6029–36. Дои:10.1128 / MCB.16.11.6029. ЧВК 231605. PMID 8887632.
  22. ^ Линь Б., Коллури С.К., Линь Ф., Лю В., Хань Ю.Х., Цао Х, Доусон М.И., Рид Дж. К., Чжан К. К. (2004). «Превращение Bcl-2 из протектора в убийцу путем взаимодействия с ядерным сиротским рецептором Nur77 / TR3». Клетка. 116 (4): 527–40. Дои:10.1016 / S0092-8674 (04) 00162-X. PMID 14980220. S2CID 17808479.
  23. ^ а б Чжан С., Баудино Т.А., Дауд Д.Р., Токумару Х., Ван В., Макдональд П.Н. (2001). «Тройные комплексы и совместное взаимодействие между NCoA-62 / Ski-взаимодействующим белком и коактиваторами стероидных рецепторов в транскрипции, опосредованной рецептором витамина D». J. Biol. Chem. 276 (44): 40614–20. Дои:10.1074 / jbc.M106263200. PMID 11514567.
  24. ^ Чен Х, Лин Р. Дж., Шильц Р. Л., Чакраварти Д., Нэш А., Надь Л., Привальский М. Л., Накатани Ю., Эванс Р. М. (1997). «Коактиватор ядерного рецептора ACTR представляет собой новую гистонацетилтрансферазу и образует мультимерный активационный комплекс с P / CAF и CBP / p300». Клетка. 90 (3): 569–80. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80516-4. PMID 9267036. S2CID 15284825.
  25. ^ Префонтен Г.Г., Вальтер Р., Гиффин В., Лемье М.Э., Папа Л., Хаше Р.Дж. (1999). «Селективное связывание рецепторов стероидных гормонов с факторами транскрипции октамера определяет транскрипционный синергизм на промоторе вируса опухоли молочной железы мыши». J. Biol. Chem. 274 (38): 26713–9. Дои:10.1074 / jbc.274.38.26713. PMID 10480874.
  26. ^ Какидзава Т., Миямото Т., Итикава К., Канеко А., Судзуки С., Хара М., Нагасава Т., Такеда Т., Мори Джи, Кумагай М., Хашизуме К. (1999). «Функциональное взаимодействие между Oct-1 и рецептором ретиноида X». J. Biol. Chem. 274 (27): 19103–8. Дои:10.1074 / jbc.274.27.19103. PMID 10383413.
  27. ^ Делрив П., Ву И, Беррис Т.П., Чин В.В., Суен С.С. (2002). «PGC-1 действует как транскрипционный коактиватор для рецепторов ретиноидов X». J. Biol. Chem. 277 (6): 3913–7. Дои:10.1074 / jbc.M109409200. PMID 11714715.
  28. ^ Tontonoz P, Graves RA, Budavari AI, Erdjument-Bromage H, Lui M, Hu E, Tempst P, Spiegelman BM (1994). «Адипоцит-специфический фактор транскрипции ARF6 представляет собой гетеродимерный комплекс двух ядерных рецепторов гормонов, PPAR гамма и RXR альфа». Нуклеиновые кислоты Res. 22 (25): 5628–34. Дои:10.1093 / nar / 22.25.5628. ЧВК 310126. PMID 7838715.
  29. ^ Бергер Дж., Пател Х.В., Вудс Дж., Хейс Н.С., Родитель С.А., Клемас Дж., Лейбовиц М.Д., Эльбрехт А., Рачубински Р.А., Капоне Дж. П., Моллер Д.Е. (2000). «Мутант PPARgamma служит доминантно отрицательным ингибитором передачи сигналов PPAR и локализуется в ядре». Мол. Клетка. Эндокринол. 162 (1–2): 57–67. Дои:10.1016 / S0303-7207 (00) 00211-2. PMID 10854698. S2CID 20343538.
  30. ^ Gampe RT, Montana VG, Lambert MH, Miller AB, Bledsoe RK, Milburn MV, Kliewer SA, Willson TM, Xu HE (2000). «Асимметрия в кристаллической структуре PPARgamma / RXRalpha раскрывает молекулярную основу гетеродимеризации ядерных рецепторов». Мол. Клетка. 5 (3): 545–55. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80448-7. PMID 10882139.
  31. ^ Такано Ю., Адачи С., Окуно М., Муто Ю., Йошиока Т., Мацусима-Нишиваки Р., Цуруми Н., Ито К., Фридман С. Л., Мориваки Н., Кодзима С., Окано Ю. (2004). «Белок пальца RING, RNF8, взаимодействует с альфа-рецептором ретиноида X и усиливает его транскрипционно-стимулирующую активность». J. Biol. Chem. 279 (18): 18926–34. Дои:10.1074 / jbc.M309148200. PMID 14981089.
