WikiDer > TBX5 (ген)

TBX5 (gene)
TBX5
Белок TBX5 PDB 2X6U.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTBX5, HOS, T-box 5, фактор транскрипции T-box 5
Внешние идентификаторыOMIM: 601620 MGI: 102541 ГомолоГен: 160 Генные карты: TBX5
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение TBX5
Геномное расположение TBX5
Группа12q24.21Начните114,353,931 бп[1]
Конец114,408,442 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TBX5 211886 s в формате fs.png

PBB GE TBX5 207155 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

6910

21388

Ансамбль

ENSG00000089225

ENSMUSG00000018263

UniProt

Q99593

P70326

RefSeq (мРНК)

NM_181486
NM_000192
NM_080717
NM_080718

NM_011537

RefSeq (белок)

NP_000183
NP_542448
NP_852259

NP_035667

Расположение (UCSC)Chr 12: 114,35 - 114,41 МбChr 5: 119,83 - 119,89 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции T-box TBX5 это белок что у людей кодируется TBX5 ген.[5][6][7]

Этот ген является членом филогенетически консервативного семейства генов, которые имеют общий ДНК-связывающий домен, Т-образная коробка. Гены Т-бокса кодируют факторы транскрипции, участвующие в регуляции процессов развития. Этот ген тесно связан[требуется разъяснение] к родственному члену семьи T-box 3 (синдром локтевой молочной железы) на хромосоме 12 человека.

Tbx5 - это ген, расположенный на длинном плече хромосомы 12.[8] Tbx5 продуцирует белок, называемый T-box 5, который действует как фактор транскрипции.[9] Ген Tbx5 участвует в развитии передних конечностей и сердца.[10] Этот ген влияет на раннее развитие передней конечности, вызывая фактор роста фибробластов, FGF10.[11]

Функция

Tbx5 участвует в развитии четырех камер сердца, электропроводящей системы и перегородки, разделяющей правую и левую стороны сердца.[12] Ген Tbx5 представляет собой фактор транскрипции, который кодирует белок, называемый Т-бокс 5. Помимо того, что он играет роль в развитии сердца, перегородки и электрической системы сердца, он также активирует гены, которые участвуют в развитии верхние конечности, руки и кисти. Этот ген участвует в формировании паттернов основных аспектов сердца; однако он также участвует в соединительной ткани мышц для формирования рисунка мышц и сухожилий. Исследование показало, что делеция Tbx5 в передних конечностях вызывает нарушение структуры мышц и сухожилий, не влияя на развитие скелета.[13] Экспрессия Tbx5 происходит в клетках мезодермы латеральной пластинки, которые формируют зачаток передних конечностей и каскад инициации конечностей. При его отсутствии зачаток передних конечностей не образуется. Заболевания и дефекты, связанные с этим геном, представляют собой синдром Холта-Орама, оба связаны с дефектами конечностей и некоторыми другими аномалиями. Сердечные дефекты включают дефекты перегородки, разделяющей левую и правую стороны сердца, аномалии проводящей системы и другие проблемы. Точный механизм, который Tbx5 активирует экспрессию генов, все еще обнаруживается и активно выясняется.

Клиническое значение

Кодируемый белок может играть роль в развитии сердца и спецификации конечностей. Мутации в этом гене были связаны с Синдром Холта-Орама, нарушение развития, поражающее сердце и верхние конечности.[10][14] Скелетно могут быть аномально согнутые пальцы, покатые плечи и фокомелия. Сердечные дефекты включают вентральную и предсердную перегородку, а также проблемы с проводящей системой.[15] Для этого гена описано несколько вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.[7]

В исследованиях, проведенных на мутантных мышах без гена TBX5, было показано, что гомозиготные мыши не пережили беременность из-за того, что сердце не развивалось после эмбрионального дня. E9.5. Также гетерозиготные мыши родились с морфологическими проблемами, такими как увеличенное сердце, дефекты межпредсердной и вентральной перегородок, а также пороки развития конечностей, подобные тем, которые обнаруживаются при синдроме Холта-Орама.[16] Подтверждение важной роли ТВХ5 в развитии сердца.