  32. ^ Бенкусса М., Бренд С, Дельмотт М. Х., Formstecher P, Лефевр P (2002). «Рецепторы ретиноевой кислоты ингибируют активацию AP1, регулируя киназу, регулируемую внеклеточными сигналами, и рекрутирование CBP на AP1-чувствительный промотор». Мол. Клетка. Биол. 22 (13): 4522–34. Дои:10.1128 / MCB.22.13.4522-4534.2002. ЧВК 133906. PMID 12052862.
  33. ^ Багге Т.Х., Поль Дж., Лонной О., Стунненберг Г.Г. (1992). «RXR альфа, беспорядочный партнер рецепторов ретиноевой кислоты и гормонов щитовидной железы». EMBO J. 11 (4): 1409–18. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05186.x. ЧВК 556590. PMID 1314167.
  34. ^ Ли Ю.К., Делл Х., Доухан Д.Х., Хадзопулу-Кладарас М., Мур Д.Д. (2000). «Орфанный ядерный рецептор SHP ингибирует ядерный фактор 4 гепатоцитов и трансактивацию рецептора ретиноида X: два механизма репрессии». Мол. Клетка. Биол. 20 (1): 187–95. Дои:10.1128 / MCB.20.1.187-195.2000. ЧВК 85074. PMID 10594021.
  35. ^ Брендель К., Скунджанс К., Ботругно О.А., Тройтер Э., Ауверкс Дж. (2002). «Маленький гетеродимерный партнер взаимодействует с альфа-рецептором Х печени и подавляет его транскрипционную активность». Мол. Эндокринол. 16 (9): 2065–76. Дои:10.1210 / me.2001-0194. PMID 12198243.
  36. ^ Цзэн М., Кумар А., Мэн Г., Гао Ц., Димри Г., Вазер Д., Группа H, Группа V (2002). «Онкопротеин E6 вируса папилломы человека 16 ингибирует трансактивацию, опосредованную ретиноидным X-рецептором, воздействуя на коактиватор ADA3 человека». J. Biol. Chem. 277 (47): 45611–8. Дои:10.1074 / jbc.M208447200. PMID 12235159.
  37. ^ Шульман И.Г., Чакраварти Д., Джугилон Х., Ромо А., Эванс Р.М. (1995). «Взаимодействие между ретиноидным рецептором X и консервативной областью ТАТА-связывающего белка опосредует гормонозависимую трансактивацию». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (18): 8288–92. Bibcode:1995PNAS ... 92.8288S. Дои:10.1073 / пнас.92.18.8288. ЧВК 41142. PMID 7667283.
  38. ^ Тено С., Анрике С., Рошфор Н., Кавай В. (1997). «Дифференциальное взаимодействие ядерных рецепторов с предполагаемым коактиватором транскрипции человека hTIF1». J. Biol. Chem. 272 (18): 12062–8. Дои:10.1074 / jbc.272.18.12062. PMID 9115274.
  39. ^ Ли В.Й., Ной Н. (2002). «Взаимодействия RXR с коактиваторами по-разному опосредуются спиралью 11 лиганд-связывающего домена рецептора». Биохимия. 41 (8): 2500–8. Дои:10.1021 / bi011764 +. PMID 11851396.
  40. ^ Монден Т., Ф. Вондисфорд, А. Н. Холленберг (1997). «Выделение и характеристика нового лиганд-зависимого белка, коактивирующего рецептор тироидного гормона». J. Biol. Chem. 272 (47): 29834–41. Дои:10.1074 / jbc.272.47.29834. PMID 9368056.
  41. ^ Jeyakumar M, Tanen MR, Bagchi MK (1997). «Анализ функциональной роли коактиватора-1 стероидного рецептора в лиганд-индуцированной трансактивации рецептором тироидного гормона». Мол. Эндокринол. 11 (6): 755–67. Дои:10.1210 / ремонт.11.6.0003. PMID 9171239.
  42. ^ Баудино Т.А., Крайчели Д.М., Джефкоат С.К., Винчестер СК, Партридж Северная Каролина, Макдональд П.Н. (1998). «Выделение и характеристика нового белка-коактиватора NCoA-62, участвующего в опосредованной витамином D транскрипции». J. Biol. Chem. 273 (26): 16434–41. Дои:10.1074 / jbc.273.26.16434. PMID 9632709.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.