Кодируемый белок играет важную роль в развитие конечностейособенно во время почка конечности инициация.[17] Например, у цыплят Tbx5 указывает состояние передних конечностей.[18] Активация Tbx5 и др. Белки Т-бокса от Hox-гены активирует сигнальные каскады, которые включают Сигнальный путь Wnt и Сигналы FGF в зачатках конечностей.[17] В конечном итоге Tbx5 приводит к развитию апикальный эктодермальный гребень (AER) и зона поляризующей активности (ЗПА) сигнальные центры в развивающейся зачатке конечности, которые определяют ориентацию роста развивающейся конечности.[17] Вместе с Tbx4, Tbx5 играет роль в формировании паттерна мягких тканей (мышц и сухожилий) костно-мышечной системы.[19]

Мутация в этом гене может вызвать Синдром Холта-Орама или Синдром Амелии.[10] Синдром Холта-Орама может вызывать несколько различных дефектов. Одним из следствий синдрома Холта-Орама является отверстие в перегородке.[9] Еще один симптом этого синдрома - аномалии костей пальцев, запястий или рук.[20] Дополнительным дефектом, который может вызвать синдром Холта-Орама, является заболевание проводимости, приводящее к аномальной частоте сердечных сокращений и аритмиям.[8] Синдром Амелии - это состояние, при котором возникает порок развития передних конечностей, потому что FGF-10 не запускается из-за мутаций Tbx5.[21] Это состояние может привести к отсутствию одной или обеих передних конечностей.

Взаимодействия

TBX5 (ген), как было показано, взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000089225 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018263 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Бассон К.Т., Бачинский Д.Р., Лин Р.К., Леви Т., Элкинс Дж.А., Султс Дж., Грейзел Д., Кроумпузу Э., Трейл Т.А., Леблан-Страчески Дж., Рено Б., Кучерлапати Р., Сейдман Дж. Г., Сейдман К.Э. (январь 1997 г.). «Мутации в человеческом TBX5 [исправленные] вызывают пороки развития конечностей и сердца при синдроме Холта-Орама». Природа Генетика. 15 (1): 30–5. Дои:10.1038 / ng0197-30. PMID 8988165. S2CID 30763654.
  6. ^ Терретт Дж. А., Ньюбери-Экоб Р., Кросс Г. С., Фентон И., Реберн Дж. А., Янг И. Д., Брук Дж. Д. (апрель 1994 г.). «Синдром Холта-Орама - это генетически гетерогенное заболевание с одним локусом, отображаемым на хромосоме 12q человека». Природа Генетика. 6 (4): 401–4. Дои:10.1038 / ng0494-401. PMID 8054982. S2CID 30213.
  7. ^ а б "Entrez Gene: TBX5 T-box 5".
  8. ^ а б Патель С., Силкок Л., Макмаллан Д., Брютон Л., Кокс Н. (август 2012 г.). «Внутригенная дупликация TBX5: семья с атипичным фенотипом синдрома Холта-Орама». Европейский журнал генетики человека. 20 (8): 863–9. Дои:10.1038 / ejhg.2012.16. ЧВК 3400730. PMID 22333898.
  9. ^ а б Чжан В.К., Ли Б.Х., Ким Г.Х., Ли Джо, Ю Х.В. (август 2015 г.). «Клиническая и молекулярная характеристика синдрома Холта-Орама с упором на сердечные проявления». Кардиология у молодых. 25 (6): 1093–8. Дои:10,1017 / с1047951114001656. PMID 25216260.
  10. ^ а б c Штаймле Дж. Д., Московиц И. П. (2017). «TBX5: ключевой регулятор развития сердца». Актуальные темы биологии развития. 122: 195–221. Дои:10.1016 / bs.ctdb.2016.08.008. ЧВК 5371404. PMID 28057264.
  11. ^ Нисимото С., Уайльд С.М., Вуд С., Логан М.П. (август 2015 г.). «RA действует в согласованном механизме прямой связи с Tbx5 для контроля индукции и инициации зачатка конечности». Отчеты по ячейкам. 12 (5): 879–91. Дои:10.1016 / j.celrep.2015.06.068. ЧВК 4553633. PMID 26212321.
  12. ^ Boogerd CJ, Evans SM (февраль 2016 г.). «TBX5 и NuRD разделяют сердца». Клетка развития. 36 (3): 242–4. Дои:10.1016 / j.devcel.2016.01.015. ЧВК 5542051. PMID 26859347.
  13. ^ Хассон, Пелег; ДеЛорье, апрель; Беннетт, Майкл; Григорьева Елена; Naiche, L.A .; Papaioannou, Virginia E .; Мохун, Тимоти Дж .; Логан, Малкольм П. О. (19 января 2010 г.). «Действия Tbx4 и Tbx5 в соединительной ткани необходимы для формирования рисунка мышц конечностей и сухожилий». Клетка развития. 18 (1): 148–156. Дои:10.1016 / j.devcel.2009.11.013. ISSN 1534-5807. ЧВК 3034643. PMID 20152185.
  14. ^ Вирдис Дж., Дессоле М., Дессоле С., Амброзини Дж., Косми Е., Черчил П. Л., Капобианко Дж. (2016). «Синдром Холта Орама: отчет о болезни и обзор литературы». Клиническое и экспериментальное акушерство и гинекология. 43 (1): 137–9. PMID 27048037.
  15. ^ Packham EA, Brook JD (апрель 2003 г.). «Гены Т-бокса при заболеваниях человека». Молекулярная генетика человека. 12 ТУ № 1 (ТУ № 1): Р37-44. Дои:10.1093 / hmg / ddg077. PMID 12668595.
  16. ^ Takeuchi JK, Ohgi M, Koshiba-Takeuchi K, Shiratori H, Sakaki I, Ogura K, Saijoh Y, Ogura T. (декабрь 2003 г.). «Tbx5 определяет положение левого / правого желудочков и межжелудочковой перегородки во время кардиогенеза». Развитие. 130 (24): 5953–64. Дои:10.1242 / dev.00797. PMID 14573514.
  17. ^ а б c Tickle C (октябрь 2015 г.). «Как эмбрион создает конечность: определение, полярность и идентичность». Журнал анатомии. 227 (4): 418–30. Дои:10.1111 / joa.12361. ЧВК 4580101. PMID 26249743.
  18. ^ Родригес-Эстебан К., Цукуи Т., Йоней С., Магаллон Дж., Тамура К., Изписуа Бельмонте Дж. К. (апрель 1999 г.). «Гены Т-бокса Tbx4 и Tbx5 регулируют рост и идентичность конечностей». Природа. 398 (6730): 814–8. Bibcode:1999Натура.398..814р. Дои:10.1038/19769. PMID 10235264. S2CID 4330287.
  19. ^ Хассон П., ДеЛорье А., Беннетт М., Григорьева Е., Найче Л.А., Папайоанну В.Э., Мохун Т.Дж., Логан М.П. (январь 2010 г.). «Tbx4 и tbx5, действующие в соединительной ткани, необходимы для формирования рисунка мышц и сухожилий конечностей». Клетка развития. 18 (1): 148–56. Дои:10.1016 / j.devcel.2009.11.013. ЧВК 3034643. PMID 20152185.
  20. ^ Пизард А., Бургон П.Г., Пол Д.Л., Бруно Б.Г., Сейдман К.Э., Сейдман Дж. Г. (июнь 2005 г.). «Коннексин 40, мишень фактора транскрипции Tbx5, рисунки на запястье, пальцах и грудины». Молекулярная и клеточная биология. 25 (12): 5073–83. Дои:10.1128 / mcb.25.12.5073-5083.2005. ЧВК 1140596. PMID 15923624.
  21. ^ Ниманн, Стефан (1993), Синдром Тетра-Амелии, GeneReviews, Вашингтонский университет, Сиэтл, PMID 20301453
  22. ^ а б Гарг В., Катирия И.С., Барнс Р., Шлутерман М.К., Кинг И.Н., Батлер, Калифорния, Ротрок С.Р., Ипен Р.С., Хираяма-Ямада К., Джу К., Мацуока Р., Коэн Д.С., Шривастава Д. (июль 2003 г.). «Мутации GATA4 вызывают врожденные пороки сердца человека и обнаруживают взаимодействие с TBX5». Природа. 424 (6947): 443–7. Bibcode:2003Натура.424..443Г. Дои:10.1038 / природа01827. PMID 12845333. S2CID 4304709.
  23. ^ Hiroi Y, Kudoh S, Monzen K, Ikeda Y, Yazaki Y, Nagai R, Komuro I. (июль 2001 г.). «Tbx5 связывается с Nkx2-5 и синергетически способствует дифференцировке кардиомиоцитов». Природа Генетика. 28 (3): 276–80. Дои:10.1038/90123. PMID 11431700. S2CID 13250085.

[1]

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  1. ^ Ссылка, Genetics Home (2010). «Ген TBX5». Домашний справочник по генетике. 18: 148–56. Дои:10.1016 / j.devcel.2009.11.013. ЧВК 3034643. PMID 20152185. Получено 13 апреля 2020.